Protein–RNA interactions for Protein: Q3V1H3

Hephl1, Hephaestin-like protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 1,159 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Hephl1Q3V1H3 Clk2-202ENSMUST00000121212 2154 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
Hephl1Q3V1H3 Dtnb-203ENSMUST00000164578 2355 ntTSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
Hephl1Q3V1H3 Arhgdia-201ENSMUST00000067936 2150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
Hephl1Q3V1H3 Kcna7-201ENSMUST00000107774 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
Hephl1Q3V1H3 Rcan1-202ENSMUST00000060005 2324 ntTSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
Hephl1Q3V1H3 CT030161.2-201ENSMUST00000218666 735 ntTSL 3 BASIC22.96■■□□□ 1.27
Hephl1Q3V1H3 Tnfsf12-202ENSMUST00000181810 1435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
Hephl1Q3V1H3 Raly-202ENSMUST00000058089 1747 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
Hephl1Q3V1H3 Tmeff1-202ENSMUST00000123476 1224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
Hephl1Q3V1H3 Panx2-202ENSMUST00000161372 2314 ntTSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
Hephl1Q3V1H3 E2f1-201ENSMUST00000000894 2755 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
Hephl1Q3V1H3 Fcnaos-201ENSMUST00000127642 1351 ntTSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
Hephl1Q3V1H3 Cetn4-201ENSMUST00000071400 1808 ntTSL 5 BASIC22.93■■□□□ 1.26
Hephl1Q3V1H3 Neurog2-201ENSMUST00000029587 2227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
Hephl1Q3V1H3 Trp53rkb-202ENSMUST00000065753 1375 ntTSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
Hephl1Q3V1H3 Zfp513-202ENSMUST00000114590 2228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
Hephl1Q3V1H3 Cnnm3-202ENSMUST00000097776 5292 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
Hephl1Q3V1H3 Rnf19b-201ENSMUST00000030584 2414 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.92■■□□□ 1.26
Hephl1Q3V1H3 Terf2-201ENSMUST00000068388 1915 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
Hephl1Q3V1H3 E2f6-201ENSMUST00000020908 2418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
Hephl1Q3V1H3 B4galt7-202ENSMUST00000100764 2195 ntTSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
Hephl1Q3V1H3 Suds3-202ENSMUST00000166397 1694 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
Hephl1Q3V1H3 Irx4-201ENSMUST00000022095 2589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
Hephl1Q3V1H3 Maz-204ENSMUST00000206254 2282 ntTSL 5 BASIC22.88■■□□□ 1.25
Hephl1Q3V1H3 Tdp2-203ENSMUST00000223804 1136 ntBASIC22.88■■□□□ 1.25
Hephl1Q3V1H3 Atp5a1-202ENSMUST00000114748 2674 ntTSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
Hephl1Q3V1H3 1700016A09Rik-201ENSMUST00000192004 835 ntBASIC22.87■■□□□ 1.25
Hephl1Q3V1H3 Cited2-203ENSMUST00000219558 2411 ntAPPRIS P1 BASIC22.87■■□□□ 1.25
Hephl1Q3V1H3 Ssbp3-202ENSMUST00000072753 1924 ntTSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
Hephl1Q3V1H3 Tnfsfm13-202ENSMUST00000174159 1470 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.86■■□□□ 1.25
Hephl1Q3V1H3 Caap1-201ENSMUST00000030313 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
Hephl1Q3V1H3 Hoxa13-201ENSMUST00000047993 1309 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.85■■□□□ 1.25
Hephl1Q3V1H3 Efna3-201ENSMUST00000029673 2363 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
Hephl1Q3V1H3 Dtnb-211ENSMUST00000173240 2218 ntTSL 5 BASIC22.85■■□□□ 1.25
Hephl1Q3V1H3 Gpr12-201ENSMUST00000036211 2219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
Hephl1Q3V1H3 Rundc3a-204ENSMUST00000107105 1861 ntTSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
Hephl1Q3V1H3 Scrt2-201ENSMUST00000064061 3395 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.83■■□□□ 1.25
Hephl1Q3V1H3 Dda1-209ENSMUST00000147642 1865 ntTSL 2 BASIC22.83■■□□□ 1.24
Hephl1Q3V1H3 Fam220a-206ENSMUST00000196487 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.24
Hephl1Q3V1H3 Peg12-201ENSMUST00000094339 2640 ntAPPRIS P1 BASIC22.82■■□□□ 1.24
Hephl1Q3V1H3 Macrod2-205ENSMUST00000110063 845 ntTSL 5 BASIC22.82■■□□□ 1.24
Hephl1Q3V1H3 Ube2f-202ENSMUST00000171112 1547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
Hephl1Q3V1H3 Gm6345-201ENSMUST00000180378 1691 ntBASIC22.81■■□□□ 1.24
Hephl1Q3V1H3 Vsig8-202ENSMUST00000177086 1519 ntTSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
Hephl1Q3V1H3 Nr2f6-201ENSMUST00000002466 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
Hephl1Q3V1H3 Zfp422-201ENSMUST00000057540 2375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
Hephl1Q3V1H3 Smarcc1-203ENSMUST00000197480 1949 ntTSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
Hephl1Q3V1H3 Gtf2a2-203ENSMUST00000119413 1034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
Hephl1Q3V1H3 A530058N18Rik-207ENSMUST00000152254 1211 ntTSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
Hephl1Q3V1H3 Aard-201ENSMUST00000090025 1348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
Hephl1Q3V1H3 Arx-202ENSMUST00000113947 2454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
Hephl1Q3V1H3 Gjc1-201ENSMUST00000068933 1903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
Hephl1Q3V1H3 Rpl19-ps4-201ENSMUST00000167150 625 ntBASIC22.77■■□□□ 1.24
Hephl1Q3V1H3 Clk2-201ENSMUST00000090927 2128 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
Hephl1Q3V1H3 Clptm1l-201ENSMUST00000022102 2340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
Hephl1Q3V1H3 Runx3-202ENSMUST00000119564 1855 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
Hephl1Q3V1H3 1190005I06Rik-201ENSMUST00000123927 844 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
Hephl1Q3V1H3 E330040D14Rik-201ENSMUST00000192299 1374 ntBASIC22.75■■□□□ 1.23
Hephl1Q3V1H3 Gkap1-201ENSMUST00000091579 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
Hephl1Q3V1H3 Spata1-201ENSMUST00000029839 1920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
Hephl1Q3V1H3 Agap3-201ENSMUST00000024123 3207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
Hephl1Q3V1H3 Ubl4a-207ENSMUST00000178691 1038 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.73■■□□□ 1.23
Hephl1Q3V1H3 Nrtn-201ENSMUST00000044752 1023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
Hephl1Q3V1H3 Dpf1-204ENSMUST00000108231 2040 ntTSL 5 BASIC22.73■■□□□ 1.23
Hephl1Q3V1H3 Gas2l1-201ENSMUST00000037146 2686 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
Hephl1Q3V1H3 Rras2-201ENSMUST00000069449 2275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
Hephl1Q3V1H3 Ctbp1-211ENSMUST00000202868 2436 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
Hephl1Q3V1H3 Acvr2b-202ENSMUST00000165044 2093 ntTSL 2 BASIC22.72■■□□□ 1.23
Hephl1Q3V1H3 Phf23-205ENSMUST00000135814 2214 ntTSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
Hephl1Q3V1H3 Ranbp1-202ENSMUST00000115645 1085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
Hephl1Q3V1H3 Orai1-201ENSMUST00000051016 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
Hephl1Q3V1H3 Klhl35-201ENSMUST00000037359 1954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
Hephl1Q3V1H3 Snta1-202ENSMUST00000109728 2131 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
Hephl1Q3V1H3 Snta1-201ENSMUST00000028991 2125 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
Hephl1Q3V1H3 Gnas-207ENSMUST00000109085 1789 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
Hephl1Q3V1H3 Plpp2-201ENSMUST00000063879 1654 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
Hephl1Q3V1H3 Gm45855-201ENSMUST00000212546 880 ntBASIC22.68■■□□□ 1.22
Hephl1Q3V1H3 Gm527-203ENSMUST00000220993 1090 ntTSL 5 BASIC22.68■■□□□ 1.22
Hephl1Q3V1H3 Dedd-201ENSMUST00000064950 1618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
Hephl1Q3V1H3 Lmo2-201ENSMUST00000111139 1434 ntTSL 5 BASIC22.67■■□□□ 1.22
Hephl1Q3V1H3 Bok-201ENSMUST00000027499 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
Hephl1Q3V1H3 Fbxo6-201ENSMUST00000030858 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
Hephl1Q3V1H3 Cds2-203ENSMUST00000110158 1247 ntTSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
Hephl1Q3V1H3 Nhlrc1-201ENSMUST00000052747 2294 ntAPPRIS P1 BASIC22.66■■□□□ 1.22
Hephl1Q3V1H3 Sept11-208ENSMUST00000202308 1792 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.66■■□□□ 1.22
Hephl1Q3V1H3 Eed-201ENSMUST00000107234 2067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
Hephl1Q3V1H3 Isoc1-201ENSMUST00000025503 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
Hephl1Q3V1H3 Gm17494-201ENSMUST00000072769 1800 ntTSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
Hephl1Q3V1H3 Susd4-202ENSMUST00000153348 1898 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.64■■□□□ 1.21
Hephl1Q3V1H3 St7-202ENSMUST00000052113 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
Hephl1Q3V1H3 Slc39a13-201ENSMUST00000073575 2469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
Hephl1Q3V1H3 Otud5-205ENSMUST00000115668 2543 ntTSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
Hephl1Q3V1H3 Efemp2-201ENSMUST00000070118 1781 ntTSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
Hephl1Q3V1H3 Zswim6-201ENSMUST00000105097 5456 ntTSL 5 BASIC22.63■■□□□ 1.21
Hephl1Q3V1H3 Guf1-201ENSMUST00000031113 1769 ntTSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
Hephl1Q3V1H3 Pradc1-201ENSMUST00000032080 1038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
Hephl1Q3V1H3 Ica1-201ENSMUST00000038403 2075 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
Hephl1Q3V1H3 Mfsd5-201ENSMUST00000051341 1742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
Hephl1Q3V1H3 Gm9397-201ENSMUST00000200125 605 ntBASIC22.6■■□□□ 1.21
Hephl1Q3V1H3 Bok-205ENSMUST00000201863 883 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.59■■□□□ 1.21
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 10.2 ms