Protein–RNA interactions for Protein: P58771

Tpm1, Tropomyosin alpha-1 chain, mousemouse

Predictions only

Length 284 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tpm1P58771 Mkrn1-202ENSMUST00000051671 1511 ntTSL 1 (best) BASIC27.32■■□□□ 1.96
Tpm1P58771 Fam136a-201ENSMUST00000071492 1643 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.31■■□□□ 1.96
Tpm1P58771 Terf2-201ENSMUST00000068388 1915 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.31■■□□□ 1.96
Tpm1P58771 Suds3-202ENSMUST00000166397 1694 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.3■■□□□ 1.96
Tpm1P58771 Panx2-202ENSMUST00000161372 2314 ntTSL 1 (best) BASIC27.28■■□□□ 1.96
Tpm1P58771 Neurog2-201ENSMUST00000029587 2227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.28■■□□□ 1.96
Tpm1P58771 Clk2-201ENSMUST00000090927 2128 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.28■■□□□ 1.96
Tpm1P58771 Gm17494-201ENSMUST00000072769 1800 ntTSL 1 (best) BASIC27.28■■□□□ 1.96
Tpm1P58771 Foxk2-201ENSMUST00000106113 5029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.28■■□□□ 1.96
Tpm1P58771 Pon2-201ENSMUST00000057792 2409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.28■■□□□ 1.96
Tpm1P58771 Cadps-201ENSMUST00000067491 5421 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC27.28■■□□□ 1.96
Tpm1P58771 Dpf1-204ENSMUST00000108231 2040 ntTSL 5 BASIC27.28■■□□□ 1.96
Tpm1P58771 Akt1s1-202ENSMUST00000107880 1757 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.27■■□□□ 1.96
Tpm1P58771 Gm30346-201ENSMUST00000218641 1699 ntBASIC27.27■■□□□ 1.96
Tpm1P58771 Prr3-201ENSMUST00000055454 2727 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.27■■□□□ 1.96
Tpm1P58771 Dapk3-202ENSMUST00000178422 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.27■■□□□ 1.96
Tpm1P58771 Mrps7-201ENSMUST00000058109 1962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.26■■□□□ 1.95
Tpm1P58771 Dda1-209ENSMUST00000147642 1865 ntTSL 2 BASIC27.25■■□□□ 1.95
Tpm1P58771 Ube2m-201ENSMUST00000005714 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.24■■□□□ 1.95
Tpm1P58771 AC153890.1-201ENSMUST00000220021 2469 ntBASIC27.23■■□□□ 1.95
Tpm1P58771 Ctnnd2-201ENSMUST00000081728 5944 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.23■■□□□ 1.95
Tpm1P58771 Caap1-201ENSMUST00000030313 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.23■■□□□ 1.95
Tpm1P58771 Maz-204ENSMUST00000206254 2282 ntTSL 5 BASIC27.23■■□□□ 1.95
Tpm1P58771 Rnf19b-201ENSMUST00000030584 2414 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.21■■□□□ 1.95
Tpm1P58771 Dtnb-203ENSMUST00000164578 2355 ntTSL 1 (best) BASIC27.21■■□□□ 1.95
Tpm1P58771 Rcan1-202ENSMUST00000060005 2324 ntTSL 1 (best) BASIC27.21■■□□□ 1.95
Tpm1P58771 Rab22a-202ENSMUST00000109110 849 ntTSL 5 BASIC27.21■■□□□ 1.95
Tpm1P58771 Bcl7c-201ENSMUST00000061468 1132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.21■■□□□ 1.95
Tpm1P58771 Fam220a-206ENSMUST00000196487 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.21■■□□□ 1.95
Tpm1P58771 Fam69b-201ENSMUST00000074240 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.2■■□□□ 1.95
Tpm1P58771 Gpr12-201ENSMUST00000036211 2219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.2■■□□□ 1.95
Tpm1P58771 Ubl4a-207ENSMUST00000178691 1038 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.2■■□□□ 1.94
Tpm1P58771 Kctd9-204ENSMUST00000150768 1302 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.19■■□□□ 1.94
Tpm1P58771 Pdia5-201ENSMUST00000023550 1808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.19■■□□□ 1.94
Tpm1P58771 Enho-201ENSMUST00000127306 1269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.19■■□□□ 1.94
Tpm1P58771 Efna3-201ENSMUST00000029673 2363 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.19■■□□□ 1.94
Tpm1P58771 Orai1-201ENSMUST00000051016 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.19■■□□□ 1.94
Tpm1P58771 Smurf1-203ENSMUST00000110677 5420 ntTSL 5 BASIC27.18■■□□□ 1.94
Tpm1P58771 Zfp358-201ENSMUST00000061508 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.17■■□□□ 1.94
Tpm1P58771 Aspscr1-201ENSMUST00000026135 1820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.17■■□□□ 1.94
Tpm1P58771 Rras2-201ENSMUST00000069449 2275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.15■■□□□ 1.94
Tpm1P58771 Btf3-201ENSMUST00000022163 1091 ntTSL 1 (best) BASIC27.12■■□□□ 1.93
Tpm1P58771 Rnf130-201ENSMUST00000054684 1415 ntTSL 1 (best) BASIC27.12■■□□□ 1.93
Tpm1P58771 Kcnmb4os2-201ENSMUST00000080943 1571 ntTSL 5 BASIC27.11■■□□□ 1.93
Tpm1P58771 BC030336-205ENSMUST00000208454 813 ntTSL 2 BASIC27.11■■□□□ 1.93
Tpm1P58771 Cited2-203ENSMUST00000219558 2411 ntAPPRIS P1 BASIC27.11■■□□□ 1.93
Tpm1P58771 Gm5814-201ENSMUST00000177586 378 ntAPPRIS P1 BASIC27.1■■□□□ 1.93
Tpm1P58771 Phf23-205ENSMUST00000135814 2214 ntTSL 1 (best) BASIC27.09■■□□□ 1.93
Tpm1P58771 Heca-201ENSMUST00000037879 5098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.08■■□□□ 1.93
Tpm1P58771 E2f6-201ENSMUST00000020908 2418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.08■■□□□ 1.93
Tpm1P58771 Atp5a1-202ENSMUST00000114748 2674 ntTSL 1 (best) BASIC27.07■■□□□ 1.92
Tpm1P58771 E2f1-201ENSMUST00000000894 2755 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.07■■□□□ 1.92
Tpm1P58771 Crim1-201ENSMUST00000112498 5995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.07■■□□□ 1.92
Tpm1P58771 Klhl35-201ENSMUST00000037359 1954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.06■■□□□ 1.92
Tpm1P58771 Gm7334-201ENSMUST00000061681 1356 ntAPPRIS P1 BASIC27.06■■□□□ 1.92
Tpm1P58771 Phlda1-201ENSMUST00000164773 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.06■■□□□ 1.92
Tpm1P58771 Arx-202ENSMUST00000113947 2454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.06■■□□□ 1.92
Tpm1P58771 Ranbp1-202ENSMUST00000115645 1085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.05■■□□□ 1.92
Tpm1P58771 Camsap1-212ENSMUST00000183461 5090 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.04■■□□□ 1.92
Tpm1P58771 Hmx1-201ENSMUST00000087674 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.04■■□□□ 1.92
Tpm1P58771 Nr2f6-201ENSMUST00000002466 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.04■■□□□ 1.92
Tpm1P58771 Galnt12-202ENSMUST00000107744 2077 ntTSL 1 (best) BASIC27.03■■□□□ 1.92
Tpm1P58771 Acvr2b-202ENSMUST00000165044 2093 ntTSL 2 BASIC27.03■■□□□ 1.92
Tpm1P58771 Irx4-201ENSMUST00000022095 2589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.03■■□□□ 1.92
Tpm1P58771 Clptm1l-201ENSMUST00000022102 2340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.03■■□□□ 1.92
Tpm1P58771 Pom121-201ENSMUST00000111171 5580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.02■■□□□ 1.92
Tpm1P58771 Ywhaq-202ENSMUST00000103002 2110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.02■■□□□ 1.92
Tpm1P58771 Fam241a-201ENSMUST00000057198 1607 ntTSL 1 (best) BASIC27.01■■□□□ 1.92
Tpm1P58771 Bok-201ENSMUST00000027499 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.01■■□□□ 1.91
Tpm1P58771 Cdc42bpg-201ENSMUST00000025681 5995 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27■■□□□ 1.91
Tpm1P58771 Zfp422-201ENSMUST00000057540 2375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.99■■□□□ 1.91
Tpm1P58771 Snta1-202ENSMUST00000109728 2131 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.99■■□□□ 1.91
Tpm1P58771 Snta1-201ENSMUST00000028991 2125 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.99■■□□□ 1.91
Tpm1P58771 Ica1-201ENSMUST00000038403 2075 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.99■■□□□ 1.91
Tpm1P58771 Ppp1cc-201ENSMUST00000086294 1442 ntTSL 1 (best) BASIC26.99■■□□□ 1.91
Tpm1P58771 Gas2l1-201ENSMUST00000037146 2686 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.98■■□□□ 1.91
Tpm1P58771 Peli2-204ENSMUST00000226513 1320 ntBASIC26.98■■□□□ 1.91
Tpm1P58771 Peg12-201ENSMUST00000094339 2640 ntAPPRIS P1 BASIC26.98■■□□□ 1.91
Tpm1P58771 Tcf15-201ENSMUST00000089112 980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.98■■□□□ 1.91
Tpm1P58771 Ctbp1-211ENSMUST00000202868 2436 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.98■■□□□ 1.91
Tpm1P58771 Dcaf15-202ENSMUST00000210279 2199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.97■■□□□ 1.91
Tpm1P58771 Sos2-201ENSMUST00000035773 5607 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC26.96■■□□□ 1.91
Tpm1P58771 Hrk-201ENSMUST00000054836 5382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.96■■□□□ 1.91
Tpm1P58771 Eed-201ENSMUST00000107234 2067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.96■■□□□ 1.91
Tpm1P58771 Bok-205ENSMUST00000201863 883 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.93■■□□□ 1.9
Tpm1P58771 A730013G03Rik-202ENSMUST00000195012 2097 ntBASIC26.93■■□□□ 1.9
Tpm1P58771 Dazap1-201ENSMUST00000092305 1994 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.92■■□□□ 1.9
Tpm1P58771 St7-202ENSMUST00000052113 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.91■■□□□ 1.9
Tpm1P58771 E330040D14Rik-201ENSMUST00000192299 1374 ntBASIC26.91■■□□□ 1.9
Tpm1P58771 Fam220a-205ENSMUST00000169329 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.9■■□□□ 1.9
Tpm1P58771 E030037K01Rik-201ENSMUST00000180928 1756 ntBASIC26.89■■□□□ 1.9
Tpm1P58771 Stau2-210ENSMUST00000149320 2214 ntTSL 5 BASIC26.88■■□□□ 1.89
Tpm1P58771 Nhlrc1-201ENSMUST00000052747 2294 ntAPPRIS P1 BASIC26.87■■□□□ 1.89
Tpm1P58771 Ube2f-202ENSMUST00000171112 1547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.87■■□□□ 1.89
Tpm1P58771 Gm26566-201ENSMUST00000181601 1038 ntAPPRIS P1 BASIC26.87■■□□□ 1.89
Tpm1P58771 Agap3-201ENSMUST00000024123 3207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.87■■□□□ 1.89
Tpm1P58771 Esyt2-201ENSMUST00000100986 5560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.87■■□□□ 1.89
Tpm1P58771 Smad2-202ENSMUST00000091831 1645 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC26.86■■□□□ 1.89
Tpm1P58771 Isoc1-201ENSMUST00000025503 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.85■■□□□ 1.89
Tpm1P58771 Rheb-201ENSMUST00000030787 1784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.85■■□□□ 1.89
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 13.9 ms