Protein–RNA interactions for Protein: Q5XPI3

Rnf123, E3 ubiquitin-protein ligase RNF123, mousemouse

Predictions only

Length 1,314 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rnf123Q5XPI3 Gm17494-201ENSMUST00000072769 1800 ntTSL 1 (best) BASIC29,94■■■□□ 2,38
Rnf123Q5XPI3 En1-201ENSMUST00000079721 2624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29,94■■■□□ 2,38
Rnf123Q5XPI3 Nrep-202ENSMUST00000168890 2185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29,93■■■□□ 2,38
Rnf123Q5XPI3 Dcaf15-202ENSMUST00000210279 2199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29,91■■■□□ 2,38
Rnf123Q5XPI3 Fam241a-201ENSMUST00000057198 1607 ntTSL 1 (best) BASIC29,91■■■□□ 2,38
Rnf123Q5XPI3 Cgref1-201ENSMUST00000031051 1442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29,91■■■□□ 2,38
Rnf123Q5XPI3 Exosc6-201ENSMUST00000210390 1326 ntAPPRIS P1 BASIC29,91■■■□□ 2,38
Rnf123Q5XPI3 Stau2-210ENSMUST00000149320 2214 ntTSL 5 BASIC29,9■■■□□ 2,38
Rnf123Q5XPI3 Rheb-201ENSMUST00000030787 1784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29,89■■■□□ 2,38
Rnf123Q5XPI3 Rbms1-202ENSMUST00000112509 1806 ntTSL 1 (best) BASIC29,89■■■□□ 2,38
Rnf123Q5XPI3 Terf2-201ENSMUST00000068388 1915 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29,87■■■□□ 2,37
Rnf123Q5XPI3 Grb2-202ENSMUST00000106495 2041 ntTSL 5 BASIC29,86■■■□□ 2,37
Rnf123Q5XPI3 Dazap1-201ENSMUST00000092305 1994 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC29,86■■■□□ 2,37
Rnf123Q5XPI3 A530058N18Rik-201ENSMUST00000128469 646 ntTSL 2 BASIC29,85■■■□□ 2,37
Rnf123Q5XPI3 Gsk3a-202ENSMUST00000108411 2248 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29,84■■■□□ 2,37
Rnf123Q5XPI3 Phf23-205ENSMUST00000135814 2214 ntTSL 1 (best) BASIC29,84■■■□□ 2,37
Rnf123Q5XPI3 Gm16148-201ENSMUST00000119653 893 ntBASIC29,83■■■□□ 2,37
Rnf123Q5XPI3 Rras2-201ENSMUST00000069449 2275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29,83■■■□□ 2,37
Rnf123Q5XPI3 1700028N14Rik-201ENSMUST00000139621 747 ntTSL 1 (best) BASIC29,82■■■□□ 2,36
Rnf123Q5XPI3 Fezf2-202ENSMUST00000224023 1917 ntBASIC29,81■■■□□ 2,36
Rnf123Q5XPI3 Coq10a-207ENSMUST00000220227 1434 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29,81■■■□□ 2,36
Rnf123Q5XPI3 Zfp358-201ENSMUST00000061508 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29,81■■■□□ 2,36
Rnf123Q5XPI3 Cldn10-203ENSMUST00000100314 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29,79■■■□□ 2,36
Rnf123Q5XPI3 Galnt12-202ENSMUST00000107744 2077 ntTSL 1 (best) BASIC29,78■■■□□ 2,36
Rnf123Q5XPI3 6530409C15Rik-202ENSMUST00000143551 1573 ntTSL 1 (best) BASIC29,78■■■□□ 2,36
Rnf123Q5XPI3 Htra4-201ENSMUST00000084031 2180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29,78■■■□□ 2,36
Rnf123Q5XPI3 Mef2a-201ENSMUST00000032776 2476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29,77■■■□□ 2,36
Rnf123Q5XPI3 Pitpna-205ENSMUST00000179445 1665 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC29,76■■■□□ 2,35
Rnf123Q5XPI3 Klhl35-201ENSMUST00000037359 1954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29,76■■■□□ 2,35
Rnf123Q5XPI3 Sowahd-201ENSMUST00000060057 1574 ntAPPRIS P1 BASIC29,75■■■□□ 2,35
Rnf123Q5XPI3 Plekha3-201ENSMUST00000111920 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29,75■■■□□ 2,35
Rnf123Q5XPI3 Triobp-206ENSMUST00000130663 1660 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29,75■■■□□ 2,35
Rnf123Q5XPI3 Pradc1-202ENSMUST00000113770 610 ntTSL 1 (best) BASIC29,74■■■□□ 2,35
Rnf123Q5XPI3 A730013G03Rik-202ENSMUST00000195012 2097 ntBASIC29,74■■■□□ 2,35
Rnf123Q5XPI3 Fkbp8-202ENSMUST00000119353 1720 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29,74■■■□□ 2,35
Rnf123Q5XPI3 Cds2-203ENSMUST00000110158 1247 ntTSL 1 (best) BASIC29,73■■■□□ 2,35
Rnf123Q5XPI3 Popdc3-201ENSMUST00000019994 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29,73■■■□□ 2,35
Rnf123Q5XPI3 E030037K01Rik-201ENSMUST00000180928 1756 ntBASIC29,72■■■□□ 2,35
Rnf123Q5XPI3 Macrod1-201ENSMUST00000040261 1274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29,71■■■□□ 2,35
Rnf123Q5XPI3 Klhl25-205ENSMUST00000206019 2299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29,71■■■□□ 2,35
Rnf123Q5XPI3 Smad2-202ENSMUST00000091831 1645 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC29,71■■■□□ 2,35
Rnf123Q5XPI3 Lsm4-204ENSMUST00000210071 575 ntTSL 5 BASIC29,71■■■□□ 2,35
Rnf123Q5XPI3 2410017I17Rik-202ENSMUST00000090537 2053 ntTSL 2 BASIC29,69■■■□□ 2,34
Rnf123Q5XPI3 Eif2ak3-204ENSMUST00000162950 927 ntTSL 1 (best) BASIC29,69■■■□□ 2,34
Rnf123Q5XPI3 St7-202ENSMUST00000052113 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29,66■■■□□ 2,34
Rnf123Q5XPI3 Fam60a-203ENSMUST00000111562 906 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC29,66■■■□□ 2,34
Rnf123Q5XPI3 Eif4ebp1-201ENSMUST00000033880 1997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29,66■■■□□ 2,34
Rnf123Q5XPI3 Dapk3-201ENSMUST00000047665 1676 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29,65■■■□□ 2,34
Rnf123Q5XPI3 Tdp2-203ENSMUST00000223804 1136 ntBASIC29,65■■■□□ 2,34
Rnf123Q5XPI3 Tcte2-204ENSMUST00000130033 1462 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29,64■■■□□ 2,34
Rnf123Q5XPI3 Acvr2b-202ENSMUST00000165044 2093 ntTSL 2 BASIC29,63■■■□□ 2,33
Rnf123Q5XPI3 Sh3glb2-203ENSMUST00000113620 1694 ntTSL 1 (best) BASIC29,63■■■□□ 2,33
Rnf123Q5XPI3 Gm527-203ENSMUST00000220993 1090 ntTSL 5 BASIC29,63■■■□□ 2,33
Rnf123Q5XPI3 Nrtn-201ENSMUST00000044752 1023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29,62■■■□□ 2,33
Rnf123Q5XPI3 Egr3-201ENSMUST00000035908 1509 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC29,61■■■□□ 2,33
Rnf123Q5XPI3 Rbm17-201ENSMUST00000040314 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29,61■■■□□ 2,33
Rnf123Q5XPI3 Rnd2-201ENSMUST00000001347 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29,61■■■□□ 2,33
Rnf123Q5XPI3 Ubp1-203ENSMUST00000116492 2111 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC29,59■■■□□ 2,33
Rnf123Q5XPI3 Dtnb-203ENSMUST00000164578 2355 ntTSL 1 (best) BASIC29,58■■■□□ 2,33
Rnf123Q5XPI3 Tbcel-204ENSMUST00000128959 1535 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29,57■■■□□ 2,32
Rnf123Q5XPI3 Odc1-201ENSMUST00000171737 2208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29,57■■■□□ 2,32
Rnf123Q5XPI3 Gm10762-201ENSMUST00000099385 1133 ntAPPRIS P1 BASIC29,56■■■□□ 2,32
Rnf123Q5XPI3 Crem-227ENSMUST00000149803 1422 ntTSL 1 (best) BASIC29,55■■■□□ 2,32
Rnf123Q5XPI3 Irx4-201ENSMUST00000022095 2589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29,54■■■□□ 2,32
Rnf123Q5XPI3 Tlx3-201ENSMUST00000037746 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29,53■■■□□ 2,32
Rnf123Q5XPI3 AC150314.2-201ENSMUST00000214135 834 ntTSL 5 BASIC29,53■■■□□ 2,32
Rnf123Q5XPI3 Kmt5a-202ENSMUST00000100709 1425 ntTSL 1 (best) BASIC29,53■■■□□ 2,32
Rnf123Q5XPI3 Neurog2-201ENSMUST00000029587 2227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29,53■■■□□ 2,32
Rnf123Q5XPI3 Marveld2-202ENSMUST00000163163 2187 ntTSL 1 (best) BASIC29,52■■■□□ 2,32
Rnf123Q5XPI3 Igfbp3-202ENSMUST00000135887 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29,52■■■□□ 2,32
Rnf123Q5XPI3 Tor1a-201ENSMUST00000028200 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29,52■■■□□ 2,32
Rnf123Q5XPI3 Reep6-202ENSMUST00000105354 2208 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29,52■■■□□ 2,32
Rnf123Q5XPI3 Reep6-205ENSMUST00000105358 2208 ntTSL 1 (best) BASIC29,52■■■□□ 2,32
Rnf123Q5XPI3 Snx3-201ENSMUST00000019939 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29,51■■■□□ 2,31
Rnf123Q5XPI3 A530058N18Rik-208ENSMUST00000131299 1387 ntTSL 2 BASIC29,5■■■□□ 2,31
Rnf123Q5XPI3 Gm266-201ENSMUST00000010673 1215 ntAPPRIS P1 BASIC29,49■■■□□ 2,31
Rnf123Q5XPI3 Kansl2-202ENSMUST00000116400 2110 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29,49■■■□□ 2,31
Rnf123Q5XPI3 Rgs7-206ENSMUST00000194555 2431 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29,49■■■□□ 2,31
Rnf123Q5XPI3 1190005I06Rik-201ENSMUST00000123927 844 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29,48■■■□□ 2,31
Rnf123Q5XPI3 CT030161.2-201ENSMUST00000218666 735 ntTSL 3 BASIC29,48■■■□□ 2,31
Rnf123Q5XPI3 Znrf3-202ENSMUST00000143746 1022 ntTSL 1 (best) BASIC29,47■■■□□ 2,31
Rnf123Q5XPI3 A530058N18Rik-207ENSMUST00000152254 1211 ntTSL 1 (best) BASIC29,47■■■□□ 2,31
Rnf123Q5XPI3 1700016A09Rik-201ENSMUST00000192004 835 ntBASIC29,47■■■□□ 2,31
Rnf123Q5XPI3 Mcat-201ENSMUST00000061882 1893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29,46■■■□□ 2,31
Rnf123Q5XPI3 Ccdc122-202ENSMUST00000095625 1195 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29,46■■■□□ 2,31
Rnf123Q5XPI3 Lemd2-201ENSMUST00000055117 2595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29,46■■■□□ 2,31
Rnf123Q5XPI3 Rtn4r-201ENSMUST00000059589 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29,46■■■□□ 2,31
Rnf123Q5XPI3 Mpp6-202ENSMUST00000036236 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29,45■■■□□ 2,31
Rnf123Q5XPI3 5730480H06Rik-201ENSMUST00000030968 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29,45■■■□□ 2,3
Rnf123Q5XPI3 Gm15672-201ENSMUST00000151512 1354 ntTSL 1 (best) BASIC29,44■■■□□ 2,3
Rnf123Q5XPI3 Macrod2-205ENSMUST00000110063 845 ntTSL 5 BASIC29,43■■■□□ 2,3
Rnf123Q5XPI3 Cbln1-201ENSMUST00000034076 2800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29,42■■■□□ 2,3
Rnf123Q5XPI3 Aard-201ENSMUST00000090025 1348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29,41■■■□□ 2,3
Rnf123Q5XPI3 Mat2b-201ENSMUST00000040167 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29,41■■■□□ 2,3
Rnf123Q5XPI3 4932443I19Rik-201ENSMUST00000166277 799 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29,41■■■□□ 2,3
Rnf123Q5XPI3 Eed-201ENSMUST00000107234 2067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29,39■■■□□ 2,3
Rnf123Q5XPI3 Wdr34-201ENSMUST00000113711 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29,39■■■□□ 2,3
Rnf123Q5XPI3 Det1-201ENSMUST00000032839 2269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29,39■■■□□ 2,3
Rnf123Q5XPI3 Tspan33-201ENSMUST00000046750 1994 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29,39■■■□□ 2,3
Rnf123Q5XPI3 A430072P03Rik-201ENSMUST00000161480 1510 ntTSL 1 (best) BASIC29,38■■■□□ 2,29
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 12,3 ms