Protein–RNA interactions for Protein: P62274

Rps29, 40S ribosomal protein S29, mousemouse

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Length 56 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rps29P62274 Iffo2-203ENSMUST00000174078 5716 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.16□□□□□ -0.14
Rps29P62274 Dazap1-203ENSMUST00000105362 2081 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.16□□□□□ -0.14
Rps29P62274 Tpst1-201ENSMUST00000040721 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.15□□□□□ -0.14
Rps29P62274 Rundc3a-204ENSMUST00000107105 1861 ntTSL 1 (best) BASIC14.15□□□□□ -0.14
Rps29P62274 Rnf220-212ENSMUST00000221654 1949 ntTSL 1 (best) BASIC14.14□□□□□ -0.15
Rps29P62274 Tmem243-201ENSMUST00000115365 1040 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.14□□□□□ -0.15
Rps29P62274 Fkbp8-202ENSMUST00000119353 1720 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.14□□□□□ -0.15
Rps29P62274 Cabp1-204ENSMUST00000112113 1621 ntTSL 1 (best) BASIC14.14□□□□□ -0.15
Rps29P62274 Il3ra-201ENSMUST00000090591 1614 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.14□□□□□ -0.15
Rps29P62274 Gm43863-201ENSMUST00000203822 1192 ntBASIC14.13□□□□□ -0.15
Rps29P62274 Tlx3-201ENSMUST00000037746 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.13□□□□□ -0.15
Rps29P62274 Cdk2ap1-201ENSMUST00000031341 1315 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.13□□□□□ -0.15
Rps29P62274 Gltp-203ENSMUST00000112214 944 ntTSL 3 BASIC14.12□□□□□ -0.15
Rps29P62274 1190005I06Rik-201ENSMUST00000123927 844 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.12□□□□□ -0.15
Rps29P62274 Zxda-201ENSMUST00000117281 2621 ntBASIC14.12□□□□□ -0.15
Rps29P62274 Hexdc-202ENSMUST00000106117 2149 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.12□□□□□ -0.15
Rps29P62274 Traf4-201ENSMUST00000017530 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.11□□□□□ -0.15
Rps29P62274 A530058N18Rik-204ENSMUST00000141209 709 ntTSL 5 BASIC14.11□□□□□ -0.15
Rps29P62274 Qrich1-209ENSMUST00000194385 975 ntTSL 2 BASIC14.11□□□□□ -0.15
Rps29P62274 Gm45855-201ENSMUST00000212546 880 ntBASIC14.11□□□□□ -0.15
Rps29P62274 Stard3nl-210ENSMUST00000222869 1030 ntTSL 5 BASIC14.11□□□□□ -0.15
Rps29P62274 AC157572.2-201ENSMUST00000226970 908 ntBASIC14.11□□□□□ -0.15
Rps29P62274 Cpsf4-201ENSMUST00000070487 1606 ntTSL 1 (best) BASIC14.11□□□□□ -0.15
Rps29P62274 Aspscr1-201ENSMUST00000026135 1820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.11□□□□□ -0.15
Rps29P62274 1810026B05Rik-206ENSMUST00000187421 519 ntTSL 3 BASIC14.1□□□□□ -0.15
Rps29P62274 Ric1-206ENSMUST00000162184 2157 ntTSL 1 (best) BASIC14.1□□□□□ -0.15
Rps29P62274 Fam241a-201ENSMUST00000057198 1607 ntTSL 1 (best) BASIC14.09□□□□□ -0.15
Rps29P62274 Gm9905-201ENSMUST00000065740 1845 ntBASIC14.09□□□□□ -0.15
Rps29P62274 Pcgf5-201ENSMUST00000062389 1566 ntTSL 5 BASIC14.09□□□□□ -0.15
Rps29P62274 Amigo1-203ENSMUST00000106659 1360 ntTSL 1 (best) BASIC14.09□□□□□ -0.15
Rps29P62274 Tmeff1-201ENSMUST00000030032 2461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.08□□□□□ -0.15
Rps29P62274 C1ql1-201ENSMUST00000057849 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.08□□□□□ -0.16
Rps29P62274 Dmwd-201ENSMUST00000032570 2494 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.08□□□□□ -0.16
Rps29P62274 Eid2-201ENSMUST00000059596 1392 ntAPPRIS P1 BASIC14.08□□□□□ -0.16
Rps29P62274 2310050C09Rik-201ENSMUST00000163439 1078 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.07□□□□□ -0.16
Rps29P62274 B4galt7-202ENSMUST00000100764 2195 ntTSL 1 (best) BASIC14.07□□□□□ -0.16
Rps29P62274 Sugct-202ENSMUST00000220514 1351 ntTSL 1 (best) BASIC14.07□□□□□ -0.16
Rps29P62274 Dtnbp1-201ENSMUST00000072329 1362 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.06□□□□□ -0.16
Rps29P62274 Cxxc4-203ENSMUST00000181904 5694 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.06□□□□□ -0.16
Rps29P62274 Dazap1-202ENSMUST00000105361 1537 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.05□□□□□ -0.16
Rps29P62274 Dcaf15-202ENSMUST00000210279 2199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.05□□□□□ -0.16
Rps29P62274 Smarcc2-205ENSMUST00000218228 603 ntTSL 5 BASIC14.04□□□□□ -0.16
Rps29P62274 Galnt12-201ENSMUST00000045041 2288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.04□□□□□ -0.16
Rps29P62274 Twist1-201ENSMUST00000049089 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.04□□□□□ -0.16
Rps29P62274 Cetn4-201ENSMUST00000071400 1808 ntTSL 5 BASIC14.04□□□□□ -0.16
Rps29P62274 Mthfd2l-203ENSMUST00000202781 688 ntTSL 1 (best) BASIC14.03□□□□□ -0.16
Rps29P62274 Ap1ar-210ENSMUST00000200409 2580 ntTSL 5 BASIC14.02□□□□□ -0.16
Rps29P62274 Fgf20-201ENSMUST00000034014 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.01□□□□□ -0.17
Rps29P62274 A730013G03Rik-202ENSMUST00000195012 2097 ntBASIC14.01□□□□□ -0.17
Rps29P62274 Ctbp1-201ENSMUST00000079746 2279 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.01□□□□□ -0.17
Rps29P62274 Gm43445-201ENSMUST00000198564 2091 ntBASIC14□□□□□ -0.17
Rps29P62274 Zfp358-201ENSMUST00000061508 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14□□□□□ -0.17
Rps29P62274 Dlx6os2-201ENSMUST00000178206 1354 ntBASIC14□□□□□ -0.17
Rps29P62274 Gm17494-201ENSMUST00000072769 1800 ntTSL 1 (best) BASIC14□□□□□ -0.17
Rps29P62274 Dleu2-206ENSMUST00000182537 318 ntTSL 2 BASIC14□□□□□ -0.17
Rps29P62274 Mcat-201ENSMUST00000061882 1893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.99□□□□□ -0.17
Rps29P62274 Msi2-202ENSMUST00000107908 695 ntTSL 5 BASIC13.99□□□□□ -0.17
Rps29P62274 Tnfsfm13-201ENSMUST00000108649 1049 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.99□□□□□ -0.17
Rps29P62274 Cdv3-205ENSMUST00000189896 1023 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.98□□□□□ -0.17
Rps29P62274 Hsd17b11-201ENSMUST00000031251 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.98□□□□□ -0.17
Rps29P62274 Zmynd12-201ENSMUST00000094819 1464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.98□□□□□ -0.17
Rps29P62274 Tor1a-201ENSMUST00000028200 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.98□□□□□ -0.17
Rps29P62274 Stard10-203ENSMUST00000164479 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.97□□□□□ -0.17
Rps29P62274 Syndig1l-204ENSMUST00000222422 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.97□□□□□ -0.17
Rps29P62274 Pdss1-201ENSMUST00000053729 1642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.97□□□□□ -0.17
Rps29P62274 Cldnd1-201ENSMUST00000023426 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.17
Rps29P62274 Zfp787-201ENSMUST00000094870 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.17
Rps29P62274 Suds3-202ENSMUST00000166397 1694 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.17
Rps29P62274 C1qtnf5-201ENSMUST00000114815 1215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.17
Rps29P62274 Dut-202ENSMUST00000082122 1020 ntTSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.17
Rps29P62274 4930577N17Rik-201ENSMUST00000139771 1625 ntBASIC13.96□□□□□ -0.17
Rps29P62274 Crip2-201ENSMUST00000084882 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.18
Rps29P62274 Gm26508-201ENSMUST00000181285 1516 ntTSL 5 BASIC13.95□□□□□ -0.18
Rps29P62274 C2cd4d-201ENSMUST00000169433 1321 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.95□□□□□ -0.18
Rps29P62274 Fam3c-201ENSMUST00000081288 1487 ntTSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
Rps29P62274 Gm20503-201ENSMUST00000174664 1294 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.95□□□□□ -0.18
Rps29P62274 E030037K01Rik-201ENSMUST00000180928 1756 ntBASIC13.95□□□□□ -0.18
Rps29P62274 Yrdc-201ENSMUST00000102628 1634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
Rps29P62274 Dpf1-204ENSMUST00000108231 2040 ntTSL 5 BASIC13.94□□□□□ -0.18
Rps29P62274 Pm20d2-201ENSMUST00000098181 1445 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.94□□□□□ -0.18
Rps29P62274 Cldn10-203ENSMUST00000100314 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
Rps29P62274 Ryk-203ENSMUST00000175883 2505 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
Rps29P62274 Dtnb-211ENSMUST00000173240 2218 ntTSL 5 BASIC13.93□□□□□ -0.18
Rps29P62274 Gng13-201ENSMUST00000115108 347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
Rps29P62274 Gm527-203ENSMUST00000220993 1090 ntTSL 5 BASIC13.93□□□□□ -0.18
Rps29P62274 Slc35a3-202ENSMUST00000120120 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
Rps29P62274 Gna13-202ENSMUST00000106702 914 ntTSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
Rps29P62274 Nrtn-201ENSMUST00000044752 1023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
Rps29P62274 Mxra7-202ENSMUST00000047715 757 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
Rps29P62274 Clk2-201ENSMUST00000090927 2128 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
Rps29P62274 Pth1r-202ENSMUST00000166716 2219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
Rps29P62274 Micu3-201ENSMUST00000068999 2219 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.92□□□□□ -0.18
Rps29P62274 Tspan33-201ENSMUST00000046750 1994 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
Rps29P62274 Reps1-206ENSMUST00000154718 2402 ntTSL 5 BASIC13.92□□□□□ -0.18
Rps29P62274 Stau2-210ENSMUST00000149320 2214 ntTSL 5 BASIC13.91□□□□□ -0.18
Rps29P62274 Upp2-202ENSMUST00000071543 2150 ntTSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
Rps29P62274 4921531C22Rik-201ENSMUST00000150145 1905 ntTSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
Rps29P62274 Mat2b-201ENSMUST00000040167 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
Rps29P62274 Dapk3-201ENSMUST00000047665 1676 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.9□□□□□ -0.18
Rps29P62274 Stard10-202ENSMUST00000163799 1723 ntTSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
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