Protein–RNA interactions for Protein: Q3V061

Trim80, Tripartite motif-containing 80, mousemouse

Predictions only

Length 624 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Trim80Q3V061 Coq10a-207ENSMUST00000220227 1434 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.05■■□□□ 1.6
Trim80Q3V061 Tdp2-203ENSMUST00000223804 1136 ntBASIC25.05■■□□□ 1.6
Trim80Q3V061 Rnf130-202ENSMUST00000102776 1502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
Trim80Q3V061 Gjc1-201ENSMUST00000068933 1903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
Trim80Q3V061 Gnas-207ENSMUST00000109085 1789 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
Trim80Q3V061 Arhgdia-201ENSMUST00000067936 2150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
Trim80Q3V061 Agap3-201ENSMUST00000024123 3207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
Trim80Q3V061 Gm6345-201ENSMUST00000180378 1691 ntBASIC25.02■■□□□ 1.6
Trim80Q3V061 Smarcc1-203ENSMUST00000197480 1949 ntTSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
Trim80Q3V061 Clk2-202ENSMUST00000121212 2154 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
Trim80Q3V061 Dtnb-211ENSMUST00000173240 2218 ntTSL 5 BASIC25.01■■□□□ 1.59
Trim80Q3V061 Cetn4-201ENSMUST00000071400 1808 ntTSL 5 BASIC25■■□□□ 1.59
Trim80Q3V061 Runx3-202ENSMUST00000119564 1855 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
Trim80Q3V061 Dtnb-203ENSMUST00000164578 2355 ntTSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
Trim80Q3V061 Fam120a-201ENSMUST00000060805 5105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
Trim80Q3V061 Arx-202ENSMUST00000113947 2454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
Trim80Q3V061 Eif2ak3-204ENSMUST00000162950 927 ntTSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
Trim80Q3V061 Atp5a1-202ENSMUST00000114748 2674 ntTSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
Trim80Q3V061 Rundc3a-204ENSMUST00000107105 1861 ntTSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
Trim80Q3V061 Ubp1-203ENSMUST00000116492 2111 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.59
Trim80Q3V061 AC153890.1-201ENSMUST00000220021 2469 ntBASIC24.95■■□□□ 1.59
Trim80Q3V061 Lsm4-204ENSMUST00000210071 575 ntTSL 5 BASIC24.95■■□□□ 1.58
Trim80Q3V061 Marveld2-202ENSMUST00000163163 2187 ntTSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
Trim80Q3V061 Terf2-201ENSMUST00000068388 1915 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
Trim80Q3V061 Btf3-201ENSMUST00000022163 1091 ntTSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
Trim80Q3V061 Dpf1-204ENSMUST00000108231 2040 ntTSL 5 BASIC24.93■■□□□ 1.58
Trim80Q3V061 Clk2-201ENSMUST00000090927 2128 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
Trim80Q3V061 Fam60a-203ENSMUST00000111562 906 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.92■■□□□ 1.58
Trim80Q3V061 Caap1-201ENSMUST00000030313 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
Trim80Q3V061 Kcnq5-206ENSMUST00000173404 2775 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.92■■□□□ 1.58
Trim80Q3V061 Sh3glb2-203ENSMUST00000113620 1694 ntTSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
Trim80Q3V061 Dapk3-209ENSMUST00000219850 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
Trim80Q3V061 Popdc3-202ENSMUST00000161803 1369 ntTSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
Trim80Q3V061 Rcan1-202ENSMUST00000060005 2324 ntTSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
Trim80Q3V061 Peli2-204ENSMUST00000226513 1320 ntBASIC24.89■■□□□ 1.58
Trim80Q3V061 Susd4-202ENSMUST00000153348 1898 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.89■■□□□ 1.57
Trim80Q3V061 Igfbp3-202ENSMUST00000135887 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.57
Trim80Q3V061 Suds3-202ENSMUST00000166397 1694 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
Trim80Q3V061 Gm26566-201ENSMUST00000181601 1038 ntAPPRIS P1 BASIC24.88■■□□□ 1.57
Trim80Q3V061 Mast2-203ENSMUST00000106485 5705 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
Trim80Q3V061 Mast2-204ENSMUST00000106486 5723 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
Trim80Q3V061 Reep6-203ENSMUST00000105355 2127 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
Trim80Q3V061 Reep6-204ENSMUST00000105357 2127 ntTSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
Trim80Q3V061 Neurog2-201ENSMUST00000029587 2227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
Trim80Q3V061 Mkrn1-202ENSMUST00000051671 1511 ntTSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
Trim80Q3V061 Rab22a-202ENSMUST00000109110 849 ntTSL 5 BASIC24.87■■□□□ 1.57
Trim80Q3V061 Guf1-201ENSMUST00000031113 1769 ntTSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
Trim80Q3V061 Cenpv-201ENSMUST00000018653 1032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
Trim80Q3V061 Fam220a-205ENSMUST00000169329 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
Trim80Q3V061 Phf23-205ENSMUST00000135814 2214 ntTSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
Trim80Q3V061 Cgref1-201ENSMUST00000031051 1442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
Trim80Q3V061 Fam220a-206ENSMUST00000196487 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
Trim80Q3V061 Rras2-201ENSMUST00000069449 2275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
Trim80Q3V061 Kcna7-201ENSMUST00000107774 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
Trim80Q3V061 Dda1-209ENSMUST00000147642 1865 ntTSL 2 BASIC24.85■■□□□ 1.57
Trim80Q3V061 Rnf149-201ENSMUST00000062525 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
Trim80Q3V061 Vsig8-202ENSMUST00000177086 1519 ntTSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
Trim80Q3V061 Tnfsf12-202ENSMUST00000181810 1435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
Trim80Q3V061 E2f1-201ENSMUST00000000894 2755 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
Trim80Q3V061 CT030161.2-201ENSMUST00000218666 735 ntTSL 3 BASIC24.83■■□□□ 1.57
Trim80Q3V061 Gm17494-201ENSMUST00000072769 1800 ntTSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
Trim80Q3V061 Mfsd5-201ENSMUST00000051341 1742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
Trim80Q3V061 Efemp2-201ENSMUST00000070118 1781 ntTSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
Trim80Q3V061 Gpr12-201ENSMUST00000036211 2219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
Trim80Q3V061 E2f6-201ENSMUST00000020908 2418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
Trim80Q3V061 1700016A09Rik-201ENSMUST00000192004 835 ntBASIC24.81■■□□□ 1.56
Trim80Q3V061 Ccdc122-202ENSMUST00000095625 1195 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
Trim80Q3V061 Panx2-202ENSMUST00000161372 2314 ntTSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
Trim80Q3V061 AC150314.2-201ENSMUST00000214135 834 ntTSL 5 BASIC24.8■■□□□ 1.56
Trim80Q3V061 Gm527-203ENSMUST00000220993 1090 ntTSL 5 BASIC24.8■■□□□ 1.56
Trim80Q3V061 Fbll1-201ENSMUST00000160726 1503 ntAPPRIS P1 BASIC24.8■■□□□ 1.56
Trim80Q3V061 Gm266-201ENSMUST00000010673 1215 ntAPPRIS P1 BASIC24.79■■□□□ 1.56
Trim80Q3V061 Gm10762-201ENSMUST00000099385 1133 ntAPPRIS P1 BASIC24.78■■□□□ 1.56
Trim80Q3V061 Zswim5-201ENSMUST00000044823 5582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
Trim80Q3V061 Acvr2b-202ENSMUST00000165044 2093 ntTSL 2 BASIC24.77■■□□□ 1.56
Trim80Q3V061 Cited2-203ENSMUST00000219558 2411 ntAPPRIS P1 BASIC24.75■■□□□ 1.55
Trim80Q3V061 Maz-204ENSMUST00000206254 2282 ntTSL 5 BASIC24.73■■□□□ 1.55
Trim80Q3V061 Lpcat4-201ENSMUST00000028554 2275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
Trim80Q3V061 1190005I06Rik-201ENSMUST00000123927 844 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
Trim80Q3V061 Nrtn-201ENSMUST00000044752 1023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
Trim80Q3V061 Zfp422-201ENSMUST00000057540 2375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
Trim80Q3V061 Peg12-201ENSMUST00000094339 2640 ntAPPRIS P1 BASIC24.72■■□□□ 1.55
Trim80Q3V061 Dennd5a-202ENSMUST00000106722 4862 ntTSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
Trim80Q3V061 Sept11-208ENSMUST00000202308 1792 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.71■■□□□ 1.55
Trim80Q3V061 Heca-201ENSMUST00000037879 5098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
Trim80Q3V061 Klhl35-201ENSMUST00000037359 1954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
Trim80Q3V061 Cebpb-201ENSMUST00000070642 1504 ntAPPRIS P1 BASIC24.71■■□□□ 1.55
Trim80Q3V061 Abhd17a-201ENSMUST00000003436 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
Trim80Q3V061 Tbx1-201ENSMUST00000009241 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
Trim80Q3V061 St7-202ENSMUST00000052113 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
Trim80Q3V061 Clptm1l-201ENSMUST00000022102 2340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
Trim80Q3V061 Tnfsfm13-201ENSMUST00000108649 1049 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.69■■□□□ 1.54
Trim80Q3V061 Eif4e2-203ENSMUST00000113230 1569 ntTSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
Trim80Q3V061 Mrps7-201ENSMUST00000058109 1962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
Trim80Q3V061 Galnt12-202ENSMUST00000107744 2077 ntTSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
Trim80Q3V061 Gas2l1-201ENSMUST00000037146 2686 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
Trim80Q3V061 Dhrs13-203ENSMUST00000122342 1791 ntTSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
Trim80Q3V061 Lrrc4b-201ENSMUST00000058667 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
Trim80Q3V061 Crlf1-201ENSMUST00000008032 1644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
Trim80Q3V061 Snta1-202ENSMUST00000109728 2131 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 114.6 ms