Protein–RNA interactions for Protein: Q61602

Gli3, Transcriptional activator GLI3, mousemouse

Predictions only

Length 1,583 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gli3Q61602 Gm12100-201ENSMUST00000150255 1933 ntTSL 1 (best) BASIC35.67■■■■□ 3.3
Gli3Q61602 Gm15039-201ENSMUST00000118914 875 ntBASIC35.64■■■■□ 3.3
Gli3Q61602 Osbpl1a-209ENSMUST00000122175 1203 ntTSL 1 (best) BASIC35.64■■■■□ 3.3
Gli3Q61602 Pard6a-201ENSMUST00000093195 1265 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC35.63■■■■□ 3.29
Gli3Q61602 Emx1-201ENSMUST00000045942 1561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.62■■■■□ 3.29
Gli3Q61602 Fam149b-201ENSMUST00000037698 924 ntTSL 1 (best) BASIC35.59■■■■□ 3.29
Gli3Q61602 Amigo1-203ENSMUST00000106659 1360 ntTSL 1 (best) BASIC35.59■■■■□ 3.29
Gli3Q61602 Lactb-202ENSMUST00000215172 1806 ntTSL 1 (best) BASIC35.58■■■■□ 3.29
Gli3Q61602 Gm28052-201ENSMUST00000150388 380 ntTSL 3 BASIC35.57■■■■□ 3.28
Gli3Q61602 Sept11-208ENSMUST00000202308 1792 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC35.57■■■■□ 3.28
Gli3Q61602 Phlda1-201ENSMUST00000164773 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.56■■■■□ 3.28
Gli3Q61602 Tcte2-204ENSMUST00000130033 1462 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC35.54■■■■□ 3.28
Gli3Q61602 Ybx2-205ENSMUST00000149194 1235 ntTSL 5 BASIC35.54■■■■□ 3.28
Gli3Q61602 Gm13889-202ENSMUST00000148314 1240 ntAPPRIS P1 BASIC35.53■■■■□ 3.28
Gli3Q61602 Ssbp3-203ENSMUST00000097934 1742 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC35.52■■■■□ 3.28
Gli3Q61602 Fam89b-202ENSMUST00000116558 1189 ntTSL 1 (best) BASIC35.51■■■■□ 3.28
Gli3Q61602 Trappc6b-203ENSMUST00000217863 797 ntTSL 2 BASIC35.51■■■■□ 3.28
Gli3Q61602 Pm20d2-201ENSMUST00000098181 1445 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC35.51■■■■□ 3.27
Gli3Q61602 Fam89a-201ENSMUST00000055257 1338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.5■■■■□ 3.27
Gli3Q61602 Tmem259-201ENSMUST00000052885 2225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.48■■■■□ 3.27
Gli3Q61602 Gm7334-201ENSMUST00000061681 1356 ntAPPRIS P1 BASIC35.47■■■■□ 3.27
Gli3Q61602 Cpsf4-201ENSMUST00000070487 1606 ntTSL 1 (best) BASIC35.47■■■■□ 3.27
Gli3Q61602 Gm5814-201ENSMUST00000177586 378 ntAPPRIS P1 BASIC35.47■■■■□ 3.27
Gli3Q61602 Nelfe-204ENSMUST00000173357 1399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.45■■■■□ 3.26
Gli3Q61602 Gm27021-201ENSMUST00000181333 758 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC35.44■■■■□ 3.26
Gli3Q61602 Ankrd60-202ENSMUST00000119453 1084 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC35.41■■■■□ 3.26
Gli3Q61602 Mxd4-202ENSMUST00000119171 1160 ntTSL 1 (best) BASIC35.4■■■■□ 3.26
Gli3Q61602 Ell2-205ENSMUST00000222194 434 ntTSL 3 BASIC35.4■■■■□ 3.26
Gli3Q61602 Mad2l2-202ENSMUST00000084129 1162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.4■■■■□ 3.26
Gli3Q61602 A030005K14Rik-201ENSMUST00000193762 1093 ntAPPRIS P1 BASIC35.38■■■■□ 3.25
Gli3Q61602 Hs3st6-201ENSMUST00000044922 1219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.38■■■■□ 3.25
Gli3Q61602 Ccm2l-201ENSMUST00000109800 2158 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC35.38■■■■□ 3.25
Gli3Q61602 Spata1-201ENSMUST00000029839 1920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.36■■■■□ 3.25
Gli3Q61602 A430072P03Rik-201ENSMUST00000161480 1510 ntTSL 1 (best) BASIC35.34■■■■□ 3.25
Gli3Q61602 Dctpp1-201ENSMUST00000035276 676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.32■■■■□ 3.24
Gli3Q61602 Mapkap1-201ENSMUST00000113123 1530 ntTSL 5 BASIC35.31■■■■□ 3.24
Gli3Q61602 Ccdc50-202ENSMUST00000096127 1096 ntTSL 1 (best) BASIC35.29■■■■□ 3.24
Gli3Q61602 Eif4e2-204ENSMUST00000113231 1119 ntTSL 1 (best) BASIC35.27■■■■□ 3.24
Gli3Q61602 Gpr137c-205ENSMUST00000227009 771 ntAPPRIS ALT2 BASIC35.26■■■■□ 3.24
Gli3Q61602 Atp1b3-201ENSMUST00000034983 1994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.26■■■■□ 3.24
Gli3Q61602 A530058N18Rik-203ENSMUST00000135729 1405 ntTSL 1 (best) BASIC35.26■■■■□ 3.23
Gli3Q61602 A530058N18Rik-208ENSMUST00000131299 1387 ntTSL 2 BASIC35.24■■■■□ 3.23
Gli3Q61602 Zmynd12-201ENSMUST00000094819 1464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.24■■■■□ 3.23
Gli3Q61602 C130046K22Rik-201ENSMUST00000129780 727 ntTSL 5 BASIC35.24■■■■□ 3.23
Gli3Q61602 Mapk3-202ENSMUST00000057669 1800 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC35.23■■■■□ 3.23
Gli3Q61602 Dnajc19-202ENSMUST00000108195 659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.22■■■■□ 3.23
Gli3Q61602 Triobp-206ENSMUST00000130663 1660 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC35.22■■■■□ 3.23
Gli3Q61602 Eva1b-202ENSMUST00000106150 1144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.21■■■■□ 3.23
Gli3Q61602 Gm44957-202ENSMUST00000205137 448 ntTSL 3 BASIC35.21■■■■□ 3.23
Gli3Q61602 Fam136a-201ENSMUST00000071492 1643 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.2■■■■□ 3.23
Gli3Q61602 Rpl38-203ENSMUST00000106599 457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.2■■■■□ 3.23
Gli3Q61602 Gm28529-202ENSMUST00000189675 670 ntTSL 2 BASIC35.2■■■■□ 3.23
Gli3Q61602 Fgf20-201ENSMUST00000034014 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.19■■■■□ 3.22
Gli3Q61602 Paqr6-203ENSMUST00000147948 837 ntTSL 2 BASIC35.19■■■■□ 3.22
Gli3Q61602 Mtor-201ENSMUST00000057580 1003 ntTSL 1 (best) BASIC35.19■■■■□ 3.22
Gli3Q61602 Tceal3-201ENSMUST00000060904 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.18■■■■□ 3.22
Gli3Q61602 Serpinb6a-201ENSMUST00000017188 1504 ntTSL 1 (best) BASIC35.18■■■■□ 3.22
Gli3Q61602 Znrf1-207ENSMUST00000173506 1238 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC35.16■■■■□ 3.22
Gli3Q61602 Tmem200b-201ENSMUST00000094666 1370 ntAPPRIS P1 BASIC35.15■■■■□ 3.22
Gli3Q61602 Gm6311-201ENSMUST00000073790 878 ntBASIC35.15■■■■□ 3.22
Gli3Q61602 Zcrb1-201ENSMUST00000076070 877 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC35.15■■■■□ 3.22
Gli3Q61602 Ppa2-203ENSMUST00000122334 1368 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC35.15■■■■□ 3.22
Gli3Q61602 Sugct-202ENSMUST00000220514 1351 ntTSL 1 (best) BASIC35.14■■■■□ 3.22
Gli3Q61602 Foxd3-201ENSMUST00000087285 2324 ntAPPRIS P1 BASIC35.14■■■■□ 3.22
Gli3Q61602 Unc119-203ENSMUST00000108295 1371 ntTSL 3 BASIC35.13■■■■□ 3.21
Gli3Q61602 Gm45051-201ENSMUST00000206838 963 ntTSL 1 (best) BASIC35.13■■■■□ 3.21
Gli3Q61602 Tsen34-211ENSMUST00000205287 1375 ntTSL 5 BASIC35.12■■■■□ 3.21
Gli3Q61602 Efhd1os-201ENSMUST00000138844 332 ntTSL 3 BASIC35.09■■■■□ 3.21
Gli3Q61602 Cadm4-201ENSMUST00000068023 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.08■■■■□ 3.21
Gli3Q61602 Gnai2-201ENSMUST00000055704 2215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.07■■■■□ 3.21
Gli3Q61602 Card19-201ENSMUST00000048946 804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.07■■■■□ 3.2
Gli3Q61602 Prelid3b-201ENSMUST00000016401 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.07■■■■□ 3.2
Gli3Q61602 Tlx2-202ENSMUST00000174674 1514 ntTSL 1 (best) BASIC35.07■■■■□ 3.2
Gli3Q61602 Hmx1-201ENSMUST00000087674 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.06■■■■□ 3.2
Gli3Q61602 Vegfa-211ENSMUST00000167860 975 ntTSL 1 (best) BASIC35.04■■■■□ 3.2
Gli3Q61602 Vegfa-212ENSMUST00000214739 1107 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC35.04■■■■□ 3.2
Gli3Q61602 Vegfa-213ENSMUST00000217017 1179 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC35.04■■■■□ 3.2
Gli3Q61602 Izumo4-205ENSMUST00000218184 1196 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC35.04■■■■□ 3.2
Gli3Q61602 AC167019.3-201ENSMUST00000228225 1266 ntBASIC35.04■■■■□ 3.2
Gli3Q61602 Otulin-201ENSMUST00000059662 1491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.04■■■■□ 3.2
Gli3Q61602 Gm8098-201ENSMUST00000146985 1499 ntTSL 1 (best) BASIC35.04■■■■□ 3.2
Gli3Q61602 Paip1-203ENSMUST00000126957 1731 ntTSL 5 BASIC35.03■■■■□ 3.2
Gli3Q61602 Cebpb-201ENSMUST00000070642 1504 ntAPPRIS P1 BASIC35.03■■■■□ 3.2
Gli3Q61602 Smagp-201ENSMUST00000066068 1132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.02■■■■□ 3.2
Gli3Q61602 Rbmxl2-201ENSMUST00000098135 1472 ntAPPRIS P1 BASIC35.02■■■■□ 3.2
Gli3Q61602 Rnf215-201ENSMUST00000003677 1874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.02■■■■□ 3.2
Gli3Q61602 Egln2-201ENSMUST00000080058 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.02■■■■□ 3.2
Gli3Q61602 Pitpna-205ENSMUST00000179445 1665 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC35■■■■□ 3.19
Gli3Q61602 Ccnyl1-203ENSMUST00000187170 1506 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC35■■■■□ 3.19
Gli3Q61602 Rundc3a-203ENSMUST00000107103 1822 ntTSL 5 BASIC35■■■■□ 3.19
Gli3Q61602 Gm19582-201ENSMUST00000187511 841 ntTSL 2 BASIC35■■■■□ 3.19
Gli3Q61602 Rab26-202ENSMUST00000061764 1291 ntTSL 2 BASIC35■■■■□ 3.19
Gli3Q61602 Arpc5l-202ENSMUST00000112862 1339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.99■■■■□ 3.19
Gli3Q61602 Fndc10-201ENSMUST00000099265 2140 ntAPPRIS P1 BASIC34.99■■■■□ 3.19
Gli3Q61602 Gm9887-201ENSMUST00000053451 624 ntAPPRIS P1 BASIC34.99■■■■□ 3.19
Gli3Q61602 Ccm2-201ENSMUST00000000388 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.97■■■■□ 3.19
Gli3Q61602 Sike1-202ENSMUST00000119450 774 ntTSL 3 BASIC34.97■■■■□ 3.19
Gli3Q61602 Cox4i1-205ENSMUST00000181586 765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.97■■■■□ 3.19
Gli3Q61602 AC125444.1-201ENSMUST00000223536 639 ntAPPRIS P1 BASIC34.97■■■■□ 3.19
Gli3Q61602 AC131739.1-201ENSMUST00000221692 1245 ntBASIC34.96■■■■□ 3.19
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 8.1 ms