Protein–RNA interactions for Protein: Q5SUD9

Bbs12, Bardet-Biedl syndrome 12 protein homolog, mousemouse

Predictions only

Length 708 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Bbs12Q5SUD9 C2cd4d-201ENSMUST00000169433 1321 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.19■■□□□ 1.14
Bbs12Q5SUD9 Ythdf1-202ENSMUST00000108876 2272 ntTSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Bbs12Q5SUD9 Twist1-201ENSMUST00000049089 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Bbs12Q5SUD9 Kmt5a-202ENSMUST00000100709 1425 ntTSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Bbs12Q5SUD9 Mtch1-201ENSMUST00000095427 1922 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Bbs12Q5SUD9 Smarcc2-205ENSMUST00000218228 603 ntTSL 5 BASIC22.16■■□□□ 1.14
Bbs12Q5SUD9 Mxra7-202ENSMUST00000047715 757 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Bbs12Q5SUD9 Triobp-206ENSMUST00000130663 1660 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.16■■□□□ 1.14
Bbs12Q5SUD9 Cnot6l-203ENSMUST00000122003 2089 ntTSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Bbs12Q5SUD9 Gjc1-201ENSMUST00000068933 1903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Bbs12Q5SUD9 Gm45716-202ENSMUST00000134929 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Bbs12Q5SUD9 Pradc1-201ENSMUST00000032080 1038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Bbs12Q5SUD9 Mrps7-201ENSMUST00000058109 1962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
Bbs12Q5SUD9 Smad7-202ENSMUST00000168918 1882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
Bbs12Q5SUD9 Gm43863-201ENSMUST00000203822 1192 ntBASIC22.14■■□□□ 1.13
Bbs12Q5SUD9 A430072P03Rik-201ENSMUST00000161480 1510 ntTSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
Bbs12Q5SUD9 C1qtnf5-201ENSMUST00000114815 1215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Bbs12Q5SUD9 Adap1-201ENSMUST00000110865 2557 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.12■■□□□ 1.13
Bbs12Q5SUD9 Tbcel-204ENSMUST00000128959 1535 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.12■■□□□ 1.13
Bbs12Q5SUD9 Dut-202ENSMUST00000082122 1020 ntTSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Bbs12Q5SUD9 Ywhah-201ENSMUST00000019109 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Bbs12Q5SUD9 Gm20503-201ENSMUST00000174664 1294 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.1■■□□□ 1.13
Bbs12Q5SUD9 Hoxa13-203ENSMUST00000147595 2395 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC22.1■■□□□ 1.13
Bbs12Q5SUD9 Gng13-201ENSMUST00000115108 347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Bbs12Q5SUD9 AC150314.2-201ENSMUST00000214135 834 ntTSL 5 BASIC22.09■■□□□ 1.13
Bbs12Q5SUD9 Zfp131-206ENSMUST00000223813 2561 ntAPPRIS P3 BASIC22.09■■□□□ 1.13
Bbs12Q5SUD9 A530058N18Rik-208ENSMUST00000131299 1387 ntTSL 2 BASIC22.09■■□□□ 1.13
Bbs12Q5SUD9 Snx3-201ENSMUST00000019939 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
Bbs12Q5SUD9 Dlx6os2-201ENSMUST00000178206 1354 ntBASIC22.08■■□□□ 1.12
Bbs12Q5SUD9 Rab2a-201ENSMUST00000060232 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Bbs12Q5SUD9 Apcdd1-202ENSMUST00000163716 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Bbs12Q5SUD9 Nelfe-204ENSMUST00000173357 1399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Bbs12Q5SUD9 Il3ra-201ENSMUST00000090591 1614 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Bbs12Q5SUD9 C530008M17Rik-201ENSMUST00000086909 1844 ntBASIC22.06■■□□□ 1.12
Bbs12Q5SUD9 Dapk3-202ENSMUST00000178422 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Bbs12Q5SUD9 Rbm17-201ENSMUST00000040314 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
Bbs12Q5SUD9 2310050C09Rik-201ENSMUST00000163439 1078 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.05■■□□□ 1.12
Bbs12Q5SUD9 Rheb-201ENSMUST00000030787 1784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Bbs12Q5SUD9 Hexdc-202ENSMUST00000106117 2149 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Bbs12Q5SUD9 A530058N18Rik-204ENSMUST00000141209 709 ntTSL 5 BASIC22.04■■□□□ 1.12
Bbs12Q5SUD9 5730480H06Rik-201ENSMUST00000030968 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Bbs12Q5SUD9 Pdia5-201ENSMUST00000023550 1808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Bbs12Q5SUD9 4932443I19Rik-201ENSMUST00000166277 799 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Bbs12Q5SUD9 AC157572.2-201ENSMUST00000226970 908 ntBASIC22.02■■□□□ 1.12
Bbs12Q5SUD9 Susd4-202ENSMUST00000153348 1898 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.02■■□□□ 1.12
Bbs12Q5SUD9 Htra4-201ENSMUST00000084031 2180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
Bbs12Q5SUD9 Fam69b-201ENSMUST00000074240 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.11
Bbs12Q5SUD9 Noxo1-201ENSMUST00000019464 2238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.11
Bbs12Q5SUD9 Runx3-202ENSMUST00000119564 1855 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Bbs12Q5SUD9 Ppp1r14b-201ENSMUST00000070850 919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Bbs12Q5SUD9 Gm6345-201ENSMUST00000180378 1691 ntBASIC22.01■■□□□ 1.11
Bbs12Q5SUD9 Fkbp8-202ENSMUST00000119353 1720 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
Bbs12Q5SUD9 Mfsd5-201ENSMUST00000051341 1742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
Bbs12Q5SUD9 Eid2-201ENSMUST00000059596 1392 ntAPPRIS P1 BASIC21.99■■□□□ 1.11
Bbs12Q5SUD9 Popdc3-201ENSMUST00000019994 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
Bbs12Q5SUD9 Ebag9-203ENSMUST00000227691 1945 ntAPPRIS P1 BASIC21.98■■□□□ 1.11
Bbs12Q5SUD9 Rab40c-201ENSMUST00000026826 2466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
Bbs12Q5SUD9 Dazap1-202ENSMUST00000105361 1537 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
Bbs12Q5SUD9 Spg7-201ENSMUST00000108868 845 ntTSL 2 BASIC21.97■■□□□ 1.11
Bbs12Q5SUD9 A330023F24Rik-201ENSMUST00000181226 955 ntTSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
Bbs12Q5SUD9 Dleu2-206ENSMUST00000182537 318 ntTSL 2 BASIC21.97■■□□□ 1.11
Bbs12Q5SUD9 Sugct-202ENSMUST00000220514 1351 ntTSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
Bbs12Q5SUD9 Guf1-201ENSMUST00000031113 1769 ntTSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
Bbs12Q5SUD9 Cdv3-205ENSMUST00000189896 1023 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
Bbs12Q5SUD9 Cpsf4-201ENSMUST00000070487 1606 ntTSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
Bbs12Q5SUD9 Dlg1-203ENSMUST00000100001 4711 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.94■■□□□ 1.1
Bbs12Q5SUD9 Tsen34-203ENSMUST00000108629 1238 ntTSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
Bbs12Q5SUD9 2810459M11Rik-201ENSMUST00000027429 1225 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
Bbs12Q5SUD9 Zfp513-202ENSMUST00000114590 2228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
Bbs12Q5SUD9 Gm9905-201ENSMUST00000065740 1845 ntBASIC21.93■■□□□ 1.1
Bbs12Q5SUD9 Tlx3-201ENSMUST00000037746 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
Bbs12Q5SUD9 Rbms1-202ENSMUST00000112509 1806 ntTSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
Bbs12Q5SUD9 Galnt12-201ENSMUST00000045041 2288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
Bbs12Q5SUD9 Amigo1-203ENSMUST00000106659 1360 ntTSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
Bbs12Q5SUD9 Ppp1r14c-202ENSMUST00000217573 2013 ntTSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
Bbs12Q5SUD9 Maf-201ENSMUST00000069009 3223 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
Bbs12Q5SUD9 Cabp1-204ENSMUST00000112113 1621 ntTSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
Bbs12Q5SUD9 Cetn4-202ENSMUST00000075537 762 ntTSL 3 BASIC21.88■■□□□ 1.09
Bbs12Q5SUD9 Ttc19-202ENSMUST00000101075 2193 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
Bbs12Q5SUD9 Cldn10-203ENSMUST00000100314 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
Bbs12Q5SUD9 Dmwd-201ENSMUST00000032570 2494 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
Bbs12Q5SUD9 Dazap1-203ENSMUST00000105362 2081 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
Bbs12Q5SUD9 Suds3-202ENSMUST00000166397 1694 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
Bbs12Q5SUD9 Ric1-206ENSMUST00000162184 2157 ntTSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
Bbs12Q5SUD9 Smarcc1-203ENSMUST00000197480 1949 ntTSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
Bbs12Q5SUD9 Ssbp3-202ENSMUST00000072753 1924 ntTSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
Bbs12Q5SUD9 Tpst1-201ENSMUST00000040721 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
Bbs12Q5SUD9 Gm26508-201ENSMUST00000181285 1516 ntTSL 5 BASIC21.83■■□□□ 1.09
Bbs12Q5SUD9 Galnt10-202ENSMUST00000108846 1745 ntTSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.08
Bbs12Q5SUD9 4930577N17Rik-201ENSMUST00000139771 1625 ntBASIC21.82■■□□□ 1.08
Bbs12Q5SUD9 Gm12523-201ENSMUST00000148844 599 ntTSL 5 BASIC21.82■■□□□ 1.08
Bbs12Q5SUD9 Gm6206-201ENSMUST00000133472 2199 ntBASIC21.82■■□□□ 1.08
Bbs12Q5SUD9 Fgf20-201ENSMUST00000034014 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
Bbs12Q5SUD9 Cbln1-201ENSMUST00000034076 2800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
Bbs12Q5SUD9 Pm20d2-201ENSMUST00000098181 1445 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.8■■□□□ 1.08
Bbs12Q5SUD9 Plekha3-201ENSMUST00000111920 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
Bbs12Q5SUD9 Zmynd12-201ENSMUST00000094819 1464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
Bbs12Q5SUD9 Smad2-202ENSMUST00000091831 1645 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.8■■□□□ 1.08
Bbs12Q5SUD9 Pcgf5-201ENSMUST00000062389 1566 ntTSL 5 BASIC21.78■■□□□ 1.08
Bbs12Q5SUD9 Tcte3-201ENSMUST00000040746 788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 16.4 ms