Protein–RNA interactions for Protein: P48725

Pcnt, Pericentrin, mousemouse

Predictions only

Length 2,898 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PcntP48725 Bckdhb-201ENSMUST00000034801 1472 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.91■■□□□ 1.9
PcntP48725 Rexo2-210ENSMUST00000217037 609 ntTSL 3 BASIC26.91■■□□□ 1.9
PcntP48725 E130304I02Rik-202ENSMUST00000187873 696 ntTSL 1 (best) BASIC26.9■■□□□ 1.9
PcntP48725 Gm26508-201ENSMUST00000181285 1516 ntTSL 5 BASIC26.89■■□□□ 1.9
PcntP48725 Ccm2-201ENSMUST00000000388 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.88■■□□□ 1.89
PcntP48725 Pard6a-201ENSMUST00000093195 1265 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.88■■□□□ 1.89
PcntP48725 Frs3-201ENSMUST00000113296 2144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.86■■□□□ 1.89
PcntP48725 4930577N17Rik-201ENSMUST00000139771 1625 ntBASIC26.85■■□□□ 1.89
PcntP48725 Slc30a2-203ENSMUST00000105873 1224 ntTSL 5 BASIC26.84■■□□□ 1.89
PcntP48725 Bcl7b-202ENSMUST00000111187 564 ntTSL 1 (best) BASIC26.83■■□□□ 1.89
PcntP48725 Rab4b-201ENSMUST00000093040 1192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.83■■□□□ 1.88
PcntP48725 Reep6-203ENSMUST00000105355 2127 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.81■■□□□ 1.88
PcntP48725 Reep6-204ENSMUST00000105357 2127 ntTSL 1 (best) BASIC26.81■■□□□ 1.88
PcntP48725 Gm12100-201ENSMUST00000150255 1933 ntTSL 1 (best) BASIC26.81■■□□□ 1.88
PcntP48725 Ppa2-201ENSMUST00000029644 1226 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.81■■□□□ 1.88
PcntP48725 Emx1-201ENSMUST00000045942 1561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.81■■□□□ 1.88
PcntP48725 Igfbp7-201ENSMUST00000046746 1116 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.8■■□□□ 1.88
PcntP48725 Nkain2-201ENSMUST00000092602 558 ntBASIC26.8■■□□□ 1.88
PcntP48725 Mocs3-201ENSMUST00000099071 1973 ntAPPRIS P1 BASIC26.79■■□□□ 1.88
PcntP48725 E130218I03Rik-204ENSMUST00000131447 888 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.79■■□□□ 1.88
PcntP48725 Smarcad1-211ENSMUST00000204696 734 ntTSL 1 (best) BASIC26.78■■□□□ 1.88
PcntP48725 Krtap28-13-201ENSMUST00000188005 992 ntAPPRIS P1 BASIC26.77■■□□□ 1.88
PcntP48725 E2f4-201ENSMUST00000015003 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.76■■□□□ 1.87
PcntP48725 Tlx1-201ENSMUST00000026236 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.76■■□□□ 1.87
PcntP48725 Egr3-201ENSMUST00000035908 1509 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.76■■□□□ 1.87
PcntP48725 Nelfe-204ENSMUST00000173357 1399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.76■■□□□ 1.87
PcntP48725 Ankrd60-202ENSMUST00000119453 1084 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC26.75■■□□□ 1.87
PcntP48725 Tcte2-204ENSMUST00000130033 1462 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.74■■□□□ 1.87
PcntP48725 Amigo1-203ENSMUST00000106659 1360 ntTSL 1 (best) BASIC26.74■■□□□ 1.87
PcntP48725 Triobp-206ENSMUST00000130663 1660 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.73■■□□□ 1.87
PcntP48725 Fam241a-202ENSMUST00000199273 2234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.72■■□□□ 1.87
PcntP48725 Osbpl1a-209ENSMUST00000122175 1203 ntTSL 1 (best) BASIC26.71■■□□□ 1.87
PcntP48725 Azin2-201ENSMUST00000030581 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.69■■□□□ 1.86
PcntP48725 Fam136a-201ENSMUST00000071492 1643 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.69■■□□□ 1.86
PcntP48725 A030003K21Rik-201ENSMUST00000222600 830 ntAPPRIS P1 BASIC26.68■■□□□ 1.86
PcntP48725 Gm7334-201ENSMUST00000061681 1356 ntAPPRIS P1 BASIC26.66■■□□□ 1.86
PcntP48725 Mad2l2-202ENSMUST00000084129 1162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.66■■□□□ 1.86
PcntP48725 Cpsf4-201ENSMUST00000070487 1606 ntTSL 1 (best) BASIC26.66■■□□□ 1.86
PcntP48725 Gdf7-202ENSMUST00000220073 1399 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.66■■□□□ 1.86
PcntP48725 Ywhaq-202ENSMUST00000103002 2110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.65■■□□□ 1.86
PcntP48725 Smagp-202ENSMUST00000172334 952 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.65■■□□□ 1.86
PcntP48725 Prelid3b-201ENSMUST00000016401 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.64■■□□□ 1.86
PcntP48725 Fam89a-201ENSMUST00000055257 1338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.64■■□□□ 1.86
PcntP48725 Gm28052-201ENSMUST00000150388 380 ntTSL 3 BASIC26.64■■□□□ 1.86
PcntP48725 Tprgl-201ENSMUST00000030896 1724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.63■■□□□ 1.85
PcntP48725 Endog-201ENSMUST00000015481 1063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.61■■□□□ 1.85
PcntP48725 Mapkap1-201ENSMUST00000113123 1530 ntTSL 5 BASIC26.61■■□□□ 1.85
PcntP48725 Fam89b-202ENSMUST00000116558 1189 ntTSL 1 (best) BASIC26.6■■□□□ 1.85
PcntP48725 Hspd1-201ENSMUST00000027123 2423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.6■■□□□ 1.85
PcntP48725 Gltp-201ENSMUST00000012028 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.59■■□□□ 1.85
PcntP48725 Pwwp2a-202ENSMUST00000094294 1814 ntTSL 5 BASIC26.57■■□□□ 1.84
PcntP48725 Mrpl23-201ENSMUST00000038675 692 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.57■■□□□ 1.84
PcntP48725 Gm30346-201ENSMUST00000218641 1699 ntBASIC26.57■■□□□ 1.84
PcntP48725 Rbfox2-201ENSMUST00000048145 1720 ntTSL 1 (best) BASIC26.54■■□□□ 1.84
PcntP48725 Fam149b-201ENSMUST00000037698 924 ntTSL 1 (best) BASIC26.54■■□□□ 1.84
PcntP48725 Tceal3-201ENSMUST00000060904 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.54■■□□□ 1.84
PcntP48725 Ell2-205ENSMUST00000222194 434 ntTSL 3 BASIC26.53■■□□□ 1.84
PcntP48725 Gm15039-201ENSMUST00000118914 875 ntBASIC26.53■■□□□ 1.84
PcntP48725 Ybx2-205ENSMUST00000149194 1235 ntTSL 5 BASIC26.52■■□□□ 1.84
PcntP48725 Suds3-202ENSMUST00000166397 1694 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.52■■□□□ 1.84
PcntP48725 C2cd4b-201ENSMUST00000171652 1327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.5■■□□□ 1.83
PcntP48725 A530058N18Rik-208ENSMUST00000131299 1387 ntTSL 2 BASIC26.5■■□□□ 1.83
PcntP48725 Hs3st6-201ENSMUST00000044922 1219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.48■■□□□ 1.83
PcntP48725 Chtf8-205ENSMUST00000176515 694 ntTSL 2 BASIC26.48■■□□□ 1.83
PcntP48725 Gm5814-201ENSMUST00000177586 378 ntAPPRIS P1 BASIC26.48■■□□□ 1.83
PcntP48725 A430072P03Rik-201ENSMUST00000161480 1510 ntTSL 1 (best) BASIC26.47■■□□□ 1.83
PcntP48725 Gm27021-201ENSMUST00000181333 758 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC26.47■■□□□ 1.83
PcntP48725 Pm20d2-201ENSMUST00000098181 1445 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.47■■□□□ 1.83
PcntP48725 Sugct-202ENSMUST00000220514 1351 ntTSL 1 (best) BASIC26.47■■□□□ 1.83
PcntP48725 Paip1-203ENSMUST00000126957 1731 ntTSL 5 BASIC26.46■■□□□ 1.83
PcntP48725 Ppp2r2d-201ENSMUST00000041097 2081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.45■■□□□ 1.83
PcntP48725 Nectin3-203ENSMUST00000096052 1746 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.45■■□□□ 1.82
PcntP48725 Trappc6b-203ENSMUST00000217863 797 ntTSL 2 BASIC26.44■■□□□ 1.82
PcntP48725 Gpr137c-205ENSMUST00000227009 771 ntAPPRIS ALT2 BASIC26.44■■□□□ 1.82
PcntP48725 Hmx1-201ENSMUST00000087674 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.44■■□□□ 1.82
PcntP48725 Fgf20-201ENSMUST00000034014 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.44■■□□□ 1.82
PcntP48725 C130046K22Rik-201ENSMUST00000129780 727 ntTSL 5 BASIC26.43■■□□□ 1.82
PcntP48725 Unc119-203ENSMUST00000108295 1371 ntTSL 3 BASIC26.43■■□□□ 1.82
PcntP48725 Serpinb6a-201ENSMUST00000017188 1504 ntTSL 1 (best) BASIC26.43■■□□□ 1.82
PcntP48725 A030005K14Rik-201ENSMUST00000193762 1093 ntAPPRIS P1 BASIC26.42■■□□□ 1.82
PcntP48725 Ldb1-208ENSMUST00000185355 2088 ntTSL 1 (best) BASIC26.42■■□□□ 1.82
PcntP48725 Ildr2-207ENSMUST00000195557 1947 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.41■■□□□ 1.82
PcntP48725 Rbm17-201ENSMUST00000040314 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.4■■□□□ 1.82
PcntP48725 Card19-201ENSMUST00000048946 804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.4■■□□□ 1.82
PcntP48725 Dnajc19-202ENSMUST00000108195 659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.4■■□□□ 1.82
PcntP48725 Eif4e2-204ENSMUST00000113231 1119 ntTSL 1 (best) BASIC26.4■■□□□ 1.82
PcntP48725 Tmem200b-201ENSMUST00000094666 1370 ntAPPRIS P1 BASIC26.4■■□□□ 1.82
PcntP48725 Eva1b-202ENSMUST00000106150 1144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.39■■□□□ 1.82
PcntP48725 Pitpna-205ENSMUST00000179445 1665 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC26.39■■□□□ 1.81
PcntP48725 Paqr6-203ENSMUST00000147948 837 ntTSL 2 BASIC26.38■■□□□ 1.81
PcntP48725 Raly-204ENSMUST00000116389 1759 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.37■■□□□ 1.81
PcntP48725 P2rx2-205ENSMUST00000200037 1569 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.37■■□□□ 1.81
PcntP48725 Ccz1-201ENSMUST00000031621 1769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.37■■□□□ 1.81
PcntP48725 AC125444.1-201ENSMUST00000223536 639 ntAPPRIS P1 BASIC26.36■■□□□ 1.81
PcntP48725 Gm6311-201ENSMUST00000073790 878 ntBASIC26.36■■□□□ 1.81
PcntP48725 Tlx2-202ENSMUST00000174674 1514 ntTSL 1 (best) BASIC26.35■■□□□ 1.81
PcntP48725 Epcam-201ENSMUST00000053577 2040 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.35■■□□□ 1.81
PcntP48725 Ldb1-207ENSMUST00000156585 2014 ntTSL 1 (best) BASIC26.34■■□□□ 1.81
PcntP48725 Zmynd12-201ENSMUST00000094819 1464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.33■■□□□ 1.81
PcntP48725 Gm28529-202ENSMUST00000189675 670 ntTSL 2 BASIC26.33■■□□□ 1.81
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 45.5 ms