Protein–RNA interactions for Protein: Q03350

Thbs2, Thrombospondin-2, mousemouse

Predictions only

Length 1,172 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Thbs2Q03350 Cnnm3-202ENSMUST00000097776 5292 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Thbs2Q03350 St7-202ENSMUST00000052113 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
Thbs2Q03350 Rnf19b-201ENSMUST00000030584 2414 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.02■■□□□ 1.12
Thbs2Q03350 AC153890.1-201ENSMUST00000220021 2469 ntBASIC22.02■■□□□ 1.12
Thbs2Q03350 Zfp358-201ENSMUST00000061508 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Thbs2Q03350 Il17d-201ENSMUST00000089494 1274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Thbs2Q03350 Eed-201ENSMUST00000107234 2067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Thbs2Q03350 Clptm1l-201ENSMUST00000022102 2340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Thbs2Q03350 E2f6-201ENSMUST00000020908 2418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
Thbs2Q03350 Nr2f6-201ENSMUST00000002466 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
Thbs2Q03350 Cited2-203ENSMUST00000219558 2411 ntAPPRIS P1 BASIC22■■□□□ 1.11
Thbs2Q03350 Dhrs13-203ENSMUST00000122342 1791 ntTSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
Thbs2Q03350 Paip1-203ENSMUST00000126957 1731 ntTSL 5 BASIC21.98■■□□□ 1.11
Thbs2Q03350 Dapk3-202ENSMUST00000178422 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
Thbs2Q03350 Sec63-201ENSMUST00000019937 6032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
Thbs2Q03350 Syt7-201ENSMUST00000073899 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
Thbs2Q03350 Lmo2-201ENSMUST00000111139 1434 ntTSL 5 BASIC21.97■■□□□ 1.11
Thbs2Q03350 Dazap1-201ENSMUST00000092305 1994 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
Thbs2Q03350 Tmed7-203ENSMUST00000151189 1348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
Thbs2Q03350 Ppp1cc-201ENSMUST00000086294 1442 ntTSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
Thbs2Q03350 Gpr12-201ENSMUST00000036211 2219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
Thbs2Q03350 Mrps7-201ENSMUST00000058109 1962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
Thbs2Q03350 Zfp422-201ENSMUST00000057540 2375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
Thbs2Q03350 Ctbp1-211ENSMUST00000202868 2436 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
Thbs2Q03350 Gm30346-201ENSMUST00000218641 1699 ntBASIC21.96■■□□□ 1.11
Thbs2Q03350 Rab22a-202ENSMUST00000109110 849 ntTSL 5 BASIC21.96■■□□□ 1.11
Thbs2Q03350 Btf3-201ENSMUST00000022163 1091 ntTSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
Thbs2Q03350 E2f1-201ENSMUST00000000894 2755 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
Thbs2Q03350 Pon2-201ENSMUST00000057792 2409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
Thbs2Q03350 Hnrnpd-202ENSMUST00000072750 1537 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC21.95■■□□□ 1.1
Thbs2Q03350 Galnt12-202ENSMUST00000107744 2077 ntTSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
Thbs2Q03350 Zfp91-201ENSMUST00000038627 5531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
Thbs2Q03350 Isoc1-201ENSMUST00000025503 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
Thbs2Q03350 Homer3-202ENSMUST00000087467 880 ntTSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
Thbs2Q03350 Gkap1-201ENSMUST00000091579 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
Thbs2Q03350 Fam69b-201ENSMUST00000074240 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
Thbs2Q03350 Fxyd1-205ENSMUST00000205439 535 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.92■■□□□ 1.1
Thbs2Q03350 Sap30l-201ENSMUST00000020826 1151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
Thbs2Q03350 Akt1s1-202ENSMUST00000107880 1757 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
Thbs2Q03350 Fam220a-206ENSMUST00000196487 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
Thbs2Q03350 Irf2bp2-201ENSMUST00000054960 5080 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.91■■□□□ 1.1
Thbs2Q03350 Uncx-201ENSMUST00000172997 2498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
Thbs2Q03350 Peg12-201ENSMUST00000094339 2640 ntAPPRIS P1 BASIC21.9■■□□□ 1.1
Thbs2Q03350 Tm6sf1-201ENSMUST00000041890 2226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
Thbs2Q03350 Fam136a-201ENSMUST00000071492 1643 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
Thbs2Q03350 Snf8-202ENSMUST00000107700 849 ntTSL 2 BASIC21.88■■□□□ 1.09
Thbs2Q03350 Pdia5-201ENSMUST00000023550 1808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
Thbs2Q03350 Peli2-204ENSMUST00000226513 1320 ntBASIC21.86■■□□□ 1.09
Thbs2Q03350 Zfp513-202ENSMUST00000114590 2228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
Thbs2Q03350 Foxc1-201ENSMUST00000062292 5844 ntAPPRIS P1 BASIC21.85■■□□□ 1.09
Thbs2Q03350 Ica1-201ENSMUST00000038403 2075 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
Thbs2Q03350 Cdc14b-207ENSMUST00000221634 1953 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
Thbs2Q03350 Fam241a-201ENSMUST00000057198 1607 ntTSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
Thbs2Q03350 Stau2-210ENSMUST00000149320 2214 ntTSL 5 BASIC21.83■■□□□ 1.09
Thbs2Q03350 Slc39a13-201ENSMUST00000073575 2469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
Thbs2Q03350 Mnx1-201ENSMUST00000001608 2018 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.83■■□□□ 1.09
Thbs2Q03350 E030037K01Rik-201ENSMUST00000180928 1756 ntBASIC21.82■■□□□ 1.08
Thbs2Q03350 Gm24804-201ENSMUST00000174982 85 ntBASIC21.82■■□□□ 1.08
Thbs2Q03350 Kcnmb4os2-201ENSMUST00000080943 1571 ntTSL 5 BASIC21.81■■□□□ 1.08
Thbs2Q03350 Atp5a1-202ENSMUST00000114748 2674 ntTSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
Thbs2Q03350 Gm26566-201ENSMUST00000181601 1038 ntAPPRIS P1 BASIC21.8■■□□□ 1.08
Thbs2Q03350 Otud5-205ENSMUST00000115668 2543 ntTSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
Thbs2Q03350 Nhlrc1-201ENSMUST00000052747 2294 ntAPPRIS P1 BASIC21.8■■□□□ 1.08
Thbs2Q03350 Prr3-201ENSMUST00000055454 2727 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
Thbs2Q03350 Snta1-202ENSMUST00000109728 2131 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
Thbs2Q03350 Snta1-201ENSMUST00000028991 2125 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
Thbs2Q03350 Dcaf15-202ENSMUST00000210279 2199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
Thbs2Q03350 Vdac3-202ENSMUST00000179233 1423 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
Thbs2Q03350 Efna3-201ENSMUST00000029673 2363 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
Thbs2Q03350 Zswim6-201ENSMUST00000105097 5456 ntTSL 5 BASIC21.78■■□□□ 1.08
Thbs2Q03350 Gas2l1-201ENSMUST00000037146 2686 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
Thbs2Q03350 Fus-201ENSMUST00000077609 1831 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
Thbs2Q03350 Ndufaf6-201ENSMUST00000058183 1082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
Thbs2Q03350 Mpp6-202ENSMUST00000036236 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
Thbs2Q03350 A730013G03Rik-202ENSMUST00000195012 2097 ntBASIC21.75■■□□□ 1.07
Thbs2Q03350 Eif4ebp1-201ENSMUST00000033880 1997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
Thbs2Q03350 Ube2m-201ENSMUST00000005714 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
Thbs2Q03350 Det1-201ENSMUST00000032839 2269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
Thbs2Q03350 Nans-201ENSMUST00000030018 2179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
Thbs2Q03350 Dapk3-201ENSMUST00000047665 1676 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.74■■□□□ 1.07
Thbs2Q03350 Mpp6-209ENSMUST00000204545 2418 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.74■■□□□ 1.07
Thbs2Q03350 Ubl4a-207ENSMUST00000178691 1038 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.73■■□□□ 1.07
Thbs2Q03350 Mapk13-201ENSMUST00000004986 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
Thbs2Q03350 Arx-202ENSMUST00000113947 2454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
Thbs2Q03350 Gnaq-201ENSMUST00000025541 5644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
Thbs2Q03350 Zbtb12-201ENSMUST00000052778 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
Thbs2Q03350 Exosc6-201ENSMUST00000210390 1326 ntAPPRIS P1 BASIC21.72■■□□□ 1.07
Thbs2Q03350 Tmem260-208ENSMUST00000226400 2281 ntAPPRIS ALT2 BASIC21.71■■□□□ 1.07
Thbs2Q03350 Orai1-201ENSMUST00000051016 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
Thbs2Q03350 Ei24-202ENSMUST00000163192 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
Thbs2Q03350 Wdr34-201ENSMUST00000113711 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
Thbs2Q03350 Sox3-201ENSMUST00000135107 2065 ntAPPRIS P1 BASIC21.67■■□□□ 1.06
Thbs2Q03350 Rtn4r-201ENSMUST00000059589 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
Thbs2Q03350 E2f5-201ENSMUST00000029069 1779 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
Thbs2Q03350 Cpe-201ENSMUST00000048967 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
Thbs2Q03350 Eya2-202ENSMUST00000088132 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
Thbs2Q03350 Epb41l4b-203ENSMUST00000095076 6746 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.66■■□□□ 1.06
Thbs2Q03350 Ranbp1-202ENSMUST00000115645 1085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
Thbs2Q03350 Phlda1-201ENSMUST00000164773 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
Thbs2Q03350 Rnf115-201ENSMUST00000029740 2209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 13.3 ms