Protein–RNA interactions for Protein: Q08024

Cbfb, Core-binding factor subunit beta, mousemouse

Predictions only

Length 187 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CbfbQ08024 Dedd-201ENSMUST00000064950 1618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
CbfbQ08024 Ring1-201ENSMUST00000025183 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
CbfbQ08024 Phf10-201ENSMUST00000024657 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
CbfbQ08024 Raly-201ENSMUST00000029120 1802 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.38■■□□□ 1.17
CbfbQ08024 Gm9397-201ENSMUST00000200125 605 ntBASIC22.37■■□□□ 1.17
CbfbQ08024 March2-205ENSMUST00000173015 1418 ntTSL 3 BASIC22.37■■□□□ 1.17
CbfbQ08024 BC037032-205ENSMUST00000187080 508 ntTSL 5 BASIC22.36■■□□□ 1.17
CbfbQ08024 Tcte2-204ENSMUST00000130033 1462 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
CbfbQ08024 Ildr2-205ENSMUST00000193860 2320 ntTSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
CbfbQ08024 Macrod1-201ENSMUST00000040261 1274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
CbfbQ08024 Gnas-207ENSMUST00000109085 1789 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
CbfbQ08024 Ebf4-203ENSMUST00000110288 2982 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.34■■□□□ 1.17
CbfbQ08024 Pfdn2-202ENSMUST00000135941 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
CbfbQ08024 Gm527-201ENSMUST00000058135 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
CbfbQ08024 Cdk2ap1-201ENSMUST00000031341 1315 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
CbfbQ08024 Hmx1-201ENSMUST00000087674 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
CbfbQ08024 Amer2-203ENSMUST00000225247 2662 ntBASIC22.31■■□□□ 1.16
CbfbQ08024 Arhgap22-201ENSMUST00000111955 2148 ntTSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
CbfbQ08024 Junos-204ENSMUST00000128094 830 ntTSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
CbfbQ08024 Lemd2-201ENSMUST00000055117 2595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
CbfbQ08024 Dtnbp1-201ENSMUST00000072329 1362 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
CbfbQ08024 Gtf2a2-203ENSMUST00000119413 1034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
CbfbQ08024 Qrich1-209ENSMUST00000194385 975 ntTSL 2 BASIC22.27■■□□□ 1.16
CbfbQ08024 Akt1s1-202ENSMUST00000107880 1757 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
CbfbQ08024 Rragc-201ENSMUST00000030399 2593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
CbfbQ08024 Eif4e2-203ENSMUST00000113230 1569 ntTSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
CbfbQ08024 Gm24970-201ENSMUST00000175582 82 ntBASIC22.24■■□□□ 1.15
CbfbQ08024 Egr3-201ENSMUST00000035908 1509 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
CbfbQ08024 Tmem243-201ENSMUST00000115365 1040 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.23■■□□□ 1.15
CbfbQ08024 Pitpna-205ENSMUST00000179445 1665 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.23■■□□□ 1.15
CbfbQ08024 Gm30346-201ENSMUST00000218641 1699 ntBASIC22.23■■□□□ 1.15
CbfbQ08024 1810026B05Rik-202ENSMUST00000184554 782 ntTSL 3 BASIC22.22■■□□□ 1.15
CbfbQ08024 1810026B05Rik-206ENSMUST00000187421 519 ntTSL 3 BASIC22.22■■□□□ 1.15
CbfbQ08024 Mthfd2l-203ENSMUST00000202781 688 ntTSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
CbfbQ08024 Clk2-203ENSMUST00000121931 2112 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.22■■□□□ 1.15
CbfbQ08024 Srp9-201ENSMUST00000027792 1367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
CbfbQ08024 Mpp6-203ENSMUST00000166318 2222 ntTSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
CbfbQ08024 Cebpb-201ENSMUST00000070642 1504 ntAPPRIS P1 BASIC22.21■■□□□ 1.15
CbfbQ08024 Tnfsfm13-201ENSMUST00000108649 1049 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.21■■□□□ 1.15
CbfbQ08024 Gm527-203ENSMUST00000220993 1090 ntTSL 5 BASIC22.21■■□□□ 1.15
CbfbQ08024 Sec63-201ENSMUST00000019937 6032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
CbfbQ08024 Crem-227ENSMUST00000149803 1422 ntTSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
CbfbQ08024 Ywhaq-202ENSMUST00000103002 2110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
CbfbQ08024 Cnnm3-201ENSMUST00000001166 5193 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
CbfbQ08024 Rpl19-ps4-201ENSMUST00000167150 625 ntBASIC22.18■■□□□ 1.14
CbfbQ08024 Lsm4-204ENSMUST00000210071 575 ntTSL 5 BASIC22.18■■□□□ 1.14
CbfbQ08024 Stard3nl-210ENSMUST00000222869 1030 ntTSL 5 BASIC22.18■■□□□ 1.14
CbfbQ08024 Maf-201ENSMUST00000069009 3223 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
CbfbQ08024 Hdgf-201ENSMUST00000005017 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
CbfbQ08024 Nrtn-201ENSMUST00000044752 1023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
CbfbQ08024 St6galnac6-204ENSMUST00000095045 2536 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
CbfbQ08024 Reep6-202ENSMUST00000105354 2208 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
CbfbQ08024 Reep6-205ENSMUST00000105358 2208 ntTSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
CbfbQ08024 Kmt5a-202ENSMUST00000100709 1425 ntTSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
CbfbQ08024 Mypop-203ENSMUST00000131087 1951 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.16■■□□□ 1.14
CbfbQ08024 4921531C22Rik-201ENSMUST00000150145 1905 ntTSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
CbfbQ08024 Gm15672-201ENSMUST00000151512 1354 ntTSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
CbfbQ08024 Gm960-202ENSMUST00000177696 2262 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.15■■□□□ 1.14
CbfbQ08024 Ankrd28-201ENSMUST00000014640 6712 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
CbfbQ08024 Snx3-201ENSMUST00000019939 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
CbfbQ08024 Pradc1-202ENSMUST00000113770 610 ntTSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
CbfbQ08024 Gsk3a-202ENSMUST00000108411 2248 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.15■■□□□ 1.14
CbfbQ08024 A430072P03Rik-201ENSMUST00000161480 1510 ntTSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
CbfbQ08024 Zfp91-201ENSMUST00000038627 5531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
CbfbQ08024 C1qtnf5-201ENSMUST00000114815 1215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
CbfbQ08024 Crip2-201ENSMUST00000084882 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
CbfbQ08024 Mxra7-202ENSMUST00000047715 757 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
CbfbQ08024 Tbcel-204ENSMUST00000128959 1535 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.12■■□□□ 1.13
CbfbQ08024 Gm43863-201ENSMUST00000203822 1192 ntBASIC22.12■■□□□ 1.13
CbfbQ08024 C2cd4d-201ENSMUST00000169433 1321 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.11■■□□□ 1.13
CbfbQ08024 Dlg1-203ENSMUST00000100001 4711 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.11■■□□□ 1.13
CbfbQ08024 Smarcc2-205ENSMUST00000218228 603 ntTSL 5 BASIC22.1■■□□□ 1.13
CbfbQ08024 2410017I17Rik-202ENSMUST00000090537 2053 ntTSL 2 BASIC22.1■■□□□ 1.13
CbfbQ08024 Pradc1-201ENSMUST00000032080 1038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
CbfbQ08024 Ryk-201ENSMUST00000035142 2852 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
CbfbQ08024 A530058N18Rik-208ENSMUST00000131299 1387 ntTSL 2 BASIC22.09■■□□□ 1.13
CbfbQ08024 Nelfe-204ENSMUST00000173357 1399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
CbfbQ08024 Dut-202ENSMUST00000082122 1020 ntTSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
CbfbQ08024 Gm20503-201ENSMUST00000174664 1294 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.07■■□□□ 1.12
CbfbQ08024 Triobp-206ENSMUST00000130663 1660 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.07■■□□□ 1.12
CbfbQ08024 Twist1-201ENSMUST00000049089 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
CbfbQ08024 Fezf2-202ENSMUST00000224023 1917 ntBASIC22.06■■□□□ 1.12
CbfbQ08024 Gng13-201ENSMUST00000115108 347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
CbfbQ08024 AC150314.2-201ENSMUST00000214135 834 ntTSL 5 BASIC22.06■■□□□ 1.12
CbfbQ08024 Klhl25-205ENSMUST00000206019 2299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
CbfbQ08024 5730480H06Rik-201ENSMUST00000030968 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
CbfbQ08024 Il3ra-201ENSMUST00000090591 1614 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
CbfbQ08024 Irf2bp2-201ENSMUST00000054960 5080 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.04■■□□□ 1.12
CbfbQ08024 Rab40c-209ENSMUST00000179998 2456 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.03■■□□□ 1.12
CbfbQ08024 A530058N18Rik-204ENSMUST00000141209 709 ntTSL 5 BASIC22.03■■□□□ 1.12
CbfbQ08024 Gpr27-201ENSMUST00000101122 2388 ntAPPRIS P1 BASIC22.03■■□□□ 1.12
CbfbQ08024 Cnnm3-202ENSMUST00000097776 5292 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
CbfbQ08024 AC157572.2-201ENSMUST00000226970 908 ntBASIC22.02■■□□□ 1.12
CbfbQ08024 Rbm17-201ENSMUST00000040314 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
CbfbQ08024 Gjc1-201ENSMUST00000068933 1903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
CbfbQ08024 Rcor2-201ENSMUST00000066646 2801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
CbfbQ08024 Rgs7-206ENSMUST00000194555 2431 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
CbfbQ08024 Mrps7-201ENSMUST00000058109 1962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
CbfbQ08024 Pdia5-201ENSMUST00000023550 1808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
CbfbQ08024 Grb2-202ENSMUST00000106495 2041 ntTSL 5 BASIC22■■□□□ 1.11
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 16.8 ms