Protein–RNA interactions for Protein: P56480

Atp5b, ATP synthase subunit beta, mitochondrial, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 529 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Atp5bP56480 Lactb-201ENSMUST00000034929 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
Atp5bP56480 Spg7-201ENSMUST00000108868 845 ntTSL 2 BASIC25.5■■□□□ 1.67
Atp5bP56480 Gnas-207ENSMUST00000109085 1789 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.5■■□□□ 1.67
Atp5bP56480 Gm15672-201ENSMUST00000151512 1354 ntTSL 1 (best) BASIC25.5■■□□□ 1.67
Atp5bP56480 Cldnd1-201ENSMUST00000023426 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
Atp5bP56480 Egr3-201ENSMUST00000035908 1509 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
Atp5bP56480 Mogs-201ENSMUST00000032114 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
Atp5bP56480 Gm43863-201ENSMUST00000203822 1192 ntBASIC25.49■■□□□ 1.67
Atp5bP56480 Rab2a-201ENSMUST00000060232 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
Atp5bP56480 Crem-227ENSMUST00000149803 1422 ntTSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
Atp5bP56480 Tpst1-201ENSMUST00000040721 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
Atp5bP56480 2810459M11Rik-201ENSMUST00000027429 1225 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
Atp5bP56480 Nrep-202ENSMUST00000168890 2185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
Atp5bP56480 Traf4-201ENSMUST00000017530 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
Atp5bP56480 Ywhah-201ENSMUST00000019109 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
Atp5bP56480 Galnt10-202ENSMUST00000108846 1745 ntTSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
Atp5bP56480 A330023F24Rik-201ENSMUST00000181226 955 ntTSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
Atp5bP56480 Dlx6os2-201ENSMUST00000178206 1354 ntBASIC25.45■■□□□ 1.67
Atp5bP56480 Ywhaq-202ENSMUST00000103002 2110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
Atp5bP56480 Fcnaos-201ENSMUST00000127642 1351 ntTSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
Atp5bP56480 Tsen34-203ENSMUST00000108629 1238 ntTSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
Atp5bP56480 Gm30346-201ENSMUST00000218641 1699 ntBASIC25.44■■□□□ 1.66
Atp5bP56480 Ppp1r14c-202ENSMUST00000217573 2013 ntTSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
Atp5bP56480 Gm45716-202ENSMUST00000134929 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
Atp5bP56480 Zfp131-206ENSMUST00000223813 2561 ntAPPRIS P3 BASIC25.43■■□□□ 1.66
Atp5bP56480 Pradc1-202ENSMUST00000113770 610 ntTSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
Atp5bP56480 Kmt5a-202ENSMUST00000100709 1425 ntTSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
Atp5bP56480 En1-201ENSMUST00000079721 2624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
Atp5bP56480 Smad7-202ENSMUST00000168918 1882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
Atp5bP56480 Eif4e2-203ENSMUST00000113230 1569 ntTSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.66
Atp5bP56480 A430072P03Rik-201ENSMUST00000161480 1510 ntTSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.66
Atp5bP56480 Grasp-201ENSMUST00000000543 2013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.65
Atp5bP56480 Phf10-201ENSMUST00000024657 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.65
Atp5bP56480 A530058N18Rik-204ENSMUST00000141209 709 ntTSL 5 BASIC25.38■■□□□ 1.65
Atp5bP56480 2310050C09Rik-201ENSMUST00000163439 1078 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.38■■□□□ 1.65
Atp5bP56480 Il3ra-201ENSMUST00000090591 1614 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
Atp5bP56480 Cetn4-202ENSMUST00000075537 762 ntTSL 3 BASIC25.37■■□□□ 1.65
Atp5bP56480 Micu3-201ENSMUST00000068999 2219 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.37■■□□□ 1.65
Atp5bP56480 Ctbp1-201ENSMUST00000079746 2279 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
Atp5bP56480 Triobp-206ENSMUST00000130663 1660 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.36■■□□□ 1.65
Atp5bP56480 Gm43445-201ENSMUST00000198564 2091 ntBASIC25.36■■□□□ 1.65
Atp5bP56480 Zfp787-201ENSMUST00000094870 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
Atp5bP56480 Gm12523-201ENSMUST00000148844 599 ntTSL 5 BASIC25.35■■□□□ 1.65
Atp5bP56480 Nelfe-204ENSMUST00000173357 1399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
Atp5bP56480 Tbcel-204ENSMUST00000128959 1535 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.34■■□□□ 1.65
Atp5bP56480 AC157572.2-201ENSMUST00000226970 908 ntBASIC25.34■■□□□ 1.65
Atp5bP56480 Ebag9-203ENSMUST00000227691 1945 ntAPPRIS P1 BASIC25.33■■□□□ 1.65
Atp5bP56480 Pfdn2-202ENSMUST00000135941 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
Atp5bP56480 Cebpb-201ENSMUST00000070642 1504 ntAPPRIS P1 BASIC25.32■■□□□ 1.64
Atp5bP56480 Cdv3-205ENSMUST00000189896 1023 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
Atp5bP56480 Arl2bp-201ENSMUST00000034228 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
Atp5bP56480 A530058N18Rik-208ENSMUST00000131299 1387 ntTSL 2 BASIC25.31■■□□□ 1.64
Atp5bP56480 Snx3-201ENSMUST00000019939 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
Atp5bP56480 Tmem189-201ENSMUST00000006587 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
Atp5bP56480 Eid2-201ENSMUST00000059596 1392 ntAPPRIS P1 BASIC25.3■■□□□ 1.64
Atp5bP56480 Ric1-206ENSMUST00000162184 2157 ntTSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
Atp5bP56480 Htra4-201ENSMUST00000084031 2180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
Atp5bP56480 Cib1-201ENSMUST00000065163 1047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
Atp5bP56480 Dazap1-202ENSMUST00000105361 1537 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
Atp5bP56480 Evx2-202ENSMUST00000173623 1428 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
Atp5bP56480 Ring1-201ENSMUST00000025183 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
Atp5bP56480 Dleu2-206ENSMUST00000182537 318 ntTSL 2 BASIC25.26■■□□□ 1.63
Atp5bP56480 Kdm2a-203ENSMUST00000116571 2413 ntTSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
Atp5bP56480 Rbm17-201ENSMUST00000040314 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
Atp5bP56480 5730480H06Rik-201ENSMUST00000030968 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
Atp5bP56480 Rnf220-212ENSMUST00000221654 1949 ntTSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
Atp5bP56480 Mef2a-201ENSMUST00000032776 2476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
Atp5bP56480 Cldn10-203ENSMUST00000100314 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
Atp5bP56480 Mrps7-201ENSMUST00000058109 1962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
Atp5bP56480 Raly-201ENSMUST00000029120 1802 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.23■■□□□ 1.63
Atp5bP56480 Gsk3a-201ENSMUST00000071739 2260 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC25.23■■□□□ 1.63
Atp5bP56480 Cpsf4-201ENSMUST00000070487 1606 ntTSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
Atp5bP56480 Sugct-202ENSMUST00000220514 1351 ntTSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
Atp5bP56480 Scx-201ENSMUST00000043089 1136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
Atp5bP56480 Gjc1-201ENSMUST00000068933 1903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
Atp5bP56480 AY074887-201ENSMUST00000054018 769 ntAPPRIS P1 BASIC25.18■■□□□ 1.62
Atp5bP56480 Rheb-201ENSMUST00000030787 1784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
Atp5bP56480 Gm9939-201ENSMUST00000067161 1154 ntBASIC25.15■■□□□ 1.62
Atp5bP56480 Fkbp8-202ENSMUST00000119353 1720 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
Atp5bP56480 Hoxa13-203ENSMUST00000147595 2395 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC25.14■■□□□ 1.62
Atp5bP56480 Tcte3-201ENSMUST00000040746 788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.62
Atp5bP56480 Tcte3-202ENSMUST00000097398 632 ntTSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.62
Atp5bP56480 Amigo1-203ENSMUST00000106659 1360 ntTSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.61
Atp5bP56480 Plekha3-201ENSMUST00000111920 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
Atp5bP56480 Plin1-206ENSMUST00000205915 2817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
Atp5bP56480 Popdc3-201ENSMUST00000019994 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
Atp5bP56480 Gm26508-201ENSMUST00000181285 1516 ntTSL 5 BASIC25.12■■□□□ 1.61
Atp5bP56480 Dapk3-202ENSMUST00000178422 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
Atp5bP56480 Stard3nl-201ENSMUST00000039694 1327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
Atp5bP56480 Uba52-205ENSMUST00000129909 705 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.11■■□□□ 1.61
Atp5bP56480 Pdia5-201ENSMUST00000023550 1808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
Atp5bP56480 4930577N17Rik-201ENSMUST00000139771 1625 ntBASIC25.1■■□□□ 1.61
Atp5bP56480 Tlx3-201ENSMUST00000037746 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
Atp5bP56480 Ttc19-202ENSMUST00000101075 2193 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
Atp5bP56480 Cabp1-204ENSMUST00000112113 1621 ntTSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
Atp5bP56480 Uba52-207ENSMUST00000140679 697 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.08■■□□□ 1.61
Atp5bP56480 Eif5a-201ENSMUST00000043419 1437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
Atp5bP56480 Ssx2ip-202ENSMUST00000106149 2416 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
Atp5bP56480 Fam69b-201ENSMUST00000074240 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.6
Atp5bP56480 Chrna5-204ENSMUST00000217408 2446 ntTSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 12 ms