Protein–RNA interactions for Protein: P51680

Ccr4, C-C chemokine receptor type 4, mousemouse

Predictions only

Length 360 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccr4P51680 Fam60a-203ENSMUST00000111562 906 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.76■■□□□ 1.23
Ccr4P51680 Znrf3-202ENSMUST00000143746 1022 ntTSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
Ccr4P51680 Zfp787-201ENSMUST00000094870 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
Ccr4P51680 Tbx1-201ENSMUST00000009241 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
Ccr4P51680 Rnd2-201ENSMUST00000001347 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
Ccr4P51680 Dpf1-204ENSMUST00000108231 2040 ntTSL 5 BASIC22.72■■□□□ 1.23
Ccr4P51680 Rheb-201ENSMUST00000030787 1784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
Ccr4P51680 Aard-201ENSMUST00000090025 1348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
Ccr4P51680 Ccdc122-202ENSMUST00000095625 1195 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
Ccr4P51680 4921531C22Rik-201ENSMUST00000150145 1905 ntTSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.23
Ccr4P51680 Dtnb-211ENSMUST00000173240 2218 ntTSL 5 BASIC22.7■■□□□ 1.23
Ccr4P51680 A530058N18Rik-207ENSMUST00000152254 1211 ntTSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
Ccr4P51680 Srsf9-201ENSMUST00000031513 1162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
Ccr4P51680 Rundc3a-204ENSMUST00000107105 1861 ntTSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
Ccr4P51680 Crem-227ENSMUST00000149803 1422 ntTSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
Ccr4P51680 Tmeff1-202ENSMUST00000123476 1224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
Ccr4P51680 1700028N14Rik-201ENSMUST00000139621 747 ntTSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
Ccr4P51680 Macrod1-201ENSMUST00000040261 1274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
Ccr4P51680 Eif2ak3-204ENSMUST00000162950 927 ntTSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
Ccr4P51680 Triobp-206ENSMUST00000130663 1660 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.67■■□□□ 1.22
Ccr4P51680 Tmem189-201ENSMUST00000006587 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
Ccr4P51680 Gm17494-201ENSMUST00000072769 1800 ntTSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
Ccr4P51680 Clk2-201ENSMUST00000090927 2128 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
Ccr4P51680 Arl2bp-201ENSMUST00000034228 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
Ccr4P51680 Clk2-203ENSMUST00000121931 2112 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.65■■□□□ 1.22
Ccr4P51680 CT030161.2-201ENSMUST00000218666 735 ntTSL 3 BASIC22.65■■□□□ 1.22
Ccr4P51680 Dcaf15-202ENSMUST00000210279 2199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
Ccr4P51680 Dda1-209ENSMUST00000147642 1865 ntTSL 2 BASIC22.64■■□□□ 1.21
Ccr4P51680 Rbms1-202ENSMUST00000112509 1806 ntTSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
Ccr4P51680 Mpp6-203ENSMUST00000166318 2222 ntTSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
Ccr4P51680 Gm527-201ENSMUST00000058135 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
Ccr4P51680 Pradc1-202ENSMUST00000113770 610 ntTSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
Ccr4P51680 Gsk3a-201ENSMUST00000071739 2260 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.61■■□□□ 1.21
Ccr4P51680 Kdm2a-203ENSMUST00000116571 2413 ntTSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
Ccr4P51680 Amer2-203ENSMUST00000225247 2662 ntBASIC22.61■■□□□ 1.21
Ccr4P51680 Popdc3-201ENSMUST00000019994 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
Ccr4P51680 Tbcel-204ENSMUST00000128959 1535 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.61■■□□□ 1.21
Ccr4P51680 Egr3-201ENSMUST00000035908 1509 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
Ccr4P51680 Gm10762-201ENSMUST00000099385 1133 ntAPPRIS P1 BASIC22.59■■□□□ 1.21
Ccr4P51680 Dennd5a-202ENSMUST00000106722 4862 ntTSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
Ccr4P51680 Fam241a-201ENSMUST00000057198 1607 ntTSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
Ccr4P51680 Cetn4-201ENSMUST00000071400 1808 ntTSL 5 BASIC22.58■■□□□ 1.21
Ccr4P51680 Aspscr1-201ENSMUST00000026135 1820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
Ccr4P51680 Fam168b-201ENSMUST00000047534 5030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
Ccr4P51680 Kmt5a-202ENSMUST00000100709 1425 ntTSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
Ccr4P51680 Galnt12-202ENSMUST00000107744 2077 ntTSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
Ccr4P51680 Rab2a-201ENSMUST00000060232 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
Ccr4P51680 Smad2-202ENSMUST00000091831 1645 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.56■■□□□ 1.2
Ccr4P51680 Ssx2ip-202ENSMUST00000106149 2416 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
Ccr4P51680 Fbxo6-201ENSMUST00000030858 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
Ccr4P51680 Gm15672-201ENSMUST00000151512 1354 ntTSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
Ccr4P51680 Fkbp8-202ENSMUST00000119353 1720 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
Ccr4P51680 Terf2-203ENSMUST00000116425 2471 ntTSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
Ccr4P51680 A430072P03Rik-201ENSMUST00000161480 1510 ntTSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
Ccr4P51680 Phf23-205ENSMUST00000135814 2214 ntTSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
Ccr4P51680 Junos-204ENSMUST00000128094 830 ntTSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
Ccr4P51680 Hrh3-208ENSMUST00000171736 906 ntTSL 5 BASIC22.53■■□□□ 1.2
Ccr4P51680 Rras2-201ENSMUST00000069449 2275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
Ccr4P51680 Rbm17-201ENSMUST00000040314 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
Ccr4P51680 Zfp358-201ENSMUST00000061508 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
Ccr4P51680 A730013G03Rik-202ENSMUST00000195012 2097 ntBASIC22.51■■□□□ 1.19
Ccr4P51680 Ctnnd2-201ENSMUST00000081728 5944 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
Ccr4P51680 5730480H06Rik-201ENSMUST00000030968 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
Ccr4P51680 A530058N18Rik-208ENSMUST00000131299 1387 ntTSL 2 BASIC22.49■■□□□ 1.19
Ccr4P51680 Stau2-210ENSMUST00000149320 2214 ntTSL 5 BASIC22.48■■□□□ 1.19
Ccr4P51680 Irx4-201ENSMUST00000022095 2589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
Ccr4P51680 Znrf2-201ENSMUST00000079869 5886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
Ccr4P51680 Mypop-203ENSMUST00000131087 1951 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.47■■□□□ 1.19
Ccr4P51680 Cadps-201ENSMUST00000067491 5421 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
Ccr4P51680 1700016A09Rik-201ENSMUST00000192004 835 ntBASIC22.46■■□□□ 1.19
Ccr4P51680 Zfp131-205ENSMUST00000223812 663 ntBASIC22.46■■□□□ 1.19
Ccr4P51680 Caap1-201ENSMUST00000030313 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
Ccr4P51680 Hdgf-201ENSMUST00000005017 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
Ccr4P51680 Gm960-202ENSMUST00000177696 2262 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.45■■□□□ 1.18
Ccr4P51680 Snx3-201ENSMUST00000019939 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
Ccr4P51680 Dazap1-201ENSMUST00000092305 1994 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
Ccr4P51680 Crim1-201ENSMUST00000112498 5995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
Ccr4P51680 Tlx3-201ENSMUST00000037746 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Ccr4P51680 Smurf1-203ENSMUST00000110677 5420 ntTSL 5 BASIC22.43■■□□□ 1.18
Ccr4P51680 Srp9-201ENSMUST00000027792 1367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
Ccr4P51680 Dedd-201ENSMUST00000064950 1618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Ccr4P51680 1700069B07Rik-202ENSMUST00000191155 939 ntBASIC22.4■■□□□ 1.18
Ccr4P51680 Gsk3a-202ENSMUST00000108411 2248 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.4■■□□□ 1.18
Ccr4P51680 Mcat-201ENSMUST00000061882 1893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Ccr4P51680 Tsc22d1-204ENSMUST00000110888 4999 ntTSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Ccr4P51680 Amigo1-201ENSMUST00000050909 5030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
Ccr4P51680 Suds3-202ENSMUST00000166397 1694 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
Ccr4P51680 Cldn10-203ENSMUST00000100314 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
Ccr4P51680 Twist1-201ENSMUST00000049089 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
Ccr4P51680 Sugct-202ENSMUST00000220514 1351 ntTSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Ccr4P51680 Ppp1r14c-202ENSMUST00000217573 2013 ntTSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Ccr4P51680 Kansl2-202ENSMUST00000116400 2110 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Ccr4P51680 Nelfe-204ENSMUST00000173357 1399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Ccr4P51680 Terf2-201ENSMUST00000068388 1915 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Ccr4P51680 Stard10-202ENSMUST00000163799 1723 ntTSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Ccr4P51680 Cabp1-204ENSMUST00000112113 1621 ntTSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Ccr4P51680 Dapk3-201ENSMUST00000047665 1676 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.36■■□□□ 1.17
Ccr4P51680 Slc16a8-201ENSMUST00000039752 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Ccr4P51680 March2-205ENSMUST00000173015 1418 ntTSL 3 BASIC22.35■■□□□ 1.17
Ccr4P51680 Eif4ebp1-201ENSMUST00000033880 1997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 13.1 ms