Protein–RNA interactions for Protein: P50220

Nkx2-1, Homeobox protein Nkx-2.1, mousemouse

Predictions only

Length 372 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Nkx2-1P50220 Zfp358-201ENSMUST00000061508 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.84
Nkx2-1P50220 Panx2-202ENSMUST00000161372 2314 ntTSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.84
Nkx2-1P50220 Grk2-210ENSMUST00000171123 1439 ntTSL 5 BASIC20.33■□□□□ 0.84
Nkx2-1P50220 Cadps-201ENSMUST00000067491 5421 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
Nkx2-1P50220 Nkx1-1-201ENSMUST00000173348 1209 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.32■□□□□ 0.84
Nkx2-1P50220 Aspscr1-201ENSMUST00000026135 1820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
Nkx2-1P50220 Gm27322-201ENSMUST00000184007 104 ntBASIC20.3■□□□□ 0.84
Nkx2-1P50220 Lmo2-201ENSMUST00000111139 1434 ntTSL 5 BASIC20.29■□□□□ 0.84
Nkx2-1P50220 Clk2-202ENSMUST00000121212 2154 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
Nkx2-1P50220 Pom121-201ENSMUST00000111171 5580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
Nkx2-1P50220 Gm960-204ENSMUST00000225896 2202 ntAPPRIS ALT2 BASIC20.29■□□□□ 0.84
Nkx2-1P50220 Clec2l-201ENSMUST00000114874 1428 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.28■□□□□ 0.84
Nkx2-1P50220 Arhgdia-201ENSMUST00000067936 2150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
Nkx2-1P50220 Hnrnpd-202ENSMUST00000072750 1537 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC20.27■□□□□ 0.84
Nkx2-1P50220 Gkap1-201ENSMUST00000091579 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
Nkx2-1P50220 Dapk3-202ENSMUST00000178422 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
Nkx2-1P50220 Smurf1-202ENSMUST00000100461 2725 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
Nkx2-1P50220 Maz-204ENSMUST00000206254 2282 ntTSL 5 BASIC20.27■□□□□ 0.83
Nkx2-1P50220 Mapk3-201ENSMUST00000050201 1267 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC20.26■□□□□ 0.83
Nkx2-1P50220 Mrps7-201ENSMUST00000058109 1962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
Nkx2-1P50220 AC153890.1-201ENSMUST00000220021 2469 ntBASIC20.25■□□□□ 0.83
Nkx2-1P50220 Smurf1-203ENSMUST00000110677 5420 ntTSL 5 BASIC20.24■□□□□ 0.83
Nkx2-1P50220 Irak1-207ENSMUST00000114360 2441 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
Nkx2-1P50220 Enho-201ENSMUST00000127306 1269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
Nkx2-1P50220 St7-202ENSMUST00000052113 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
Nkx2-1P50220 Gm30346-201ENSMUST00000218641 1699 ntBASIC20.23■□□□□ 0.83
Nkx2-1P50220 Clptm1l-201ENSMUST00000022102 2340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
Nkx2-1P50220 Eed-201ENSMUST00000107234 2067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
Nkx2-1P50220 Popdc3-202ENSMUST00000161803 1369 ntTSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
Nkx2-1P50220 Galnt12-202ENSMUST00000107744 2077 ntTSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
Nkx2-1P50220 E2f6-201ENSMUST00000020908 2418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
Nkx2-1P50220 Gm8066-201ENSMUST00000197762 485 ntTSL 3 BASIC20.22■□□□□ 0.83
Nkx2-1P50220 Fam69b-201ENSMUST00000074240 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
Nkx2-1P50220 Cited2-203ENSMUST00000219558 2411 ntAPPRIS P1 BASIC20.22■□□□□ 0.83
Nkx2-1P50220 Gm26115-201ENSMUST00000175605 87 ntBASIC20.21■□□□□ 0.83
Nkx2-1P50220 Akt1s1-202ENSMUST00000107880 1757 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
Nkx2-1P50220 Fam136a-201ENSMUST00000071492 1643 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
Nkx2-1P50220 Pdia5-201ENSMUST00000023550 1808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
Nkx2-1P50220 Rnf19b-201ENSMUST00000030584 2414 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.19■□□□□ 0.82
Nkx2-1P50220 Camsap1-212ENSMUST00000183461 5090 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.19■□□□□ 0.82
Nkx2-1P50220 Isoc1-201ENSMUST00000025503 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
Nkx2-1P50220 Crim1-201ENSMUST00000112498 5995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
Nkx2-1P50220 Zfp422-201ENSMUST00000057540 2375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
Nkx2-1P50220 Nr2f6-201ENSMUST00000002466 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
Nkx2-1P50220 Dazap1-201ENSMUST00000092305 1994 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
Nkx2-1P50220 AC166822.3-201ENSMUST00000227394 661 ntBASIC20.18■□□□□ 0.82
Nkx2-1P50220 E2f1-201ENSMUST00000000894 2755 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
Nkx2-1P50220 Gpr12-201ENSMUST00000036211 2219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Nkx2-1P50220 Olfm1-203ENSMUST00000102879 1072 ntTSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Nkx2-1P50220 Cdc42bpg-201ENSMUST00000025681 5995 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.16■□□□□ 0.82
Nkx2-1P50220 Ctbp1-211ENSMUST00000202868 2436 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Nkx2-1P50220 Fam220a-206ENSMUST00000196487 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Nkx2-1P50220 Peg12-201ENSMUST00000094339 2640 ntAPPRIS P1 BASIC20.13■□□□□ 0.81
Nkx2-1P50220 Pon2-201ENSMUST00000057792 2409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Nkx2-1P50220 Cdc14b-207ENSMUST00000221634 1953 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Nkx2-1P50220 Fam241a-201ENSMUST00000057198 1607 ntTSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Nkx2-1P50220 Rnf130-202ENSMUST00000102776 1502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Nkx2-1P50220 E030037K01Rik-201ENSMUST00000180928 1756 ntBASIC20.11■□□□□ 0.81
Nkx2-1P50220 Tm6sf1-201ENSMUST00000041890 2226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Nkx2-1P50220 Gm12184-201ENSMUST00000104959 1310 ntAPPRIS P1 BASIC20.1■□□□□ 0.81
Nkx2-1P50220 Slc39a13-201ENSMUST00000073575 2469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Nkx2-1P50220 Gm8109-201ENSMUST00000194076 746 ntBASIC20.1■□□□□ 0.81
Nkx2-1P50220 Mnx1-201ENSMUST00000001608 2018 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.1■□□□□ 0.81
Nkx2-1P50220 Ube2m-201ENSMUST00000005714 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Nkx2-1P50220 Qk-202ENSMUST00000097414 4658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
Nkx2-1P50220 Mpp6-202ENSMUST00000036236 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
Nkx2-1P50220 Hrk-201ENSMUST00000054836 5382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
Nkx2-1P50220 Dcaf15-202ENSMUST00000210279 2199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
Nkx2-1P50220 A730013G03Rik-202ENSMUST00000195012 2097 ntBASIC20.07■□□□□ 0.8
Nkx2-1P50220 Ica1-201ENSMUST00000038403 2075 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
Nkx2-1P50220 Stau2-210ENSMUST00000149320 2214 ntTSL 5 BASIC20.07■□□□□ 0.8
Nkx2-1P50220 Esyt2-201ENSMUST00000100986 5560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
Nkx2-1P50220 Syt7-201ENSMUST00000073899 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
Nkx2-1P50220 Zfp513-202ENSMUST00000114590 2228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
Nkx2-1P50220 Gas2l1-201ENSMUST00000037146 2686 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
Nkx2-1P50220 Sos2-201ENSMUST00000035773 5607 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.06■□□□□ 0.8
Nkx2-1P50220 Cadps-203ENSMUST00000112658 5458 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
Nkx2-1P50220 Atp5a1-202ENSMUST00000114748 2674 ntTSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
Nkx2-1P50220 Tcf15-201ENSMUST00000089112 980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
Nkx2-1P50220 Nhlrc1-201ENSMUST00000052747 2294 ntAPPRIS P1 BASIC20.04■□□□□ 0.8
Nkx2-1P50220 Dapk3-201ENSMUST00000047665 1676 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.03■□□□□ 0.8
Nkx2-1P50220 Eif4ebp1-201ENSMUST00000033880 1997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
Nkx2-1P50220 Fcho2-201ENSMUST00000040340 5122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
Nkx2-1P50220 Uncx-201ENSMUST00000172997 2498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
Nkx2-1P50220 Fus-201ENSMUST00000077609 1831 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
Nkx2-1P50220 Zbtb12-201ENSMUST00000052778 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
Nkx2-1P50220 Otud5-205ENSMUST00000115668 2543 ntTSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.79
Nkx2-1P50220 Prr3-201ENSMUST00000055454 2727 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
Nkx2-1P50220 Det1-201ENSMUST00000032839 2269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
Nkx2-1P50220 E2f5-201ENSMUST00000029069 1779 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
Nkx2-1P50220 Pou4f1-201ENSMUST00000053016 4445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
Nkx2-1P50220 Ubl4a-207ENSMUST00000178691 1038 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20■□□□□ 0.79
Nkx2-1P50220 Orai1-201ENSMUST00000051016 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
Nkx2-1P50220 6330403L08Rik-202ENSMUST00000187923 5522 ntBASIC19.99■□□□□ 0.79
Nkx2-1P50220 Mkrn1-202ENSMUST00000051671 1511 ntTSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
Nkx2-1P50220 Ywhaq-202ENSMUST00000103002 2110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
Nkx2-1P50220 Nans-201ENSMUST00000030018 2179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
Nkx2-1P50220 Hmx1-201ENSMUST00000087674 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
Nkx2-1P50220 Snta1-202ENSMUST00000109728 2131 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
Nkx2-1P50220 Snta1-201ENSMUST00000028991 2125 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 13.8 ms