Protein–RNA interactions for Protein: Q3UMU9

Hdgfl2, Hepatoma-derived growth factor-related protein 2, mousemouse

Predictions only

Length 669 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Hdgfl2Q3UMU9 Ywhah-201ENSMUST00000019109 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
Hdgfl2Q3UMU9 Ube2e2-205ENSMUST00000150727 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
Hdgfl2Q3UMU9 Ebag9-203ENSMUST00000227691 1945 ntAPPRIS P1 BASIC24.37■■□□□ 1.49
Hdgfl2Q3UMU9 Phlda1-201ENSMUST00000164773 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
Hdgfl2Q3UMU9 Smad7-202ENSMUST00000168918 1882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
Hdgfl2Q3UMU9 Gm7334-201ENSMUST00000061681 1356 ntAPPRIS P1 BASIC24.35■■□□□ 1.49
Hdgfl2Q3UMU9 Akt1s1-202ENSMUST00000107880 1757 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
Hdgfl2Q3UMU9 Xkr7-201ENSMUST00000037235 2711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
Hdgfl2Q3UMU9 Evx2-202ENSMUST00000173623 1428 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
Hdgfl2Q3UMU9 Sowahd-201ENSMUST00000060057 1574 ntAPPRIS P1 BASIC24.33■■□□□ 1.49
Hdgfl2Q3UMU9 Hoxa13-203ENSMUST00000147595 2395 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC24.33■■□□□ 1.49
Hdgfl2Q3UMU9 6530409C15Rik-202ENSMUST00000143551 1573 ntTSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.48
Hdgfl2Q3UMU9 Rnd2-201ENSMUST00000001347 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
Hdgfl2Q3UMU9 Gm24970-201ENSMUST00000175582 82 ntBASIC24.31■■□□□ 1.48
Hdgfl2Q3UMU9 1810026B05Rik-206ENSMUST00000187421 519 ntTSL 3 BASIC24.31■■□□□ 1.48
Hdgfl2Q3UMU9 Gm29254-202ENSMUST00000189302 883 ntTSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
Hdgfl2Q3UMU9 Cetn4-202ENSMUST00000075537 762 ntTSL 3 BASIC24.31■■□□□ 1.48
Hdgfl2Q3UMU9 Gnas-207ENSMUST00000109085 1789 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
Hdgfl2Q3UMU9 Tmem243-201ENSMUST00000115365 1040 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.29■■□□□ 1.48
Hdgfl2Q3UMU9 Gm2018-201ENSMUST00000140754 478 ntTSL 2 BASIC24.29■■□□□ 1.48
Hdgfl2Q3UMU9 Gm6206-201ENSMUST00000133472 2199 ntBASIC24.29■■□□□ 1.48
Hdgfl2Q3UMU9 Galnt12-201ENSMUST00000045041 2288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
Hdgfl2Q3UMU9 Galnt10-202ENSMUST00000108846 1745 ntTSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
Hdgfl2Q3UMU9 Fcnaos-201ENSMUST00000127642 1351 ntTSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
Hdgfl2Q3UMU9 Znrf3-202ENSMUST00000143746 1022 ntTSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
Hdgfl2Q3UMU9 Ppp1r3e-202ENSMUST00000177403 1957 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.25■■□□□ 1.47
Hdgfl2Q3UMU9 Macrod1-201ENSMUST00000040261 1274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
Hdgfl2Q3UMU9 Hexdc-202ENSMUST00000106117 2149 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
Hdgfl2Q3UMU9 Stard3nl-210ENSMUST00000222869 1030 ntTSL 5 BASIC24.23■■□□□ 1.47
Hdgfl2Q3UMU9 Micu3-201ENSMUST00000068999 2219 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.22■■□□□ 1.47
Hdgfl2Q3UMU9 Hmx1-201ENSMUST00000087674 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
Hdgfl2Q3UMU9 Gm30346-201ENSMUST00000218641 1699 ntBASIC24.21■■□□□ 1.47
Hdgfl2Q3UMU9 Gm527-201ENSMUST00000058135 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.47
Hdgfl2Q3UMU9 Nrep-202ENSMUST00000168890 2185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
Hdgfl2Q3UMU9 Gm9905-201ENSMUST00000065740 1845 ntBASIC24.19■■□□□ 1.46
Hdgfl2Q3UMU9 Uba52-207ENSMUST00000140679 697 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.19■■□□□ 1.46
Hdgfl2Q3UMU9 Hrh3-208ENSMUST00000171736 906 ntTSL 5 BASIC24.19■■□□□ 1.46
Hdgfl2Q3UMU9 Tcte2-204ENSMUST00000130033 1462 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
Hdgfl2Q3UMU9 Ebf4-203ENSMUST00000110288 2982 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.18■■□□□ 1.46
Hdgfl2Q3UMU9 Rtn2-201ENSMUST00000032559 1990 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
Hdgfl2Q3UMU9 Raly-201ENSMUST00000029120 1802 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.17■■□□□ 1.46
Hdgfl2Q3UMU9 Junos-204ENSMUST00000128094 830 ntTSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
Hdgfl2Q3UMU9 Eif4e2-203ENSMUST00000113230 1569 ntTSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
Hdgfl2Q3UMU9 Ywhaq-202ENSMUST00000103002 2110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
Hdgfl2Q3UMU9 Ctbp1-201ENSMUST00000079746 2279 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
Hdgfl2Q3UMU9 Gm9939-201ENSMUST00000067161 1154 ntBASIC24.13■■□□□ 1.45
Hdgfl2Q3UMU9 Pitpna-205ENSMUST00000179445 1665 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.12■■□□□ 1.45
Hdgfl2Q3UMU9 Bcl7c-207ENSMUST00000207019 654 ntTSL 3 BASIC24.12■■□□□ 1.45
Hdgfl2Q3UMU9 Gm43445-201ENSMUST00000198564 2091 ntBASIC24.11■■□□□ 1.45
Hdgfl2Q3UMU9 Rnf220-212ENSMUST00000221654 1949 ntTSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
Hdgfl2Q3UMU9 Gjc1-201ENSMUST00000068933 1903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
Hdgfl2Q3UMU9 Cebpb-201ENSMUST00000070642 1504 ntAPPRIS P1 BASIC24.1■■□□□ 1.45
Hdgfl2Q3UMU9 Zfyve21-201ENSMUST00000021714 1308 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
Hdgfl2Q3UMU9 Ttc19-202ENSMUST00000101075 2193 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
Hdgfl2Q3UMU9 Crem-227ENSMUST00000149803 1422 ntTSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
Hdgfl2Q3UMU9 Gm8503-201ENSMUST00000118131 455 ntBASIC24.08■■□□□ 1.45
Hdgfl2Q3UMU9 Mef2a-201ENSMUST00000032776 2476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
Hdgfl2Q3UMU9 Mrps7-201ENSMUST00000058109 1962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
Hdgfl2Q3UMU9 En1-201ENSMUST00000079721 2624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
Hdgfl2Q3UMU9 Egr3-201ENSMUST00000035908 1509 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
Hdgfl2Q3UMU9 Naa20-201ENSMUST00000002805 1172 ntTSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
Hdgfl2Q3UMU9 Gm15672-201ENSMUST00000151512 1354 ntTSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
Hdgfl2Q3UMU9 Pfdn2-202ENSMUST00000135941 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
Hdgfl2Q3UMU9 AC158592.1-201ENSMUST00000215560 1113 ntTSL 5 BASIC24.03■■□□□ 1.44
Hdgfl2Q3UMU9 Triobp-206ENSMUST00000130663 1660 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.02■■□□□ 1.44
Hdgfl2Q3UMU9 Scx-201ENSMUST00000043089 1136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
Hdgfl2Q3UMU9 Cldnd1-201ENSMUST00000023426 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
Hdgfl2Q3UMU9 Ildr2-205ENSMUST00000193860 2320 ntTSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
Hdgfl2Q3UMU9 4930542C12Rik-201ENSMUST00000171096 1203 ntBASIC24■■□□□ 1.43
Hdgfl2Q3UMU9 Zswim6-201ENSMUST00000105097 5456 ntTSL 5 BASIC24■■□□□ 1.43
Hdgfl2Q3UMU9 Srp9-201ENSMUST00000027792 1367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
Hdgfl2Q3UMU9 Twist1-201ENSMUST00000049089 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
Hdgfl2Q3UMU9 Gm17110-201ENSMUST00000171248 735 ntTSL 3 BASIC23.99■■□□□ 1.43
Hdgfl2Q3UMU9 Zfp787-201ENSMUST00000094870 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
Hdgfl2Q3UMU9 Tmem189-201ENSMUST00000006587 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
Hdgfl2Q3UMU9 Kmt5a-202ENSMUST00000100709 1425 ntTSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
Hdgfl2Q3UMU9 Gm6821-201ENSMUST00000107540 542 ntBASIC23.97■■□□□ 1.43
Hdgfl2Q3UMU9 Cnnm3-201ENSMUST00000001166 5193 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
Hdgfl2Q3UMU9 Dlx6os2-201ENSMUST00000178206 1354 ntBASIC23.97■■□□□ 1.43
Hdgfl2Q3UMU9 Tbcel-204ENSMUST00000128959 1535 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.95■■□□□ 1.43
Hdgfl2Q3UMU9 A430072P03Rik-201ENSMUST00000161480 1510 ntTSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.43
Hdgfl2Q3UMU9 Stradb-202ENSMUST00000114296 1348 ntTSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
Hdgfl2Q3UMU9 Runx3-202ENSMUST00000119564 1855 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
Hdgfl2Q3UMU9 Dapk3-202ENSMUST00000178422 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
Hdgfl2Q3UMU9 Gsk3a-201ENSMUST00000071739 2260 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC23.95■■□□□ 1.42
Hdgfl2Q3UMU9 Ssbp3-202ENSMUST00000072753 1924 ntTSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
Hdgfl2Q3UMU9 Eif5a-201ENSMUST00000043419 1437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
Hdgfl2Q3UMU9 Fam69b-201ENSMUST00000074240 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
Hdgfl2Q3UMU9 Susd4-202ENSMUST00000153348 1898 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.93■■□□□ 1.42
Hdgfl2Q3UMU9 Rab2a-201ENSMUST00000060232 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
Hdgfl2Q3UMU9 Rheb-201ENSMUST00000030787 1784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
Hdgfl2Q3UMU9 Mfsd5-201ENSMUST00000051341 1742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
Hdgfl2Q3UMU9 Gm43863-201ENSMUST00000203822 1192 ntBASIC23.92■■□□□ 1.42
Hdgfl2Q3UMU9 Smarcc1-203ENSMUST00000197480 1949 ntTSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
Hdgfl2Q3UMU9 Pdia5-201ENSMUST00000023550 1808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
Hdgfl2Q3UMU9 Gm6345-201ENSMUST00000180378 1691 ntBASIC23.91■■□□□ 1.42
Hdgfl2Q3UMU9 Arl2bp-201ENSMUST00000034228 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
Hdgfl2Q3UMU9 Dlg1-203ENSMUST00000100001 4711 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.9■■□□□ 1.42
Hdgfl2Q3UMU9 Anapc11-202ENSMUST00000093140 962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
Hdgfl2Q3UMU9 A530058N18Rik-208ENSMUST00000131299 1387 ntTSL 2 BASIC23.9■■□□□ 1.42
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 75.3 ms