Protein–RNA interactions for Protein: Q3US16

Tceanc, Transcription elongation factor A N-terminal and central domain-containing protein, mousemouse

Predictions only

Length 359 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TceancQ3US16 1190005I06Rik-201ENSMUST00000123927 844 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
TceancQ3US16 Capns1-201ENSMUST00000001845 1600 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC25.72■■□□□ 1.71
TceancQ3US16 A430072P03Rik-201ENSMUST00000161480 1510 ntTSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
TceancQ3US16 Popdc3-201ENSMUST00000019994 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.71
TceancQ3US16 Qrich1-209ENSMUST00000194385 975 ntTSL 2 BASIC25.7■■□□□ 1.7
TceancQ3US16 Snx3-201ENSMUST00000019939 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
TceancQ3US16 Twist1-201ENSMUST00000049089 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
TceancQ3US16 Ccdc9-202ENSMUST00000118976 2175 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
TceancQ3US16 Tbx1-201ENSMUST00000009241 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
TceancQ3US16 5730480H06Rik-201ENSMUST00000030968 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
TceancQ3US16 1810026B05Rik-206ENSMUST00000187421 519 ntTSL 3 BASIC25.65■■□□□ 1.7
TceancQ3US16 Dcaf15-202ENSMUST00000210279 2199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.65■■□□□ 1.7
TceancQ3US16 Tlx3-201ENSMUST00000037746 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.7
TceancQ3US16 Gm45855-201ENSMUST00000212546 880 ntBASIC25.63■■□□□ 1.69
TceancQ3US16 Rundc3a-204ENSMUST00000107105 1861 ntTSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
TceancQ3US16 B4galt7-202ENSMUST00000100764 2195 ntTSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
TceancQ3US16 Ctbp1-201ENSMUST00000079746 2279 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.62■■□□□ 1.69
TceancQ3US16 1810026B05Rik-202ENSMUST00000184554 782 ntTSL 3 BASIC25.62■■□□□ 1.69
TceancQ3US16 Stard3nl-210ENSMUST00000222869 1030 ntTSL 5 BASIC25.62■■□□□ 1.69
TceancQ3US16 Nrtn-201ENSMUST00000044752 1023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.62■■□□□ 1.69
TceancQ3US16 Gm24970-201ENSMUST00000175582 82 ntBASIC25.61■■□□□ 1.69
TceancQ3US16 Suds3-202ENSMUST00000166397 1694 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
TceancQ3US16 Nelfe-204ENSMUST00000173357 1399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
TceancQ3US16 Dlx6os2-201ENSMUST00000178206 1354 ntBASIC25.58■■□□□ 1.69
TceancQ3US16 Il3ra-201ENSMUST00000090591 1614 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.69
TceancQ3US16 Gm43445-201ENSMUST00000198564 2091 ntBASIC25.57■■□□□ 1.68
TceancQ3US16 Gm43863-201ENSMUST00000203822 1192 ntBASIC25.57■■□□□ 1.68
TceancQ3US16 1110008F13Rik-201ENSMUST00000029165 1045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
TceancQ3US16 Aspscr1-201ENSMUST00000026135 1820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
TceancQ3US16 Dpf1-204ENSMUST00000108231 2040 ntTSL 5 BASIC25.57■■□□□ 1.68
TceancQ3US16 Micu3-201ENSMUST00000068999 2219 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.57■■□□□ 1.68
TceancQ3US16 Gm6206-201ENSMUST00000133472 2199 ntBASIC25.56■■□□□ 1.68
TceancQ3US16 2310050C09Rik-201ENSMUST00000163439 1078 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.56■■□□□ 1.68
TceancQ3US16 Upp2-202ENSMUST00000071543 2150 ntTSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
TceancQ3US16 Pth1r-202ENSMUST00000166716 2219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
TceancQ3US16 Fam241a-201ENSMUST00000057198 1607 ntTSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
TceancQ3US16 Cabp1-204ENSMUST00000112113 1621 ntTSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
TceancQ3US16 Smad2-202ENSMUST00000091831 1645 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.55■■□□□ 1.68
TceancQ3US16 Galnt12-201ENSMUST00000045041 2288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
TceancQ3US16 Amigo1-203ENSMUST00000106659 1360 ntTSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
TceancQ3US16 Gm9905-201ENSMUST00000065740 1845 ntBASIC25.52■■□□□ 1.68
TceancQ3US16 Dleu2-206ENSMUST00000182537 318 ntTSL 2 BASIC25.52■■□□□ 1.68
TceancQ3US16 Mthfd2l-203ENSMUST00000202781 688 ntTSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
TceancQ3US16 Cdk2ap1-201ENSMUST00000031341 1315 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
TceancQ3US16 Eid2-201ENSMUST00000059596 1392 ntAPPRIS P1 BASIC25.52■■□□□ 1.68
TceancQ3US16 Stau2-210ENSMUST00000149320 2214 ntTSL 5 BASIC25.51■■□□□ 1.67
TceancQ3US16 Tmem243-201ENSMUST00000115365 1040 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.5■■□□□ 1.67
TceancQ3US16 A530058N18Rik-204ENSMUST00000141209 709 ntTSL 5 BASIC25.5■■□□□ 1.67
TceancQ3US16 Dda1-209ENSMUST00000147642 1865 ntTSL 2 BASIC25.5■■□□□ 1.67
TceancQ3US16 Gm527-203ENSMUST00000220993 1090 ntTSL 5 BASIC25.5■■□□□ 1.67
TceancQ3US16 Hexdc-202ENSMUST00000106117 2149 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
TceancQ3US16 Dtnbp1-201ENSMUST00000072329 1362 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
TceancQ3US16 Sugct-202ENSMUST00000220514 1351 ntTSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.67
TceancQ3US16 Mcat-201ENSMUST00000061882 1893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.67
TceancQ3US16 Clk2-201ENSMUST00000090927 2128 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
TceancQ3US16 C2cd4d-201ENSMUST00000169433 1321 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.45■■□□□ 1.66
TceancQ3US16 Pcgf5-201ENSMUST00000062389 1566 ntTSL 5 BASIC25.45■■□□□ 1.66
TceancQ3US16 4921531C22Rik-201ENSMUST00000150145 1905 ntTSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
TceancQ3US16 Dazap1-202ENSMUST00000105361 1537 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
TceancQ3US16 AC157572.2-201ENSMUST00000226970 908 ntBASIC25.44■■□□□ 1.66
TceancQ3US16 Cpsf4-201ENSMUST00000070487 1606 ntTSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
TceancQ3US16 Dtnb-211ENSMUST00000173240 2218 ntTSL 5 BASIC25.44■■□□□ 1.66
TceancQ3US16 A730013G03Rik-202ENSMUST00000195012 2097 ntBASIC25.43■■□□□ 1.66
TceancQ3US16 Crip2-201ENSMUST00000084882 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
TceancQ3US16 Zfp787-201ENSMUST00000094870 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
TceancQ3US16 Gm17494-201ENSMUST00000072769 1800 ntTSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
TceancQ3US16 C1ql1-201ENSMUST00000057849 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
TceancQ3US16 Cldnd1-201ENSMUST00000023426 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.66
TceancQ3US16 Smarcc2-205ENSMUST00000218228 603 ntTSL 5 BASIC25.39■■□□□ 1.66
TceancQ3US16 Cetn4-201ENSMUST00000071400 1808 ntTSL 5 BASIC25.39■■□□□ 1.65
TceancQ3US16 Galnt12-202ENSMUST00000107744 2077 ntTSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
TceancQ3US16 Tnfsfm13-201ENSMUST00000108649 1049 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.37■■□□□ 1.65
TceancQ3US16 Fgf20-201ENSMUST00000034014 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
TceancQ3US16 Ildr2-205ENSMUST00000193860 2320 ntTSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
TceancQ3US16 Adap1-201ENSMUST00000110865 2557 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.36■■□□□ 1.65
TceancQ3US16 Dazap1-201ENSMUST00000092305 1994 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
TceancQ3US16 Gm20503-201ENSMUST00000174664 1294 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.35■■□□□ 1.65
TceancQ3US16 Gtf2a2-203ENSMUST00000119413 1034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
TceancQ3US16 Fam196a-201ENSMUST00000171394 2490 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.34■■□□□ 1.65
TceancQ3US16 Cdv3-205ENSMUST00000189896 1023 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
TceancQ3US16 Slc16a8-201ENSMUST00000039752 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.64
TceancQ3US16 Tor1a-201ENSMUST00000028200 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
TceancQ3US16 Phf23-205ENSMUST00000135814 2214 ntTSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
TceancQ3US16 Mpp6-203ENSMUST00000166318 2222 ntTSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
TceancQ3US16 Mxra7-202ENSMUST00000047715 757 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
TceancQ3US16 Zmynd12-201ENSMUST00000094819 1464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
TceancQ3US16 Cldn10-203ENSMUST00000100314 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
TceancQ3US16 Dut-202ENSMUST00000082122 1020 ntTSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
TceancQ3US16 Stard10-202ENSMUST00000163799 1723 ntTSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
TceancQ3US16 Clk2-203ENSMUST00000121931 2112 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.29■■□□□ 1.64
TceancQ3US16 Yrdc-201ENSMUST00000102628 1634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
TceancQ3US16 Odc1-201ENSMUST00000171737 2208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
TceancQ3US16 Tspan33-201ENSMUST00000046750 1994 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
TceancQ3US16 Pm20d2-201ENSMUST00000098181 1445 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.28■■□□□ 1.64
TceancQ3US16 Zfp358-201ENSMUST00000061508 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
TceancQ3US16 4930577N17Rik-201ENSMUST00000139771 1625 ntBASIC25.27■■□□□ 1.64
TceancQ3US16 Fam120aos-201ENSMUST00000180775 1780 ntTSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
TceancQ3US16 Rpl19-ps4-201ENSMUST00000167150 625 ntBASIC25.27■■□□□ 1.64
TceancQ3US16 Arl2bp-201ENSMUST00000034228 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
TceancQ3US16 Gng13-201ENSMUST00000115108 347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 16.5 ms