Protein–RNA interactions for Protein: Q60649

Clpb, Caseinolytic peptidase B protein homolog, mousemouse

Predictions only

Length 677 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ClpbQ60649 Rpl19-ps4-201ENSMUST00000167150 625 ntBASIC23.68■■□□□ 1.38
ClpbQ60649 BC037032-205ENSMUST00000187080 508 ntTSL 5 BASIC23.67■■□□□ 1.38
ClpbQ60649 March2-205ENSMUST00000173015 1418 ntTSL 3 BASIC23.67■■□□□ 1.38
ClpbQ60649 Kdm2a-203ENSMUST00000116571 2413 ntTSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
ClpbQ60649 Guf1-201ENSMUST00000031113 1769 ntTSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
ClpbQ60649 Hrh3-208ENSMUST00000171736 906 ntTSL 5 BASIC23.66■■□□□ 1.38
ClpbQ60649 Gm30346-201ENSMUST00000218641 1699 ntBASIC23.66■■□□□ 1.38
ClpbQ60649 Cdk2ap1-201ENSMUST00000031341 1315 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
ClpbQ60649 4921531C22Rik-201ENSMUST00000150145 1905 ntTSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
ClpbQ60649 Rtn2-201ENSMUST00000032559 1990 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.38
ClpbQ60649 Gm527-203ENSMUST00000220993 1090 ntTSL 5 BASIC23.64■■□□□ 1.37
ClpbQ60649 Phlda1-201ENSMUST00000164773 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
ClpbQ60649 Dtnbp1-201ENSMUST00000072329 1362 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
ClpbQ60649 B4galt7-202ENSMUST00000100764 2195 ntTSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
ClpbQ60649 Nrtn-201ENSMUST00000044752 1023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
ClpbQ60649 Gm527-201ENSMUST00000058135 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
ClpbQ60649 Mrps7-201ENSMUST00000058109 1962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
ClpbQ60649 Qrich1-209ENSMUST00000194385 975 ntTSL 2 BASIC23.62■■□□□ 1.37
ClpbQ60649 Mpp6-203ENSMUST00000166318 2222 ntTSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
ClpbQ60649 Clk2-203ENSMUST00000121931 2112 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.61■■□□□ 1.37
ClpbQ60649 Ppp1r14c-202ENSMUST00000217573 2013 ntTSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
ClpbQ60649 Pradc1-201ENSMUST00000032080 1038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
ClpbQ60649 Macrod1-201ENSMUST00000040261 1274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
ClpbQ60649 Amer2-203ENSMUST00000225247 2662 ntBASIC23.59■■□□□ 1.37
ClpbQ60649 Mef2a-201ENSMUST00000032776 2476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
ClpbQ60649 Rundc3a-204ENSMUST00000107105 1861 ntTSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
ClpbQ60649 Junos-204ENSMUST00000128094 830 ntTSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
ClpbQ60649 Mthfd2l-203ENSMUST00000202781 688 ntTSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
ClpbQ60649 Lsm4-204ENSMUST00000210071 575 ntTSL 5 BASIC23.57■■□□□ 1.36
ClpbQ60649 Dapk3-202ENSMUST00000178422 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
ClpbQ60649 Tnfsfm13-201ENSMUST00000108649 1049 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.56■■□□□ 1.36
ClpbQ60649 Tcte2-204ENSMUST00000130033 1462 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
ClpbQ60649 Efemp2-201ENSMUST00000070118 1781 ntTSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
ClpbQ60649 1810026B05Rik-206ENSMUST00000187421 519 ntTSL 3 BASIC23.55■■□□□ 1.36
ClpbQ60649 Ssx2ip-202ENSMUST00000106149 2416 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
ClpbQ60649 En1-201ENSMUST00000079721 2624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
ClpbQ60649 Nrep-202ENSMUST00000168890 2185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
ClpbQ60649 Dpf1-204ENSMUST00000108231 2040 ntTSL 5 BASIC23.52■■□□□ 1.36
ClpbQ60649 Hmx1-201ENSMUST00000087674 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
ClpbQ60649 Fam69b-201ENSMUST00000074240 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
ClpbQ60649 Dtnb-211ENSMUST00000173240 2218 ntTSL 5 BASIC23.51■■□□□ 1.35
ClpbQ60649 1810026B05Rik-202ENSMUST00000184554 782 ntTSL 3 BASIC23.51■■□□□ 1.35
ClpbQ60649 Cetn4-201ENSMUST00000071400 1808 ntTSL 5 BASIC23.5■■□□□ 1.35
ClpbQ60649 Gm24970-201ENSMUST00000175582 82 ntBASIC23.5■■□□□ 1.35
ClpbQ60649 Crip2-201ENSMUST00000084882 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
ClpbQ60649 Tmem243-201ENSMUST00000115365 1040 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.49■■□□□ 1.35
ClpbQ60649 Stard3nl-210ENSMUST00000222869 1030 ntTSL 5 BASIC23.49■■□□□ 1.35
ClpbQ60649 Tbx1-201ENSMUST00000009241 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
ClpbQ60649 Mxra7-202ENSMUST00000047715 757 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
ClpbQ60649 C2cd4d-201ENSMUST00000169433 1321 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.48■■□□□ 1.35
ClpbQ60649 Clk2-201ENSMUST00000090927 2128 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
ClpbQ60649 Smarcc2-205ENSMUST00000218228 603 ntTSL 5 BASIC23.47■■□□□ 1.35
ClpbQ60649 Pdia5-201ENSMUST00000023550 1808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
ClpbQ60649 Hdgf-201ENSMUST00000005017 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
ClpbQ60649 Pitpna-205ENSMUST00000179445 1665 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.46■■□□□ 1.35
ClpbQ60649 AC150314.2-201ENSMUST00000214135 834 ntTSL 5 BASIC23.46■■□□□ 1.35
ClpbQ60649 Plekha3-201ENSMUST00000111920 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
ClpbQ60649 Mypop-203ENSMUST00000131087 1951 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.45■■□□□ 1.35
ClpbQ60649 C1qtnf5-201ENSMUST00000114815 1215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
ClpbQ60649 Ywhaq-202ENSMUST00000103002 2110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
ClpbQ60649 Srp9-201ENSMUST00000027792 1367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
ClpbQ60649 Crem-227ENSMUST00000149803 1422 ntTSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
ClpbQ60649 Gm960-202ENSMUST00000177696 2262 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.43■■□□□ 1.34
ClpbQ60649 Htra4-201ENSMUST00000084031 2180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
ClpbQ60649 Egr3-201ENSMUST00000035908 1509 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
ClpbQ60649 Gm17494-201ENSMUST00000072769 1800 ntTSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
ClpbQ60649 Gm15672-201ENSMUST00000151512 1354 ntTSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
ClpbQ60649 Dut-202ENSMUST00000082122 1020 ntTSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
ClpbQ60649 Aspscr1-201ENSMUST00000026135 1820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
ClpbQ60649 Gng13-201ENSMUST00000115108 347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
ClpbQ60649 Twist1-201ENSMUST00000049089 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
ClpbQ60649 Gsk3a-202ENSMUST00000108411 2248 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.4■■□□□ 1.34
ClpbQ60649 Uncx-201ENSMUST00000172997 2498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.34
ClpbQ60649 Gm20503-201ENSMUST00000174664 1294 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.39■■□□□ 1.33
ClpbQ60649 Arhgap22-201ENSMUST00000111955 2148 ntTSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
ClpbQ60649 Gm43863-201ENSMUST00000203822 1192 ntBASIC23.38■■□□□ 1.33
ClpbQ60649 Cbln1-201ENSMUST00000034076 2800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
ClpbQ60649 Caap1-201ENSMUST00000030313 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
ClpbQ60649 Dda1-209ENSMUST00000147642 1865 ntTSL 2 BASIC23.37■■□□□ 1.33
ClpbQ60649 Pradc1-202ENSMUST00000113770 610 ntTSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
ClpbQ60649 Phf23-205ENSMUST00000135814 2214 ntTSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
ClpbQ60649 Dlg1-203ENSMUST00000100001 4711 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.37■■□□□ 1.33
ClpbQ60649 4932443I19Rik-201ENSMUST00000166277 799 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
ClpbQ60649 Iffo2-203ENSMUST00000174078 5716 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
ClpbQ60649 Suds3-202ENSMUST00000166397 1694 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
ClpbQ60649 Kmt5a-202ENSMUST00000100709 1425 ntTSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
ClpbQ60649 Rras2-201ENSMUST00000069449 2275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
ClpbQ60649 Grb2-202ENSMUST00000106495 2041 ntTSL 5 BASIC23.35■■□□□ 1.33
ClpbQ60649 Cldn10-203ENSMUST00000100314 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
ClpbQ60649 A430072P03Rik-201ENSMUST00000161480 1510 ntTSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
ClpbQ60649 Dcaf15-202ENSMUST00000210279 2199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
ClpbQ60649 Galnt12-202ENSMUST00000107744 2077 ntTSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
ClpbQ60649 Triobp-206ENSMUST00000130663 1660 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.32■■□□□ 1.32
ClpbQ60649 Terf2-201ENSMUST00000068388 1915 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
ClpbQ60649 Irx4-201ENSMUST00000022095 2589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
ClpbQ60649 Dlx6os2-201ENSMUST00000178206 1354 ntBASIC23.3■■□□□ 1.32
ClpbQ60649 Tbcel-204ENSMUST00000128959 1535 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.3■■□□□ 1.32
ClpbQ60649 Ppp1r14b-201ENSMUST00000070850 919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
ClpbQ60649 Klhl25-205ENSMUST00000206019 2299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
ClpbQ60649 Fam241a-201ENSMUST00000057198 1607 ntTSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 34 ms