Protein–RNA interactions for Protein: P83917

Cbx1, Chromobox protein homolog 1, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 185 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cbx1P83917 Pom121-201ENSMUST00000111171 5580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.32■■□□□ 1.8
Cbx1P83917 Rnf19b-206ENSMUST00000168461 2532 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC26.32■■□□□ 1.8
Cbx1P83917 Habp4-201ENSMUST00000021929 2564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.32■■□□□ 1.8
Cbx1P83917 Ltk-201ENSMUST00000028759 3080 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC26.32■■□□□ 1.8
Cbx1P83917 Nrgn-201ENSMUST00000065668 1453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.31■■□□□ 1.8
Cbx1P83917 Ccdc9-201ENSMUST00000041010 2379 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.31■■□□□ 1.8
Cbx1P83917 Ran-202ENSMUST00000111343 2423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.31■■□□□ 1.8
Cbx1P83917 St7-202ENSMUST00000052113 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.31■■□□□ 1.8
Cbx1P83917 Dennd5a-202ENSMUST00000106722 4862 ntTSL 1 (best) BASIC26.31■■□□□ 1.8
Cbx1P83917 Vps37b-201ENSMUST00000040967 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.3■■□□□ 1.8
Cbx1P83917 Cadm1-202ENSMUST00000085909 2126 ntTSL 1 (best) BASIC26.29■■□□□ 1.8
Cbx1P83917 Clk2-201ENSMUST00000090927 2128 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.29■■□□□ 1.8
Cbx1P83917 Kat2b-201ENSMUST00000000724 4653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.28■■□□□ 1.8
Cbx1P83917 Phf23-205ENSMUST00000135814 2214 ntTSL 1 (best) BASIC26.28■■□□□ 1.8
Cbx1P83917 P3h4-201ENSMUST00000066489 2178 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.27■■□□□ 1.8
Cbx1P83917 5031425E22Rik-201ENSMUST00000101522 2110 ntBASIC26.27■■□□□ 1.8
Cbx1P83917 Pdgfb-201ENSMUST00000000500 2918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.26■■□□□ 1.79
Cbx1P83917 Homer3-201ENSMUST00000003669 2323 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.25■■□□□ 1.79
Cbx1P83917 Ctnnd2-201ENSMUST00000081728 5944 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.25■■□□□ 1.79
Cbx1P83917 Ssbp3-202ENSMUST00000072753 1924 ntTSL 1 (best) BASIC26.24■■□□□ 1.79
Cbx1P83917 Ctage5-218ENSMUST00000177162 2728 ntTSL 5 BASIC26.23■■□□□ 1.79
Cbx1P83917 Msl2-202ENSMUST00000189616 2612 ntTSL 5 BASIC26.23■■□□□ 1.79
Cbx1P83917 Tusc1-201ENSMUST00000066774 1374 ntAPPRIS P1 BASIC26.22■■□□□ 1.79
Cbx1P83917 Sox1-201ENSMUST00000180353 4832 ntAPPRIS P1 BASIC26.22■■□□□ 1.79
Cbx1P83917 Kctd15-202ENSMUST00000108069 2407 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.21■■□□□ 1.79
Cbx1P83917 Det1-201ENSMUST00000032839 2269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.21■■□□□ 1.79
Cbx1P83917 Arglu1-201ENSMUST00000048545 3197 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.2■■□□□ 1.79
Cbx1P83917 Kif1bp-206ENSMUST00000162525 2311 ntTSL 5 BASIC26.19■■□□□ 1.78
Cbx1P83917 B4galt2-201ENSMUST00000030266 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.19■■□□□ 1.78
Cbx1P83917 Tmem143-201ENSMUST00000069772 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.18■■□□□ 1.78
Cbx1P83917 Crlf1-201ENSMUST00000008032 1644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.18■■□□□ 1.78
Cbx1P83917 Taf4-201ENSMUST00000041618 4416 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.18■■□□□ 1.78
Cbx1P83917 Hoxb3-202ENSMUST00000093944 3190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.18■■□□□ 1.78
Cbx1P83917 H1f0-201ENSMUST00000180086 2287 ntAPPRIS P1 BASIC26.18■■□□□ 1.78
Cbx1P83917 Znrf2-201ENSMUST00000079869 5886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.18■■□□□ 1.78
Cbx1P83917 Pdcd4-201ENSMUST00000025931 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.17■■□□□ 1.78
Cbx1P83917 Casp9-202ENSMUST00000097805 1498 ntTSL 1 (best) BASIC26.17■■□□□ 1.78
Cbx1P83917 Deaf1-201ENSMUST00000080553 2135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.17■■□□□ 1.78
Cbx1P83917 H2afy-202ENSMUST00000045788 1933 ntTSL 1 (best) BASIC26.17■■□□□ 1.78
Cbx1P83917 Dpf1-204ENSMUST00000108231 2040 ntTSL 5 BASIC26.16■■□□□ 1.78
Cbx1P83917 Efcc1-202ENSMUST00000159570 2293 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC26.14■■□□□ 1.78
Cbx1P83917 Phf14-203ENSMUST00000115511 3336 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.14■■□□□ 1.78
Cbx1P83917 Klhl22-201ENSMUST00000117192 2754 ntTSL 5 BASIC26.13■■□□□ 1.77
Cbx1P83917 Kdm2a-208ENSMUST00000176483 1128 ntTSL 1 (best) BASIC26.13■■□□□ 1.77
Cbx1P83917 Ssbp3-203ENSMUST00000097934 1742 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.12■■□□□ 1.77
Cbx1P83917 Fam174a-201ENSMUST00000059975 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.12■■□□□ 1.77
Cbx1P83917 Smarcc1-203ENSMUST00000197480 1949 ntTSL 1 (best) BASIC26.12■■□□□ 1.77
Cbx1P83917 Gjc1-201ENSMUST00000068933 1903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.12■■□□□ 1.77
Cbx1P83917 Ccz1-201ENSMUST00000031621 1769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.11■■□□□ 1.77
Cbx1P83917 Foxd2-201ENSMUST00000068654 2592 ntAPPRIS P1 BASIC26.11■■□□□ 1.77
Cbx1P83917 Ildr2-206ENSMUST00000194964 2467 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.11■■□□□ 1.77
Cbx1P83917 Ube2q1-201ENSMUST00000038356 3077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.11■■□□□ 1.77
Cbx1P83917 Ubp1-204ENSMUST00000214095 2320 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.1■■□□□ 1.77
Cbx1P83917 Sox3-201ENSMUST00000135107 2065 ntAPPRIS P1 BASIC26.1■■□□□ 1.77
Cbx1P83917 Igfbp3-201ENSMUST00000020702 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.1■■□□□ 1.77
Cbx1P83917 Paqr3-202ENSMUST00000112968 1875 ntTSL 1 (best) BASIC26.1■■□□□ 1.77
Cbx1P83917 Gm17494-201ENSMUST00000072769 1800 ntTSL 1 (best) BASIC26.09■■□□□ 1.77
Cbx1P83917 Gm6345-201ENSMUST00000180378 1691 ntBASIC26.09■■□□□ 1.77
Cbx1P83917 Pgbd5-204ENSMUST00000140012 3222 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.08■■□□□ 1.77
Cbx1P83917 Bzw1-202ENSMUST00000186949 1492 ntTSL 5 BASIC26.08■■□□□ 1.77
Cbx1P83917 Ei24-201ENSMUST00000115086 2220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.08■■□□□ 1.77
Cbx1P83917 Tgfbr1-205ENSMUST00000126171 1829 ntTSL 5 BASIC26.07■■□□□ 1.76
Cbx1P83917 Fcnaos-201ENSMUST00000127642 1351 ntTSL 1 (best) BASIC26.07■■□□□ 1.76
Cbx1P83917 Ctage5-203ENSMUST00000170992 2785 ntTSL 1 (best) BASIC26.06■■□□□ 1.76
Cbx1P83917 Zswim5-201ENSMUST00000044823 5582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.06■■□□□ 1.76
Cbx1P83917 Cdc14b-207ENSMUST00000221634 1953 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.06■■□□□ 1.76
Cbx1P83917 Drd4-201ENSMUST00000026569 2799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.05■■□□□ 1.76
Cbx1P83917 Foxe1-201ENSMUST00000095097 2804 ntAPPRIS P1 BASIC26.05■■□□□ 1.76
Cbx1P83917 Tead1-203ENSMUST00000084705 2543 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.05■■□□□ 1.76
Cbx1P83917 Tcf4-246ENSMUST00000202116 2986 ntTSL 1 (best) BASIC26.04■■□□□ 1.76
Cbx1P83917 Kansl1l-202ENSMUST00000113987 2342 ntTSL 1 (best) BASIC26.03■■□□□ 1.76
Cbx1P83917 Dusp5-201ENSMUST00000038287 2473 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.03■■□□□ 1.76
Cbx1P83917 Dedd-204ENSMUST00000111300 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
Cbx1P83917 Larp4b-204ENSMUST00000188939 2658 ntTSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
Cbx1P83917 Wwc1-201ENSMUST00000018993 4531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
Cbx1P83917 Raly-202ENSMUST00000058089 1747 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
Cbx1P83917 Elf2-204ENSMUST00000108053 2611 ntTSL 1 (best) BASIC26.01■■□□□ 1.76
Cbx1P83917 Elf2-203ENSMUST00000108051 2514 ntTSL 1 (best) BASIC26.01■■□□□ 1.75
Cbx1P83917 Ddx43-201ENSMUST00000113367 2207 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.01■■□□□ 1.75
Cbx1P83917 St7-208ENSMUST00000115419 2194 ntTSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
Cbx1P83917 Qk-202ENSMUST00000097414 4658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.99■■□□□ 1.75
Cbx1P83917 Fam204a-201ENSMUST00000065286 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.99■■□□□ 1.75
Cbx1P83917 Amigo1-201ENSMUST00000050909 5030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.99■■□□□ 1.75
Cbx1P83917 2510039O18Rik-201ENSMUST00000103232 2731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.99■■□□□ 1.75
Cbx1P83917 Usp12-201ENSMUST00000085614 4327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.99■■□□□ 1.75
Cbx1P83917 Runx3-202ENSMUST00000119564 1855 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.98■■□□□ 1.75
Cbx1P83917 Slc17a7-201ENSMUST00000085374 2915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.98■■□□□ 1.75
Cbx1P83917 Grin2d-203ENSMUST00000211713 5244 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.98■■□□□ 1.75
Cbx1P83917 Prelid3b-201ENSMUST00000016401 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.98■■□□□ 1.75
Cbx1P83917 Insc-208ENSMUST00000169913 2321 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.98■■□□□ 1.75
Cbx1P83917 Epb41l4b-201ENSMUST00000030142 3247 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.97■■□□□ 1.75
Cbx1P83917 Hnrnpl-201ENSMUST00000038572 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.97■■□□□ 1.75
Cbx1P83917 Impdh1-201ENSMUST00000078155 2437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.97■■□□□ 1.75
Cbx1P83917 Rtn4r-201ENSMUST00000059589 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.97■■□□□ 1.75
Cbx1P83917 St6galnac6-203ENSMUST00000095044 2394 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.96■■□□□ 1.75
Cbx1P83917 Fkbp8-204ENSMUST00000119698 1799 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.95■■□□□ 1.75
Cbx1P83917 Dact1-202ENSMUST00000150639 2448 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.95■■□□□ 1.75
Cbx1P83917 Mast2-203ENSMUST00000106485 5705 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.95■■□□□ 1.74
Cbx1P83917 Mast2-204ENSMUST00000106486 5723 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.95■■□□□ 1.74
Cbx1P83917 Il17rd-202ENSMUST00000223942 2186 ntBASIC25.93■■□□□ 1.74
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 13.2 ms