Protein–RNA interactions for Protein: P53798

Fdft1, Squalene synthase, mousemouse

Predictions only

Length 416 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Fdft1P53798 Pdia5-201ENSMUST00000023550 1808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
Fdft1P53798 6530409C15Rik-202ENSMUST00000143551 1573 ntTSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.52
Fdft1P53798 Pitpna-205ENSMUST00000179445 1665 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.56■■□□□ 1.52
Fdft1P53798 Dyrk1a-202ENSMUST00000119878 5759 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.56■■□□□ 1.52
Fdft1P53798 Sowahd-201ENSMUST00000060057 1574 ntAPPRIS P1 BASIC24.55■■□□□ 1.52
Fdft1P53798 Cds2-203ENSMUST00000110158 1247 ntTSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
Fdft1P53798 Dlg1-203ENSMUST00000100001 4711 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.54■■□□□ 1.52
Fdft1P53798 B4galt7-202ENSMUST00000100764 2195 ntTSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
Fdft1P53798 Reep6-202ENSMUST00000105354 2208 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
Fdft1P53798 Reep6-205ENSMUST00000105358 2208 ntTSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
Fdft1P53798 2210008F06Rik-201ENSMUST00000180805 1082 ntTSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
Fdft1P53798 Ildr2-205ENSMUST00000193860 2320 ntTSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
Fdft1P53798 Maz-201ENSMUST00000032916 2347 ntTSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
Fdft1P53798 Efemp2-201ENSMUST00000070118 1781 ntTSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
Fdft1P53798 Tcte2-204ENSMUST00000130033 1462 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
Fdft1P53798 1700028N14Rik-201ENSMUST00000139621 747 ntTSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
Fdft1P53798 Rnd2-201ENSMUST00000001347 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
Fdft1P53798 Ryk-201ENSMUST00000035142 2852 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
Fdft1P53798 Bin1-202ENSMUST00000091967 2118 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
Fdft1P53798 Fam60a-203ENSMUST00000111562 906 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.49■■□□□ 1.51
Fdft1P53798 Hoxa13-201ENSMUST00000047993 1309 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.49■■□□□ 1.51
Fdft1P53798 Aard-201ENSMUST00000090025 1348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
Fdft1P53798 Dpf1-204ENSMUST00000108231 2040 ntTSL 5 BASIC24.47■■□□□ 1.51
Fdft1P53798 Rheb-201ENSMUST00000030787 1784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
Fdft1P53798 Tbx1-201ENSMUST00000009241 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
Fdft1P53798 Gpr27-201ENSMUST00000101122 2388 ntAPPRIS P1 BASIC24.46■■□□□ 1.51
Fdft1P53798 Srsf9-201ENSMUST00000031513 1162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
Fdft1P53798 Ccdc122-202ENSMUST00000095625 1195 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
Fdft1P53798 Rundc3a-204ENSMUST00000107105 1861 ntTSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.51
Fdft1P53798 Tmeff1-202ENSMUST00000123476 1224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
Fdft1P53798 Macrod1-201ENSMUST00000040261 1274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
Fdft1P53798 4921531C22Rik-201ENSMUST00000150145 1905 ntTSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
Fdft1P53798 A530058N18Rik-207ENSMUST00000152254 1211 ntTSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
Fdft1P53798 Znrf3-202ENSMUST00000143746 1022 ntTSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
Fdft1P53798 Zfp513-202ENSMUST00000114590 2228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
Fdft1P53798 Triobp-206ENSMUST00000130663 1660 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.43■■□□□ 1.5
Fdft1P53798 Dtnb-211ENSMUST00000173240 2218 ntTSL 5 BASIC24.42■■□□□ 1.5
Fdft1P53798 Irak1-207ENSMUST00000114360 2441 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
Fdft1P53798 Cnnm3-201ENSMUST00000001166 5193 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
Fdft1P53798 CT030161.2-201ENSMUST00000218666 735 ntTSL 3 BASIC24.4■■□□□ 1.5
Fdft1P53798 Rbms1-202ENSMUST00000112509 1806 ntTSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
Fdft1P53798 Dcaf15-202ENSMUST00000210279 2199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.5
Fdft1P53798 Crem-227ENSMUST00000149803 1422 ntTSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.5
Fdft1P53798 Pradc1-202ENSMUST00000113770 610 ntTSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
Fdft1P53798 Clk2-201ENSMUST00000090927 2128 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
Fdft1P53798 Clk2-203ENSMUST00000121931 2112 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.38■■□□□ 1.49
Fdft1P53798 Mpp6-203ENSMUST00000166318 2222 ntTSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
Fdft1P53798 Amer2-203ENSMUST00000225247 2662 ntBASIC24.37■■□□□ 1.49
Fdft1P53798 Eif2ak3-204ENSMUST00000162950 927 ntTSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
Fdft1P53798 Gm10762-201ENSMUST00000099385 1133 ntAPPRIS P1 BASIC24.36■■□□□ 1.49
Fdft1P53798 Gm527-201ENSMUST00000058135 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
Fdft1P53798 Gm17494-201ENSMUST00000072769 1800 ntTSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
Fdft1P53798 Tbcel-204ENSMUST00000128959 1535 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.35■■□□□ 1.49
Fdft1P53798 Egr3-201ENSMUST00000035908 1509 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
Fdft1P53798 Popdc3-201ENSMUST00000019994 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
Fdft1P53798 Dda1-209ENSMUST00000147642 1865 ntTSL 2 BASIC24.34■■□□□ 1.49
Fdft1P53798 Fkbp8-202ENSMUST00000119353 1720 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
Fdft1P53798 Gm960-204ENSMUST00000225896 2202 ntAPPRIS ALT2 BASIC24.33■■□□□ 1.49
Fdft1P53798 Smurf1-202ENSMUST00000100461 2725 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
Fdft1P53798 Aspscr1-201ENSMUST00000026135 1820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.48
Fdft1P53798 Adgrb1-203ENSMUST00000185682 2744 ntTSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.48
Fdft1P53798 Fam241a-201ENSMUST00000057198 1607 ntTSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
Fdft1P53798 Cetn4-201ENSMUST00000071400 1808 ntTSL 5 BASIC24.31■■□□□ 1.48
Fdft1P53798 Gm15672-201ENSMUST00000151512 1354 ntTSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
Fdft1P53798 Kmt5a-202ENSMUST00000100709 1425 ntTSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
Fdft1P53798 Galnt12-202ENSMUST00000107744 2077 ntTSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
Fdft1P53798 Hrh3-208ENSMUST00000171736 906 ntTSL 5 BASIC24.28■■□□□ 1.48
Fdft1P53798 Phf23-205ENSMUST00000135814 2214 ntTSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
Fdft1P53798 Smad2-202ENSMUST00000091831 1645 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.28■■□□□ 1.48
Fdft1P53798 Junos-204ENSMUST00000128094 830 ntTSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
Fdft1P53798 Rbm17-201ENSMUST00000040314 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
Fdft1P53798 Stau2-210ENSMUST00000149320 2214 ntTSL 5 BASIC24.27■■□□□ 1.48
Fdft1P53798 Fbxo6-201ENSMUST00000030858 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
Fdft1P53798 Igfbp3-202ENSMUST00000135887 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
Fdft1P53798 A430072P03Rik-201ENSMUST00000161480 1510 ntTSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
Fdft1P53798 A730013G03Rik-202ENSMUST00000195012 2097 ntBASIC24.25■■□□□ 1.47
Fdft1P53798 Gsk3a-202ENSMUST00000108411 2248 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.25■■□□□ 1.47
Fdft1P53798 Rab40c-209ENSMUST00000179998 2456 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.25■■□□□ 1.47
Fdft1P53798 2410017I17Rik-202ENSMUST00000090537 2053 ntTSL 2 BASIC24.24■■□□□ 1.47
Fdft1P53798 Hdgf-201ENSMUST00000005017 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
Fdft1P53798 Rras2-201ENSMUST00000069449 2275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
Fdft1P53798 Mypop-203ENSMUST00000131087 1951 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.23■■□□□ 1.47
Fdft1P53798 A530058N18Rik-208ENSMUST00000131299 1387 ntTSL 2 BASIC24.22■■□□□ 1.47
Fdft1P53798 Zfp131-205ENSMUST00000223812 663 ntBASIC24.22■■□□□ 1.47
Fdft1P53798 Zfp358-201ENSMUST00000061508 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
Fdft1P53798 1700016A09Rik-201ENSMUST00000192004 835 ntBASIC24.21■■□□□ 1.47
Fdft1P53798 Fezf2-202ENSMUST00000224023 1917 ntBASIC24.21■■□□□ 1.47
Fdft1P53798 Cnnm3-202ENSMUST00000097776 5292 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
Fdft1P53798 Kansl2-201ENSMUST00000023727 2311 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.21■■□□□ 1.47
Fdft1P53798 5730480H06Rik-201ENSMUST00000030968 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
Fdft1P53798 Tlx3-201ENSMUST00000037746 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.47
Fdft1P53798 Prr3-201ENSMUST00000055454 2727 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.47
Fdft1P53798 Arhgdia-201ENSMUST00000067936 2150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
Fdft1P53798 Dazap1-201ENSMUST00000092305 1994 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
Fdft1P53798 Irx4-201ENSMUST00000022095 2589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
Fdft1P53798 Caap1-201ENSMUST00000030313 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
Fdft1P53798 Snx3-201ENSMUST00000019939 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
Fdft1P53798 Dedd-201ENSMUST00000064950 1618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
Fdft1P53798 Clk2-202ENSMUST00000121212 2154 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
Fdft1P53798 Rcor2-201ENSMUST00000066646 2801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 13.5 ms