Protein–RNA interactions for Protein: Q09324

Gcnt1, Beta-1,3-galactosyl-O-glycosyl-glycoprotein beta-1,6-N-acetylglucosaminyltransferase, mousemouse

Predictions only

Length 428 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gcnt1Q09324 Pfdn2-202ENSMUST00000135941 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.51■■■□□ 2.15
Gcnt1Q09324 Popdc3-201ENSMUST00000019994 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.51■■■□□ 2.15
Gcnt1Q09324 Twist1-201ENSMUST00000049089 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.51■■■□□ 2.15
Gcnt1Q09324 Dazap1-203ENSMUST00000105362 2081 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.5■■■□□ 2.15
Gcnt1Q09324 Nrtn-201ENSMUST00000044752 1023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.5■■■□□ 2.15
Gcnt1Q09324 Cdk2ap1-201ENSMUST00000031341 1315 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.49■■■□□ 2.15
Gcnt1Q09324 Rbms1-202ENSMUST00000112509 1806 ntTSL 1 (best) BASIC28.49■■■□□ 2.15
Gcnt1Q09324 5730480H06Rik-201ENSMUST00000030968 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.49■■■□□ 2.15
Gcnt1Q09324 Ttc19-202ENSMUST00000101075 2193 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.47■■■□□ 2.15
Gcnt1Q09324 Nelfe-204ENSMUST00000173357 1399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.46■■■□□ 2.15
Gcnt1Q09324 Tmem243-201ENSMUST00000115365 1040 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.44■■■□□ 2.14
Gcnt1Q09324 Gm43863-201ENSMUST00000203822 1192 ntBASIC28.44■■■□□ 2.14
Gcnt1Q09324 Dtnbp1-201ENSMUST00000072329 1362 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.44■■■□□ 2.14
Gcnt1Q09324 Gm527-203ENSMUST00000220993 1090 ntTSL 5 BASIC28.43■■■□□ 2.14
Gcnt1Q09324 Il3ra-201ENSMUST00000090591 1614 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.43■■■□□ 2.14
Gcnt1Q09324 Tlx3-201ENSMUST00000037746 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.43■■■□□ 2.14
Gcnt1Q09324 Mthfd2l-203ENSMUST00000202781 688 ntTSL 1 (best) BASIC28.42■■■□□ 2.14
Gcnt1Q09324 Efemp2-201ENSMUST00000070118 1781 ntTSL 1 (best) BASIC28.42■■■□□ 2.14
Gcnt1Q09324 Dlx6os2-201ENSMUST00000178206 1354 ntBASIC28.4■■■□□ 2.14
Gcnt1Q09324 Rnf220-212ENSMUST00000221654 1949 ntTSL 1 (best) BASIC28.4■■■□□ 2.14
Gcnt1Q09324 2310050C09Rik-201ENSMUST00000163439 1078 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.4■■■□□ 2.14
Gcnt1Q09324 Tbx1-201ENSMUST00000009241 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.39■■■□□ 2.13
Gcnt1Q09324 Rab40c-201ENSMUST00000026826 2466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.38■■■□□ 2.13
Gcnt1Q09324 Ppp1r3e-202ENSMUST00000177403 1957 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.37■■■□□ 2.13
Gcnt1Q09324 Eid2-201ENSMUST00000059596 1392 ntAPPRIS P1 BASIC28.36■■■□□ 2.13
Gcnt1Q09324 Zxda-201ENSMUST00000117281 2621 ntBASIC28.35■■■□□ 2.13
Gcnt1Q09324 A530058N18Rik-204ENSMUST00000141209 709 ntTSL 5 BASIC28.35■■■□□ 2.13
Gcnt1Q09324 C2cd4d-201ENSMUST00000169433 1321 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC28.35■■■□□ 2.13
Gcnt1Q09324 Cabp1-204ENSMUST00000112113 1621 ntTSL 1 (best) BASIC28.35■■■□□ 2.13
Gcnt1Q09324 Crip2-201ENSMUST00000084882 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.34■■■□□ 2.13
Gcnt1Q09324 Dcaf15-202ENSMUST00000210279 2199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.33■■■□□ 2.13
Gcnt1Q09324 Amigo1-203ENSMUST00000106659 1360 ntTSL 1 (best) BASIC28.33■■■□□ 2.13
Gcnt1Q09324 Suds3-202ENSMUST00000166397 1694 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.32■■■□□ 2.12
Gcnt1Q09324 Gtf2a2-203ENSMUST00000119413 1034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.32■■■□□ 2.12
Gcnt1Q09324 Tnfsfm13-201ENSMUST00000108649 1049 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.31■■■□□ 2.12
Gcnt1Q09324 Dleu2-206ENSMUST00000182537 318 ntTSL 2 BASIC28.31■■■□□ 2.12
Gcnt1Q09324 Smarcc2-205ENSMUST00000218228 603 ntTSL 5 BASIC28.31■■■□□ 2.12
Gcnt1Q09324 Smad2-202ENSMUST00000091831 1645 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC28.31■■■□□ 2.12
Gcnt1Q09324 AC157572.2-201ENSMUST00000226970 908 ntBASIC28.3■■■□□ 2.12
Gcnt1Q09324 Cpsf4-201ENSMUST00000070487 1606 ntTSL 1 (best) BASIC28.29■■■□□ 2.12
Gcnt1Q09324 Ryk-203ENSMUST00000175883 2505 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.28■■■□□ 2.12
Gcnt1Q09324 Sugct-202ENSMUST00000220514 1351 ntTSL 1 (best) BASIC28.28■■■□□ 2.12
Gcnt1Q09324 Rundc3a-204ENSMUST00000107105 1861 ntTSL 1 (best) BASIC28.28■■■□□ 2.12
Gcnt1Q09324 B4galt7-202ENSMUST00000100764 2195 ntTSL 1 (best) BASIC28.28■■■□□ 2.12
Gcnt1Q09324 Dazap1-202ENSMUST00000105361 1537 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC28.28■■■□□ 2.12
Gcnt1Q09324 Gm20503-201ENSMUST00000174664 1294 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.25■■■□□ 2.11
Gcnt1Q09324 Fam241a-201ENSMUST00000057198 1607 ntTSL 1 (best) BASIC28.25■■■□□ 2.11
Gcnt1Q09324 Rpl19-ps4-201ENSMUST00000167150 625 ntBASIC28.23■■■□□ 2.11
Gcnt1Q09324 Mxra7-202ENSMUST00000047715 757 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.23■■■□□ 2.11
Gcnt1Q09324 Aspscr1-201ENSMUST00000026135 1820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.22■■■□□ 2.11
Gcnt1Q09324 Reps1-206ENSMUST00000154718 2402 ntTSL 5 BASIC28.22■■■□□ 2.11
Gcnt1Q09324 Pcgf5-201ENSMUST00000062389 1566 ntTSL 5 BASIC28.22■■■□□ 2.11
Gcnt1Q09324 Dut-202ENSMUST00000082122 1020 ntTSL 1 (best) BASIC28.22■■■□□ 2.11
Gcnt1Q09324 Dda1-209ENSMUST00000147642 1865 ntTSL 2 BASIC28.21■■■□□ 2.11
Gcnt1Q09324 Dpf1-204ENSMUST00000108231 2040 ntTSL 5 BASIC28.2■■■□□ 2.11
Gcnt1Q09324 Cdv3-205ENSMUST00000189896 1023 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.19■■■□□ 2.1
Gcnt1Q09324 Lsm4-204ENSMUST00000210071 575 ntTSL 5 BASIC28.19■■■□□ 2.1
Gcnt1Q09324 Ctbp1-201ENSMUST00000079746 2279 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.18■■■□□ 2.1
Gcnt1Q09324 C1qtnf5-201ENSMUST00000114815 1215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.18■■■□□ 2.1
Gcnt1Q09324 C1ql1-201ENSMUST00000057849 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.17■■■□□ 2.1
Gcnt1Q09324 Gng13-201ENSMUST00000115108 347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.17■■■□□ 2.1
Gcnt1Q09324 Mcat-201ENSMUST00000061882 1893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.17■■■□□ 2.1
Gcnt1Q09324 Fgf20-201ENSMUST00000034014 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.15■■■□□ 2.1
Gcnt1Q09324 Gm43445-201ENSMUST00000198564 2091 ntBASIC28.14■■■□□ 2.1
Gcnt1Q09324 Stau2-210ENSMUST00000149320 2214 ntTSL 5 BASIC28.14■■■□□ 2.1
Gcnt1Q09324 A730013G03Rik-202ENSMUST00000195012 2097 ntBASIC28.12■■■□□ 2.09
Gcnt1Q09324 Micu3-201ENSMUST00000068999 2219 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.11■■■□□ 2.09
Gcnt1Q09324 Galnt12-201ENSMUST00000045041 2288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.1■■■□□ 2.09
Gcnt1Q09324 Ccdc9-202ENSMUST00000118976 2175 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.1■■■□□ 2.09
Gcnt1Q09324 Zmynd12-201ENSMUST00000094819 1464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.09■■■□□ 2.09
Gcnt1Q09324 Ppp1r14b-201ENSMUST00000070850 919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.09■■■□□ 2.09
Gcnt1Q09324 4930577N17Rik-201ENSMUST00000139771 1625 ntBASIC28.08■■■□□ 2.09
Gcnt1Q09324 Gm9905-201ENSMUST00000065740 1845 ntBASIC28.08■■■□□ 2.09
Gcnt1Q09324 Pm20d2-201ENSMUST00000098181 1445 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.08■■■□□ 2.09
Gcnt1Q09324 Clk2-201ENSMUST00000090927 2128 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC28.07■■■□□ 2.08
Gcnt1Q09324 Tsen34-203ENSMUST00000108629 1238 ntTSL 1 (best) BASIC28.06■■■□□ 2.08
Gcnt1Q09324 Gm6206-201ENSMUST00000133472 2199 ntBASIC28.06■■■□□ 2.08
Gcnt1Q09324 Hexdc-202ENSMUST00000106117 2149 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.05■■■□□ 2.08
Gcnt1Q09324 Dtnb-211ENSMUST00000173240 2218 ntTSL 5 BASIC28.05■■■□□ 2.08
Gcnt1Q09324 Gm17494-201ENSMUST00000072769 1800 ntTSL 1 (best) BASIC28.05■■■□□ 2.08
Gcnt1Q09324 Gm26508-201ENSMUST00000181285 1516 ntTSL 5 BASIC28.04■■■□□ 2.08
Gcnt1Q09324 A330023F24Rik-201ENSMUST00000181226 955 ntTSL 1 (best) BASIC28.04■■■□□ 2.08
Gcnt1Q09324 Pth1r-202ENSMUST00000166716 2219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.03■■■□□ 2.08
Gcnt1Q09324 Upp2-202ENSMUST00000071543 2150 ntTSL 1 (best) BASIC28.03■■■□□ 2.08
Gcnt1Q09324 Slc16a8-201ENSMUST00000039752 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.02■■■□□ 2.08
Gcnt1Q09324 Stard10-202ENSMUST00000163799 1723 ntTSL 1 (best) BASIC28.02■■■□□ 2.08
Gcnt1Q09324 AC150314.2-201ENSMUST00000214135 834 ntTSL 5 BASIC28.02■■■□□ 2.08
Gcnt1Q09324 Yrdc-201ENSMUST00000102628 1634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.02■■■□□ 2.08
Gcnt1Q09324 4921531C22Rik-201ENSMUST00000150145 1905 ntTSL 1 (best) BASIC28.01■■■□□ 2.07
Gcnt1Q09324 Spg7-201ENSMUST00000108868 845 ntTSL 2 BASIC28.01■■■□□ 2.07
Gcnt1Q09324 4932443I19Rik-201ENSMUST00000166277 799 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.01■■■□□ 2.07
Gcnt1Q09324 Galnt12-202ENSMUST00000107744 2077 ntTSL 1 (best) BASIC28.01■■■□□ 2.07
Gcnt1Q09324 Cetn4-201ENSMUST00000071400 1808 ntTSL 5 BASIC28■■■□□ 2.07
Gcnt1Q09324 Tor1a-201ENSMUST00000028200 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28■■■□□ 2.07
Gcnt1Q09324 Tspan33-201ENSMUST00000046750 1994 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.98■■■□□ 2.07
Gcnt1Q09324 Cldn10-203ENSMUST00000100314 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.98■■■□□ 2.07
Gcnt1Q09324 Tcte3-201ENSMUST00000040746 788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.97■■■□□ 2.07
Gcnt1Q09324 Cetn4-202ENSMUST00000075537 762 ntTSL 3 BASIC27.97■■■□□ 2.07
Gcnt1Q09324 Tcte3-202ENSMUST00000097398 632 ntTSL 1 (best) BASIC27.97■■■□□ 2.07
Gcnt1Q09324 Zfp787-201ENSMUST00000094870 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.96■■■□□ 2.07
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 13.6 ms