Protein–RNA interactions for Protein: Q0VE29

Samd12, Sterile alpha motif domain-containing protein 12, mousemouse

Predictions only

Length 161 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Samd12Q0VE29 Olfm1-201ENSMUST00000028177 2757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
Samd12Q0VE29 Pura-201ENSMUST00000051301 3145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
Samd12Q0VE29 Cdc14b-207ENSMUST00000221634 1953 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
Samd12Q0VE29 Bod1-201ENSMUST00000058060 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
Samd12Q0VE29 Ppp1cc-202ENSMUST00000102528 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
Samd12Q0VE29 Crk-204ENSMUST00000108426 671 ntTSL 3 BASIC21.91■■□□□ 1.1
Samd12Q0VE29 Asmt-201ENSMUST00000178693 1191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
Samd12Q0VE29 Hnrnpd-203ENSMUST00000112939 1670 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.91■■□□□ 1.1
Samd12Q0VE29 H2afy-202ENSMUST00000045788 1933 ntTSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
Samd12Q0VE29 Homer3-201ENSMUST00000003669 2323 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
Samd12Q0VE29 Guf1-201ENSMUST00000031113 1769 ntTSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.1
Samd12Q0VE29 Deaf1-201ENSMUST00000080553 2135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.1
Samd12Q0VE29 Efcc1-202ENSMUST00000159570 2293 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.89■■□□□ 1.09
Samd12Q0VE29 Aspscr1-201ENSMUST00000026135 1820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
Samd12Q0VE29 Cadm1-202ENSMUST00000085909 2126 ntTSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
Samd12Q0VE29 Zfp358-201ENSMUST00000061508 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
Samd12Q0VE29 Dazap1-201ENSMUST00000092305 1994 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
Samd12Q0VE29 Mfsd5-201ENSMUST00000051341 1742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
Samd12Q0VE29 Brwd1-203ENSMUST00000113827 2382 ntTSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
Samd12Q0VE29 Rtn4r-201ENSMUST00000059589 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
Samd12Q0VE29 Agap3-206ENSMUST00000212381 1191 ntTSL 5 BASIC21.87■■□□□ 1.09
Samd12Q0VE29 Paqr3-202ENSMUST00000112968 1875 ntTSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
Samd12Q0VE29 Fam174a-201ENSMUST00000059975 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
Samd12Q0VE29 Kctd15-202ENSMUST00000108069 2407 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.86■■□□□ 1.09
Samd12Q0VE29 P3h4-201ENSMUST00000066489 2178 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
Samd12Q0VE29 Iars2-202ENSMUST00000110974 2431 ntTSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
Samd12Q0VE29 Gnas-207ENSMUST00000109085 1789 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
Samd12Q0VE29 Agpat5-201ENSMUST00000033847 2841 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
Samd12Q0VE29 Homer3-206ENSMUST00000140212 2608 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
Samd12Q0VE29 Shf-201ENSMUST00000048635 1431 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
Samd12Q0VE29 B4galt2-201ENSMUST00000030266 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
Samd12Q0VE29 Crk-202ENSMUST00000093115 965 ntTSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
Samd12Q0VE29 Tbx1-201ENSMUST00000009241 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
Samd12Q0VE29 Six3-201ENSMUST00000162695 2838 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.82■■□□□ 1.08
Samd12Q0VE29 St7-208ENSMUST00000115419 2194 ntTSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
Samd12Q0VE29 Hnrnpl-201ENSMUST00000038572 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
Samd12Q0VE29 Abhd17b-201ENSMUST00000052556 2475 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.8■■□□□ 1.08
Samd12Q0VE29 Dusp7-201ENSMUST00000172306 3213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
Samd12Q0VE29 1700026D11Rik-201ENSMUST00000126910 2033 ntTSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
Samd12Q0VE29 Vps37b-201ENSMUST00000040967 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
Samd12Q0VE29 Gm17641-201ENSMUST00000166328 2350 ntBASIC21.78■■□□□ 1.08
Samd12Q0VE29 Ei24-201ENSMUST00000115086 2220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
Samd12Q0VE29 Plpp2-201ENSMUST00000063879 1654 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
Samd12Q0VE29 Ildr2-206ENSMUST00000194964 2467 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
Samd12Q0VE29 Galnt12-202ENSMUST00000107744 2077 ntTSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
Samd12Q0VE29 Pdcd4-201ENSMUST00000025931 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
Samd12Q0VE29 Rab21-202ENSMUST00000218831 843 ntBASIC21.73■■□□□ 1.07
Samd12Q0VE29 Mef2a-203ENSMUST00000076325 2664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
Samd12Q0VE29 Fam204a-201ENSMUST00000065286 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
Samd12Q0VE29 Ran-202ENSMUST00000111343 2423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
Samd12Q0VE29 Det1-201ENSMUST00000032839 2269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
Samd12Q0VE29 Zbtb12-201ENSMUST00000052778 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
Samd12Q0VE29 Csnk1g2-201ENSMUST00000079773 2348 ntTSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
Samd12Q0VE29 Wdr34-201ENSMUST00000113711 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
Samd12Q0VE29 St6galnac6-203ENSMUST00000095044 2394 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
Samd12Q0VE29 2610307P16Rik-205ENSMUST00000148885 1870 ntTSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
Samd12Q0VE29 Tead1-203ENSMUST00000084705 2543 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
Samd12Q0VE29 Dync1i1-203ENSMUST00000115556 2718 ntTSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
Samd12Q0VE29 Frat2-201ENSMUST00000059231 2161 ntAPPRIS P1 BASIC21.7■■□□□ 1.06
Samd12Q0VE29 Rnf19b-206ENSMUST00000168461 2532 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.69■■□□□ 1.06
Samd12Q0VE29 Tnfsfm13-202ENSMUST00000174159 1470 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.69■■□□□ 1.06
Samd12Q0VE29 Otud5-204ENSMUST00000115667 2708 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.69■■□□□ 1.06
Samd12Q0VE29 H1f0-201ENSMUST00000180086 2287 ntAPPRIS P1 BASIC21.68■■□□□ 1.06
Samd12Q0VE29 Ubp1-204ENSMUST00000214095 2320 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
Samd12Q0VE29 Ccdc9-201ENSMUST00000041010 2379 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
Samd12Q0VE29 Spata1-201ENSMUST00000029839 1920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
Samd12Q0VE29 Tmem143-201ENSMUST00000069772 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
Samd12Q0VE29 Mipep-204ENSMUST00000225043 1548 ntBASIC21.65■■□□□ 1.06
Samd12Q0VE29 Tmem240-201ENSMUST00000127188 1308 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.65■■□□□ 1.06
Samd12Q0VE29 Ptpn4-203ENSMUST00000163435 2365 ntTSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
Samd12Q0VE29 E030037K01Rik-201ENSMUST00000180928 1756 ntBASIC21.65■■□□□ 1.06
Samd12Q0VE29 Kif1bp-206ENSMUST00000162525 2311 ntTSL 5 BASIC21.64■■□□□ 1.06
Samd12Q0VE29 Capns1-201ENSMUST00000001845 1600 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.63■■□□□ 1.05
Samd12Q0VE29 Ctage5-218ENSMUST00000177162 2728 ntTSL 5 BASIC21.63■■□□□ 1.05
Samd12Q0VE29 Mpp6-202ENSMUST00000036236 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
Samd12Q0VE29 Iffo2-203ENSMUST00000174078 5716 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
Samd12Q0VE29 E2f5-201ENSMUST00000029069 1779 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
Samd12Q0VE29 Ppp2cb-201ENSMUST00000009774 1469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
Samd12Q0VE29 Habp4-201ENSMUST00000021929 2564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
Samd12Q0VE29 Gxylt1-202ENSMUST00000057896 1891 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.61■■□□□ 1.05
Samd12Q0VE29 Glrx5-203ENSMUST00000223244 793 ntTSL 5 BASIC21.61■■□□□ 1.05
Samd12Q0VE29 Il17rd-202ENSMUST00000223942 2186 ntBASIC21.6■■□□□ 1.05
Samd12Q0VE29 Kansl1l-202ENSMUST00000113987 2342 ntTSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
Samd12Q0VE29 Lrrc75a-201ENSMUST00000057194 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
Samd12Q0VE29 Preb-209ENSMUST00000202567 1869 ntTSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
Samd12Q0VE29 Ddx43-201ENSMUST00000113367 2207 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.59■■□□□ 1.05
Samd12Q0VE29 Gal3st1-202ENSMUST00000078757 1749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
Samd12Q0VE29 Igfbp3-201ENSMUST00000020702 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.04
Samd12Q0VE29 Cebpb-201ENSMUST00000070642 1504 ntAPPRIS P1 BASIC21.57■■□□□ 1.04
Samd12Q0VE29 Dusp5-201ENSMUST00000038287 2473 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.57■■□□□ 1.04
Samd12Q0VE29 Thra-202ENSMUST00000103139 2246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
Samd12Q0VE29 Gpr137c-202ENSMUST00000147957 1395 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
Samd12Q0VE29 Gm38287-201ENSMUST00000195193 2051 ntTSL 3 BASIC21.56■■□□□ 1.04
Samd12Q0VE29 Cnnm3-201ENSMUST00000001166 5193 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
Samd12Q0VE29 Kcnc3-203ENSMUST00000207493 2731 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.56■■□□□ 1.04
Samd12Q0VE29 Msto1-202ENSMUST00000126245 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
Samd12Q0VE29 Vsig8-202ENSMUST00000177086 1519 ntTSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
Samd12Q0VE29 Stau2-210ENSMUST00000149320 2214 ntTSL 5 BASIC21.55■■□□□ 1.04
Samd12Q0VE29 Slc22a17-208ENSMUST00000228119 2348 ntAPPRIS P1 BASIC21.55■■□□□ 1.04
Samd12Q0VE29 Elf2-203ENSMUST00000108051 2514 ntTSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 65.2 ms