Protein–RNA interactions for Protein: Q02853

Mmp11, Stromelysin-3, mousemouse

Predictions only

Length 492 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Mmp11Q02853 Fkbp8-202ENSMUST00000119353 1720 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
Mmp11Q02853 Gm15672-201ENSMUST00000151512 1354 ntTSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
Mmp11Q02853 Junos-204ENSMUST00000128094 830 ntTSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
Mmp11Q02853 Hrh3-208ENSMUST00000171736 906 ntTSL 5 BASIC24.29■■□□□ 1.48
Mmp11Q02853 1700016A09Rik-201ENSMUST00000192004 835 ntBASIC24.29■■□□□ 1.48
Mmp11Q02853 Rundc3a-204ENSMUST00000107105 1861 ntTSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
Mmp11Q02853 Tbcel-204ENSMUST00000128959 1535 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.29■■□□□ 1.48
Mmp11Q02853 1700069B07Rik-202ENSMUST00000191155 939 ntBASIC24.28■■□□□ 1.48
Mmp11Q02853 Zfp131-206ENSMUST00000223813 2561 ntAPPRIS P3 BASIC24.28■■□□□ 1.48
Mmp11Q02853 Dcaf15-202ENSMUST00000210279 2199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
Mmp11Q02853 Kmt5a-202ENSMUST00000100709 1425 ntTSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
Mmp11Q02853 Dedd-201ENSMUST00000064950 1618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
Mmp11Q02853 Popdc3-201ENSMUST00000019994 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
Mmp11Q02853 Ildr2-205ENSMUST00000193860 2320 ntTSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
Mmp11Q02853 Cldnd1-201ENSMUST00000023426 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
Mmp11Q02853 Rbm17-201ENSMUST00000040314 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
Mmp11Q02853 Gltp-203ENSMUST00000112214 944 ntTSL 3 BASIC24.23■■□□□ 1.47
Mmp11Q02853 4921531C22Rik-201ENSMUST00000150145 1905 ntTSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
Mmp11Q02853 Zfp787-201ENSMUST00000094870 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
Mmp11Q02853 Dtnb-211ENSMUST00000173240 2218 ntTSL 5 BASIC24.22■■□□□ 1.47
Mmp11Q02853 A430072P03Rik-201ENSMUST00000161480 1510 ntTSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
Mmp11Q02853 Clk2-201ENSMUST00000090927 2128 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.47
Mmp11Q02853 A530058N18Rik-208ENSMUST00000131299 1387 ntTSL 2 BASIC24.2■■□□□ 1.46
Mmp11Q02853 Aspscr1-201ENSMUST00000026135 1820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
Mmp11Q02853 Fam241a-201ENSMUST00000057198 1607 ntTSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
Mmp11Q02853 March2-205ENSMUST00000173015 1418 ntTSL 3 BASIC24.18■■□□□ 1.46
Mmp11Q02853 Dda1-209ENSMUST00000147642 1865 ntTSL 2 BASIC24.17■■□□□ 1.46
Mmp11Q02853 5730480H06Rik-201ENSMUST00000030968 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
Mmp11Q02853 Tlx3-201ENSMUST00000037746 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
Mmp11Q02853 Gm17494-201ENSMUST00000072769 1800 ntTSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
Mmp11Q02853 Srp9-201ENSMUST00000027792 1367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
Mmp11Q02853 Smad2-202ENSMUST00000091831 1645 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.15■■□□□ 1.46
Mmp11Q02853 Tdp2-203ENSMUST00000223804 1136 ntBASIC24.15■■□□□ 1.46
Mmp11Q02853 Mogs-201ENSMUST00000032114 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
Mmp11Q02853 Stau2-210ENSMUST00000149320 2214 ntTSL 5 BASIC24.15■■□□□ 1.46
Mmp11Q02853 Snx3-201ENSMUST00000019939 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
Mmp11Q02853 Mpp6-203ENSMUST00000166318 2222 ntTSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
Mmp11Q02853 Twist1-201ENSMUST00000049089 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
Mmp11Q02853 Galnt12-202ENSMUST00000107744 2077 ntTSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
Mmp11Q02853 Clk2-203ENSMUST00000121931 2112 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.13■■□□□ 1.45
Mmp11Q02853 BC037032-205ENSMUST00000187080 508 ntTSL 5 BASIC24.12■■□□□ 1.45
Mmp11Q02853 Arl2bp-201ENSMUST00000034228 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
Mmp11Q02853 Cetn4-201ENSMUST00000071400 1808 ntTSL 5 BASIC24.11■■□□□ 1.45
Mmp11Q02853 Suds3-202ENSMUST00000166397 1694 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
Mmp11Q02853 A730013G03Rik-202ENSMUST00000195012 2097 ntBASIC24.11■■□□□ 1.45
Mmp11Q02853 Capns1-201ENSMUST00000001845 1600 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.1■■□□□ 1.45
Mmp11Q02853 Phf23-205ENSMUST00000135814 2214 ntTSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
Mmp11Q02853 Gm9397-201ENSMUST00000200125 605 ntBASIC24.09■■□□□ 1.45
Mmp11Q02853 Nelfe-204ENSMUST00000173357 1399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
Mmp11Q02853 Cabp1-204ENSMUST00000112113 1621 ntTSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
Mmp11Q02853 Tmem189-201ENSMUST00000006587 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
Mmp11Q02853 Qrich1-209ENSMUST00000194385 975 ntTSL 2 BASIC24.06■■□□□ 1.44
Mmp11Q02853 1810026B05Rik-206ENSMUST00000187421 519 ntTSL 3 BASIC24.05■■□□□ 1.44
Mmp11Q02853 Dazap1-201ENSMUST00000092305 1994 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
Mmp11Q02853 Amer2-203ENSMUST00000225247 2662 ntBASIC24.05■■□□□ 1.44
Mmp11Q02853 Mcat-201ENSMUST00000061882 1893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
Mmp11Q02853 1190005I06Rik-201ENSMUST00000123927 844 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
Mmp11Q02853 Gsk3a-201ENSMUST00000071739 2260 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC24.04■■□□□ 1.44
Mmp11Q02853 Rras2-201ENSMUST00000069449 2275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
Mmp11Q02853 Kdm2a-203ENSMUST00000116571 2413 ntTSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
Mmp11Q02853 Sugct-202ENSMUST00000220514 1351 ntTSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
Mmp11Q02853 Zfp358-201ENSMUST00000061508 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.43
Mmp11Q02853 Ssx2ip-202ENSMUST00000106149 2416 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
Mmp11Q02853 Il3ra-201ENSMUST00000090591 1614 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
Mmp11Q02853 Gm43863-201ENSMUST00000203822 1192 ntBASIC24■■□□□ 1.43
Mmp11Q02853 Gm45855-201ENSMUST00000212546 880 ntBASIC24■■□□□ 1.43
Mmp11Q02853 Stard3nl-210ENSMUST00000222869 1030 ntTSL 5 BASIC24■■□□□ 1.43
Mmp11Q02853 Caap1-201ENSMUST00000030313 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
Mmp11Q02853 Amigo1-203ENSMUST00000106659 1360 ntTSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
Mmp11Q02853 2310050C09Rik-201ENSMUST00000163439 1078 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.97■■□□□ 1.43
Mmp11Q02853 Rab2a-201ENSMUST00000060232 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
Mmp11Q02853 Slc16a8-201ENSMUST00000039752 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
Mmp11Q02853 Pcgf5-201ENSMUST00000062389 1566 ntTSL 5 BASIC23.96■■□□□ 1.43
Mmp11Q02853 1110008F13Rik-201ENSMUST00000029165 1045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
Mmp11Q02853 Odc1-201ENSMUST00000171737 2208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
Mmp11Q02853 Cldn10-203ENSMUST00000100314 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
Mmp11Q02853 Kansl2-202ENSMUST00000116400 2110 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
Mmp11Q02853 Eid2-201ENSMUST00000059596 1392 ntAPPRIS P1 BASIC23.95■■□□□ 1.42
Mmp11Q02853 Irx4-201ENSMUST00000022095 2589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
Mmp11Q02853 Gm24970-201ENSMUST00000175582 82 ntBASIC23.95■■□□□ 1.42
Mmp11Q02853 Dleu2-206ENSMUST00000182537 318 ntTSL 2 BASIC23.95■■□□□ 1.42
Mmp11Q02853 Stard10-202ENSMUST00000163799 1723 ntTSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
Mmp11Q02853 Eif4ebp1-201ENSMUST00000033880 1997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
Mmp11Q02853 Dapk3-201ENSMUST00000047665 1676 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.92■■□□□ 1.42
Mmp11Q02853 Hdgf-201ENSMUST00000005017 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
Mmp11Q02853 1810026B05Rik-202ENSMUST00000184554 782 ntTSL 3 BASIC23.92■■□□□ 1.42
Mmp11Q02853 Dazap1-202ENSMUST00000105361 1537 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
Mmp11Q02853 C1ql1-201ENSMUST00000057849 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
Mmp11Q02853 Dlx6os2-201ENSMUST00000178206 1354 ntBASIC23.91■■□□□ 1.42
Mmp11Q02853 A530058N18Rik-204ENSMUST00000141209 709 ntTSL 5 BASIC23.91■■□□□ 1.42
Mmp11Q02853 Cpsf4-201ENSMUST00000070487 1606 ntTSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
Mmp11Q02853 Tmem243-201ENSMUST00000115365 1040 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.9■■□□□ 1.42
Mmp11Q02853 Mypop-203ENSMUST00000131087 1951 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.9■■□□□ 1.42
Mmp11Q02853 Tspan33-201ENSMUST00000046750 1994 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
Mmp11Q02853 Gm960-202ENSMUST00000177696 2262 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.9■■□□□ 1.42
Mmp11Q02853 Fam120aos-201ENSMUST00000180775 1780 ntTSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.42
Mmp11Q02853 Rtn4r-201ENSMUST00000059589 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.42
Mmp11Q02853 AC157572.2-201ENSMUST00000226970 908 ntBASIC23.89■■□□□ 1.41
Mmp11Q02853 Tor1a-201ENSMUST00000028200 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
Mmp11Q02853 Mthfd2l-203ENSMUST00000202781 688 ntTSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 42.9 ms