Protein–RNA interactions for Protein: Q61493

Rev3l, DNA polymerase zeta catalytic subunit, mousemouse

Predictions only

Length 3,122 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rev3lQ61493 Ube2m-201ENSMUST00000005714 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.85■■□□□ 1.73
Rev3lQ61493 Gdf7-202ENSMUST00000220073 1399 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.85■■□□□ 1.73
Rev3lQ61493 Amigo1-203ENSMUST00000106659 1360 ntTSL 1 (best) BASIC25.83■■□□□ 1.73
Rev3lQ61493 E130218I03Rik-204ENSMUST00000131447 888 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.83■■□□□ 1.73
Rev3lQ61493 Calm3-201ENSMUST00000019514 2290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.82■■□□□ 1.72
Rev3lQ61493 Emx1-201ENSMUST00000045942 1561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.81■■□□□ 1.72
Rev3lQ61493 Sept11-208ENSMUST00000202308 1792 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.81■■□□□ 1.72
Rev3lQ61493 Crem-227ENSMUST00000149803 1422 ntTSL 1 (best) BASIC25.81■■□□□ 1.72
Rev3lQ61493 Fndc10-201ENSMUST00000099265 2140 ntAPPRIS P1 BASIC25.8■■□□□ 1.72
Rev3lQ61493 Pard6a-201ENSMUST00000093195 1265 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.8■■□□□ 1.72
Rev3lQ61493 Egln2-201ENSMUST00000080058 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
Rev3lQ61493 Ube2ql1-201ENSMUST00000065118 2674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
Rev3lQ61493 Endog-201ENSMUST00000015481 1063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
Rev3lQ61493 A030003K21Rik-201ENSMUST00000222600 830 ntAPPRIS P1 BASIC25.77■■□□□ 1.72
Rev3lQ61493 Fam149b-201ENSMUST00000037698 924 ntTSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
Rev3lQ61493 Zic2-201ENSMUST00000075888 2440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
Rev3lQ61493 Mad2l2-202ENSMUST00000084129 1162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
Rev3lQ61493 Tnfsfm13-202ENSMUST00000174159 1470 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.75■■□□□ 1.71
Rev3lQ61493 Akt1s1-202ENSMUST00000107880 1757 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
Rev3lQ61493 Wsb2-201ENSMUST00000031309 2421 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
Rev3lQ61493 Osbpl1a-209ENSMUST00000122175 1203 ntTSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
Rev3lQ61493 Egr3-201ENSMUST00000035908 1509 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.7
Rev3lQ61493 Chtf8-205ENSMUST00000176515 694 ntTSL 2 BASIC25.7■■□□□ 1.7
Rev3lQ61493 Rnf215-201ENSMUST00000003677 1874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
Rev3lQ61493 Fam89b-202ENSMUST00000116558 1189 ntTSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
Rev3lQ61493 Mapk3-202ENSMUST00000057669 1800 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
Rev3lQ61493 Ankrd60-202ENSMUST00000119453 1084 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC25.66■■□□□ 1.7
Rev3lQ61493 Ybx2-205ENSMUST00000149194 1235 ntTSL 5 BASIC25.66■■□□□ 1.7
Rev3lQ61493 Ell2-205ENSMUST00000222194 434 ntTSL 3 BASIC25.66■■□□□ 1.7
Rev3lQ61493 Ccm2-201ENSMUST00000000388 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.65■■□□□ 1.7
Rev3lQ61493 Tcte2-204ENSMUST00000130033 1462 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.7
Rev3lQ61493 Cpsf4-201ENSMUST00000070487 1606 ntTSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
Rev3lQ61493 Pkdcc-204ENSMUST00000170794 2446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.62■■□□□ 1.69
Rev3lQ61493 C2cd4b-201ENSMUST00000171652 1327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
Rev3lQ61493 Gm28052-201ENSMUST00000150388 380 ntTSL 3 BASIC25.61■■□□□ 1.69
Rev3lQ61493 Trappc6b-203ENSMUST00000217863 797 ntTSL 2 BASIC25.61■■□□□ 1.69
Rev3lQ61493 Nelfe-204ENSMUST00000173357 1399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
Rev3lQ61493 Mapkap1-201ENSMUST00000113123 1530 ntTSL 5 BASIC25.59■■□□□ 1.69
Rev3lQ61493 Gm27021-201ENSMUST00000181333 758 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC25.59■■□□□ 1.69
Rev3lQ61493 Hs3st6-201ENSMUST00000044922 1219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.69
Rev3lQ61493 A030005K14Rik-201ENSMUST00000193762 1093 ntAPPRIS P1 BASIC25.54■■□□□ 1.68
Rev3lQ61493 Gm7334-201ENSMUST00000061681 1356 ntAPPRIS P1 BASIC25.53■■□□□ 1.68
Rev3lQ61493 Dnajc19-202ENSMUST00000108195 659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
Rev3lQ61493 Eif4e2-204ENSMUST00000113231 1119 ntTSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
Rev3lQ61493 C130046K22Rik-201ENSMUST00000129780 727 ntTSL 5 BASIC25.52■■□□□ 1.68
Rev3lQ61493 Reep6-203ENSMUST00000105355 2127 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
Rev3lQ61493 Reep6-204ENSMUST00000105357 2127 ntTSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
Rev3lQ61493 Tceal3-201ENSMUST00000060904 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
Rev3lQ61493 Tlx1-201ENSMUST00000026236 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
Rev3lQ61493 Fam136a-201ENSMUST00000071492 1643 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.5■■□□□ 1.67
Rev3lQ61493 Eva1b-202ENSMUST00000106150 1144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.5■■□□□ 1.67
Rev3lQ61493 Dctpp1-201ENSMUST00000035276 676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.5■■□□□ 1.67
Rev3lQ61493 Triobp-206ENSMUST00000130663 1660 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.49■■□□□ 1.67
Rev3lQ61493 Pm20d2-201ENSMUST00000098181 1445 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.48■■□□□ 1.67
Rev3lQ61493 Unc119-203ENSMUST00000108295 1371 ntTSL 3 BASIC25.48■■□□□ 1.67
Rev3lQ61493 Gm28529-202ENSMUST00000189675 670 ntTSL 2 BASIC25.47■■□□□ 1.67
Rev3lQ61493 Ppa2-203ENSMUST00000122334 1368 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
Rev3lQ61493 Serpinb6a-201ENSMUST00000017188 1504 ntTSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
Rev3lQ61493 Mocs3-201ENSMUST00000099071 1973 ntAPPRIS P1 BASIC25.47■■□□□ 1.67
Rev3lQ61493 Paqr6-203ENSMUST00000147948 837 ntTSL 2 BASIC25.47■■□□□ 1.67
Rev3lQ61493 Rpl38-203ENSMUST00000106599 457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
Rev3lQ61493 Gm44957-202ENSMUST00000205137 448 ntTSL 3 BASIC25.46■■□□□ 1.67
Rev3lQ61493 Tlx2-202ENSMUST00000174674 1514 ntTSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.67
Rev3lQ61493 A430072P03Rik-201ENSMUST00000161480 1510 ntTSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
Rev3lQ61493 Vegfa-211ENSMUST00000167860 975 ntTSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
Rev3lQ61493 Vegfa-212ENSMUST00000214739 1107 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
Rev3lQ61493 Vegfa-213ENSMUST00000217017 1179 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
Rev3lQ61493 Gm6311-201ENSMUST00000073790 878 ntBASIC25.44■■□□□ 1.66
Rev3lQ61493 Gm26699-201ENSMUST00000180825 2291 ntTSL 5 BASIC25.44■■□□□ 1.66
Rev3lQ61493 Ywhaq-202ENSMUST00000103002 2110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
Rev3lQ61493 Card19-201ENSMUST00000048946 804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
Rev3lQ61493 AC125444.1-201ENSMUST00000223536 639 ntAPPRIS P1 BASIC25.43■■□□□ 1.66
Rev3lQ61493 Tmem200b-201ENSMUST00000094666 1370 ntAPPRIS P1 BASIC25.42■■□□□ 1.66
Rev3lQ61493 Smagp-201ENSMUST00000066068 1132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
Rev3lQ61493 Frs3-201ENSMUST00000113296 2144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
Rev3lQ61493 Gm5814-201ENSMUST00000177586 378 ntAPPRIS P1 BASIC25.39■■□□□ 1.66
Rev3lQ61493 A530058N18Rik-208ENSMUST00000131299 1387 ntTSL 2 BASIC25.39■■□□□ 1.66
Rev3lQ61493 Sike1-202ENSMUST00000119450 774 ntTSL 3 BASIC25.39■■□□□ 1.65
Rev3lQ61493 Prelid3b-201ENSMUST00000016401 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
Rev3lQ61493 Gpr137c-205ENSMUST00000227009 771 ntAPPRIS ALT2 BASIC25.37■■□□□ 1.65
Rev3lQ61493 Foxd3-201ENSMUST00000087285 2324 ntAPPRIS P1 BASIC25.37■■□□□ 1.65
Rev3lQ61493 Efhd1os-201ENSMUST00000138844 332 ntTSL 3 BASIC25.37■■□□□ 1.65
Rev3lQ61493 Cebpb-201ENSMUST00000070642 1504 ntAPPRIS P1 BASIC25.36■■□□□ 1.65
Rev3lQ61493 Tprgl-201ENSMUST00000030896 1724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
Rev3lQ61493 Fgf20-201ENSMUST00000034014 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
Rev3lQ61493 Tmem259-201ENSMUST00000052885 2225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
Rev3lQ61493 Tsen34-211ENSMUST00000205287 1375 ntTSL 5 BASIC25.35■■□□□ 1.65
Rev3lQ61493 E2f4-201ENSMUST00000015003 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
Rev3lQ61493 Zmynd12-201ENSMUST00000094819 1464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
Rev3lQ61493 Sugct-202ENSMUST00000220514 1351 ntTSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
Rev3lQ61493 Hmx1-201ENSMUST00000087674 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
Rev3lQ61493 Raly-204ENSMUST00000116389 1759 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.34■■□□□ 1.65
Rev3lQ61493 Rbmxl2-201ENSMUST00000098135 1472 ntAPPRIS P1 BASIC25.33■■□□□ 1.65
Rev3lQ61493 Arpc5l-202ENSMUST00000112862 1339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
Rev3lQ61493 Rbm17-201ENSMUST00000040314 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
Rev3lQ61493 Zcrb1-201ENSMUST00000076070 877 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
Rev3lQ61493 Pitpna-205ENSMUST00000179445 1665 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.32■■□□□ 1.64
Rev3lQ61493 Gm12100-201ENSMUST00000150255 1933 ntTSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
Rev3lQ61493 Nectin3-203ENSMUST00000096052 1746 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
Rev3lQ61493 Mxd4-202ENSMUST00000119171 1160 ntTSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 14.9 ms