Protein–RNA interactions for Protein: P58321

Uchl4, Ubiquitin carboxyl-terminal hydrolase isozyme L4, mousemouse

Predictions only

Length 233 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Uchl4P58321 Ebag9-203ENSMUST00000227691 1945 ntAPPRIS P1 BASIC26.49■■□□□ 1.83
Uchl4P58321 Srp9-201ENSMUST00000027792 1367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.49■■□□□ 1.83
Uchl4P58321 Gm24970-201ENSMUST00000175582 82 ntBASIC26.49■■□□□ 1.83
Uchl4P58321 Smarcc2-205ENSMUST00000218228 603 ntTSL 5 BASIC26.49■■□□□ 1.83
Uchl4P58321 Cebpb-201ENSMUST00000070642 1504 ntAPPRIS P1 BASIC26.49■■□□□ 1.83
Uchl4P58321 4932443I19Rik-201ENSMUST00000166277 799 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.48■■□□□ 1.83
Uchl4P58321 Tmem243-201ENSMUST00000115365 1040 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.46■■□□□ 1.83
Uchl4P58321 Galnt10-202ENSMUST00000108846 1745 ntTSL 1 (best) BASIC26.45■■□□□ 1.83
Uchl4P58321 Gm43863-201ENSMUST00000203822 1192 ntBASIC26.44■■□□□ 1.82
Uchl4P58321 Dlx6os2-201ENSMUST00000178206 1354 ntBASIC26.44■■□□□ 1.82
Uchl4P58321 Adap1-201ENSMUST00000110865 2557 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.44■■□□□ 1.82
Uchl4P58321 C1qtnf5-201ENSMUST00000114815 1215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.43■■□□□ 1.82
Uchl4P58321 Dut-202ENSMUST00000082122 1020 ntTSL 1 (best) BASIC26.43■■□□□ 1.82
Uchl4P58321 Hexdc-202ENSMUST00000106117 2149 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.42■■□□□ 1.82
Uchl4P58321 Kmt5a-202ENSMUST00000100709 1425 ntTSL 1 (best) BASIC26.42■■□□□ 1.82
Uchl4P58321 Galnt12-201ENSMUST00000045041 2288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.42■■□□□ 1.82
Uchl4P58321 Tbcel-204ENSMUST00000128959 1535 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.4■■□□□ 1.82
Uchl4P58321 A430072P03Rik-201ENSMUST00000161480 1510 ntTSL 1 (best) BASIC26.4■■□□□ 1.82
Uchl4P58321 Gng13-201ENSMUST00000115108 347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.4■■□□□ 1.82
Uchl4P58321 Ppp1r14b-201ENSMUST00000070850 919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.4■■□□□ 1.82
Uchl4P58321 Gm6206-201ENSMUST00000133472 2199 ntBASIC26.39■■□□□ 1.82
Uchl4P58321 Ppp1r3e-202ENSMUST00000177403 1957 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.39■■□□□ 1.82
Uchl4P58321 Gm20503-201ENSMUST00000174664 1294 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.39■■□□□ 1.82
Uchl4P58321 AC150314.2-201ENSMUST00000214135 834 ntTSL 5 BASIC26.39■■□□□ 1.82
Uchl4P58321 Zxda-201ENSMUST00000117281 2621 ntBASIC26.38■■□□□ 1.81
Uchl4P58321 Rheb-201ENSMUST00000030787 1784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.38■■□□□ 1.81
Uchl4P58321 Gm9905-201ENSMUST00000065740 1845 ntBASIC26.38■■□□□ 1.81
Uchl4P58321 Dapk3-202ENSMUST00000178422 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.37■■□□□ 1.81
Uchl4P58321 Fam69b-201ENSMUST00000074240 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.37■■□□□ 1.81
Uchl4P58321 2310050C09Rik-201ENSMUST00000163439 1078 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.36■■□□□ 1.81
Uchl4P58321 Spg7-201ENSMUST00000108868 845 ntTSL 2 BASIC26.35■■□□□ 1.81
Uchl4P58321 Runx3-202ENSMUST00000119564 1855 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.34■■□□□ 1.81
Uchl4P58321 Susd4-202ENSMUST00000153348 1898 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.34■■□□□ 1.81
Uchl4P58321 Fkbp8-202ENSMUST00000119353 1720 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.34■■□□□ 1.81
Uchl4P58321 Mfsd5-201ENSMUST00000051341 1742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.34■■□□□ 1.81
Uchl4P58321 Il3ra-201ENSMUST00000090591 1614 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.33■■□□□ 1.81
Uchl4P58321 Dleu2-206ENSMUST00000182537 318 ntTSL 2 BASIC26.33■■□□□ 1.81
Uchl4P58321 A530058N18Rik-208ENSMUST00000131299 1387 ntTSL 2 BASIC26.33■■□□□ 1.8
Uchl4P58321 Pdia5-201ENSMUST00000023550 1808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.31■■□□□ 1.8
Uchl4P58321 2810459M11Rik-201ENSMUST00000027429 1225 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.31■■□□□ 1.8
Uchl4P58321 Rbm17-201ENSMUST00000040314 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.31■■□□□ 1.8
Uchl4P58321 A530058N18Rik-204ENSMUST00000141209 709 ntTSL 5 BASIC26.3■■□□□ 1.8
Uchl4P58321 Nelfe-204ENSMUST00000173357 1399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.3■■□□□ 1.8
Uchl4P58321 Zfp131-206ENSMUST00000223813 2561 ntAPPRIS P3 BASIC26.3■■□□□ 1.8
Uchl4P58321 Raly-201ENSMUST00000029120 1802 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.3■■□□□ 1.8
Uchl4P58321 A330023F24Rik-201ENSMUST00000181226 955 ntTSL 1 (best) BASIC26.29■■□□□ 1.8
Uchl4P58321 Micu3-201ENSMUST00000068999 2219 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.29■■□□□ 1.8
Uchl4P58321 AC157572.2-201ENSMUST00000226970 908 ntBASIC26.27■■□□□ 1.8
Uchl4P58321 5730480H06Rik-201ENSMUST00000030968 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.27■■□□□ 1.8
Uchl4P58321 Mogs-201ENSMUST00000032114 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.26■■□□□ 1.79
Uchl4P58321 Dazap1-202ENSMUST00000105361 1537 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.26■■□□□ 1.79
Uchl4P58321 Sugct-202ENSMUST00000220514 1351 ntTSL 1 (best) BASIC26.25■■□□□ 1.79
Uchl4P58321 Eid2-201ENSMUST00000059596 1392 ntAPPRIS P1 BASIC26.25■■□□□ 1.79
Uchl4P58321 Ctbp1-201ENSMUST00000079746 2279 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.25■■□□□ 1.79
Uchl4P58321 Rnf220-212ENSMUST00000221654 1949 ntTSL 1 (best) BASIC26.25■■□□□ 1.79
Uchl4P58321 Pfdn2-202ENSMUST00000135941 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.25■■□□□ 1.79
Uchl4P58321 Guf1-201ENSMUST00000031113 1769 ntTSL 1 (best) BASIC26.24■■□□□ 1.79
Uchl4P58321 Suds3-202ENSMUST00000166397 1694 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.24■■□□□ 1.79
Uchl4P58321 Gm6345-201ENSMUST00000180378 1691 ntBASIC26.23■■□□□ 1.79
Uchl4P58321 Smarcc1-203ENSMUST00000197480 1949 ntTSL 1 (best) BASIC26.22■■□□□ 1.79
Uchl4P58321 Rbms1-202ENSMUST00000112509 1806 ntTSL 1 (best) BASIC26.22■■□□□ 1.79
Uchl4P58321 Gm43445-201ENSMUST00000198564 2091 ntBASIC26.22■■□□□ 1.79
Uchl4P58321 Ssbp3-202ENSMUST00000072753 1924 ntTSL 1 (best) BASIC26.22■■□□□ 1.79
Uchl4P58321 Popdc3-201ENSMUST00000019994 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.21■■□□□ 1.79
Uchl4P58321 Cdv3-205ENSMUST00000189896 1023 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.21■■□□□ 1.79
Uchl4P58321 Snx3-201ENSMUST00000019939 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.21■■□□□ 1.79
Uchl4P58321 Cetn4-202ENSMUST00000075537 762 ntTSL 3 BASIC26.2■■□□□ 1.78
Uchl4P58321 Tlx3-201ENSMUST00000037746 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.19■■□□□ 1.78
Uchl4P58321 Tsen34-203ENSMUST00000108629 1238 ntTSL 1 (best) BASIC26.18■■□□□ 1.78
Uchl4P58321 Cldnd1-201ENSMUST00000023426 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.17■■□□□ 1.78
Uchl4P58321 Amigo1-203ENSMUST00000106659 1360 ntTSL 1 (best) BASIC26.16■■□□□ 1.78
Uchl4P58321 Cpsf4-201ENSMUST00000070487 1606 ntTSL 1 (best) BASIC26.15■■□□□ 1.78
Uchl4P58321 Ttc19-202ENSMUST00000101075 2193 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.15■■□□□ 1.78
Uchl4P58321 Cabp1-204ENSMUST00000112113 1621 ntTSL 1 (best) BASIC26.14■■□□□ 1.77
Uchl4P58321 Zfp787-201ENSMUST00000094870 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.1■■□□□ 1.77
Uchl4P58321 Evx2-202ENSMUST00000173623 1428 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.09■■□□□ 1.77
Uchl4P58321 Dcaf15-202ENSMUST00000210279 2199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.09■■□□□ 1.77
Uchl4P58321 Terf2-203ENSMUST00000116425 2471 ntTSL 1 (best) BASIC26.08■■□□□ 1.77
Uchl4P58321 Gm26508-201ENSMUST00000181285 1516 ntTSL 5 BASIC26.08■■□□□ 1.77
Uchl4P58321 Pm20d2-201ENSMUST00000098181 1445 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.07■■□□□ 1.76
Uchl4P58321 Fgf20-201ENSMUST00000034014 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.06■■□□□ 1.76
Uchl4P58321 Gm12523-201ENSMUST00000148844 599 ntTSL 5 BASIC26.06■■□□□ 1.76
Uchl4P58321 Tcte3-201ENSMUST00000040746 788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.06■■□□□ 1.76
Uchl4P58321 Tcte3-202ENSMUST00000097398 632 ntTSL 1 (best) BASIC26.06■■□□□ 1.76
Uchl4P58321 4930577N17Rik-201ENSMUST00000139771 1625 ntBASIC26.06■■□□□ 1.76
Uchl4P58321 Zmynd12-201ENSMUST00000094819 1464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.05■■□□□ 1.76
Uchl4P58321 Efemp2-201ENSMUST00000070118 1781 ntTSL 1 (best) BASIC26.04■■□□□ 1.76
Uchl4P58321 Ildr2-205ENSMUST00000193860 2320 ntTSL 1 (best) BASIC26.03■■□□□ 1.76
Uchl4P58321 Arl2bp-201ENSMUST00000034228 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
Uchl4P58321 Rab2a-201ENSMUST00000060232 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
Uchl4P58321 Tmem189-201ENSMUST00000006587 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
Uchl4P58321 Uba52-205ENSMUST00000129909 705 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.01■■□□□ 1.75
Uchl4P58321 Smad2-202ENSMUST00000091831 1645 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.99■■□□□ 1.75
Uchl4P58321 Scx-201ENSMUST00000043089 1136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.99■■□□□ 1.75
Uchl4P58321 Gsk3a-201ENSMUST00000071739 2260 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC25.99■■□□□ 1.75
Uchl4P58321 Pcgf5-201ENSMUST00000062389 1566 ntTSL 5 BASIC25.99■■□□□ 1.75
Uchl4P58321 Bckdhb-206ENSMUST00000190637 1477 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.98■■□□□ 1.75
Uchl4P58321 Stard10-202ENSMUST00000163799 1723 ntTSL 1 (best) BASIC25.97■■□□□ 1.75
Uchl4P58321 Cib1-201ENSMUST00000065163 1047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.97■■□□□ 1.75
Uchl4P58321 Gm9939-201ENSMUST00000067161 1154 ntBASIC25.97■■□□□ 1.75
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 16.8 ms