Protein–RNA interactions for Protein: P51491

Opn1sw, Short-wave-sensitive opsin 1, mousemouse

Predictions only

Length 346 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Opn1swP51491 Fbxo6-201ENSMUST00000030858 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
Opn1swP51491 Gm960-202ENSMUST00000177696 2262 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.69■■□□□ 1.22
Opn1swP51491 Iffo2-203ENSMUST00000174078 5716 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
Opn1swP51491 2410017I17Rik-202ENSMUST00000090537 2053 ntTSL 2 BASIC22.68■■□□□ 1.22
Opn1swP51491 Tnfsfm13-202ENSMUST00000174159 1470 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.67■■□□□ 1.22
Opn1swP51491 Gm9397-201ENSMUST00000200125 605 ntBASIC22.67■■□□□ 1.22
Opn1swP51491 Klhl25-205ENSMUST00000206019 2299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
Opn1swP51491 Spata1-201ENSMUST00000029839 1920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
Opn1swP51491 Mthfd2l-203ENSMUST00000202781 688 ntTSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
Opn1swP51491 Qrich1-209ENSMUST00000194385 975 ntTSL 2 BASIC22.64■■□□□ 1.21
Opn1swP51491 Smarcc2-205ENSMUST00000218228 603 ntTSL 5 BASIC22.64■■□□□ 1.21
Opn1swP51491 Capns1-201ENSMUST00000001845 1600 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.64■■□□□ 1.21
Opn1swP51491 Plpp2-201ENSMUST00000063879 1654 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
Opn1swP51491 Ube2f-202ENSMUST00000171112 1547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
Opn1swP51491 Gjc1-201ENSMUST00000068933 1903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
Opn1swP51491 Ssbp3-202ENSMUST00000072753 1924 ntTSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
Opn1swP51491 Rgs7-206ENSMUST00000194555 2431 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
Opn1swP51491 Tnfsf12-202ENSMUST00000181810 1435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
Opn1swP51491 Cds2-203ENSMUST00000110158 1247 ntTSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
Opn1swP51491 Gpr27-201ENSMUST00000101122 2388 ntAPPRIS P1 BASIC22.6■■□□□ 1.21
Opn1swP51491 Dyrk1a-202ENSMUST00000119878 5759 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.59■■□□□ 1.21
Opn1swP51491 Cnnm3-201ENSMUST00000001166 5193 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
Opn1swP51491 Mxra7-202ENSMUST00000047715 757 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
Opn1swP51491 Xkr7-201ENSMUST00000037235 2711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
Opn1swP51491 Vsig8-202ENSMUST00000177086 1519 ntTSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
Opn1swP51491 BC037032-205ENSMUST00000187080 508 ntTSL 5 BASIC22.58■■□□□ 1.21
Opn1swP51491 Grb2-202ENSMUST00000106495 2041 ntTSL 5 BASIC22.58■■□□□ 1.2
Opn1swP51491 B4galt7-202ENSMUST00000100764 2195 ntTSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
Opn1swP51491 Gm6345-201ENSMUST00000180378 1691 ntBASIC22.57■■□□□ 1.2
Opn1swP51491 Gnas-207ENSMUST00000109085 1789 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
Opn1swP51491 Fezf2-202ENSMUST00000224023 1917 ntBASIC22.57■■□□□ 1.2
Opn1swP51491 Smarcc1-203ENSMUST00000197480 1949 ntTSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
Opn1swP51491 Crip2-201ENSMUST00000084882 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
Opn1swP51491 Adgrb1-203ENSMUST00000185682 2744 ntTSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
Opn1swP51491 Runx3-202ENSMUST00000119564 1855 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
Opn1swP51491 C2cd4d-201ENSMUST00000169433 1321 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.55■■□□□ 1.2
Opn1swP51491 Dut-202ENSMUST00000082122 1020 ntTSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
Opn1swP51491 Irx4-201ENSMUST00000022095 2589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
Opn1swP51491 Dtnb-211ENSMUST00000173240 2218 ntTSL 5 BASIC22.53■■□□□ 1.2
Opn1swP51491 2810459M11Rik-201ENSMUST00000027429 1225 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
Opn1swP51491 Ppp1r14b-201ENSMUST00000070850 919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
Opn1swP51491 March2-205ENSMUST00000173015 1418 ntTSL 3 BASIC22.53■■□□□ 1.2
Opn1swP51491 Cetn4-201ENSMUST00000071400 1808 ntTSL 5 BASIC22.52■■□□□ 1.2
Opn1swP51491 E330040D14Rik-201ENSMUST00000192299 1374 ntBASIC22.52■■□□□ 1.2
Opn1swP51491 C1qtnf5-201ENSMUST00000114815 1215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
Opn1swP51491 Gng13-201ENSMUST00000115108 347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
Opn1swP51491 Rundc3a-204ENSMUST00000107105 1861 ntTSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
Opn1swP51491 1810026B05Rik-206ENSMUST00000187421 519 ntTSL 3 BASIC22.5■■□□□ 1.19
Opn1swP51491 Dtnb-203ENSMUST00000164578 2355 ntTSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
Opn1swP51491 Kansl2-201ENSMUST00000023727 2311 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.49■■□□□ 1.19
Opn1swP51491 Sec63-201ENSMUST00000019937 6032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
Opn1swP51491 Spg7-201ENSMUST00000108868 845 ntTSL 2 BASIC22.49■■□□□ 1.19
Opn1swP51491 Gm20503-201ENSMUST00000174664 1294 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.48■■□□□ 1.19
Opn1swP51491 Ranbp1-202ENSMUST00000115645 1085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
Opn1swP51491 Cnnm3-202ENSMUST00000097776 5292 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
Opn1swP51491 Terf2-201ENSMUST00000068388 1915 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
Opn1swP51491 Orai1-201ENSMUST00000051016 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
Opn1swP51491 Clk2-201ENSMUST00000090927 2128 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
Opn1swP51491 Dpf1-204ENSMUST00000108231 2040 ntTSL 5 BASIC22.45■■□□□ 1.18
Opn1swP51491 Ubp1-203ENSMUST00000116492 2111 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
Opn1swP51491 Susd4-202ENSMUST00000153348 1898 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.45■■□□□ 1.18
Opn1swP51491 Caap1-201ENSMUST00000030313 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
Opn1swP51491 Marveld2-202ENSMUST00000163163 2187 ntTSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
Opn1swP51491 Reep6-203ENSMUST00000105355 2127 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
Opn1swP51491 Reep6-204ENSMUST00000105357 2127 ntTSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
Opn1swP51491 1810026B05Rik-202ENSMUST00000184554 782 ntTSL 3 BASIC22.43■■□□□ 1.18
Opn1swP51491 Mfsd5-201ENSMUST00000051341 1742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Opn1swP51491 Suds3-202ENSMUST00000166397 1694 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
Opn1swP51491 Bok-201ENSMUST00000027499 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
Opn1swP51491 Pradc1-202ENSMUST00000113770 610 ntTSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
Opn1swP51491 Ubl4a-207ENSMUST00000178691 1038 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.42■■□□□ 1.18
Opn1swP51491 Guf1-201ENSMUST00000031113 1769 ntTSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
Opn1swP51491 A330023F24Rik-201ENSMUST00000181226 955 ntTSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Opn1swP51491 Phf23-205ENSMUST00000135814 2214 ntTSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Opn1swP51491 Smurf1-202ENSMUST00000100461 2725 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Opn1swP51491 Rcan1-202ENSMUST00000060005 2324 ntTSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Opn1swP51491 Gkap1-201ENSMUST00000091579 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Opn1swP51491 Maz-201ENSMUST00000032916 2347 ntTSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Opn1swP51491 Stard3nl-210ENSMUST00000222869 1030 ntTSL 5 BASIC22.39■■□□□ 1.17
Opn1swP51491 Fbll1-201ENSMUST00000160726 1503 ntAPPRIS P1 BASIC22.39■■□□□ 1.17
Opn1swP51491 Efemp2-201ENSMUST00000070118 1781 ntTSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
Opn1swP51491 Rras2-201ENSMUST00000069449 2275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
Opn1swP51491 Neurog2-201ENSMUST00000029587 2227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
Opn1swP51491 Dda1-209ENSMUST00000147642 1865 ntTSL 2 BASIC22.39■■□□□ 1.17
Opn1swP51491 Bin1-202ENSMUST00000091967 2118 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Opn1swP51491 Sowahd-201ENSMUST00000060057 1574 ntAPPRIS P1 BASIC22.37■■□□□ 1.17
Opn1swP51491 Rnd2-201ENSMUST00000001347 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Opn1swP51491 Gm24970-201ENSMUST00000175582 82 ntBASIC22.36■■□□□ 1.17
Opn1swP51491 Gm17494-201ENSMUST00000072769 1800 ntTSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Opn1swP51491 AC153890.1-201ENSMUST00000220021 2469 ntBASIC22.35■■□□□ 1.17
Opn1swP51491 Hrh3-208ENSMUST00000171736 906 ntTSL 5 BASIC22.35■■□□□ 1.17
Opn1swP51491 Kcna7-201ENSMUST00000107774 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Opn1swP51491 Junos-204ENSMUST00000128094 830 ntTSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Opn1swP51491 Gm527-201ENSMUST00000058135 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Opn1swP51491 E2f1-201ENSMUST00000000894 2755 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
Opn1swP51491 Igfbp3-202ENSMUST00000135887 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
Opn1swP51491 Tmem243-201ENSMUST00000115365 1040 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.32■■□□□ 1.16
Opn1swP51491 Cetn4-202ENSMUST00000075537 762 ntTSL 3 BASIC22.32■■□□□ 1.16
Opn1swP51491 E2f6-201ENSMUST00000020908 2418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
Opn1swP51491 Bok-205ENSMUST00000201863 883 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.31■■□□□ 1.16
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 12.9 ms