Protein–RNA interactions for Protein: Q5FW85

Ecm2, Extracellular matrix protein 2, mousemouse

Predictions only

Length 670 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ecm2Q5FW85 AC157572.2-201ENSMUST00000226970 908 ntBASIC35.66■■■■□ 3.3
Ecm2Q5FW85 Dapk3-209ENSMUST00000219850 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.66■■■■□ 3.3
Ecm2Q5FW85 Asph-201ENSMUST00000038564 1174 ntTSL 1 (best) BASIC35.64■■■■□ 3.3
Ecm2Q5FW85 Asph-205ENSMUST00000098275 1007 ntTSL 5 BASIC35.64■■■■□ 3.3
Ecm2Q5FW85 Ddrgk1-201ENSMUST00000089559 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.63■■■■□ 3.29
Ecm2Q5FW85 Hs3st6-201ENSMUST00000044922 1219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.61■■■■□ 3.29
Ecm2Q5FW85 Gpr25-201ENSMUST00000086395 1077 ntAPPRIS P1 BASIC35.61■■■■□ 3.29
Ecm2Q5FW85 Pard6a-201ENSMUST00000093195 1265 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC35.61■■■■□ 3.29
Ecm2Q5FW85 Slc39a13-203ENSMUST00000111436 1291 ntTSL 1 (best) BASIC35.6■■■■□ 3.29
Ecm2Q5FW85 Fam89b-203ENSMUST00000161368 1160 ntTSL 1 (best) BASIC35.6■■■■□ 3.29
Ecm2Q5FW85 Fam89b-202ENSMUST00000116558 1189 ntTSL 1 (best) BASIC35.59■■■■□ 3.29
Ecm2Q5FW85 Mad2l2-202ENSMUST00000084129 1162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.59■■■■□ 3.29
Ecm2Q5FW85 Gm8098-201ENSMUST00000146985 1499 ntTSL 1 (best) BASIC35.59■■■■□ 3.29
Ecm2Q5FW85 Abhd17a-201ENSMUST00000003436 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.59■■■■□ 3.29
Ecm2Q5FW85 Gm45051-201ENSMUST00000206838 963 ntTSL 1 (best) BASIC35.58■■■■□ 3.29
Ecm2Q5FW85 Rpl38-203ENSMUST00000106599 457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.57■■■■□ 3.28
Ecm2Q5FW85 Endog-201ENSMUST00000015481 1063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.57■■■■□ 3.28
Ecm2Q5FW85 Atp1b3-201ENSMUST00000034983 1994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.56■■■■□ 3.28
Ecm2Q5FW85 Gm28052-201ENSMUST00000150388 380 ntTSL 3 BASIC35.56■■■■□ 3.28
Ecm2Q5FW85 Gm6311-201ENSMUST00000073790 878 ntBASIC35.53■■■■□ 3.28
Ecm2Q5FW85 Srp9-201ENSMUST00000027792 1367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.52■■■■□ 3.28
Ecm2Q5FW85 Dleu2-206ENSMUST00000182537 318 ntTSL 2 BASIC35.51■■■■□ 3.28
Ecm2Q5FW85 Rnf215-201ENSMUST00000003677 1874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.5■■■■□ 3.27
Ecm2Q5FW85 Cadm4-201ENSMUST00000068023 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.49■■■■□ 3.27
Ecm2Q5FW85 Lrrc1-204ENSMUST00000183734 2113 ntTSL 1 (best) BASIC35.49■■■■□ 3.27
Ecm2Q5FW85 C2cd4b-201ENSMUST00000171652 1327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.48■■■■□ 3.27
Ecm2Q5FW85 Dnajc19-202ENSMUST00000108195 659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.46■■■■□ 3.27
Ecm2Q5FW85 Ranbp1-202ENSMUST00000115645 1085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.46■■■■□ 3.27
Ecm2Q5FW85 Ppa2-203ENSMUST00000122334 1368 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC35.46■■■■□ 3.27
Ecm2Q5FW85 Il3ra-201ENSMUST00000090591 1614 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC35.43■■■■□ 3.26
Ecm2Q5FW85 Gjd3-201ENSMUST00000062931 837 ntAPPRIS P1 BASIC35.43■■■■□ 3.26
Ecm2Q5FW85 Wsb2-201ENSMUST00000031309 2421 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC35.42■■■■□ 3.26
Ecm2Q5FW85 Gm13889-202ENSMUST00000148314 1240 ntAPPRIS P1 BASIC35.42■■■■□ 3.26
Ecm2Q5FW85 Trappc6b-207ENSMUST00000218686 785 ntTSL 3 BASIC35.42■■■■□ 3.26
Ecm2Q5FW85 Ppp1r35-201ENSMUST00000031739 956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.42■■■■□ 3.26
Ecm2Q5FW85 AC163623.1-201ENSMUST00000213738 727 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC35.41■■■■□ 3.26
Ecm2Q5FW85 6530409C15Rik-202ENSMUST00000143551 1573 ntTSL 1 (best) BASIC35.4■■■■□ 3.26
Ecm2Q5FW85 Cox4i1-205ENSMUST00000181586 765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.4■■■■□ 3.26
Ecm2Q5FW85 Zcrb1-201ENSMUST00000076070 877 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC35.4■■■■□ 3.26
Ecm2Q5FW85 9230104M06Rik-201ENSMUST00000180971 1963 ntBASIC35.39■■■■□ 3.26
Ecm2Q5FW85 Ell2-205ENSMUST00000222194 434 ntTSL 3 BASIC35.39■■■■□ 3.26
Ecm2Q5FW85 Unc119-203ENSMUST00000108295 1371 ntTSL 3 BASIC35.38■■■■□ 3.26
Ecm2Q5FW85 Dhrs13-203ENSMUST00000122342 1791 ntTSL 1 (best) BASIC35.36■■■■□ 3.25
Ecm2Q5FW85 Znrf1-207ENSMUST00000173506 1238 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC35.36■■■■□ 3.25
Ecm2Q5FW85 Gm43573-201ENSMUST00000196445 570 ntTSL 5 BASIC35.36■■■■□ 3.25
Ecm2Q5FW85 Ube2q2-202ENSMUST00000121677 1680 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC35.35■■■■□ 3.25
Ecm2Q5FW85 Dazap1-202ENSMUST00000105361 1537 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC35.34■■■■□ 3.25
Ecm2Q5FW85 Osbpl1a-209ENSMUST00000122175 1203 ntTSL 1 (best) BASIC35.31■■■■□ 3.24
Ecm2Q5FW85 Rnaseh2c-201ENSMUST00000025864 1126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.3■■■■□ 3.24
Ecm2Q5FW85 Eva1b-202ENSMUST00000106150 1144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.28■■■■□ 3.24
Ecm2Q5FW85 Rnaset2b-201ENSMUST00000089119 1013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.28■■■■□ 3.24
Ecm2Q5FW85 Cited4-201ENSMUST00000094814 1249 ntAPPRIS P1 BASIC35.26■■■■□ 3.24
Ecm2Q5FW85 Ldb1-208ENSMUST00000185355 2088 ntTSL 1 (best) BASIC35.26■■■■□ 3.23
Ecm2Q5FW85 Gm26508-201ENSMUST00000181285 1516 ntTSL 5 BASIC35.26■■■■□ 3.23
Ecm2Q5FW85 Gm27021-201ENSMUST00000181333 758 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC35.25■■■■□ 3.23
Ecm2Q5FW85 1700020L24Rik-201ENSMUST00000037378 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.23■■■■□ 3.23
Ecm2Q5FW85 Bok-201ENSMUST00000027499 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.2■■■■□ 3.23
Ecm2Q5FW85 Gli3-204ENSMUST00000141194 466 ntTSL 2 BASIC35.19■■■■□ 3.22
Ecm2Q5FW85 Fam241a-202ENSMUST00000199273 2234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.19■■■■□ 3.22
Ecm2Q5FW85 Rps2-ps13-201ENSMUST00000117295 882 ntBASIC35.18■■■■□ 3.22
Ecm2Q5FW85 Gm12366-201ENSMUST00000121722 873 ntBASIC35.18■■■■□ 3.22
Ecm2Q5FW85 Rps2-206ENSMUST00000146867 962 ntTSL 5 BASIC35.18■■■■□ 3.22
Ecm2Q5FW85 Paqr6-203ENSMUST00000147948 837 ntTSL 2 BASIC35.18■■■■□ 3.22
Ecm2Q5FW85 Rps2-ps10-201ENSMUST00000076842 879 ntBASIC35.18■■■■□ 3.22
Ecm2Q5FW85 Gm5786-201ENSMUST00000085368 882 ntBASIC35.18■■■■□ 3.22
Ecm2Q5FW85 Gm7334-201ENSMUST00000061681 1356 ntAPPRIS P1 BASIC35.17■■■■□ 3.22
Ecm2Q5FW85 Ccnyl1-203ENSMUST00000187170 1506 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC35.16■■■■□ 3.22
Ecm2Q5FW85 Shf-201ENSMUST00000048635 1431 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC35.16■■■■□ 3.22
Ecm2Q5FW85 Klhl15-202ENSMUST00000113908 1235 ntTSL 1 (best) BASIC35.16■■■■□ 3.22
Ecm2Q5FW85 4930577N17Rik-201ENSMUST00000139771 1625 ntBASIC35.15■■■■□ 3.22
Ecm2Q5FW85 Faim-202ENSMUST00000112911 803 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC35.15■■■■□ 3.22
Ecm2Q5FW85 Pmvk-201ENSMUST00000029564 1194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.15■■■■□ 3.22
Ecm2Q5FW85 Card19-201ENSMUST00000048946 804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.15■■■■□ 3.22
Ecm2Q5FW85 Tmem240-202ENSMUST00000147721 817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.14■■■■□ 3.22
Ecm2Q5FW85 Smagp-201ENSMUST00000066068 1132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.14■■■■□ 3.22
Ecm2Q5FW85 Epcam-201ENSMUST00000053577 2040 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC35.13■■■■□ 3.21
Ecm2Q5FW85 Rpsa-204ENSMUST00000217317 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.12■■■■□ 3.21
Ecm2Q5FW85 Efhd1os-201ENSMUST00000138844 332 ntTSL 3 BASIC35.1■■■■□ 3.21
Ecm2Q5FW85 Bloc1s2-201ENSMUST00000079033 878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.1■■■■□ 3.21
Ecm2Q5FW85 Gm16764-201ENSMUST00000138891 541 ntTSL 5 BASIC35.09■■■■□ 3.21
Ecm2Q5FW85 Tcfl5-201ENSMUST00000037877 2225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.08■■■■□ 3.21
Ecm2Q5FW85 Gnai2-201ENSMUST00000055704 2215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.08■■■■□ 3.21
Ecm2Q5FW85 Mpped1-208ENSMUST00000163723 1064 ntTSL 5 BASIC35.07■■■■□ 3.2
Ecm2Q5FW85 Gm5297-201ENSMUST00000198555 1171 ntBASIC35.07■■■■□ 3.2
Ecm2Q5FW85 Calm3-201ENSMUST00000019514 2290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.06■■■■□ 3.2
Ecm2Q5FW85 Gm27040-201ENSMUST00000181984 504 ntTSL 2 BASIC35.03■■■■□ 3.2
Ecm2Q5FW85 Gm15672-201ENSMUST00000151512 1354 ntTSL 1 (best) BASIC35.02■■■■□ 3.2
Ecm2Q5FW85 Egln2-201ENSMUST00000080058 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.01■■■■□ 3.2
Ecm2Q5FW85 AC167019.3-201ENSMUST00000228225 1266 ntBASIC35■■■■□ 3.19
Ecm2Q5FW85 Tmem200b-201ENSMUST00000094666 1370 ntAPPRIS P1 BASIC35■■■■□ 3.19
Ecm2Q5FW85 AC125444.1-201ENSMUST00000223536 639 ntAPPRIS P1 BASIC34.99■■■■□ 3.19
Ecm2Q5FW85 Cebpb-201ENSMUST00000070642 1504 ntAPPRIS P1 BASIC34.98■■■■□ 3.19
Ecm2Q5FW85 Arpc5l-202ENSMUST00000112862 1339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.97■■■■□ 3.19
Ecm2Q5FW85 Bok-205ENSMUST00000201863 883 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC34.94■■■■□ 3.18
Ecm2Q5FW85 Rbmxl2-201ENSMUST00000098135 1472 ntAPPRIS P1 BASIC34.94■■■■□ 3.18
Ecm2Q5FW85 Lactb-202ENSMUST00000215172 1806 ntTSL 1 (best) BASIC34.94■■■■□ 3.18
Ecm2Q5FW85 C130046K22Rik-201ENSMUST00000129780 727 ntTSL 5 BASIC34.93■■■■□ 3.18
Ecm2Q5FW85 Ubl4a-207ENSMUST00000178691 1038 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC34.93■■■■□ 3.18
Ecm2Q5FW85 Tceal3-201ENSMUST00000060904 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.93■■■■□ 3.18
Ecm2Q5FW85 Mtor-201ENSMUST00000057580 1003 ntTSL 1 (best) BASIC34.92■■■■□ 3.18
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 15.2 ms