Protein–RNA interactions for Protein: Q3TNA1

Xylb, Xylulose kinase, mousemouse

Predictions only

Length 551 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
XylbQ3TNA1 Macrod2-205ENSMUST00000110063 845 ntTSL 5 BASIC21.8■■□□□ 1.08
XylbQ3TNA1 Znrf3-202ENSMUST00000143746 1022 ntTSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
XylbQ3TNA1 Dda1-209ENSMUST00000147642 1865 ntTSL 2 BASIC21.79■■□□□ 1.08
XylbQ3TNA1 Arl2bp-201ENSMUST00000034228 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
XylbQ3TNA1 4921531C22Rik-201ENSMUST00000150145 1905 ntTSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
XylbQ3TNA1 Macrod1-201ENSMUST00000040261 1274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
XylbQ3TNA1 Dpf1-204ENSMUST00000108231 2040 ntTSL 5 BASIC21.77■■□□□ 1.07
XylbQ3TNA1 A530058N18Rik-207ENSMUST00000152254 1211 ntTSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
XylbQ3TNA1 Srsf9-201ENSMUST00000031513 1162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
XylbQ3TNA1 Aard-201ENSMUST00000090025 1348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
XylbQ3TNA1 Cbln1-201ENSMUST00000034076 2800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
XylbQ3TNA1 1700028N14Rik-201ENSMUST00000139621 747 ntTSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
XylbQ3TNA1 Cetn4-201ENSMUST00000071400 1808 ntTSL 5 BASIC21.75■■□□□ 1.07
XylbQ3TNA1 Dtnb-211ENSMUST00000173240 2218 ntTSL 5 BASIC21.75■■□□□ 1.07
XylbQ3TNA1 Rbms1-202ENSMUST00000112509 1806 ntTSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
XylbQ3TNA1 Aspscr1-201ENSMUST00000026135 1820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
XylbQ3TNA1 Fam60a-203ENSMUST00000111562 906 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.74■■□□□ 1.07
XylbQ3TNA1 Pradc1-202ENSMUST00000113770 610 ntTSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
XylbQ3TNA1 Popdc3-201ENSMUST00000019994 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
XylbQ3TNA1 Triobp-206ENSMUST00000130663 1660 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.73■■□□□ 1.07
XylbQ3TNA1 Egr3-201ENSMUST00000035908 1509 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
XylbQ3TNA1 Clk2-203ENSMUST00000121931 2112 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.73■■□□□ 1.07
XylbQ3TNA1 Dcaf15-202ENSMUST00000210279 2199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
XylbQ3TNA1 Clk2-201ENSMUST00000090927 2128 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
XylbQ3TNA1 Ccdc122-202ENSMUST00000095625 1195 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
XylbQ3TNA1 Hoxa13-201ENSMUST00000047993 1309 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.72■■□□□ 1.07
XylbQ3TNA1 Crem-227ENSMUST00000149803 1422 ntTSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
XylbQ3TNA1 Gm17494-201ENSMUST00000072769 1800 ntTSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
XylbQ3TNA1 Ppp1r14c-202ENSMUST00000217573 2013 ntTSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
XylbQ3TNA1 Tbcel-204ENSMUST00000128959 1535 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.7■■□□□ 1.07
XylbQ3TNA1 Fam241a-201ENSMUST00000057198 1607 ntTSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
XylbQ3TNA1 Mpp6-203ENSMUST00000166318 2222 ntTSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
XylbQ3TNA1 2210008F06Rik-201ENSMUST00000180805 1082 ntTSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
XylbQ3TNA1 Tmem189-201ENSMUST00000006587 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
XylbQ3TNA1 Zfp513-202ENSMUST00000114590 2228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
XylbQ3TNA1 Smad2-202ENSMUST00000091831 1645 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.69■■□□□ 1.06
XylbQ3TNA1 Kdm2a-203ENSMUST00000116571 2413 ntTSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
XylbQ3TNA1 Kmt5a-202ENSMUST00000100709 1425 ntTSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
XylbQ3TNA1 Plekha3-201ENSMUST00000111920 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
XylbQ3TNA1 Tmeff1-202ENSMUST00000123476 1224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
XylbQ3TNA1 CT030161.2-201ENSMUST00000218666 735 ntTSL 3 BASIC21.67■■□□□ 1.06
XylbQ3TNA1 Rbm17-201ENSMUST00000040314 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
XylbQ3TNA1 Fkbp8-202ENSMUST00000119353 1720 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
XylbQ3TNA1 Dyrk1a-202ENSMUST00000119878 5759 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.66■■□□□ 1.06
XylbQ3TNA1 Cnnm3-201ENSMUST00000001166 5193 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
XylbQ3TNA1 Gm527-201ENSMUST00000058135 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
XylbQ3TNA1 Snx3-201ENSMUST00000019939 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
XylbQ3TNA1 Cldn10-203ENSMUST00000100314 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
XylbQ3TNA1 Gsk3a-201ENSMUST00000071739 2260 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC21.64■■□□□ 1.05
XylbQ3TNA1 Zfp358-201ENSMUST00000061508 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
XylbQ3TNA1 A430072P03Rik-201ENSMUST00000161480 1510 ntTSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
XylbQ3TNA1 A730013G03Rik-202ENSMUST00000195012 2097 ntBASIC21.63■■□□□ 1.05
XylbQ3TNA1 A530058N18Rik-208ENSMUST00000131299 1387 ntTSL 2 BASIC21.62■■□□□ 1.05
XylbQ3TNA1 Gm15672-201ENSMUST00000151512 1354 ntTSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
XylbQ3TNA1 Eif2ak3-204ENSMUST00000162950 927 ntTSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
XylbQ3TNA1 Ryk-201ENSMUST00000035142 2852 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
XylbQ3TNA1 Galnt12-202ENSMUST00000107744 2077 ntTSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
XylbQ3TNA1 Hrh3-208ENSMUST00000171736 906 ntTSL 5 BASIC21.61■■□□□ 1.05
XylbQ3TNA1 5730480H06Rik-201ENSMUST00000030968 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
XylbQ3TNA1 Ier5l-201ENSMUST00000065134 2683 ntAPPRIS P1 BASIC21.61■■□□□ 1.05
XylbQ3TNA1 Ssx2ip-202ENSMUST00000106149 2416 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
XylbQ3TNA1 Stau2-210ENSMUST00000149320 2214 ntTSL 5 BASIC21.6■■□□□ 1.05
XylbQ3TNA1 Sec63-201ENSMUST00000019937 6032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
XylbQ3TNA1 Amer2-203ENSMUST00000225247 2662 ntBASIC21.59■■□□□ 1.05
XylbQ3TNA1 Gm10762-201ENSMUST00000099385 1133 ntAPPRIS P1 BASIC21.58■■□□□ 1.05
XylbQ3TNA1 Suds3-202ENSMUST00000166397 1694 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
XylbQ3TNA1 Caap1-201ENSMUST00000030313 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.04
XylbQ3TNA1 Fbxo6-201ENSMUST00000030858 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
XylbQ3TNA1 Rras2-201ENSMUST00000069449 2275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
XylbQ3TNA1 Tlx3-201ENSMUST00000037746 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
XylbQ3TNA1 Phf23-205ENSMUST00000135814 2214 ntTSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
XylbQ3TNA1 Junos-204ENSMUST00000128094 830 ntTSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
XylbQ3TNA1 Gm960-202ENSMUST00000177696 2262 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.55■■□□□ 1.04
XylbQ3TNA1 Irx4-201ENSMUST00000022095 2589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
XylbQ3TNA1 Mypop-203ENSMUST00000131087 1951 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.54■■□□□ 1.04
XylbQ3TNA1 St6galnac6-204ENSMUST00000095045 2536 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
XylbQ3TNA1 Prr3-201ENSMUST00000055454 2727 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
XylbQ3TNA1 Terf2-201ENSMUST00000068388 1915 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
XylbQ3TNA1 Irak1-207ENSMUST00000114360 2441 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
XylbQ3TNA1 Srp9-201ENSMUST00000027792 1367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
XylbQ3TNA1 Dazap1-201ENSMUST00000092305 1994 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
XylbQ3TNA1 Cabp1-204ENSMUST00000112113 1621 ntTSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
XylbQ3TNA1 Mcat-201ENSMUST00000061882 1893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
XylbQ3TNA1 Nelfe-204ENSMUST00000173357 1399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
XylbQ3TNA1 E030037K01Rik-201ENSMUST00000180928 1756 ntBASIC21.49■■□□□ 1.03
XylbQ3TNA1 Smurf1-202ENSMUST00000100461 2725 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
XylbQ3TNA1 Hdgf-201ENSMUST00000005017 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
XylbQ3TNA1 Dapk3-201ENSMUST00000047665 1676 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.47■■□□□ 1.03
XylbQ3TNA1 1700016A09Rik-201ENSMUST00000192004 835 ntBASIC21.47■■□□□ 1.03
XylbQ3TNA1 Eif4ebp1-201ENSMUST00000033880 1997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
XylbQ3TNA1 Cnnm3-202ENSMUST00000097776 5292 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
XylbQ3TNA1 Zfp131-205ENSMUST00000223812 663 ntBASIC21.46■■□□□ 1.03
XylbQ3TNA1 Grb2-202ENSMUST00000106495 2041 ntTSL 5 BASIC21.46■■□□□ 1.03
XylbQ3TNA1 Maz-201ENSMUST00000032916 2347 ntTSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
XylbQ3TNA1 Dedd-201ENSMUST00000064950 1618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
XylbQ3TNA1 Gsk3a-202ENSMUST00000108411 2248 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.44■■□□□ 1.02
XylbQ3TNA1 Rnf19b-201ENSMUST00000030584 2414 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.44■■□□□ 1.02
XylbQ3TNA1 Kansl2-202ENSMUST00000116400 2110 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
XylbQ3TNA1 Bin1-202ENSMUST00000091967 2118 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
XylbQ3TNA1 March2-205ENSMUST00000173015 1418 ntTSL 3 BASIC21.44■■□□□ 1.02
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 59.4 ms