Protein–RNA interactions for Protein: Q3V460

Smim26, Gene model 561, (NCBI), mousemouse

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Length 107 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Smim26Q3V460 Cdan1-201ENSMUST00000110700 5996 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
Smim26Q3V460 Clk2-202ENSMUST00000121212 2154 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Smim26Q3V460 Ube2q2-202ENSMUST00000121677 1680 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
Smim26Q3V460 Grb2-202ENSMUST00000106495 2041 ntTSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
Smim26Q3V460 Rnf19b-201ENSMUST00000030584 2414 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
Smim26Q3V460 Kcna7-201ENSMUST00000107774 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Smim26Q3V460 Gm960-204ENSMUST00000225896 2202 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.41■□□□□ 0.22
Smim26Q3V460 Adgrb1-203ENSMUST00000185682 2744 ntTSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Smim26Q3V460 Hoxc13-201ENSMUST00000001700 2461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Smim26Q3V460 Scrt2-201ENSMUST00000064061 3395 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
Smim26Q3V460 Neurog2-201ENSMUST00000029587 2227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Smim26Q3V460 Arnt2-201ENSMUST00000085077 6151 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Smim26Q3V460 Gm6345-201ENSMUST00000180378 1691 ntBASIC16.37■□□□□ 0.21
Smim26Q3V460 Agap2-202ENSMUST00000217941 5573 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Smim26Q3V460 Zcchc2-201ENSMUST00000118196 5796 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
Smim26Q3V460 B4galt6-201ENSMUST00000070080 5808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Smim26Q3V460 Rundc3a-204ENSMUST00000107105 1861 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Smim26Q3V460 Cntln-204ENSMUST00000169371 5365 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
Smim26Q3V460 Cnot6-203ENSMUST00000145353 5736 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
Smim26Q3V460 Adgrb1-201ENSMUST00000042035 6228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Smim26Q3V460 Zranb1-202ENSMUST00000106157 5008 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
Smim26Q3V460 Ski-201ENSMUST00000030917 5522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Smim26Q3V460 Rcor2-201ENSMUST00000066646 2801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.21
Smim26Q3V460 Rnf149-204ENSMUST00000195705 389 ntTSL 3 BASIC16.33■□□□□ 0.2
Smim26Q3V460 Panx2-202ENSMUST00000161372 2314 ntTSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Smim26Q3V460 Pds5a-209ENSMUST00000201948 8934 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.32■□□□□ 0.2
Smim26Q3V460 Mipep-204ENSMUST00000225043 1548 ntBASIC16.31■□□□□ 0.2
Smim26Q3V460 Ino80b-201ENSMUST00000032109 1038 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Smim26Q3V460 Rab40c-209ENSMUST00000179998 2456 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.31■□□□□ 0.2
Smim26Q3V460 Fam220a-206ENSMUST00000196487 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Smim26Q3V460 B4galt7-202ENSMUST00000100764 2195 ntTSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Smim26Q3V460 Lemd3-202ENSMUST00000119944 4743 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Smim26Q3V460 Mapk3-202ENSMUST00000057669 1800 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Smim26Q3V460 Susd4-202ENSMUST00000153348 1898 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.3■□□□□ 0.2
Smim26Q3V460 Maz-204ENSMUST00000206254 2282 ntTSL 5 BASIC16.3■□□□□ 0.2
Smim26Q3V460 Rexo2-201ENSMUST00000034524 1077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Smim26Q3V460 Agap3-201ENSMUST00000024123 3207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Smim26Q3V460 Znrf3-201ENSMUST00000109867 6311 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.28■□□□□ 0.2
Smim26Q3V460 Klhl35-201ENSMUST00000037359 1954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Smim26Q3V460 Maf-202ENSMUST00000109104 6360 ntAPPRIS P2 BASIC16.28■□□□□ 0.2
Smim26Q3V460 Caap1-201ENSMUST00000030313 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Smim26Q3V460 Dtnb-211ENSMUST00000173240 2218 ntTSL 5 BASIC16.27■□□□□ 0.2
Smim26Q3V460 Crlf1-201ENSMUST00000008032 1644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Smim26Q3V460 Ppp2cb-201ENSMUST00000009774 1469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
Smim26Q3V460 Dtnb-203ENSMUST00000164578 2355 ntTSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
Smim26Q3V460 Rnf111-204ENSMUST00000213647 4961 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Smim26Q3V460 Gpr12-201ENSMUST00000036211 2219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Smim26Q3V460 Ubtf-210ENSMUST00000174302 4692 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.26■□□□□ 0.19
Smim26Q3V460 Ssbp3-202ENSMUST00000072753 1924 ntTSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Smim26Q3V460 Gnas-207ENSMUST00000109085 1789 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Smim26Q3V460 Dda1-209ENSMUST00000147642 1865 ntTSL 2 BASIC16.25■□□□□ 0.19
Smim26Q3V460 Gabbr2-201ENSMUST00000107749 5750 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.24■□□□□ 0.19
Smim26Q3V460 Gm12339-201ENSMUST00000127424 728 ntTSL 3 BASIC16.24■□□□□ 0.19
Smim26Q3V460 Rcan1-202ENSMUST00000060005 2324 ntTSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Smim26Q3V460 Fam102b-202ENSMUST00000171143 5702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Smim26Q3V460 Tnfsfm13-202ENSMUST00000174159 1470 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.23■□□□□ 0.19
Smim26Q3V460 Usp12-201ENSMUST00000085614 4327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Smim26Q3V460 Stat5b-201ENSMUST00000004143 5062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Smim26Q3V460 Gm17494-201ENSMUST00000072769 1800 ntTSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Smim26Q3V460 Rnf149-201ENSMUST00000062525 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Smim26Q3V460 AC124392.1-201ENSMUST00000225172 5324 ntBASIC16.21■□□□□ 0.19
Smim26Q3V460 Efna3-201ENSMUST00000029673 2363 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Smim26Q3V460 Fcho2-204ENSMUST00000179563 1586 ntTSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.18
Smim26Q3V460 Runx3-202ENSMUST00000119564 1855 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Smim26Q3V460 Acvr2b-202ENSMUST00000165044 2093 ntTSL 2 BASIC16.2■□□□□ 0.18
Smim26Q3V460 Ica1-201ENSMUST00000038403 2075 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Smim26Q3V460 AC153890.1-201ENSMUST00000220021 2469 ntBASIC16.2■□□□□ 0.18
Smim26Q3V460 Smarcc1-203ENSMUST00000197480 1949 ntTSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Smim26Q3V460 Guf1-201ENSMUST00000031113 1769 ntTSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Smim26Q3V460 Eed-201ENSMUST00000107234 2067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Smim26Q3V460 Tbx1-201ENSMUST00000009241 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Smim26Q3V460 Plpp2-201ENSMUST00000063879 1654 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Smim26Q3V460 Pon2-201ENSMUST00000057792 2409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Smim26Q3V460 Clk2-201ENSMUST00000090927 2128 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Smim26Q3V460 Mxi1-202ENSMUST00000025998 4996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Smim26Q3V460 Magi3-201ENSMUST00000064371 6640 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Smim26Q3V460 Zfp358-201ENSMUST00000061508 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Smim26Q3V460 Eml4-201ENSMUST00000049503 5109 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Smim26Q3V460 Cited2-203ENSMUST00000219558 2411 ntAPPRIS P1 BASIC16.17■□□□□ 0.18
Smim26Q3V460 Clptm1l-201ENSMUST00000022102 2340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Smim26Q3V460 Fbxl17-201ENSMUST00000024761 4925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Smim26Q3V460 Gjc1-201ENSMUST00000068933 1903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Smim26Q3V460 Ammecr1-201ENSMUST00000041317 5437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Smim26Q3V460 Hs2st1-201ENSMUST00000043325 6177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Smim26Q3V460 Neurl4-202ENSMUST00000108617 4892 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.18
Smim26Q3V460 Brd1-203ENSMUST00000109381 4886 ntTSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.18
Smim26Q3V460 Dpy19l1-206ENSMUST00000170356 4715 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
Smim26Q3V460 Aes-201ENSMUST00000002518 1411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Smim26Q3V460 Kcnq5-206ENSMUST00000173404 2775 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
Smim26Q3V460 Rras2-201ENSMUST00000069449 2275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Smim26Q3V460 Efemp2-201ENSMUST00000070118 1781 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Smim26Q3V460 Hnrnpd-203ENSMUST00000112939 1670 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
Smim26Q3V460 Dirc2-201ENSMUST00000023554 5395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Smim26Q3V460 Gas2l1-201ENSMUST00000037146 2686 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Smim26Q3V460 Nr2f6-201ENSMUST00000002466 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Smim26Q3V460 Gpr137c-202ENSMUST00000147957 1395 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Smim26Q3V460 Vsig8-202ENSMUST00000177086 1519 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Smim26Q3V460 Ctbp1-211ENSMUST00000202868 2436 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Smim26Q3V460 Mbd3-204ENSMUST00000105349 1566 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Smim26Q3V460 Dpf1-204ENSMUST00000108231 2040 ntTSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 58.8 ms