Protein–RNA interactions for Protein: Q3TS39

1700066B19Rik, RIKEN cDNA 1700066B19 gene, mousemouse

Predictions only

Length 127 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
1700066B19RikQ3TS39 Dcaf15-202ENSMUST00000210279 2199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
1700066B19RikQ3TS39 Ildr2-205ENSMUST00000193860 2320 ntTSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
1700066B19RikQ3TS39 Kmt5a-202ENSMUST00000100709 1425 ntTSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
1700066B19RikQ3TS39 Crem-227ENSMUST00000149803 1422 ntTSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
1700066B19RikQ3TS39 Tmeff1-202ENSMUST00000123476 1224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
1700066B19RikQ3TS39 CT030161.2-201ENSMUST00000218666 735 ntTSL 3 BASIC23.25■■□□□ 1.31
1700066B19RikQ3TS39 Fkbp8-202ENSMUST00000119353 1720 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
1700066B19RikQ3TS39 Rbm17-201ENSMUST00000040314 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
1700066B19RikQ3TS39 Fam241a-201ENSMUST00000057198 1607 ntTSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
1700066B19RikQ3TS39 Snx3-201ENSMUST00000019939 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
1700066B19RikQ3TS39 Dtnb-211ENSMUST00000173240 2218 ntTSL 5 BASIC23.23■■□□□ 1.31
1700066B19RikQ3TS39 Clk2-201ENSMUST00000090927 2128 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
1700066B19RikQ3TS39 Smad2-202ENSMUST00000091831 1645 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.22■■□□□ 1.31
1700066B19RikQ3TS39 Gm527-201ENSMUST00000058135 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
1700066B19RikQ3TS39 Gm17494-201ENSMUST00000072769 1800 ntTSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
1700066B19RikQ3TS39 Clk2-203ENSMUST00000121931 2112 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.21■■□□□ 1.31
1700066B19RikQ3TS39 A530058N18Rik-208ENSMUST00000131299 1387 ntTSL 2 BASIC23.2■■□□□ 1.3
1700066B19RikQ3TS39 Gm15672-201ENSMUST00000151512 1354 ntTSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
1700066B19RikQ3TS39 Mpp6-203ENSMUST00000166318 2222 ntTSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
1700066B19RikQ3TS39 Hrh3-208ENSMUST00000171736 906 ntTSL 5 BASIC23.18■■□□□ 1.3
1700066B19RikQ3TS39 A430072P03Rik-201ENSMUST00000161480 1510 ntTSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
1700066B19RikQ3TS39 Gm10762-201ENSMUST00000099385 1133 ntAPPRIS P1 BASIC23.17■■□□□ 1.3
1700066B19RikQ3TS39 5730480H06Rik-201ENSMUST00000030968 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
1700066B19RikQ3TS39 Stau2-210ENSMUST00000149320 2214 ntTSL 5 BASIC23.16■■□□□ 1.3
1700066B19RikQ3TS39 Zfp131-206ENSMUST00000223813 2561 ntAPPRIS P3 BASIC23.16■■□□□ 1.3
1700066B19RikQ3TS39 Suds3-202ENSMUST00000166397 1694 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
1700066B19RikQ3TS39 A730013G03Rik-202ENSMUST00000195012 2097 ntBASIC23.15■■□□□ 1.3
1700066B19RikQ3TS39 Tlx3-201ENSMUST00000037746 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
1700066B19RikQ3TS39 Eif2ak3-204ENSMUST00000162950 927 ntTSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
1700066B19RikQ3TS39 Kdm2a-203ENSMUST00000116571 2413 ntTSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
1700066B19RikQ3TS39 Zfp358-201ENSMUST00000061508 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
1700066B19RikQ3TS39 Junos-204ENSMUST00000128094 830 ntTSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
1700066B19RikQ3TS39 Tmem189-201ENSMUST00000006587 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
1700066B19RikQ3TS39 Rab2a-201ENSMUST00000060232 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
1700066B19RikQ3TS39 Adgrb2-207ENSMUST00000120204 5170 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
1700066B19RikQ3TS39 Fbxo6-201ENSMUST00000030858 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
1700066B19RikQ3TS39 Galnt12-202ENSMUST00000107744 2077 ntTSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
1700066B19RikQ3TS39 Gsk3a-201ENSMUST00000071739 2260 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC23.1■■□□□ 1.29
1700066B19RikQ3TS39 Caap1-201ENSMUST00000030313 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
1700066B19RikQ3TS39 Srp9-201ENSMUST00000027792 1367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
1700066B19RikQ3TS39 Nelfe-204ENSMUST00000173357 1399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
1700066B19RikQ3TS39 Ssx2ip-202ENSMUST00000106149 2416 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
1700066B19RikQ3TS39 Cabp1-204ENSMUST00000112113 1621 ntTSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
1700066B19RikQ3TS39 Phf23-205ENSMUST00000135814 2214 ntTSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
1700066B19RikQ3TS39 Rras2-201ENSMUST00000069449 2275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
1700066B19RikQ3TS39 Zfp131-205ENSMUST00000223812 663 ntBASIC23.05■■□□□ 1.28
1700066B19RikQ3TS39 1700016A09Rik-201ENSMUST00000192004 835 ntBASIC23.04■■□□□ 1.28
1700066B19RikQ3TS39 Dedd-201ENSMUST00000064950 1618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
1700066B19RikQ3TS39 Mcat-201ENSMUST00000061882 1893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
1700066B19RikQ3TS39 E030037K01Rik-201ENSMUST00000180928 1756 ntBASIC23.03■■□□□ 1.28
1700066B19RikQ3TS39 Dazap1-201ENSMUST00000092305 1994 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
1700066B19RikQ3TS39 Gm960-202ENSMUST00000177696 2262 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.02■■□□□ 1.28
1700066B19RikQ3TS39 Amer2-203ENSMUST00000225247 2662 ntBASIC23.02■■□□□ 1.28
1700066B19RikQ3TS39 Terf2-201ENSMUST00000068388 1915 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
1700066B19RikQ3TS39 March2-205ENSMUST00000173015 1418 ntTSL 3 BASIC23.01■■□□□ 1.27
1700066B19RikQ3TS39 Mypop-203ENSMUST00000131087 1951 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23■■□□□ 1.27
1700066B19RikQ3TS39 Mogs-201ENSMUST00000032114 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
1700066B19RikQ3TS39 Dapk3-201ENSMUST00000047665 1676 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23■■□□□ 1.27
1700066B19RikQ3TS39 Eif4ebp1-201ENSMUST00000033880 1997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
1700066B19RikQ3TS39 Pcgf5-201ENSMUST00000062389 1566 ntTSL 5 BASIC22.98■■□□□ 1.27
1700066B19RikQ3TS39 Cldn10-203ENSMUST00000100314 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
1700066B19RikQ3TS39 Rtn2-201ENSMUST00000032559 1990 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
1700066B19RikQ3TS39 C1ql1-201ENSMUST00000057849 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
1700066B19RikQ3TS39 Tor1a-201ENSMUST00000028200 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
1700066B19RikQ3TS39 Zxdb-201ENSMUST00000101388 5619 ntAPPRIS P1 BASIC22.95■■□□□ 1.26
1700066B19RikQ3TS39 Amigo1-203ENSMUST00000106659 1360 ntTSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
1700066B19RikQ3TS39 BC037032-205ENSMUST00000187080 508 ntTSL 5 BASIC22.95■■□□□ 1.26
1700066B19RikQ3TS39 Tdp2-203ENSMUST00000223804 1136 ntBASIC22.95■■□□□ 1.26
1700066B19RikQ3TS39 Hdgf-201ENSMUST00000005017 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
1700066B19RikQ3TS39 Grb2-202ENSMUST00000106495 2041 ntTSL 5 BASIC22.94■■□□□ 1.26
1700066B19RikQ3TS39 Pard6a-205ENSMUST00000212430 1261 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
1700066B19RikQ3TS39 Ppp1r14c-202ENSMUST00000217573 2013 ntTSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
1700066B19RikQ3TS39 Odc1-201ENSMUST00000171737 2208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
1700066B19RikQ3TS39 Il3ra-201ENSMUST00000090591 1614 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
1700066B19RikQ3TS39 Kansl2-202ENSMUST00000116400 2110 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
1700066B19RikQ3TS39 Tspan33-201ENSMUST00000046750 1994 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
1700066B19RikQ3TS39 Mat2b-201ENSMUST00000040167 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
1700066B19RikQ3TS39 1700069B07Rik-202ENSMUST00000191155 939 ntBASIC22.92■■□□□ 1.26
1700066B19RikQ3TS39 Twist1-201ENSMUST00000049089 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
1700066B19RikQ3TS39 Klhl35-201ENSMUST00000037359 1954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
1700066B19RikQ3TS39 Sugct-202ENSMUST00000220514 1351 ntTSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
1700066B19RikQ3TS39 Plin1-206ENSMUST00000205915 2817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
1700066B19RikQ3TS39 Slc16a8-201ENSMUST00000039752 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
1700066B19RikQ3TS39 Gm9397-201ENSMUST00000200125 605 ntBASIC22.9■■□□□ 1.26
1700066B19RikQ3TS39 Terf2-203ENSMUST00000116425 2471 ntTSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
1700066B19RikQ3TS39 Gsk3a-202ENSMUST00000108411 2248 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.9■■□□□ 1.26
1700066B19RikQ3TS39 Capns1-201ENSMUST00000001845 1600 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.9■■□□□ 1.26
1700066B19RikQ3TS39 Eid2-201ENSMUST00000059596 1392 ntAPPRIS P1 BASIC22.89■■□□□ 1.26
1700066B19RikQ3TS39 Fam120aos-201ENSMUST00000180775 1780 ntTSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.26
1700066B19RikQ3TS39 Rtn4r-201ENSMUST00000059589 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
1700066B19RikQ3TS39 Gm43863-201ENSMUST00000203822 1192 ntBASIC22.88■■□□□ 1.25
1700066B19RikQ3TS39 Cpsf4-201ENSMUST00000070487 1606 ntTSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
1700066B19RikQ3TS39 Yrdc-201ENSMUST00000102628 1634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
1700066B19RikQ3TS39 Hsd17b11-201ENSMUST00000031251 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
1700066B19RikQ3TS39 Nucks1-203ENSMUST00000189946 2375 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
1700066B19RikQ3TS39 Fezf2-202ENSMUST00000224023 1917 ntBASIC22.86■■□□□ 1.25
1700066B19RikQ3TS39 Mpp6-202ENSMUST00000036236 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
1700066B19RikQ3TS39 Stard10-202ENSMUST00000163799 1723 ntTSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
1700066B19RikQ3TS39 St7-202ENSMUST00000052113 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
1700066B19RikQ3TS39 Slc35a3-202ENSMUST00000120120 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 9.6 ms