Protein–RNA interactions for Protein: P56480

Atp5b, ATP synthase subunit beta, mitochondrial, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 529 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Atp5bP56480 Lactb-201ENSMUST00000034929 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
Atp5bP56480 Spg7-201ENSMUST00000108868 845 ntTSL 2 BASIC25.5■■□□□ 1.67
Atp5bP56480 Gnas-207ENSMUST00000109085 1789 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.5■■□□□ 1.67
Atp5bP56480 Gm15672-201ENSMUST00000151512 1354 ntTSL 1 (best) BASIC25.5■■□□□ 1.67
Atp5bP56480 Cldnd1-201ENSMUST00000023426 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
Atp5bP56480 Egr3-201ENSMUST00000035908 1509 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
Atp5bP56480 Mogs-201ENSMUST00000032114 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
Atp5bP56480 Gm43863-201ENSMUST00000203822 1192 ntBASIC25.49■■□□□ 1.67
Atp5bP56480 Rab2a-201ENSMUST00000060232 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
Atp5bP56480 Crem-227ENSMUST00000149803 1422 ntTSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
Atp5bP56480 Tpst1-201ENSMUST00000040721 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
Atp5bP56480 2810459M11Rik-201ENSMUST00000027429 1225 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
Atp5bP56480 Nrep-202ENSMUST00000168890 2185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
Atp5bP56480 Traf4-201ENSMUST00000017530 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
Atp5bP56480 Ywhah-201ENSMUST00000019109 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
Atp5bP56480 Galnt10-202ENSMUST00000108846 1745 ntTSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
Atp5bP56480 A330023F24Rik-201ENSMUST00000181226 955 ntTSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
Atp5bP56480 Dlx6os2-201ENSMUST00000178206 1354 ntBASIC25.45■■□□□ 1.67
Atp5bP56480 Ywhaq-202ENSMUST00000103002 2110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
Atp5bP56480 Fcnaos-201ENSMUST00000127642 1351 ntTSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
Atp5bP56480 Tsen34-203ENSMUST00000108629 1238 ntTSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
Atp5bP56480 Gm30346-201ENSMUST00000218641 1699 ntBASIC25.44■■□□□ 1.66
Atp5bP56480 Ppp1r14c-202ENSMUST00000217573 2013 ntTSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
Atp5bP56480 Gm45716-202ENSMUST00000134929 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
Atp5bP56480 Zfp131-206ENSMUST00000223813 2561 ntAPPRIS P3 BASIC25.43■■□□□ 1.66
Atp5bP56480 Pradc1-202ENSMUST00000113770 610 ntTSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
Atp5bP56480 Kmt5a-202ENSMUST00000100709 1425 ntTSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
Atp5bP56480 En1-201ENSMUST00000079721 2624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
Atp5bP56480 Smad7-202ENSMUST00000168918 1882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
Atp5bP56480 Eif4e2-203ENSMUST00000113230 1569 ntTSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.66
Atp5bP56480 A430072P03Rik-201ENSMUST00000161480 1510 ntTSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.66
Atp5bP56480 Grasp-201ENSMUST00000000543 2013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.65
Atp5bP56480 Phf10-201ENSMUST00000024657 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.65
Atp5bP56480 A530058N18Rik-204ENSMUST00000141209 709 ntTSL 5 BASIC25.38■■□□□ 1.65
Atp5bP56480 2310050C09Rik-201ENSMUST00000163439 1078 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.38■■□□□ 1.65
Atp5bP56480 Il3ra-201ENSMUST00000090591 1614 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
Atp5bP56480 Cetn4-202ENSMUST00000075537 762 ntTSL 3 BASIC25.37■■□□□ 1.65
Atp5bP56480 Micu3-201ENSMUST00000068999 2219 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.37■■□□□ 1.65
Atp5bP56480 Ctbp1-201ENSMUST00000079746 2279 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
Atp5bP56480 Triobp-206ENSMUST00000130663 1660 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.36■■□□□ 1.65
Atp5bP56480 Gm43445-201ENSMUST00000198564 2091 ntBASIC25.36■■□□□ 1.65
Atp5bP56480 Zfp787-201ENSMUST00000094870 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
Atp5bP56480 Gm12523-201ENSMUST00000148844 599 ntTSL 5 BASIC25.35■■□□□ 1.65
Atp5bP56480 Nelfe-204ENSMUST00000173357 1399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
Atp5bP56480 Tbcel-204ENSMUST00000128959 1535 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.34■■□□□ 1.65
Atp5bP56480 AC157572.2-201ENSMUST00000226970 908 ntBASIC25.34■■□□□ 1.65
Atp5bP56480 Ebag9-203ENSMUST00000227691 1945 ntAPPRIS P1 BASIC25.33■■□□□ 1.65
Atp5bP56480 Pfdn2-202ENSMUST00000135941 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
Atp5bP56480 Cebpb-201ENSMUST00000070642 1504 ntAPPRIS P1 BASIC25.32■■□□□ 1.64
Atp5bP56480 Cdv3-205ENSMUST00000189896 1023 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
Atp5bP56480 Arl2bp-201ENSMUST00000034228 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
Atp5bP56480 A530058N18Rik-208ENSMUST00000131299 1387 ntTSL 2 BASIC25.31■■□□□ 1.64
Atp5bP56480 Snx3-201ENSMUST00000019939 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
Atp5bP56480 Tmem189-201ENSMUST00000006587 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
Atp5bP56480 Eid2-201ENSMUST00000059596 1392 ntAPPRIS P1 BASIC25.3■■□□□ 1.64
Atp5bP56480 Ric1-206ENSMUST00000162184 2157 ntTSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
Atp5bP56480 Htra4-201ENSMUST00000084031 2180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
Atp5bP56480 Cib1-201ENSMUST00000065163 1047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
Atp5bP56480 Dazap1-202ENSMUST00000105361 1537 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
Atp5bP56480 Evx2-202ENSMUST00000173623 1428 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
Atp5bP56480 Ring1-201ENSMUST00000025183 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
Atp5bP56480 Dleu2-206ENSMUST00000182537 318 ntTSL 2 BASIC25.26■■□□□ 1.63
Atp5bP56480 Kdm2a-203ENSMUST00000116571 2413 ntTSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
Atp5bP56480 Rbm17-201ENSMUST00000040314 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
Atp5bP56480 5730480H06Rik-201ENSMUST00000030968 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
Atp5bP56480 Rnf220-212ENSMUST00000221654 1949 ntTSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
Atp5bP56480 Mef2a-201ENSMUST00000032776 2476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
Atp5bP56480 Cldn10-203ENSMUST00000100314 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
Atp5bP56480 Mrps7-201ENSMUST00000058109 1962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
Atp5bP56480 Raly-201ENSMUST00000029120 1802 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.23■■□□□ 1.63
Atp5bP56480 Gsk3a-201ENSMUST00000071739 2260 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC25.23■■□□□ 1.63
Atp5bP56480 Cpsf4-201ENSMUST00000070487 1606 ntTSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
Atp5bP56480 Sugct-202ENSMUST00000220514 1351 ntTSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
Atp5bP56480 Scx-201ENSMUST00000043089 1136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
Atp5bP56480 Gjc1-201ENSMUST00000068933 1903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
Atp5bP56480 AY074887-201ENSMUST00000054018 769 ntAPPRIS P1 BASIC25.18■■□□□ 1.62
Atp5bP56480 Rheb-201ENSMUST00000030787 1784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
Atp5bP56480 Gm9939-201ENSMUST00000067161 1154 ntBASIC25.15■■□□□ 1.62
Atp5bP56480 Fkbp8-202ENSMUST00000119353 1720 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
Atp5bP56480 Hoxa13-203ENSMUST00000147595 2395 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC25.14■■□□□ 1.62
Atp5bP56480 Tcte3-201ENSMUST00000040746 788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.62
Atp5bP56480 Tcte3-202ENSMUST00000097398 632 ntTSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.62
Atp5bP56480 Amigo1-203ENSMUST00000106659 1360 ntTSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.61
Atp5bP56480 Plekha3-201ENSMUST00000111920 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
Atp5bP56480 Plin1-206ENSMUST00000205915 2817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
Atp5bP56480 Popdc3-201ENSMUST00000019994 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
Atp5bP56480 Gm26508-201ENSMUST00000181285 1516 ntTSL 5 BASIC25.12■■□□□ 1.61
Atp5bP56480 Dapk3-202ENSMUST00000178422 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
Atp5bP56480 Stard3nl-201ENSMUST00000039694 1327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
Atp5bP56480 Uba52-205ENSMUST00000129909 705 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.11■■□□□ 1.61
Atp5bP56480 Pdia5-201ENSMUST00000023550 1808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
Atp5bP56480 4930577N17Rik-201ENSMUST00000139771 1625 ntBASIC25.1■■□□□ 1.61
Atp5bP56480 Tlx3-201ENSMUST00000037746 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
Atp5bP56480 Ttc19-202ENSMUST00000101075 2193 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
Atp5bP56480 Cabp1-204ENSMUST00000112113 1621 ntTSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
Atp5bP56480 Uba52-207ENSMUST00000140679 697 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.08■■□□□ 1.61
Atp5bP56480 Eif5a-201ENSMUST00000043419 1437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
Atp5bP56480 Ssx2ip-202ENSMUST00000106149 2416 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
Atp5bP56480 Fam69b-201ENSMUST00000074240 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.6
Atp5bP56480 Chrna5-204ENSMUST00000217408 2446 ntTSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 18.1 ms