Protein–RNA interactions for Protein: Q62217

Sema5a, Semaphorin-5A, mousemouse

Predictions only

Length 1,077 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Sema5aQ62217 Amer2-203ENSMUST00000225247 2662 ntBASIC26.31■■□□□ 1.8
Sema5aQ62217 Kdm2a-203ENSMUST00000116571 2413 ntTSL 1 (best) BASIC26.3■■□□□ 1.8
Sema5aQ62217 Aspscr1-201ENSMUST00000026135 1820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.3■■□□□ 1.8
Sema5aQ62217 Rab2a-201ENSMUST00000060232 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.29■■□□□ 1.8
Sema5aQ62217 Pradc1-202ENSMUST00000113770 610 ntTSL 1 (best) BASIC26.29■■□□□ 1.8
Sema5aQ62217 Gm17494-201ENSMUST00000072769 1800 ntTSL 1 (best) BASIC26.28■■□□□ 1.8
Sema5aQ62217 Cetn4-201ENSMUST00000071400 1808 ntTSL 5 BASIC26.28■■□□□ 1.8
Sema5aQ62217 Terf2-203ENSMUST00000116425 2471 ntTSL 1 (best) BASIC26.27■■□□□ 1.8
Sema5aQ62217 Crem-227ENSMUST00000149803 1422 ntTSL 1 (best) BASIC26.27■■□□□ 1.8
Sema5aQ62217 Tmeff1-202ENSMUST00000123476 1224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.26■■□□□ 1.79
Sema5aQ62217 Znrf3-202ENSMUST00000143746 1022 ntTSL 1 (best) BASIC26.26■■□□□ 1.79
Sema5aQ62217 Fkbp8-202ENSMUST00000119353 1720 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.25■■□□□ 1.79
Sema5aQ62217 A530058N18Rik-207ENSMUST00000152254 1211 ntTSL 1 (best) BASIC26.25■■□□□ 1.79
Sema5aQ62217 Ccdc122-202ENSMUST00000095625 1195 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.25■■□□□ 1.79
Sema5aQ62217 Dda1-209ENSMUST00000147642 1865 ntTSL 2 BASIC26.25■■□□□ 1.79
Sema5aQ62217 Fam241a-201ENSMUST00000057198 1607 ntTSL 1 (best) BASIC26.25■■□□□ 1.79
Sema5aQ62217 Phf23-205ENSMUST00000135814 2214 ntTSL 1 (best) BASIC26.24■■□□□ 1.79
Sema5aQ62217 Ssx2ip-202ENSMUST00000106149 2416 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.24■■□□□ 1.79
Sema5aQ62217 Galnt12-202ENSMUST00000107744 2077 ntTSL 1 (best) BASIC26.23■■□□□ 1.79
Sema5aQ62217 Srsf9-201ENSMUST00000031513 1162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.23■■□□□ 1.79
Sema5aQ62217 Stau2-210ENSMUST00000149320 2214 ntTSL 5 BASIC26.22■■□□□ 1.79
Sema5aQ62217 Popdc3-201ENSMUST00000019994 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.21■■□□□ 1.79
Sema5aQ62217 Egr3-201ENSMUST00000035908 1509 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.21■■□□□ 1.79
Sema5aQ62217 Tbcel-204ENSMUST00000128959 1535 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.2■■□□□ 1.79
Sema5aQ62217 Gm527-201ENSMUST00000058135 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.19■■□□□ 1.78
Sema5aQ62217 CT030161.2-201ENSMUST00000218666 735 ntTSL 3 BASIC26.18■■□□□ 1.78
Sema5aQ62217 Gm10762-201ENSMUST00000099385 1133 ntAPPRIS P1 BASIC26.18■■□□□ 1.78
Sema5aQ62217 Rras2-201ENSMUST00000069449 2275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.18■■□□□ 1.78
Sema5aQ62217 Dazap1-201ENSMUST00000092305 1994 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.18■■□□□ 1.78
Sema5aQ62217 Gm15672-201ENSMUST00000151512 1354 ntTSL 1 (best) BASIC26.17■■□□□ 1.78
Sema5aQ62217 Hdgf-201ENSMUST00000005017 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.16■■□□□ 1.78
Sema5aQ62217 Kmt5a-202ENSMUST00000100709 1425 ntTSL 1 (best) BASIC26.15■■□□□ 1.78
Sema5aQ62217 Smad2-202ENSMUST00000091831 1645 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC26.15■■□□□ 1.78
Sema5aQ62217 Caap1-201ENSMUST00000030313 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.15■■□□□ 1.78
Sema5aQ62217 Rbm17-201ENSMUST00000040314 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.15■■□□□ 1.78
Sema5aQ62217 A730013G03Rik-202ENSMUST00000195012 2097 ntBASIC26.15■■□□□ 1.78
Sema5aQ62217 Mypop-203ENSMUST00000131087 1951 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.14■■□□□ 1.77
Sema5aQ62217 Irx4-201ENSMUST00000022095 2589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.13■■□□□ 1.77
Sema5aQ62217 Gm960-202ENSMUST00000177696 2262 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC26.12■■□□□ 1.77
Sema5aQ62217 Zfp358-201ENSMUST00000061508 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.11■■□□□ 1.77
Sema5aQ62217 Ppp1r14c-202ENSMUST00000217573 2013 ntTSL 1 (best) BASIC26.11■■□□□ 1.77
Sema5aQ62217 Junos-204ENSMUST00000128094 830 ntTSL 1 (best) BASIC26.11■■□□□ 1.77
Sema5aQ62217 Eif2ak3-204ENSMUST00000162950 927 ntTSL 1 (best) BASIC26.1■■□□□ 1.77
Sema5aQ62217 A430072P03Rik-201ENSMUST00000161480 1510 ntTSL 1 (best) BASIC26.09■■□□□ 1.77
Sema5aQ62217 Gsk3a-202ENSMUST00000108411 2248 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.08■■□□□ 1.77
Sema5aQ62217 A530058N18Rik-208ENSMUST00000131299 1387 ntTSL 2 BASIC26.08■■□□□ 1.77
Sema5aQ62217 Tlx3-201ENSMUST00000037746 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.08■■□□□ 1.77
Sema5aQ62217 Hrh3-208ENSMUST00000171736 906 ntTSL 5 BASIC26.07■■□□□ 1.76
Sema5aQ62217 Nucks1-203ENSMUST00000189946 2375 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.07■■□□□ 1.76
Sema5aQ62217 Suds3-202ENSMUST00000166397 1694 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.06■■□□□ 1.76
Sema5aQ62217 5730480H06Rik-201ENSMUST00000030968 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.05■■□□□ 1.76
Sema5aQ62217 Fbxo6-201ENSMUST00000030858 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.04■■□□□ 1.76
Sema5aQ62217 Grb2-202ENSMUST00000106495 2041 ntTSL 5 BASIC26.03■■□□□ 1.76
Sema5aQ62217 Odc1-201ENSMUST00000171737 2208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
Sema5aQ62217 Snx3-201ENSMUST00000019939 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.01■■□□□ 1.75
Sema5aQ62217 Mcat-201ENSMUST00000061882 1893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.01■■□□□ 1.75
Sema5aQ62217 Terf2-201ENSMUST00000068388 1915 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.01■■□□□ 1.75
Sema5aQ62217 Kansl2-202ENSMUST00000116400 2110 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
Sema5aQ62217 Dapk3-201ENSMUST00000047665 1676 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26■■□□□ 1.75
Sema5aQ62217 Eif4ebp1-201ENSMUST00000033880 1997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
Sema5aQ62217 Rtn2-201ENSMUST00000032559 1990 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.99■■□□□ 1.75
Sema5aQ62217 Cldn10-203ENSMUST00000100314 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.99■■□□□ 1.75
Sema5aQ62217 Dedd-201ENSMUST00000064950 1618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.98■■□□□ 1.75
Sema5aQ62217 Zfp131-205ENSMUST00000223812 663 ntBASIC25.97■■□□□ 1.75
Sema5aQ62217 Arhgap22-201ENSMUST00000111955 2148 ntTSL 1 (best) BASIC25.97■■□□□ 1.75
Sema5aQ62217 Srp9-201ENSMUST00000027792 1367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.96■■□□□ 1.75
Sema5aQ62217 Mef2a-201ENSMUST00000032776 2476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.96■■□□□ 1.75
Sema5aQ62217 E030037K01Rik-201ENSMUST00000180928 1756 ntBASIC25.96■■□□□ 1.75
Sema5aQ62217 Cabp1-204ENSMUST00000112113 1621 ntTSL 1 (best) BASIC25.96■■□□□ 1.75
Sema5aQ62217 Plekha3-201ENSMUST00000111920 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.95■■□□□ 1.75
Sema5aQ62217 St7-202ENSMUST00000052113 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.95■■□□□ 1.75
Sema5aQ62217 Klhl25-205ENSMUST00000206019 2299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.95■■□□□ 1.74
Sema5aQ62217 Slc16a8-201ENSMUST00000039752 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.95■■□□□ 1.74
Sema5aQ62217 1700016A09Rik-201ENSMUST00000192004 835 ntBASIC25.94■■□□□ 1.74
Sema5aQ62217 Twist1-201ENSMUST00000049089 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.94■■□□□ 1.74
Sema5aQ62217 Rtn4r-201ENSMUST00000059589 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.93■■□□□ 1.74
Sema5aQ62217 Nelfe-204ENSMUST00000173357 1399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.92■■□□□ 1.74
Sema5aQ62217 Dtnb-203ENSMUST00000164578 2355 ntTSL 1 (best) BASIC25.91■■□□□ 1.74
Sema5aQ62217 2410017I17Rik-202ENSMUST00000090537 2053 ntTSL 2 BASIC25.91■■□□□ 1.74
Sema5aQ62217 Tor1a-201ENSMUST00000028200 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.89■■□□□ 1.74
Sema5aQ62217 Stard10-202ENSMUST00000163799 1723 ntTSL 1 (best) BASIC25.89■■□□□ 1.74
Sema5aQ62217 Fam120aos-201ENSMUST00000180775 1780 ntTSL 1 (best) BASIC25.89■■□□□ 1.73
Sema5aQ62217 Acvr2b-202ENSMUST00000165044 2093 ntTSL 2 BASIC25.89■■□□□ 1.73
Sema5aQ62217 March2-205ENSMUST00000173015 1418 ntTSL 3 BASIC25.88■■□□□ 1.73
Sema5aQ62217 Mat2b-201ENSMUST00000040167 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.88■■□□□ 1.73
Sema5aQ62217 Tspan33-201ENSMUST00000046750 1994 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.88■■□□□ 1.73
Sema5aQ62217 Sugct-202ENSMUST00000220514 1351 ntTSL 1 (best) BASIC25.87■■□□□ 1.73
Sema5aQ62217 Pcgf5-201ENSMUST00000062389 1566 ntTSL 5 BASIC25.86■■□□□ 1.73
Sema5aQ62217 Mpp6-202ENSMUST00000036236 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.86■■□□□ 1.73
Sema5aQ62217 BC037032-205ENSMUST00000187080 508 ntTSL 5 BASIC25.86■■□□□ 1.73
Sema5aQ62217 1700069B07Rik-202ENSMUST00000191155 939 ntBASIC25.86■■□□□ 1.73
Sema5aQ62217 En1-201ENSMUST00000079721 2624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.86■■□□□ 1.73
Sema5aQ62217 Klhl35-201ENSMUST00000037359 1954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.85■■□□□ 1.73
Sema5aQ62217 Fezf2-202ENSMUST00000224023 1917 ntBASIC25.84■■□□□ 1.73
Sema5aQ62217 Nr2f6-201ENSMUST00000002466 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.84■■□□□ 1.73
Sema5aQ62217 Pard6a-205ENSMUST00000212430 1261 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.84■■□□□ 1.73
Sema5aQ62217 Cbln1-201ENSMUST00000034076 2800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.84■■□□□ 1.73
Sema5aQ62217 Amigo1-203ENSMUST00000106659 1360 ntTSL 1 (best) BASIC25.83■■□□□ 1.73
Sema5aQ62217 C1ql1-201ENSMUST00000057849 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.82■■□□□ 1.72
Sema5aQ62217 Cxxc4-203ENSMUST00000181904 5694 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC25.81■■□□□ 1.72
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 28.1 ms