Protein–RNA interactions for Protein: P63260

Actg1, Actin, cytoplasmic 2, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 375 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Actg1P63260 Amigo1-201ENSMUST00000050909 5030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
Actg1P63260 Dennd5a-202ENSMUST00000106722 4862 ntTSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Actg1P63260 Neurog2-201ENSMUST00000029587 2227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Actg1P63260 Susd4-202ENSMUST00000153348 1898 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.41■■□□□ 1.02
Actg1P63260 Fbll1-201ENSMUST00000160726 1503 ntAPPRIS P1 BASIC21.4■■□□□ 1.02
Actg1P63260 Kansl2-201ENSMUST00000023727 2311 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.4■■□□□ 1.02
Actg1P63260 Ryk-201ENSMUST00000035142 2852 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Actg1P63260 Rcor2-201ENSMUST00000066646 2801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.02
Actg1P63260 Bin1-202ENSMUST00000091967 2118 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Actg1P63260 Eif2ak3-204ENSMUST00000162950 927 ntTSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Actg1P63260 Clk2-201ENSMUST00000090927 2128 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Actg1P63260 Tbx1-201ENSMUST00000009241 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Actg1P63260 Rab40c-209ENSMUST00000179998 2456 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.37■■□□□ 1.01
Actg1P63260 Maz-201ENSMUST00000032916 2347 ntTSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Actg1P63260 Efemp2-201ENSMUST00000070118 1781 ntTSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Actg1P63260 Mfsd5-201ENSMUST00000051341 1742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Actg1P63260 Dtnb-203ENSMUST00000164578 2355 ntTSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Actg1P63260 Dda1-209ENSMUST00000147642 1865 ntTSL 2 BASIC21.37■■□□□ 1.01
Actg1P63260 Gm17494-201ENSMUST00000072769 1800 ntTSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Actg1P63260 Adgrb1-203ENSMUST00000185682 2744 ntTSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Actg1P63260 Klhl35-201ENSMUST00000037359 1954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Actg1P63260 Lsm4-204ENSMUST00000210071 575 ntTSL 5 BASIC21.35■■□□□ 1.01
Actg1P63260 Crlf1-201ENSMUST00000008032 1644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Actg1P63260 Kcna7-201ENSMUST00000107774 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Actg1P63260 Tdp2-203ENSMUST00000223804 1136 ntBASIC21.33■■□□□ 1.01
Actg1P63260 Cebpb-201ENSMUST00000070642 1504 ntAPPRIS P1 BASIC21.33■■□□□ 1
Actg1P63260 Exosc6-201ENSMUST00000210390 1326 ntAPPRIS P1 BASIC21.32■■□□□ 1
Actg1P63260 Dpf1-204ENSMUST00000108231 2040 ntTSL 5 BASIC21.32■■□□□ 1
Actg1P63260 Tsc22d1-204ENSMUST00000110888 4999 ntTSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Actg1P63260 Reep6-203ENSMUST00000105355 2127 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Actg1P63260 Reep6-204ENSMUST00000105357 2127 ntTSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Actg1P63260 Rras2-201ENSMUST00000069449 2275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Actg1P63260 Heca-201ENSMUST00000037879 5098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Actg1P63260 Acvr2b-202ENSMUST00000165044 2093 ntTSL 2 BASIC21.29■■□□□ 1
Actg1P63260 Eif4e2-203ENSMUST00000113230 1569 ntTSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Actg1P63260 Znrf2-201ENSMUST00000079869 5886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Actg1P63260 Zfp358-201ENSMUST00000061508 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Actg1P63260 Clk2-202ENSMUST00000121212 2154 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
Actg1P63260 Panx2-202ENSMUST00000161372 2314 ntTSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
Actg1P63260 Xkr7-201ENSMUST00000037235 2711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
Actg1P63260 Arhgdia-201ENSMUST00000067936 2150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
Actg1P63260 Aspscr1-201ENSMUST00000026135 1820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■□□□□ 0.99
Actg1P63260 Rcan1-202ENSMUST00000060005 2324 ntTSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Actg1P63260 AC150314.2-201ENSMUST00000214135 834 ntTSL 5 BASIC21.26■□□□□ 0.99
Actg1P63260 Gm960-204ENSMUST00000225896 2202 ntAPPRIS ALT2 BASIC21.24■□□□□ 0.99
Actg1P63260 Coq10a-207ENSMUST00000220227 1434 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.24■□□□□ 0.99
Actg1P63260 Sept11-208ENSMUST00000202308 1792 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.24■□□□□ 0.99
Actg1P63260 Fam60a-203ENSMUST00000111562 906 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.24■□□□□ 0.99
Actg1P63260 Cenpv-201ENSMUST00000018653 1032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
Actg1P63260 Abhd17a-201ENSMUST00000003436 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
Actg1P63260 Paip1-203ENSMUST00000126957 1731 ntTSL 5 BASIC21.24■□□□□ 0.99
Actg1P63260 Dhrs13-203ENSMUST00000122342 1791 ntTSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
Actg1P63260 1700028N14Rik-201ENSMUST00000139621 747 ntTSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
Actg1P63260 Phf23-205ENSMUST00000135814 2214 ntTSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
Actg1P63260 Maz-204ENSMUST00000206254 2282 ntTSL 5 BASIC21.21■□□□□ 0.99
Actg1P63260 Irx4-201ENSMUST00000022095 2589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
Actg1P63260 Vdac3-202ENSMUST00000179233 1423 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
Actg1P63260 Foxk2-201ENSMUST00000106113 5029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.99
Actg1P63260 Eed-201ENSMUST00000107234 2067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
Actg1P63260 Dapk3-202ENSMUST00000178422 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
Actg1P63260 Gkap1-201ENSMUST00000091579 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
Actg1P63260 Gm527-203ENSMUST00000220993 1090 ntTSL 5 BASIC21.18■□□□□ 0.98
Actg1P63260 Lmo2-201ENSMUST00000111139 1434 ntTSL 5 BASIC21.18■□□□□ 0.98
Actg1P63260 Irak1-207ENSMUST00000114360 2441 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
Actg1P63260 Hnrnpd-202ENSMUST00000072750 1537 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC21.18■□□□□ 0.98
Actg1P63260 1700016A09Rik-201ENSMUST00000192004 835 ntBASIC21.17■□□□□ 0.98
Actg1P63260 Clptm1l-201ENSMUST00000022102 2340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
Actg1P63260 Sh3glb2-203ENSMUST00000113620 1694 ntTSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
Actg1P63260 Smurf1-202ENSMUST00000100461 2725 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
Actg1P63260 St7-202ENSMUST00000052113 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
Actg1P63260 CT030161.2-201ENSMUST00000218666 735 ntTSL 3 BASIC21.14■□□□□ 0.97
Actg1P63260 Btf3-201ENSMUST00000022163 1091 ntTSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
Actg1P63260 AC153890.1-201ENSMUST00000220021 2469 ntBASIC21.13■□□□□ 0.97
Actg1P63260 Rnf19b-201ENSMUST00000030584 2414 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.13■□□□□ 0.97
Actg1P63260 Gm30346-201ENSMUST00000218641 1699 ntBASIC21.13■□□□□ 0.97
Actg1P63260 1190005I06Rik-201ENSMUST00000123927 844 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
Actg1P63260 Mrps7-201ENSMUST00000058109 1962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
Actg1P63260 Gpr12-201ENSMUST00000036211 2219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
Actg1P63260 Cited2-203ENSMUST00000219558 2411 ntAPPRIS P1 BASIC21.13■□□□□ 0.97
Actg1P63260 Pdia5-201ENSMUST00000023550 1808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
Actg1P63260 Fam69b-201ENSMUST00000074240 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
Actg1P63260 Fam220a-206ENSMUST00000196487 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
Actg1P63260 Ccdc122-202ENSMUST00000095625 1195 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
Actg1P63260 Galnt12-202ENSMUST00000107744 2077 ntTSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
Actg1P63260 Nrtn-201ENSMUST00000044752 1023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
Actg1P63260 Nr2f6-201ENSMUST00000002466 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
Actg1P63260 Ctbp1-211ENSMUST00000202868 2436 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
Actg1P63260 E2f6-201ENSMUST00000020908 2418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
Actg1P63260 Isoc1-201ENSMUST00000025503 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
Actg1P63260 Ctnnd2-201ENSMUST00000081728 5944 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
Actg1P63260 Zfp422-201ENSMUST00000057540 2375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
Actg1P63260 Pom121-201ENSMUST00000111171 5580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
Actg1P63260 A530058N18Rik-201ENSMUST00000128469 646 ntTSL 2 BASIC21.09■□□□□ 0.97
Actg1P63260 Gm45855-201ENSMUST00000212546 880 ntBASIC21.09■□□□□ 0.97
Actg1P63260 Gm10762-201ENSMUST00000099385 1133 ntAPPRIS P1 BASIC21.09■□□□□ 0.97
Actg1P63260 Popdc3-202ENSMUST00000161803 1369 ntTSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
Actg1P63260 Rnf130-202ENSMUST00000102776 1502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
Actg1P63260 Tnfsfm13-201ENSMUST00000108649 1049 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.08■□□□□ 0.97
Actg1P63260 Fam136a-201ENSMUST00000071492 1643 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
Actg1P63260 Cadps-201ENSMUST00000067491 5421 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 18 ms