Protein–RNA interactions for Protein: Q3U0K8

Ogfod1, Prolyl 3-hydroxylase OGFOD1, mousemouse

Predictions only

Length 545 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ogfod1Q3U0K8 Gm7334-201ENSMUST00000061681 1356 ntAPPRIS P1 BASIC27.63■■■□□ 2.01
Ogfod1Q3U0K8 Gm6345-201ENSMUST00000180378 1691 ntBASIC27.63■■■□□ 2.01
Ogfod1Q3U0K8 Runx3-202ENSMUST00000119564 1855 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.62■■■□□ 2.01
Ogfod1Q3U0K8 Macrod1-201ENSMUST00000040261 1274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.62■■■□□ 2.01
Ogfod1Q3U0K8 Cib1-201ENSMUST00000065163 1047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.62■■■□□ 2.01
Ogfod1Q3U0K8 Evx2-202ENSMUST00000173623 1428 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.61■■■□□ 2.01
Ogfod1Q3U0K8 Dlx6os2-201ENSMUST00000178206 1354 ntBASIC27.6■■■□□ 2.01
Ogfod1Q3U0K8 Mfsd5-201ENSMUST00000051341 1742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.59■■■□□ 2.01
Ogfod1Q3U0K8 Gm12523-201ENSMUST00000148844 599 ntTSL 5 BASIC27.59■■■□□ 2.01
Ogfod1Q3U0K8 Twist1-201ENSMUST00000049089 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.59■■■□□ 2.01
Ogfod1Q3U0K8 Hmx1-201ENSMUST00000087674 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.58■■■□□ 2.01
Ogfod1Q3U0K8 Pfdn2-202ENSMUST00000135941 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.58■■■□□ 2.01
Ogfod1Q3U0K8 Susd4-202ENSMUST00000153348 1898 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.57■■■□□ 2
Ogfod1Q3U0K8 Raly-201ENSMUST00000029120 1802 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.57■■■□□ 2
Ogfod1Q3U0K8 Gm5814-201ENSMUST00000177586 378 ntAPPRIS P1 BASIC27.56■■■□□ 2
Ogfod1Q3U0K8 Mrps7-201ENSMUST00000058109 1962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.54■■■□□ 2
Ogfod1Q3U0K8 Zxda-201ENSMUST00000117281 2621 ntBASIC27.54■■■□□ 2
Ogfod1Q3U0K8 Ppp1r3e-202ENSMUST00000177403 1957 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.53■■■□□ 2
Ogfod1Q3U0K8 AY074887-201ENSMUST00000054018 769 ntAPPRIS P1 BASIC27.51■■□□□ 1.99
Ogfod1Q3U0K8 Rnf220-212ENSMUST00000221654 1949 ntTSL 1 (best) BASIC27.5■■□□□ 1.99
Ogfod1Q3U0K8 Gm43863-201ENSMUST00000203822 1192 ntBASIC27.5■■□□□ 1.99
Ogfod1Q3U0K8 Ywhaq-202ENSMUST00000103002 2110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.5■■□□□ 1.99
Ogfod1Q3U0K8 Guf1-201ENSMUST00000031113 1769 ntTSL 1 (best) BASIC27.48■■□□□ 1.99
Ogfod1Q3U0K8 Dapk3-202ENSMUST00000178422 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.47■■□□□ 1.99
Ogfod1Q3U0K8 Upp2-202ENSMUST00000071543 2150 ntTSL 1 (best) BASIC27.47■■□□□ 1.99
Ogfod1Q3U0K8 Pth1r-202ENSMUST00000166716 2219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.47■■□□□ 1.99
Ogfod1Q3U0K8 Srp9-201ENSMUST00000027792 1367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.46■■□□□ 1.99
Ogfod1Q3U0K8 Ssbp3-202ENSMUST00000072753 1924 ntTSL 1 (best) BASIC27.45■■□□□ 1.99
Ogfod1Q3U0K8 Smarcc1-203ENSMUST00000197480 1949 ntTSL 1 (best) BASIC27.43■■□□□ 1.98
Ogfod1Q3U0K8 Tcte2-204ENSMUST00000130033 1462 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.43■■□□□ 1.98
Ogfod1Q3U0K8 Galnt12-201ENSMUST00000045041 2288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.41■■□□□ 1.98
Ogfod1Q3U0K8 Gm9939-201ENSMUST00000067161 1154 ntBASIC27.41■■□□□ 1.98
Ogfod1Q3U0K8 Gm15672-201ENSMUST00000151512 1354 ntTSL 1 (best) BASIC27.4■■□□□ 1.98
Ogfod1Q3U0K8 Fam196a-201ENSMUST00000171394 2490 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.4■■□□□ 1.98
Ogfod1Q3U0K8 Bcl7c-207ENSMUST00000207019 654 ntTSL 3 BASIC27.4■■□□□ 1.98
Ogfod1Q3U0K8 Fam69b-201ENSMUST00000074240 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.39■■□□□ 1.98
Ogfod1Q3U0K8 Ube2e2-205ENSMUST00000150727 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.39■■□□□ 1.98
Ogfod1Q3U0K8 Gm6206-201ENSMUST00000133472 2199 ntBASIC27.39■■□□□ 1.97
Ogfod1Q3U0K8 Ctbp1-201ENSMUST00000079746 2279 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.38■■□□□ 1.97
Ogfod1Q3U0K8 2310050C09Rik-201ENSMUST00000163439 1078 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.38■■□□□ 1.97
Ogfod1Q3U0K8 Pdia5-201ENSMUST00000023550 1808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.38■■□□□ 1.97
Ogfod1Q3U0K8 Gm9905-201ENSMUST00000065740 1845 ntBASIC27.38■■□□□ 1.97
Ogfod1Q3U0K8 Hexdc-202ENSMUST00000106117 2149 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.37■■□□□ 1.97
Ogfod1Q3U0K8 A530058N18Rik-204ENSMUST00000141209 709 ntTSL 5 BASIC27.35■■□□□ 1.97
Ogfod1Q3U0K8 Gm29254-202ENSMUST00000189302 883 ntTSL 1 (best) BASIC27.35■■□□□ 1.97
Ogfod1Q3U0K8 Scx-201ENSMUST00000043089 1136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.35■■□□□ 1.97
Ogfod1Q3U0K8 Gm43445-201ENSMUST00000198564 2091 ntBASIC27.34■■□□□ 1.97
Ogfod1Q3U0K8 Crem-227ENSMUST00000149803 1422 ntTSL 1 (best) BASIC27.34■■□□□ 1.97
Ogfod1Q3U0K8 Micu3-201ENSMUST00000068999 2219 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.34■■□□□ 1.97
Ogfod1Q3U0K8 Pitpna-205ENSMUST00000179445 1665 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC27.33■■□□□ 1.97
Ogfod1Q3U0K8 Efemp2-201ENSMUST00000070118 1781 ntTSL 1 (best) BASIC27.32■■□□□ 1.96
Ogfod1Q3U0K8 Cdv3-205ENSMUST00000189896 1023 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.32■■□□□ 1.96
Ogfod1Q3U0K8 Egr3-201ENSMUST00000035908 1509 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.31■■□□□ 1.96
Ogfod1Q3U0K8 Eif5a-201ENSMUST00000043419 1437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.31■■□□□ 1.96
Ogfod1Q3U0K8 Ttc19-202ENSMUST00000101075 2193 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.31■■□□□ 1.96
Ogfod1Q3U0K8 Il3ra-201ENSMUST00000090591 1614 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.3■■□□□ 1.96
Ogfod1Q3U0K8 AC157572.2-201ENSMUST00000226970 908 ntBASIC27.29■■□□□ 1.96
Ogfod1Q3U0K8 B4galt7-202ENSMUST00000100764 2195 ntTSL 1 (best) BASIC27.28■■□□□ 1.96
Ogfod1Q3U0K8 Rundc3a-204ENSMUST00000107105 1861 ntTSL 1 (best) BASIC27.28■■□□□ 1.96
Ogfod1Q3U0K8 Rheb-201ENSMUST00000030787 1784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.28■■□□□ 1.96
Ogfod1Q3U0K8 Gm2018-201ENSMUST00000140754 478 ntTSL 2 BASIC27.26■■□□□ 1.95
Ogfod1Q3U0K8 Dleu2-206ENSMUST00000182537 318 ntTSL 2 BASIC27.26■■□□□ 1.95
Ogfod1Q3U0K8 Tcte3-201ENSMUST00000040746 788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.26■■□□□ 1.95
Ogfod1Q3U0K8 Tcte3-202ENSMUST00000097398 632 ntTSL 1 (best) BASIC27.26■■□□□ 1.95
Ogfod1Q3U0K8 Tbx1-201ENSMUST00000009241 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.26■■□□□ 1.95
Ogfod1Q3U0K8 Triobp-206ENSMUST00000130663 1660 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.25■■□□□ 1.95
Ogfod1Q3U0K8 Gm6821-201ENSMUST00000107540 542 ntBASIC27.23■■□□□ 1.95
Ogfod1Q3U0K8 Gm8503-201ENSMUST00000118131 455 ntBASIC27.23■■□□□ 1.95
Ogfod1Q3U0K8 Eid2-201ENSMUST00000059596 1392 ntAPPRIS P1 BASIC27.22■■□□□ 1.95
Ogfod1Q3U0K8 Cldnd1-201ENSMUST00000023426 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.22■■□□□ 1.95
Ogfod1Q3U0K8 Uba52-205ENSMUST00000129909 705 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.22■■□□□ 1.95
Ogfod1Q3U0K8 Uba52-207ENSMUST00000140679 697 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.22■■□□□ 1.95
Ogfod1Q3U0K8 Adap1-201ENSMUST00000110865 2557 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.22■■□□□ 1.95
Ogfod1Q3U0K8 Dazap1-202ENSMUST00000105361 1537 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.21■■□□□ 1.95
Ogfod1Q3U0K8 4930542C12Rik-201ENSMUST00000171096 1203 ntBASIC27.21■■□□□ 1.95
Ogfod1Q3U0K8 Rbms1-202ENSMUST00000112509 1806 ntTSL 1 (best) BASIC27.2■■□□□ 1.95
Ogfod1Q3U0K8 Kmt5a-202ENSMUST00000100709 1425 ntTSL 1 (best) BASIC27.2■■□□□ 1.94
Ogfod1Q3U0K8 A430072P03Rik-201ENSMUST00000161480 1510 ntTSL 1 (best) BASIC27.2■■□□□ 1.94
Ogfod1Q3U0K8 Gm5987-201ENSMUST00000196433 1151 ntBASIC27.19■■□□□ 1.94
Ogfod1Q3U0K8 Naa20-201ENSMUST00000002805 1172 ntTSL 1 (best) BASIC27.19■■□□□ 1.94
Ogfod1Q3U0K8 Zfp787-201ENSMUST00000094870 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.19■■□□□ 1.94
Ogfod1Q3U0K8 Fkbp8-202ENSMUST00000119353 1720 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.17■■□□□ 1.94
Ogfod1Q3U0K8 Dpf1-204ENSMUST00000108231 2040 ntTSL 5 BASIC27.17■■□□□ 1.94
Ogfod1Q3U0K8 Nelfe-204ENSMUST00000173357 1399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.16■■□□□ 1.94
Ogfod1Q3U0K8 Aspscr1-201ENSMUST00000026135 1820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.16■■□□□ 1.94
Ogfod1Q3U0K8 Zfyve21-201ENSMUST00000021714 1308 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.16■■□□□ 1.94
Ogfod1Q3U0K8 Dcaf15-202ENSMUST00000210279 2199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.15■■□□□ 1.94
Ogfod1Q3U0K8 Popdc3-201ENSMUST00000019994 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.15■■□□□ 1.94
Ogfod1Q3U0K8 Tbcel-204ENSMUST00000128959 1535 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.14■■□□□ 1.94
Ogfod1Q3U0K8 4921531C22Rik-201ENSMUST00000150145 1905 ntTSL 1 (best) BASIC27.14■■□□□ 1.93
Ogfod1Q3U0K8 Tceal5-201ENSMUST00000066819 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.13■■□□□ 1.93
Ogfod1Q3U0K8 Stard3nl-201ENSMUST00000039694 1327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.13■■□□□ 1.93
Ogfod1Q3U0K8 Rbm17-201ENSMUST00000040314 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.12■■□□□ 1.93
Ogfod1Q3U0K8 Ildr2-205ENSMUST00000193860 2320 ntTSL 1 (best) BASIC27.1■■□□□ 1.93
Ogfod1Q3U0K8 Dda1-209ENSMUST00000147642 1865 ntTSL 2 BASIC27.09■■□□□ 1.93
Ogfod1Q3U0K8 A530058N18Rik-208ENSMUST00000131299 1387 ntTSL 2 BASIC27.09■■□□□ 1.93
Ogfod1Q3U0K8 Fam241a-201ENSMUST00000057198 1607 ntTSL 1 (best) BASIC27.08■■□□□ 1.93
Ogfod1Q3U0K8 Clk2-201ENSMUST00000090927 2128 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.08■■□□□ 1.93
Ogfod1Q3U0K8 Cpsf4-201ENSMUST00000070487 1606 ntTSL 1 (best) BASIC27.08■■□□□ 1.93
Ogfod1Q3U0K8 Cetn4-201ENSMUST00000071400 1808 ntTSL 5 BASIC27.07■■□□□ 1.92
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 9.3 ms