Protein–RNA interactions for Protein: Q5STT6

Fam71b, Protein FAM71B, mousemouse

Predictions only

Length 665 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Fam71bQ5STT6 Ildr2-205ENSMUST00000193860 2320 ntTSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
Fam71bQ5STT6 Sept11-208ENSMUST00000202308 1792 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.11■■□□□ 1.45
Fam71bQ5STT6 Hnrnpd-202ENSMUST00000072750 1537 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC24.1■■□□□ 1.45
Fam71bQ5STT6 Paip1-203ENSMUST00000126957 1731 ntTSL 5 BASIC24.1■■□□□ 1.45
Fam71bQ5STT6 Arl2bp-201ENSMUST00000034228 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
Fam71bQ5STT6 Macrod2-205ENSMUST00000110063 845 ntTSL 5 BASIC24.09■■□□□ 1.45
Fam71bQ5STT6 Ssbp3-202ENSMUST00000072753 1924 ntTSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
Fam71bQ5STT6 Gsk3a-201ENSMUST00000071739 2260 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC24.08■■□□□ 1.45
Fam71bQ5STT6 AC150314.2-201ENSMUST00000214135 834 ntTSL 5 BASIC24.08■■□□□ 1.45
Fam71bQ5STT6 Dtnbp1-201ENSMUST00000072329 1362 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
Fam71bQ5STT6 Tnfsfm13-201ENSMUST00000108649 1049 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.07■■□□□ 1.44
Fam71bQ5STT6 Cldn10-203ENSMUST00000100314 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
Fam71bQ5STT6 1110008F13Rik-201ENSMUST00000029165 1045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
Fam71bQ5STT6 Cdk2ap1-201ENSMUST00000031341 1315 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
Fam71bQ5STT6 E330040D14Rik-201ENSMUST00000192299 1374 ntBASIC24.05■■□□□ 1.44
Fam71bQ5STT6 Susd4-202ENSMUST00000153348 1898 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.05■■□□□ 1.44
Fam71bQ5STT6 Kdm2a-203ENSMUST00000116571 2413 ntTSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
Fam71bQ5STT6 Fbxo6-201ENSMUST00000030858 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
Fam71bQ5STT6 Smarcc1-203ENSMUST00000197480 1949 ntTSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
Fam71bQ5STT6 Fam136a-201ENSMUST00000071492 1643 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
Fam71bQ5STT6 Mfsd5-201ENSMUST00000051341 1742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
Fam71bQ5STT6 Efna3-201ENSMUST00000029673 2363 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
Fam71bQ5STT6 Akt1s1-202ENSMUST00000107880 1757 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
Fam71bQ5STT6 Gm20634-201ENSMUST00000090779 2956 ntBASIC24.02■■□□□ 1.44
Fam71bQ5STT6 Cebpb-201ENSMUST00000070642 1504 ntAPPRIS P1 BASIC24.02■■□□□ 1.44
Fam71bQ5STT6 Gm9397-201ENSMUST00000200125 605 ntBASIC24.02■■□□□ 1.44
Fam71bQ5STT6 Eif4e2-203ENSMUST00000113230 1569 ntTSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
Fam71bQ5STT6 4921531C22Rik-201ENSMUST00000150145 1905 ntTSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
Fam71bQ5STT6 Dedd-201ENSMUST00000064950 1618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
Fam71bQ5STT6 Gtpbp2-201ENSMUST00000024748 2966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
Fam71bQ5STT6 Guf1-201ENSMUST00000031113 1769 ntTSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
Fam71bQ5STT6 Smurf1-202ENSMUST00000100461 2725 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
Fam71bQ5STT6 Mpp6-203ENSMUST00000166318 2222 ntTSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
Fam71bQ5STT6 Capns1-201ENSMUST00000001845 1600 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.99■■□□□ 1.43
Fam71bQ5STT6 Gm30346-201ENSMUST00000218641 1699 ntBASIC23.99■■□□□ 1.43
Fam71bQ5STT6 Ppp1r14c-202ENSMUST00000217573 2013 ntTSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
Fam71bQ5STT6 Clk2-203ENSMUST00000121931 2112 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.98■■□□□ 1.43
Fam71bQ5STT6 Ranbp1-202ENSMUST00000115645 1085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
Fam71bQ5STT6 Ube2f-202ENSMUST00000171112 1547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
Fam71bQ5STT6 Ubl4a-207ENSMUST00000178691 1038 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.97■■□□□ 1.43
Fam71bQ5STT6 Amer2-203ENSMUST00000225247 2662 ntBASIC23.97■■□□□ 1.43
Fam71bQ5STT6 Cds2-203ENSMUST00000110158 1247 ntTSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
Fam71bQ5STT6 Smarcc2-205ENSMUST00000218228 603 ntTSL 5 BASIC23.96■■□□□ 1.43
Fam71bQ5STT6 Ube2m-201ENSMUST00000005714 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
Fam71bQ5STT6 Mrps7-201ENSMUST00000058109 1962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
Fam71bQ5STT6 Rundc3a-204ENSMUST00000107105 1861 ntTSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
Fam71bQ5STT6 BC037032-205ENSMUST00000187080 508 ntTSL 5 BASIC23.94■■□□□ 1.42
Fam71bQ5STT6 Mthfd2l-203ENSMUST00000202781 688 ntTSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
Fam71bQ5STT6 Ssx2ip-202ENSMUST00000106149 2416 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
Fam71bQ5STT6 Orai1-201ENSMUST00000051016 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
Fam71bQ5STT6 Gsx1-201ENSMUST00000065382 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
Fam71bQ5STT6 March2-205ENSMUST00000173015 1418 ntTSL 3 BASIC23.92■■□□□ 1.42
Fam71bQ5STT6 Qrich1-209ENSMUST00000194385 975 ntTSL 2 BASIC23.91■■□□□ 1.42
Fam71bQ5STT6 Efemp2-201ENSMUST00000070118 1781 ntTSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
Fam71bQ5STT6 4932443I19Rik-201ENSMUST00000166277 799 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
Fam71bQ5STT6 Dapk3-202ENSMUST00000178422 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.41
Fam71bQ5STT6 Crip2-201ENSMUST00000084882 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
Fam71bQ5STT6 Dpf1-204ENSMUST00000108231 2040 ntTSL 5 BASIC23.87■■□□□ 1.41
Fam71bQ5STT6 Dtnb-211ENSMUST00000173240 2218 ntTSL 5 BASIC23.87■■□□□ 1.41
Fam71bQ5STT6 Phlda1-201ENSMUST00000164773 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
Fam71bQ5STT6 Dut-202ENSMUST00000082122 1020 ntTSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
Fam71bQ5STT6 Cetn4-201ENSMUST00000071400 1808 ntTSL 5 BASIC23.86■■□□□ 1.41
Fam71bQ5STT6 Fam69b-201ENSMUST00000074240 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
Fam71bQ5STT6 Gm960-204ENSMUST00000225896 2202 ntAPPRIS ALT2 BASIC23.85■■□□□ 1.41
Fam71bQ5STT6 Hdgf-201ENSMUST00000005017 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
Fam71bQ5STT6 Mypop-203ENSMUST00000131087 1951 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.84■■□□□ 1.41
Fam71bQ5STT6 Bok-201ENSMUST00000027499 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
Fam71bQ5STT6 Mxra7-202ENSMUST00000047715 757 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
Fam71bQ5STT6 C2cd4d-201ENSMUST00000169433 1321 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.84■■□□□ 1.41
Fam71bQ5STT6 Plekha3-201ENSMUST00000111920 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
Fam71bQ5STT6 Irak1-202ENSMUST00000068286 2537 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
Fam71bQ5STT6 C1qtnf5-201ENSMUST00000114815 1215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
Fam71bQ5STT6 Gm960-202ENSMUST00000177696 2262 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.83■■□□□ 1.41
Fam71bQ5STT6 Clk2-201ENSMUST00000090927 2128 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.4
Fam71bQ5STT6 Gm20503-201ENSMUST00000174664 1294 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.82■■□□□ 1.4
Fam71bQ5STT6 1810026B05Rik-202ENSMUST00000184554 782 ntTSL 3 BASIC23.82■■□□□ 1.4
Fam71bQ5STT6 Tbx1-201ENSMUST00000009241 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
Fam71bQ5STT6 Gng13-201ENSMUST00000115108 347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
Fam71bQ5STT6 Pdia5-201ENSMUST00000023550 1808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
Fam71bQ5STT6 1810026B05Rik-206ENSMUST00000187421 519 ntTSL 3 BASIC23.79■■□□□ 1.4
Fam71bQ5STT6 Cbln1-201ENSMUST00000034076 2800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
Fam71bQ5STT6 Rnd2-201ENSMUST00000001347 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
Fam71bQ5STT6 Sowahd-201ENSMUST00000060057 1574 ntAPPRIS P1 BASIC23.78■■□□□ 1.4
Fam71bQ5STT6 Kcnc3-206ENSMUST00000208651 2728 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.78■■□□□ 1.4
Fam71bQ5STT6 Gsk3a-202ENSMUST00000108411 2248 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.78■■□□□ 1.4
Fam71bQ5STT6 Hrh3-208ENSMUST00000171736 906 ntTSL 5 BASIC23.78■■□□□ 1.4
Fam71bQ5STT6 Ihh-201ENSMUST00000164097 2468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
Fam71bQ5STT6 Arhgap22-201ENSMUST00000111955 2148 ntTSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
Fam71bQ5STT6 Gm7334-201ENSMUST00000061681 1356 ntAPPRIS P1 BASIC23.78■■□□□ 1.4
Fam71bQ5STT6 Gm17494-201ENSMUST00000072769 1800 ntTSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
Fam71bQ5STT6 Gm24970-201ENSMUST00000175582 82 ntBASIC23.77■■□□□ 1.4
Fam71bQ5STT6 Ppp1r14b-201ENSMUST00000070850 919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
Fam71bQ5STT6 Hmx1-201ENSMUST00000087674 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
Fam71bQ5STT6 Lpcat4-201ENSMUST00000028554 2275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
Fam71bQ5STT6 Ywhaq-202ENSMUST00000103002 2110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
Fam71bQ5STT6 Tmem243-201ENSMUST00000115365 1040 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.75■■□□□ 1.39
Fam71bQ5STT6 Bok-205ENSMUST00000201863 883 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.75■■□□□ 1.39
Fam71bQ5STT6 2810459M11Rik-201ENSMUST00000027429 1225 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
Fam71bQ5STT6 1700026D11Rik-201ENSMUST00000126910 2033 ntTSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
Fam71bQ5STT6 Aspscr1-201ENSMUST00000026135 1820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 13.8 ms