Protein–RNA interactions for Protein: P70270

Rad54l, DNA repair and recombination protein RAD54-like, mousemouse

Predictions only

Length 747 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rad54lP70270 Fkbp8-202ENSMUST00000119353 1720 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.41■■□□□ 1.82
Rad54lP70270 Fbxo6-201ENSMUST00000030858 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.4■■□□□ 1.82
Rad54lP70270 Junos-204ENSMUST00000128094 830 ntTSL 1 (best) BASIC26.4■■□□□ 1.82
Rad54lP70270 Gm15672-201ENSMUST00000151512 1354 ntTSL 1 (best) BASIC26.4■■□□□ 1.82
Rad54lP70270 Dcaf15-202ENSMUST00000210279 2199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.4■■□□□ 1.82
Rad54lP70270 Cldnd1-201ENSMUST00000023426 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.39■■□□□ 1.82
Rad54lP70270 Popdc3-201ENSMUST00000019994 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.39■■□□□ 1.82
Rad54lP70270 Hrh3-208ENSMUST00000171736 906 ntTSL 5 BASIC26.39■■□□□ 1.82
Rad54lP70270 Kmt5a-202ENSMUST00000100709 1425 ntTSL 1 (best) BASIC26.39■■□□□ 1.81
Rad54lP70270 Zfp787-201ENSMUST00000094870 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.38■■□□□ 1.81
Rad54lP70270 Ildr2-205ENSMUST00000193860 2320 ntTSL 1 (best) BASIC26.37■■□□□ 1.81
Rad54lP70270 Zfp131-206ENSMUST00000223813 2561 ntAPPRIS P3 BASIC26.36■■□□□ 1.81
Rad54lP70270 4921531C22Rik-201ENSMUST00000150145 1905 ntTSL 1 (best) BASIC26.36■■□□□ 1.81
Rad54lP70270 1700016A09Rik-201ENSMUST00000192004 835 ntBASIC26.35■■□□□ 1.81
Rad54lP70270 Rbm17-201ENSMUST00000040314 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.35■■□□□ 1.81
Rad54lP70270 Dedd-201ENSMUST00000064950 1618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.33■■□□□ 1.81
Rad54lP70270 Aspscr1-201ENSMUST00000026135 1820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.33■■□□□ 1.81
Rad54lP70270 Dtnb-211ENSMUST00000173240 2218 ntTSL 5 BASIC26.33■■□□□ 1.81
Rad54lP70270 1700069B07Rik-202ENSMUST00000191155 939 ntBASIC26.33■■□□□ 1.81
Rad54lP70270 Pard6a-205ENSMUST00000212430 1261 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.33■■□□□ 1.81
Rad54lP70270 Clk2-201ENSMUST00000090927 2128 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.32■■□□□ 1.8
Rad54lP70270 A430072P03Rik-201ENSMUST00000161480 1510 ntTSL 1 (best) BASIC26.32■■□□□ 1.8
Rad54lP70270 A530058N18Rik-208ENSMUST00000131299 1387 ntTSL 2 BASIC26.32■■□□□ 1.8
Rad54lP70270 Dda1-209ENSMUST00000147642 1865 ntTSL 2 BASIC26.32■■□□□ 1.8
Rad54lP70270 Fam241a-201ENSMUST00000057198 1607 ntTSL 1 (best) BASIC26.32■■□□□ 1.8
Rad54lP70270 Smad2-202ENSMUST00000091831 1645 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC26.28■■□□□ 1.8
Rad54lP70270 Gm17494-201ENSMUST00000072769 1800 ntTSL 1 (best) BASIC26.28■■□□□ 1.8
Rad54lP70270 5730480H06Rik-201ENSMUST00000030968 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.28■■□□□ 1.8
Rad54lP70270 Tlx3-201ENSMUST00000037746 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.26■■□□□ 1.79
Rad54lP70270 Snx3-201ENSMUST00000019939 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.26■■□□□ 1.79
Rad54lP70270 Srp9-201ENSMUST00000027792 1367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.26■■□□□ 1.79
Rad54lP70270 Gltp-203ENSMUST00000112214 944 ntTSL 3 BASIC26.26■■□□□ 1.79
Rad54lP70270 Clk2-203ENSMUST00000121931 2112 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC26.26■■□□□ 1.79
Rad54lP70270 Cetn4-201ENSMUST00000071400 1808 ntTSL 5 BASIC26.25■■□□□ 1.79
Rad54lP70270 Mpp6-203ENSMUST00000166318 2222 ntTSL 1 (best) BASIC26.25■■□□□ 1.79
Rad54lP70270 Arl2bp-201ENSMUST00000034228 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.25■■□□□ 1.79
Rad54lP70270 Stau2-210ENSMUST00000149320 2214 ntTSL 5 BASIC26.24■■□□□ 1.79
Rad54lP70270 March2-205ENSMUST00000173015 1418 ntTSL 3 BASIC26.24■■□□□ 1.79
Rad54lP70270 Galnt12-202ENSMUST00000107744 2077 ntTSL 1 (best) BASIC26.23■■□□□ 1.79
Rad54lP70270 A730013G03Rik-202ENSMUST00000195012 2097 ntBASIC26.21■■□□□ 1.79
Rad54lP70270 Tdp2-203ENSMUST00000223804 1136 ntBASIC26.21■■□□□ 1.79
Rad54lP70270 Twist1-201ENSMUST00000049089 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.21■■□□□ 1.79
Rad54lP70270 Mogs-201ENSMUST00000032114 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.2■■□□□ 1.79
Rad54lP70270 Suds3-202ENSMUST00000166397 1694 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.2■■□□□ 1.78
Rad54lP70270 Phf23-205ENSMUST00000135814 2214 ntTSL 1 (best) BASIC26.18■■□□□ 1.78
Rad54lP70270 BC037032-205ENSMUST00000187080 508 ntTSL 5 BASIC26.18■■□□□ 1.78
Rad54lP70270 Nelfe-204ENSMUST00000173357 1399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.18■■□□□ 1.78
Rad54lP70270 Tmem189-201ENSMUST00000006587 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.17■■□□□ 1.78
Rad54lP70270 Cabp1-204ENSMUST00000112113 1621 ntTSL 1 (best) BASIC26.16■■□□□ 1.78
Rad54lP70270 Gsk3a-201ENSMUST00000071739 2260 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC26.16■■□□□ 1.78
Rad54lP70270 Gm9397-201ENSMUST00000200125 605 ntBASIC26.15■■□□□ 1.78
Rad54lP70270 Dazap1-201ENSMUST00000092305 1994 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.15■■□□□ 1.78
Rad54lP70270 Capns1-201ENSMUST00000001845 1600 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC26.14■■□□□ 1.78
Rad54lP70270 Kdm2a-203ENSMUST00000116571 2413 ntTSL 1 (best) BASIC26.14■■□□□ 1.78
Rad54lP70270 Zfp358-201ENSMUST00000061508 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.14■■□□□ 1.77
Rad54lP70270 Rras2-201ENSMUST00000069449 2275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.14■■□□□ 1.77
Rad54lP70270 Amer2-203ENSMUST00000225247 2662 ntBASIC26.13■■□□□ 1.77
Rad54lP70270 Mcat-201ENSMUST00000061882 1893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.13■■□□□ 1.77
Rad54lP70270 1810026B05Rik-206ENSMUST00000187421 519 ntTSL 3 BASIC26.11■■□□□ 1.77
Rad54lP70270 Qrich1-209ENSMUST00000194385 975 ntTSL 2 BASIC26.11■■□□□ 1.77
Rad54lP70270 Ssx2ip-202ENSMUST00000106149 2416 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.1■■□□□ 1.77
Rad54lP70270 Sugct-202ENSMUST00000220514 1351 ntTSL 1 (best) BASIC26.1■■□□□ 1.77
Rad54lP70270 Caap1-201ENSMUST00000030313 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.1■■□□□ 1.77
Rad54lP70270 Rab2a-201ENSMUST00000060232 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.09■■□□□ 1.77
Rad54lP70270 Il3ra-201ENSMUST00000090591 1614 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.08■■□□□ 1.77
Rad54lP70270 1190005I06Rik-201ENSMUST00000123927 844 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.08■■□□□ 1.77
Rad54lP70270 Gm43863-201ENSMUST00000203822 1192 ntBASIC26.08■■□□□ 1.77
Rad54lP70270 Amigo1-203ENSMUST00000106659 1360 ntTSL 1 (best) BASIC26.07■■□□□ 1.76
Rad54lP70270 Cldn10-203ENSMUST00000100314 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.06■■□□□ 1.76
Rad54lP70270 Stard3nl-210ENSMUST00000222869 1030 ntTSL 5 BASIC26.06■■□□□ 1.76
Rad54lP70270 Slc16a8-201ENSMUST00000039752 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.05■■□□□ 1.76
Rad54lP70270 Pcgf5-201ENSMUST00000062389 1566 ntTSL 5 BASIC26.05■■□□□ 1.76
Rad54lP70270 Kansl2-202ENSMUST00000116400 2110 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.05■■□□□ 1.76
Rad54lP70270 Dapk3-201ENSMUST00000047665 1676 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.04■■□□□ 1.76
Rad54lP70270 2310050C09Rik-201ENSMUST00000163439 1078 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.04■■□□□ 1.76
Rad54lP70270 Odc1-201ENSMUST00000171737 2208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.03■■□□□ 1.76
Rad54lP70270 Gm45855-201ENSMUST00000212546 880 ntBASIC26.03■■□□□ 1.76
Rad54lP70270 Eid2-201ENSMUST00000059596 1392 ntAPPRIS P1 BASIC26.03■■□□□ 1.76
Rad54lP70270 Stard10-202ENSMUST00000163799 1723 ntTSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
Rad54lP70270 Eif4ebp1-201ENSMUST00000033880 1997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
Rad54lP70270 Dleu2-206ENSMUST00000182537 318 ntTSL 2 BASIC26.02■■□□□ 1.76
Rad54lP70270 Mypop-203ENSMUST00000131087 1951 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.02■■□□□ 1.76
Rad54lP70270 C1ql1-201ENSMUST00000057849 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.01■■□□□ 1.75
Rad54lP70270 Gm960-202ENSMUST00000177696 2262 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC26■■□□□ 1.75
Rad54lP70270 Hdgf-201ENSMUST00000005017 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
Rad54lP70270 Tor1a-201ENSMUST00000028200 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
Rad54lP70270 Irx4-201ENSMUST00000022095 2589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
Rad54lP70270 Gm24970-201ENSMUST00000175582 82 ntBASIC26■■□□□ 1.75
Rad54lP70270 E030037K01Rik-201ENSMUST00000180928 1756 ntBASIC26■■□□□ 1.75
Rad54lP70270 1110008F13Rik-201ENSMUST00000029165 1045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.99■■□□□ 1.75
Rad54lP70270 Tspan33-201ENSMUST00000046750 1994 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.98■■□□□ 1.75
Rad54lP70270 Fam120aos-201ENSMUST00000180775 1780 ntTSL 1 (best) BASIC25.98■■□□□ 1.75
Rad54lP70270 Cpsf4-201ENSMUST00000070487 1606 ntTSL 1 (best) BASIC25.98■■□□□ 1.75
Rad54lP70270 Rtn4r-201ENSMUST00000059589 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.98■■□□□ 1.75
Rad54lP70270 Dazap1-202ENSMUST00000105361 1537 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.98■■□□□ 1.75
Rad54lP70270 Mat2b-201ENSMUST00000040167 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.96■■□□□ 1.75
Rad54lP70270 A530058N18Rik-204ENSMUST00000141209 709 ntTSL 5 BASIC25.96■■□□□ 1.75
Rad54lP70270 1810026B05Rik-202ENSMUST00000184554 782 ntTSL 3 BASIC25.96■■□□□ 1.75
Rad54lP70270 AC157572.2-201ENSMUST00000226970 908 ntBASIC25.96■■□□□ 1.75
Rad54lP70270 Yrdc-201ENSMUST00000102628 1634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.96■■□□□ 1.75
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 31.9 ms