Protein–RNA interactions for Protein: P51942

Matn1, Cartilage matrix protein, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 500 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Matn1P51942 Zfp422-201ENSMUST00000057540 2375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
Matn1P51942 Zfp358-201ENSMUST00000061508 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
Matn1P51942 Cited2-203ENSMUST00000219558 2411 ntAPPRIS P1 BASIC24.2■■□□□ 1.46
Matn1P51942 Pdia5-201ENSMUST00000023550 1808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
Matn1P51942 Syt7-201ENSMUST00000073899 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
Matn1P51942 Nr2f6-201ENSMUST00000002466 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
Matn1P51942 Clptm1l-201ENSMUST00000022102 2340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
Matn1P51942 Dcaf15-202ENSMUST00000210279 2199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
Matn1P51942 Enho-201ENSMUST00000127306 1269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
Matn1P51942 Gm12184-201ENSMUST00000104959 1310 ntAPPRIS P1 BASIC24.17■■□□□ 1.46
Matn1P51942 Rnf19b-201ENSMUST00000030584 2414 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.16■■□□□ 1.46
Matn1P51942 Mkrn1-202ENSMUST00000051671 1511 ntTSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
Matn1P51942 Ube2m-201ENSMUST00000005714 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
Matn1P51942 Gm960-204ENSMUST00000225896 2202 ntAPPRIS ALT2 BASIC24.16■■□□□ 1.46
Matn1P51942 Isoc1-201ENSMUST00000025503 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
Matn1P51942 Phlda1-201ENSMUST00000164773 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
Matn1P51942 Peg12-201ENSMUST00000094339 2640 ntAPPRIS P1 BASIC24.14■■□□□ 1.46
Matn1P51942 Maz-204ENSMUST00000206254 2282 ntTSL 5 BASIC24.14■■□□□ 1.46
Matn1P51942 Eed-201ENSMUST00000107234 2067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
Matn1P51942 Fam241a-201ENSMUST00000057198 1607 ntTSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
Matn1P51942 Ctbp1-211ENSMUST00000202868 2436 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
Matn1P51942 Tm6sf1-201ENSMUST00000041890 2226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
Matn1P51942 Irak1-207ENSMUST00000114360 2441 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
Matn1P51942 Pon2-201ENSMUST00000057792 2409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
Matn1P51942 Ywhaq-202ENSMUST00000103002 2110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
Matn1P51942 Clk2-202ENSMUST00000121212 2154 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
Matn1P51942 Rnf130-201ENSMUST00000054684 1415 ntTSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
Matn1P51942 Arhgdia-201ENSMUST00000067936 2150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.44
Matn1P51942 Kcnmb4os2-201ENSMUST00000080943 1571 ntTSL 5 BASIC24.08■■□□□ 1.44
Matn1P51942 Rab22a-202ENSMUST00000109110 849 ntTSL 5 BASIC24.06■■□□□ 1.44
Matn1P51942 A730013G03Rik-202ENSMUST00000195012 2097 ntBASIC24.06■■□□□ 1.44
Matn1P51942 Eif4ebp1-201ENSMUST00000033880 1997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
Matn1P51942 Cdc14b-207ENSMUST00000221634 1953 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
Matn1P51942 Gm26115-201ENSMUST00000175605 87 ntBASIC24.04■■□□□ 1.44
Matn1P51942 Hmx1-201ENSMUST00000087674 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
Matn1P51942 Odc1-201ENSMUST00000171737 2208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
Matn1P51942 Det1-201ENSMUST00000032839 2269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
Matn1P51942 Ubl4a-207ENSMUST00000178691 1038 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.03■■□□□ 1.44
Matn1P51942 E030037K01Rik-201ENSMUST00000180928 1756 ntBASIC24.02■■□□□ 1.44
Matn1P51942 Gpr12-201ENSMUST00000036211 2219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
Matn1P51942 Orai1-201ENSMUST00000051016 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
Matn1P51942 Olfm1-203ENSMUST00000102879 1072 ntTSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
Matn1P51942 Dapk3-201ENSMUST00000047665 1676 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.01■■□□□ 1.43
Matn1P51942 Slc39a13-201ENSMUST00000073575 2469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
Matn1P51942 Mpp6-202ENSMUST00000036236 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
Matn1P51942 Atp5a1-202ENSMUST00000114748 2674 ntTSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
Matn1P51942 Rbms1-202ENSMUST00000112509 1806 ntTSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
Matn1P51942 Otud5-205ENSMUST00000115668 2543 ntTSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
Matn1P51942 Nhlrc1-201ENSMUST00000052747 2294 ntAPPRIS P1 BASIC23.97■■□□□ 1.43
Matn1P51942 Gm7334-201ENSMUST00000061681 1356 ntAPPRIS P1 BASIC23.97■■□□□ 1.43
Matn1P51942 Tcf15-201ENSMUST00000089112 980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
Matn1P51942 Kansl2-202ENSMUST00000116400 2110 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
Matn1P51942 Rheb-201ENSMUST00000030787 1784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
Matn1P51942 Mnx1-201ENSMUST00000001608 2018 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.96■■□□□ 1.43
Matn1P51942 Prr3-201ENSMUST00000055454 2727 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
Matn1P51942 Gm8109-201ENSMUST00000194076 746 ntBASIC23.95■■□□□ 1.42
Matn1P51942 Bok-201ENSMUST00000027499 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
Matn1P51942 Ppp1cc-201ENSMUST00000086294 1442 ntTSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
Matn1P51942 Mpp6-209ENSMUST00000204545 2418 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.93■■□□□ 1.42
Matn1P51942 Ube2f-202ENSMUST00000171112 1547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
Matn1P51942 Wdr34-201ENSMUST00000113711 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
Matn1P51942 Bok-205ENSMUST00000201863 883 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.92■■□□□ 1.42
Matn1P51942 St7-208ENSMUST00000115419 2194 ntTSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
Matn1P51942 Peli2-204ENSMUST00000226513 1320 ntBASIC23.91■■□□□ 1.42
Matn1P51942 Fam220a-206ENSMUST00000196487 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
Matn1P51942 Zfp513-202ENSMUST00000114590 2228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
Matn1P51942 Gas2l1-201ENSMUST00000037146 2686 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
Matn1P51942 Tnfsfm13-203ENSMUST00000180587 2235 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.88■■□□□ 1.41
Matn1P51942 Nans-201ENSMUST00000030018 2179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
Matn1P51942 Btf3-201ENSMUST00000022163 1091 ntTSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
Matn1P51942 Snta1-202ENSMUST00000109728 2131 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
Matn1P51942 Snta1-201ENSMUST00000028991 2125 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
Matn1P51942 Rtn4r-201ENSMUST00000059589 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
Matn1P51942 Ranbp1-202ENSMUST00000115645 1085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
Matn1P51942 Zbtb12-201ENSMUST00000052778 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
Matn1P51942 Tmem260-208ENSMUST00000226400 2281 ntAPPRIS ALT2 BASIC23.85■■□□□ 1.41
Matn1P51942 Cpe-201ENSMUST00000048967 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
Matn1P51942 Fus-201ENSMUST00000077609 1831 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
Matn1P51942 Iffo2-203ENSMUST00000174078 5716 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
Matn1P51942 Smad2-202ENSMUST00000091831 1645 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.83■■□□□ 1.41
Matn1P51942 Ica1-201ENSMUST00000038403 2075 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
Matn1P51942 Gm5814-201ENSMUST00000177586 378 ntAPPRIS P1 BASIC23.82■■□□□ 1.4
Matn1P51942 Csnk1g2-201ENSMUST00000079773 2348 ntTSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
Matn1P51942 Rnf115-201ENSMUST00000029740 2209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
Matn1P51942 Efna3-201ENSMUST00000029673 2363 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
Matn1P51942 Vdac3-202ENSMUST00000179233 1423 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
Matn1P51942 Arx-202ENSMUST00000113947 2454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
Matn1P51942 Ei24-202ENSMUST00000163192 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
Matn1P51942 Lrfn1-203ENSMUST00000189877 1852 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.77■■□□□ 1.4
Matn1P51942 Six3-201ENSMUST00000162695 2838 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.77■■□□□ 1.4
Matn1P51942 Pitpna-205ENSMUST00000179445 1665 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.76■■□□□ 1.39
Matn1P51942 E2f5-201ENSMUST00000029069 1779 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
Matn1P51942 Gm26566-201ENSMUST00000181601 1038 ntAPPRIS P1 BASIC23.76■■□□□ 1.39
Matn1P51942 5031425E22Rik-201ENSMUST00000101522 2110 ntBASIC23.75■■□□□ 1.39
Matn1P51942 Fzd9-201ENSMUST00000062572 2293 ntAPPRIS P1 BASIC23.75■■□□□ 1.39
Matn1P51942 Bcl7b-201ENSMUST00000031692 1758 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
Matn1P51942 Paqr3-202ENSMUST00000112968 1875 ntTSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
Matn1P51942 Eya2-202ENSMUST00000088132 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
Matn1P51942 Fkbp8-202ENSMUST00000119353 1720 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
Matn1P51942 E330040D14Rik-201ENSMUST00000192299 1374 ntBASIC23.73■■□□□ 1.39
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 67.5 ms