Protein–RNA interactions for Protein: Q5U4E2

Repin1, Replication initiator 1, mousemouse

Predictions only

Length 545 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Repin1Q5U4E2 Nemp1-202ENSMUST00000118612 1522 ntTSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
Repin1Q5U4E2 Mipep-204ENSMUST00000225043 1548 ntBASIC23.35■■□□□ 1.33
Repin1Q5U4E2 Tlx2-202ENSMUST00000174674 1514 ntTSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
Repin1Q5U4E2 Jdp2-203ENSMUST00000177587 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
Repin1Q5U4E2 AC157572.2-201ENSMUST00000226970 908 ntBASIC23.34■■□□□ 1.33
Repin1Q5U4E2 Flt3l-211ENSMUST00000211429 1358 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
Repin1Q5U4E2 Emx1-201ENSMUST00000045942 1561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
Repin1Q5U4E2 Vsig8-202ENSMUST00000177086 1519 ntTSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
Repin1Q5U4E2 Fbxo6-203ENSMUST00000105706 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.32
Repin1Q5U4E2 Rragc-201ENSMUST00000030399 2593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
Repin1Q5U4E2 Trp53i13-201ENSMUST00000060417 1463 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
Repin1Q5U4E2 Rpl38-203ENSMUST00000106599 457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
Repin1Q5U4E2 Slc39a13-203ENSMUST00000111436 1291 ntTSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
Repin1Q5U4E2 Sowahd-201ENSMUST00000060057 1574 ntAPPRIS P1 BASIC23.31■■□□□ 1.32
Repin1Q5U4E2 E130218I03Rik-204ENSMUST00000131447 888 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.3■■□□□ 1.32
Repin1Q5U4E2 Mad2l2-202ENSMUST00000084129 1162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
Repin1Q5U4E2 Fam89b-202ENSMUST00000116558 1189 ntTSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
Repin1Q5U4E2 Gm12100-201ENSMUST00000150255 1933 ntTSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
Repin1Q5U4E2 Dapk3-209ENSMUST00000219850 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
Repin1Q5U4E2 Eid2-201ENSMUST00000059596 1392 ntAPPRIS P1 BASIC23.28■■□□□ 1.32
Repin1Q5U4E2 Fam89b-203ENSMUST00000161368 1160 ntTSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
Repin1Q5U4E2 Gm8098-201ENSMUST00000146985 1499 ntTSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
Repin1Q5U4E2 Gpr25-201ENSMUST00000086395 1077 ntAPPRIS P1 BASIC23.24■■□□□ 1.31
Repin1Q5U4E2 Srp9-201ENSMUST00000027792 1367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
Repin1Q5U4E2 Gnai2-202ENSMUST00000192615 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
Repin1Q5U4E2 Endog-201ENSMUST00000015481 1063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
Repin1Q5U4E2 Asph-201ENSMUST00000038564 1174 ntTSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
Repin1Q5U4E2 Gm6311-201ENSMUST00000073790 878 ntBASIC23.23■■□□□ 1.31
Repin1Q5U4E2 Asph-205ENSMUST00000098275 1007 ntTSL 5 BASIC23.23■■□□□ 1.31
Repin1Q5U4E2 Dnajc19-202ENSMUST00000108195 659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
Repin1Q5U4E2 Gm13889-202ENSMUST00000148314 1240 ntAPPRIS P1 BASIC23.21■■□□□ 1.31
Repin1Q5U4E2 Gm28052-201ENSMUST00000150388 380 ntTSL 3 BASIC23.21■■□□□ 1.31
Repin1Q5U4E2 Ranbp1-202ENSMUST00000115645 1085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
Repin1Q5U4E2 Rnaseh2c-201ENSMUST00000025864 1126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
Repin1Q5U4E2 Ddrgk1-201ENSMUST00000089559 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
Repin1Q5U4E2 C2cd4b-201ENSMUST00000171652 1327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
Repin1Q5U4E2 Abhd17a-201ENSMUST00000003436 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
Repin1Q5U4E2 Ppp1r35-201ENSMUST00000031739 956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
Repin1Q5U4E2 AC163623.1-201ENSMUST00000213738 727 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.16■■□□□ 1.3
Repin1Q5U4E2 Trappc6b-207ENSMUST00000218686 785 ntTSL 3 BASIC23.16■■□□□ 1.3
Repin1Q5U4E2 Ell2-205ENSMUST00000222194 434 ntTSL 3 BASIC23.16■■□□□ 1.3
Repin1Q5U4E2 Ppa2-203ENSMUST00000122334 1368 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
Repin1Q5U4E2 Hs3st6-201ENSMUST00000044922 1219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
Repin1Q5U4E2 Il3ra-201ENSMUST00000090591 1614 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
Repin1Q5U4E2 Vsig8-201ENSMUST00000061835 1801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
Repin1Q5U4E2 Xkr7-201ENSMUST00000037235 2711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
Repin1Q5U4E2 Dleu2-206ENSMUST00000182537 318 ntTSL 2 BASIC23.12■■□□□ 1.29
Repin1Q5U4E2 Gm43936-201ENSMUST00000203987 490 ntTSL 5 BASIC23.12■■□□□ 1.29
Repin1Q5U4E2 Pmvk-201ENSMUST00000029564 1194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
Repin1Q5U4E2 Pard6a-201ENSMUST00000093195 1265 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
Repin1Q5U4E2 6530409C15Rik-202ENSMUST00000143551 1573 ntTSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
Repin1Q5U4E2 Zxda-201ENSMUST00000117281 2621 ntBASIC23.11■■□□□ 1.29
Repin1Q5U4E2 Znrf1-207ENSMUST00000173506 1238 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.11■■□□□ 1.29
Repin1Q5U4E2 Cited4-201ENSMUST00000094814 1249 ntAPPRIS P1 BASIC23.11■■□□□ 1.29
Repin1Q5U4E2 Zfp131-207ENSMUST00000224946 1783 ntBASIC23.11■■□□□ 1.29
Repin1Q5U4E2 Gjd3-201ENSMUST00000062931 837 ntAPPRIS P1 BASIC23.1■■□□□ 1.29
Repin1Q5U4E2 Samd1-201ENSMUST00000095228 2071 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.09■■□□□ 1.29
Repin1Q5U4E2 Gm43573-201ENSMUST00000196445 570 ntTSL 5 BASIC23.08■■□□□ 1.29
Repin1Q5U4E2 Dazap1-202ENSMUST00000105361 1537 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.28
Repin1Q5U4E2 Sept3-202ENSMUST00000116423 2467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
Repin1Q5U4E2 Unc119-203ENSMUST00000108295 1371 ntTSL 3 BASIC23.06■■□□□ 1.28
Repin1Q5U4E2 Zcrb1-201ENSMUST00000076070 877 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
Repin1Q5U4E2 Dhrs13-203ENSMUST00000122342 1791 ntTSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
Repin1Q5U4E2 Faim-202ENSMUST00000112911 803 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC23.05■■□□□ 1.28
Repin1Q5U4E2 Gm27021-201ENSMUST00000181333 758 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC23.05■■□□□ 1.28
Repin1Q5U4E2 Cox4i1-205ENSMUST00000181586 765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
Repin1Q5U4E2 Ccdc9-202ENSMUST00000118976 2175 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
Repin1Q5U4E2 Shf-201ENSMUST00000048635 1431 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
Repin1Q5U4E2 Gm26508-201ENSMUST00000181285 1516 ntTSL 5 BASIC23.03■■□□□ 1.28
Repin1Q5U4E2 Gm5297-201ENSMUST00000198555 1171 ntBASIC23.03■■□□□ 1.28
Repin1Q5U4E2 Osbpl1a-209ENSMUST00000122175 1203 ntTSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
Repin1Q5U4E2 Ier5l-201ENSMUST00000065134 2683 ntAPPRIS P1 BASIC23.02■■□□□ 1.28
Repin1Q5U4E2 Gm7334-201ENSMUST00000061681 1356 ntAPPRIS P1 BASIC23.01■■□□□ 1.27
Repin1Q5U4E2 Eva1b-202ENSMUST00000106150 1144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
Repin1Q5U4E2 Gli3-204ENSMUST00000141194 466 ntTSL 2 BASIC22.99■■□□□ 1.27
Repin1Q5U4E2 Rnaset2b-201ENSMUST00000089119 1013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
Repin1Q5U4E2 Glt8d1-201ENSMUST00000022476 2018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
Repin1Q5U4E2 Tmem240-202ENSMUST00000147721 817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
Repin1Q5U4E2 1700020L24Rik-201ENSMUST00000037378 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
Repin1Q5U4E2 Gm15823-201ENSMUST00000064305 670 ntBASIC22.97■■□□□ 1.27
Repin1Q5U4E2 Bok-201ENSMUST00000027499 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
Repin1Q5U4E2 AC125444.1-201ENSMUST00000223536 639 ntAPPRIS P1 BASIC22.96■■□□□ 1.27
Repin1Q5U4E2 Rps2-ps13-201ENSMUST00000117295 882 ntBASIC22.95■■□□□ 1.26
Repin1Q5U4E2 Gm12366-201ENSMUST00000121722 873 ntBASIC22.95■■□□□ 1.26
Repin1Q5U4E2 4930577N17Rik-201ENSMUST00000139771 1625 ntBASIC22.95■■□□□ 1.26
Repin1Q5U4E2 Rps2-206ENSMUST00000146867 962 ntTSL 5 BASIC22.95■■□□□ 1.26
Repin1Q5U4E2 Paqr6-203ENSMUST00000147948 837 ntTSL 2 BASIC22.95■■□□□ 1.26
Repin1Q5U4E2 Card19-201ENSMUST00000048946 804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
Repin1Q5U4E2 Rps2-ps10-201ENSMUST00000076842 879 ntBASIC22.95■■□□□ 1.26
Repin1Q5U4E2 Gm5786-201ENSMUST00000085368 882 ntBASIC22.95■■□□□ 1.26
Repin1Q5U4E2 Brsk2-203ENSMUST00000078200 2363 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
Repin1Q5U4E2 Efhd1os-201ENSMUST00000138844 332 ntTSL 3 BASIC22.94■■□□□ 1.26
Repin1Q5U4E2 Smagp-201ENSMUST00000066068 1132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
Repin1Q5U4E2 Ccnyl1-203ENSMUST00000187170 1506 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.92■■□□□ 1.26
Repin1Q5U4E2 Rpsa-204ENSMUST00000217317 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
Repin1Q5U4E2 Lrrc1-204ENSMUST00000183734 2113 ntTSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
Repin1Q5U4E2 Bloc1s2-201ENSMUST00000079033 878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
Repin1Q5U4E2 Tcfl5-201ENSMUST00000037877 2225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
Repin1Q5U4E2 Ube2q2-202ENSMUST00000121677 1680 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.9■■□□□ 1.26
Repin1Q5U4E2 Ubl4a-207ENSMUST00000178691 1038 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.89■■□□□ 1.25
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 54.8 ms