Protein–RNA interactions for Protein: P54731

Faf1, FAS-associated factor 1, mousemouse

Predictions only

Length 649 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Faf1P54731 Ube2m-201ENSMUST00000005714 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
Faf1P54731 Gm30346-201ENSMUST00000218641 1699 ntBASIC23.53■■□□□ 1.36
Faf1P54731 Arhgdia-201ENSMUST00000067936 2150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
Faf1P54731 Rundc3a-204ENSMUST00000107105 1861 ntTSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
Faf1P54731 Mast2-203ENSMUST00000106485 5705 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
Faf1P54731 Mast2-204ENSMUST00000106486 5723 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
Faf1P54731 Gm26115-201ENSMUST00000175605 87 ntBASIC23.52■■□□□ 1.36
Faf1P54731 Smurf1-201ENSMUST00000085684 5343 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
Faf1P54731 Mrps7-201ENSMUST00000058109 1962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
Faf1P54731 Olfm1-203ENSMUST00000102879 1072 ntTSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
Faf1P54731 Ubl4a-207ENSMUST00000178691 1038 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.51■■□□□ 1.35
Faf1P54731 Pon2-201ENSMUST00000057792 2409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
Faf1P54731 Igfbp3-202ENSMUST00000135887 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
Faf1P54731 Orai1-201ENSMUST00000051016 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
Faf1P54731 Clk2-202ENSMUST00000121212 2154 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
Faf1P54731 Onecut3-201ENSMUST00000051773 4776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
Faf1P54731 Efemp2-201ENSMUST00000070118 1781 ntTSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
Faf1P54731 Gm8109-201ENSMUST00000194076 746 ntBASIC23.48■■□□□ 1.35
Faf1P54731 Grin2d-203ENSMUST00000211713 5244 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.48■■□□□ 1.35
Faf1P54731 Kansl2-201ENSMUST00000023727 2311 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.48■■□□□ 1.35
Faf1P54731 Dapk3-202ENSMUST00000178422 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
Faf1P54731 Peli2-204ENSMUST00000226513 1320 ntBASIC23.47■■□□□ 1.35
Faf1P54731 Dtnb-211ENSMUST00000173240 2218 ntTSL 5 BASIC23.47■■□□□ 1.35
Faf1P54731 Cetn4-201ENSMUST00000071400 1808 ntTSL 5 BASIC23.46■■□□□ 1.35
Faf1P54731 Tbx1-201ENSMUST00000009241 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
Faf1P54731 Dpf1-204ENSMUST00000108231 2040 ntTSL 5 BASIC23.44■■□□□ 1.34
Faf1P54731 Rnf149-201ENSMUST00000062525 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
Faf1P54731 Mypop-203ENSMUST00000131087 1951 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.43■■□□□ 1.34
Faf1P54731 Cadps-203ENSMUST00000112658 5458 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
Faf1P54731 Fam69b-201ENSMUST00000074240 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
Faf1P54731 Rab40c-209ENSMUST00000179998 2456 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.41■■□□□ 1.34
Faf1P54731 Clk2-201ENSMUST00000090927 2128 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
Faf1P54731 Camsap1-212ENSMUST00000183461 5090 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.41■■□□□ 1.34
Faf1P54731 Hdgf-201ENSMUST00000005017 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
Faf1P54731 Phlda1-201ENSMUST00000164773 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
Faf1P54731 Agap3-201ENSMUST00000024123 3207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
Faf1P54731 Ranbp1-202ENSMUST00000115645 1085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
Faf1P54731 Pdia5-201ENSMUST00000023550 1808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
Faf1P54731 Scrt2-201ENSMUST00000064061 3395 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.38■■□□□ 1.33
Faf1P54731 Rcor2-201ENSMUST00000066646 2801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
Faf1P54731 Fam220a-205ENSMUST00000169329 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
Faf1P54731 Gm17494-201ENSMUST00000072769 1800 ntTSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
Faf1P54731 Arx-202ENSMUST00000113947 2454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
Faf1P54731 Bok-201ENSMUST00000027499 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
Faf1P54731 Gm5814-201ENSMUST00000177586 378 ntAPPRIS P1 BASIC23.37■■□□□ 1.33
Faf1P54731 Gm26566-201ENSMUST00000181601 1038 ntAPPRIS P1 BASIC23.37■■□□□ 1.33
Faf1P54731 Gm7334-201ENSMUST00000061681 1356 ntAPPRIS P1 BASIC23.37■■□□□ 1.33
Faf1P54731 Homer3-202ENSMUST00000087467 880 ntTSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
Faf1P54731 Fam220a-206ENSMUST00000196487 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
Faf1P54731 Vdac3-202ENSMUST00000179233 1423 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
Faf1P54731 Hmx1-201ENSMUST00000087674 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
Faf1P54731 2410017I17Rik-202ENSMUST00000090537 2053 ntTSL 2 BASIC23.35■■□□□ 1.33
Faf1P54731 Fezf2-202ENSMUST00000224023 1917 ntBASIC23.35■■□□□ 1.33
Faf1P54731 Dda1-209ENSMUST00000147642 1865 ntTSL 2 BASIC23.34■■□□□ 1.33
Faf1P54731 Cdc42bpg-201ENSMUST00000025681 5995 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.34■■□□□ 1.33
Faf1P54731 Ywhaq-202ENSMUST00000103002 2110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
Faf1P54731 Fxyd1-205ENSMUST00000205439 535 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.34■■□□□ 1.33
Faf1P54731 Il17d-201ENSMUST00000089494 1274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
Faf1P54731 Gsk3a-202ENSMUST00000108411 2248 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.33■■□□□ 1.33
Faf1P54731 Ube2f-202ENSMUST00000171112 1547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
Faf1P54731 Caap1-201ENSMUST00000030313 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
Faf1P54731 Aspscr1-201ENSMUST00000026135 1820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
Faf1P54731 Bok-205ENSMUST00000201863 883 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.31■■□□□ 1.32
Faf1P54731 Sox1-201ENSMUST00000180353 4832 ntAPPRIS P1 BASIC23.3■■□□□ 1.32
Faf1P54731 Grb2-202ENSMUST00000106495 2041 ntTSL 5 BASIC23.3■■□□□ 1.32
Faf1P54731 E330040D14Rik-201ENSMUST00000192299 1374 ntBASIC23.3■■□□□ 1.32
Faf1P54731 Rgs7-206ENSMUST00000194555 2431 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
Faf1P54731 Terf2-201ENSMUST00000068388 1915 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
Faf1P54731 Suds3-202ENSMUST00000166397 1694 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
Faf1P54731 Atp5a1-202ENSMUST00000114748 2674 ntTSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
Faf1P54731 Rras2-201ENSMUST00000069449 2275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
Faf1P54731 Sap30l-201ENSMUST00000020826 1151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
Faf1P54731 Phf23-205ENSMUST00000135814 2214 ntTSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
Faf1P54731 AC153890.1-201ENSMUST00000220021 2469 ntBASIC23.28■■□□□ 1.32
Faf1P54731 Grin2d-201ENSMUST00000002848 5431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
Faf1P54731 Esyt2-201ENSMUST00000100986 5560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
Faf1P54731 Zfp358-201ENSMUST00000061508 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
Faf1P54731 Gpr12-201ENSMUST00000036211 2219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.31
Faf1P54731 Trp53rkb-202ENSMUST00000065753 1375 ntTSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
Faf1P54731 Kat2b-201ENSMUST00000000724 4653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
Faf1P54731 Klhl25-205ENSMUST00000206019 2299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
Faf1P54731 Pan3-209ENSMUST00000176600 5541 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.25■■□□□ 1.31
Faf1P54731 Kcna7-201ENSMUST00000107774 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
Faf1P54731 Galnt12-202ENSMUST00000107744 2077 ntTSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
Faf1P54731 Kcnq5-206ENSMUST00000173404 2775 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.24■■□□□ 1.31
Faf1P54731 Marveld2-202ENSMUST00000163163 2187 ntTSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
Faf1P54731 Crim1-201ENSMUST00000112498 5995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
Faf1P54731 Kcnc3-202ENSMUST00000107907 5281 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.23■■□□□ 1.31
Faf1P54731 Dcaf15-202ENSMUST00000210279 2199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
Faf1P54731 Fam241a-201ENSMUST00000057198 1607 ntTSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
Faf1P54731 Lrrc4b-201ENSMUST00000058667 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
Faf1P54731 Gm5601-202ENSMUST00000207161 1437 ntTSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
Faf1P54731 Tgfbrap1-202ENSMUST00000186694 5385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
Faf1P54731 Panx2-202ENSMUST00000161372 2314 ntTSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
Faf1P54731 Tmed7-203ENSMUST00000151189 1348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
Faf1P54731 Snf8-202ENSMUST00000107700 849 ntTSL 2 BASIC23.18■■□□□ 1.3
Faf1P54731 Lpcat4-201ENSMUST00000028554 2275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
Faf1P54731 Pou4f1-201ENSMUST00000053016 4445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
Faf1P54731 Rheb-201ENSMUST00000030787 1784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
Faf1P54731 Wwc1-201ENSMUST00000018993 4531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 14.2 ms