Protein–RNA interactions for Protein: P57080

Usp25, Ubiquitin carboxyl-terminal hydrolase 25, mousemouse

Predictions only

Length 1,055 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Usp25P57080 Pdia5-201ENSMUST00000023550 1808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.02■■■□□ 2.08
Usp25P57080 E2f6-201ENSMUST00000020908 2418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28■■■□□ 2.07
Usp25P57080 Mapk3-201ENSMUST00000050201 1267 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC28■■■□□ 2.07
Usp25P57080 Clptm1l-201ENSMUST00000022102 2340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.99■■■□□ 2.07
Usp25P57080 Gm960-204ENSMUST00000225896 2202 ntAPPRIS ALT2 BASIC27.99■■■□□ 2.07
Usp25P57080 AC153890.1-201ENSMUST00000220021 2469 ntBASIC27.98■■■□□ 2.07
Usp25P57080 Maz-204ENSMUST00000206254 2282 ntTSL 5 BASIC27.98■■■□□ 2.07
Usp25P57080 Smurf1-202ENSMUST00000100461 2725 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.97■■■□□ 2.07
Usp25P57080 Eed-201ENSMUST00000107234 2067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.97■■■□□ 2.07
Usp25P57080 Cited2-203ENSMUST00000219558 2411 ntAPPRIS P1 BASIC27.97■■■□□ 2.07
Usp25P57080 Zfp422-201ENSMUST00000057540 2375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.96■■■□□ 2.07
Usp25P57080 Nr2f6-201ENSMUST00000002466 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.96■■■□□ 2.07
Usp25P57080 E2f1-201ENSMUST00000000894 2755 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.96■■■□□ 2.07
Usp25P57080 Clk2-202ENSMUST00000121212 2154 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.96■■■□□ 2.07
Usp25P57080 Stau2-210ENSMUST00000149320 2214 ntTSL 5 BASIC27.95■■■□□ 2.07
Usp25P57080 Isoc1-201ENSMUST00000025503 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.94■■■□□ 2.06
Usp25P57080 Rnf19b-201ENSMUST00000030584 2414 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.94■■■□□ 2.06
Usp25P57080 Arhgdia-201ENSMUST00000067936 2150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.94■■■□□ 2.06
Usp25P57080 Ube2m-201ENSMUST00000005714 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.94■■■□□ 2.06
Usp25P57080 Fam241a-201ENSMUST00000057198 1607 ntTSL 1 (best) BASIC27.93■■■□□ 2.06
Usp25P57080 Syt7-201ENSMUST00000073899 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.93■■■□□ 2.06
Usp25P57080 Dcaf15-202ENSMUST00000210279 2199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.92■■■□□ 2.06
Usp25P57080 Ctbp1-211ENSMUST00000202868 2436 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.91■■■□□ 2.06
Usp25P57080 Irak1-207ENSMUST00000114360 2441 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.91■■■□□ 2.06
Usp25P57080 Mkrn1-202ENSMUST00000051671 1511 ntTSL 1 (best) BASIC27.87■■■□□ 2.05
Usp25P57080 Tm6sf1-201ENSMUST00000041890 2226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.87■■■□□ 2.05
Usp25P57080 Peg12-201ENSMUST00000094339 2640 ntAPPRIS P1 BASIC27.87■■■□□ 2.05
Usp25P57080 Phlda1-201ENSMUST00000164773 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.86■■■□□ 2.05
Usp25P57080 Gm12184-201ENSMUST00000104959 1310 ntAPPRIS P1 BASIC27.86■■■□□ 2.05
Usp25P57080 Iffo2-203ENSMUST00000174078 5716 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.85■■■□□ 2.05
Usp25P57080 Cdc14b-207ENSMUST00000221634 1953 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.85■■■□□ 2.05
Usp25P57080 E030037K01Rik-201ENSMUST00000180928 1756 ntBASIC27.84■■■□□ 2.05
Usp25P57080 A730013G03Rik-202ENSMUST00000195012 2097 ntBASIC27.84■■■□□ 2.05
Usp25P57080 Pon2-201ENSMUST00000057792 2409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.84■■■□□ 2.05
Usp25P57080 Cnnm3-201ENSMUST00000001166 5193 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC27.83■■■□□ 2.05
Usp25P57080 Gpr12-201ENSMUST00000036211 2219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.83■■■□□ 2.05
Usp25P57080 Ywhaq-202ENSMUST00000103002 2110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.82■■■□□ 2.04
Usp25P57080 Ubl4a-207ENSMUST00000178691 1038 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.81■■■□□ 2.04
Usp25P57080 Eif4ebp1-201ENSMUST00000033880 1997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.8■■■□□ 2.04
Usp25P57080 Hmx1-201ENSMUST00000087674 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.8■■■□□ 2.04
Usp25P57080 Mpp6-202ENSMUST00000036236 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.79■■■□□ 2.04
Usp25P57080 Dapk3-201ENSMUST00000047665 1676 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.78■■■□□ 2.04
Usp25P57080 Slc39a13-201ENSMUST00000073575 2469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.78■■■□□ 2.04
Usp25P57080 Orai1-201ENSMUST00000051016 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.78■■■□□ 2.04
Usp25P57080 Rab22a-202ENSMUST00000109110 849 ntTSL 5 BASIC27.78■■■□□ 2.04
Usp25P57080 Mnx1-201ENSMUST00000001608 2018 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.77■■■□□ 2.04
Usp25P57080 Det1-201ENSMUST00000032839 2269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.76■■■□□ 2.04
Usp25P57080 Kcnmb4os2-201ENSMUST00000080943 1571 ntTSL 5 BASIC27.74■■■□□ 2.03
Usp25P57080 Fam220a-206ENSMUST00000196487 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.74■■■□□ 2.03
Usp25P57080 Gm7334-201ENSMUST00000061681 1356 ntAPPRIS P1 BASIC27.73■■■□□ 2.03
Usp25P57080 Rbms1-202ENSMUST00000112509 1806 ntTSL 1 (best) BASIC27.71■■■□□ 2.03
Usp25P57080 Otud5-205ENSMUST00000115668 2543 ntTSL 1 (best) BASIC27.71■■■□□ 2.03
Usp25P57080 Nhlrc1-201ENSMUST00000052747 2294 ntAPPRIS P1 BASIC27.71■■■□□ 2.03
Usp25P57080 Odc1-201ENSMUST00000171737 2208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.71■■■□□ 2.03
Usp25P57080 Atp5a1-202ENSMUST00000114748 2674 ntTSL 1 (best) BASIC27.69■■■□□ 2.02
Usp25P57080 Zfp513-202ENSMUST00000114590 2228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.69■■■□□ 2.02
Usp25P57080 Rnf130-201ENSMUST00000054684 1415 ntTSL 1 (best) BASIC27.68■■■□□ 2.02
Usp25P57080 Kansl2-202ENSMUST00000116400 2110 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.68■■■□□ 2.02
Usp25P57080 Rheb-201ENSMUST00000030787 1784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.68■■■□□ 2.02
Usp25P57080 Zbtb12-201ENSMUST00000052778 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.67■■■□□ 2.02
Usp25P57080 Ica1-201ENSMUST00000038403 2075 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.67■■■□□ 2.02
Usp25P57080 Bok-201ENSMUST00000027499 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.66■■■□□ 2.02
Usp25P57080 Fus-201ENSMUST00000077609 1831 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.66■■■□□ 2.02
Usp25P57080 Mpp6-209ENSMUST00000204545 2418 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.65■■■□□ 2.02
Usp25P57080 Gas2l1-201ENSMUST00000037146 2686 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.65■■■□□ 2.02
Usp25P57080 Wdr34-201ENSMUST00000113711 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.64■■■□□ 2.02
Usp25P57080 Tcf15-201ENSMUST00000089112 980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.64■■■□□ 2.02
Usp25P57080 Nans-201ENSMUST00000030018 2179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.64■■■□□ 2.02
Usp25P57080 Cnnm3-202ENSMUST00000097776 5292 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.63■■■□□ 2.01
Usp25P57080 Gm5814-201ENSMUST00000177586 378 ntAPPRIS P1 BASIC27.63■■■□□ 2.01
Usp25P57080 Prr3-201ENSMUST00000055454 2727 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.62■■■□□ 2.01
Usp25P57080 Smad2-202ENSMUST00000091831 1645 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC27.62■■■□□ 2.01
Usp25P57080 Snta1-202ENSMUST00000109728 2131 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.61■■■□□ 2.01
Usp25P57080 Snta1-201ENSMUST00000028991 2125 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.61■■■□□ 2.01
Usp25P57080 E2f5-201ENSMUST00000029069 1779 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.61■■■□□ 2.01
Usp25P57080 Bok-205ENSMUST00000201863 883 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.61■■■□□ 2.01
Usp25P57080 St7-208ENSMUST00000115419 2194 ntTSL 1 (best) BASIC27.6■■■□□ 2.01
Usp25P57080 Tmem260-208ENSMUST00000226400 2281 ntAPPRIS ALT2 BASIC27.6■■■□□ 2.01
Usp25P57080 Dyrk1a-202ENSMUST00000119878 5759 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.58■■■□□ 2.01
Usp25P57080 Ranbp1-202ENSMUST00000115645 1085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.58■■■□□ 2.01
Usp25P57080 Rtn4r-201ENSMUST00000059589 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.58■■■□□ 2.01
Usp25P57080 Btf3-201ENSMUST00000022163 1091 ntTSL 1 (best) BASIC27.57■■■□□ 2
Usp25P57080 Cpe-201ENSMUST00000048967 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.57■■■□□ 2
Usp25P57080 Ei24-202ENSMUST00000163192 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.57■■■□□ 2
Usp25P57080 Tnfsfm13-203ENSMUST00000180587 2235 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC27.56■■■□□ 2
Usp25P57080 Rnf115-201ENSMUST00000029740 2209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.56■■■□□ 2
Usp25P57080 Ube2f-202ENSMUST00000171112 1547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.56■■■□□ 2
Usp25P57080 Peli2-204ENSMUST00000226513 1320 ntBASIC27.54■■■□□ 2
Usp25P57080 Efna3-201ENSMUST00000029673 2363 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.54■■■□□ 2
Usp25P57080 Paqr3-202ENSMUST00000112968 1875 ntTSL 1 (best) BASIC27.53■■■□□ 2
Usp25P57080 Ppp1cc-201ENSMUST00000086294 1442 ntTSL 1 (best) BASIC27.52■■■□□ 2
Usp25P57080 Sox3-201ENSMUST00000135107 2065 ntAPPRIS P1 BASIC27.51■■□□□ 1.99
Usp25P57080 Tmed7-203ENSMUST00000151189 1348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.5■■□□□ 1.99
Usp25P57080 Fzd9-201ENSMUST00000062572 2293 ntAPPRIS P1 BASIC27.5■■□□□ 1.99
Usp25P57080 Arx-202ENSMUST00000113947 2454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.5■■□□□ 1.99
Usp25P57080 5031425E22Rik-201ENSMUST00000101522 2110 ntBASIC27.5■■□□□ 1.99
Usp25P57080 Eya2-202ENSMUST00000088132 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.49■■□□□ 1.99
Usp25P57080 Lrfn1-203ENSMUST00000189877 1852 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC27.49■■□□□ 1.99
Usp25P57080 Popdc3-201ENSMUST00000019994 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.47■■□□□ 1.99
Usp25P57080 Il17d-201ENSMUST00000089494 1274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.47■■□□□ 1.99
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 12.9 ms