Protein–RNA interactions for Protein: P48025

Syk, Tyrosine-protein kinase SYK, mousemouse

Predictions only

Length 629 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SykP48025 Gm24970-201ENSMUST00000175582 82 ntBASIC25.7■■□□□ 1.7
SykP48025 5730480H06Rik-201ENSMUST00000030968 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.7
SykP48025 Raly-201ENSMUST00000029120 1802 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.7■■□□□ 1.7
SykP48025 Dazap1-203ENSMUST00000105362 2081 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
SykP48025 Nelfe-204ENSMUST00000173357 1399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
SykP48025 Ttc19-202ENSMUST00000101075 2193 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
SykP48025 Twist1-201ENSMUST00000049089 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
SykP48025 1810026B05Rik-202ENSMUST00000184554 782 ntTSL 3 BASIC25.68■■□□□ 1.7
SykP48025 Stard3nl-210ENSMUST00000222869 1030 ntTSL 5 BASIC25.68■■□□□ 1.7
SykP48025 Cdk2ap1-201ENSMUST00000031341 1315 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
SykP48025 Rbms1-202ENSMUST00000112509 1806 ntTSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
SykP48025 Tmem243-201ENSMUST00000115365 1040 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.66■■□□□ 1.7
SykP48025 Gm43863-201ENSMUST00000203822 1192 ntBASIC25.64■■□□□ 1.7
SykP48025 Tbx1-201ENSMUST00000009241 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
SykP48025 Dtnbp1-201ENSMUST00000072329 1362 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.62■■□□□ 1.69
SykP48025 Tlx3-201ENSMUST00000037746 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.62■■□□□ 1.69
SykP48025 Efemp2-201ENSMUST00000070118 1781 ntTSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
SykP48025 Mthfd2l-203ENSMUST00000202781 688 ntTSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
SykP48025 Il3ra-201ENSMUST00000090591 1614 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
SykP48025 Ppp1r3e-202ENSMUST00000177403 1957 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.6■■□□□ 1.69
SykP48025 Nrtn-201ENSMUST00000044752 1023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
SykP48025 Rnf220-212ENSMUST00000221654 1949 ntTSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
SykP48025 Zxda-201ENSMUST00000117281 2621 ntBASIC25.58■■□□□ 1.69
SykP48025 Rab40c-201ENSMUST00000026826 2466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.69
SykP48025 2310050C09Rik-201ENSMUST00000163439 1078 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.57■■□□□ 1.68
SykP48025 Gm527-203ENSMUST00000220993 1090 ntTSL 5 BASIC25.57■■□□□ 1.68
SykP48025 Cabp1-204ENSMUST00000112113 1621 ntTSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
SykP48025 Smad2-202ENSMUST00000091831 1645 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.56■■□□□ 1.68
SykP48025 A530058N18Rik-204ENSMUST00000141209 709 ntTSL 5 BASIC25.55■■□□□ 1.68
SykP48025 Sugct-202ENSMUST00000220514 1351 ntTSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
SykP48025 Eid2-201ENSMUST00000059596 1392 ntAPPRIS P1 BASIC25.55■■□□□ 1.68
SykP48025 C2cd4d-201ENSMUST00000169433 1321 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.54■■□□□ 1.68
SykP48025 Dlx6os2-201ENSMUST00000178206 1354 ntBASIC25.54■■□□□ 1.68
SykP48025 Crip2-201ENSMUST00000084882 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
SykP48025 Dcaf15-202ENSMUST00000210279 2199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
SykP48025 AC157572.2-201ENSMUST00000226970 908 ntBASIC25.52■■□□□ 1.68
SykP48025 Amigo1-203ENSMUST00000106659 1360 ntTSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
SykP48025 Cpsf4-201ENSMUST00000070487 1606 ntTSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
SykP48025 B4galt7-202ENSMUST00000100764 2195 ntTSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
SykP48025 Rundc3a-204ENSMUST00000107105 1861 ntTSL 1 (best) BASIC25.5■■□□□ 1.67
SykP48025 Ryk-203ENSMUST00000175883 2505 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.5■■□□□ 1.67
SykP48025 Dda1-209ENSMUST00000147642 1865 ntTSL 2 BASIC25.49■■□□□ 1.67
SykP48025 Dazap1-202ENSMUST00000105361 1537 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
SykP48025 Dleu2-206ENSMUST00000182537 318 ntTSL 2 BASIC25.49■■□□□ 1.67
SykP48025 Suds3-202ENSMUST00000166397 1694 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
SykP48025 Tnfsfm13-201ENSMUST00000108649 1049 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.48■■□□□ 1.67
SykP48025 Fam241a-201ENSMUST00000057198 1607 ntTSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
SykP48025 Reps1-206ENSMUST00000154718 2402 ntTSL 5 BASIC25.47■■□□□ 1.67
SykP48025 Gtf2a2-203ENSMUST00000119413 1034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
SykP48025 Smarcc2-205ENSMUST00000218228 603 ntTSL 5 BASIC25.46■■□□□ 1.67
SykP48025 Mxra7-202ENSMUST00000047715 757 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
SykP48025 Aspscr1-201ENSMUST00000026135 1820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
SykP48025 Pcgf5-201ENSMUST00000062389 1566 ntTSL 5 BASIC25.44■■□□□ 1.66
SykP48025 C1qtnf5-201ENSMUST00000114815 1215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
SykP48025 Gm20503-201ENSMUST00000174664 1294 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.43■■□□□ 1.66
SykP48025 Cdv3-205ENSMUST00000189896 1023 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
SykP48025 Dpf1-204ENSMUST00000108231 2040 ntTSL 5 BASIC25.42■■□□□ 1.66
SykP48025 Ctbp1-201ENSMUST00000079746 2279 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
SykP48025 Dut-202ENSMUST00000082122 1020 ntTSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
SykP48025 Cxxc4-203ENSMUST00000181904 5694 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC25.4■■□□□ 1.66
SykP48025 C1ql1-201ENSMUST00000057849 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
SykP48025 Mcat-201ENSMUST00000061882 1893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.66
SykP48025 Fgf20-201ENSMUST00000034014 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.65
SykP48025 Gm43445-201ENSMUST00000198564 2091 ntBASIC25.38■■□□□ 1.65
SykP48025 Rpl19-ps4-201ENSMUST00000167150 625 ntBASIC25.38■■□□□ 1.65
SykP48025 Lsm4-204ENSMUST00000210071 575 ntTSL 5 BASIC25.38■■□□□ 1.65
SykP48025 Galnt12-201ENSMUST00000045041 2288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
SykP48025 Gng13-201ENSMUST00000115108 347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
SykP48025 Gm9905-201ENSMUST00000065740 1845 ntBASIC25.36■■□□□ 1.65
SykP48025 A730013G03Rik-202ENSMUST00000195012 2097 ntBASIC25.36■■□□□ 1.65
SykP48025 Micu3-201ENSMUST00000068999 2219 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.36■■□□□ 1.65
SykP48025 Hexdc-202ENSMUST00000106117 2149 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
SykP48025 Ccdc9-202ENSMUST00000118976 2175 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
SykP48025 Zmynd12-201ENSMUST00000094819 1464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
SykP48025 Gm17494-201ENSMUST00000072769 1800 ntTSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
SykP48025 Stau2-210ENSMUST00000149320 2214 ntTSL 5 BASIC25.33■■□□□ 1.65
SykP48025 Pm20d2-201ENSMUST00000098181 1445 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.32■■□□□ 1.64
SykP48025 Dtnb-211ENSMUST00000173240 2218 ntTSL 5 BASIC25.32■■□□□ 1.64
SykP48025 Gm26508-201ENSMUST00000181285 1516 ntTSL 5 BASIC25.32■■□□□ 1.64
SykP48025 4930577N17Rik-201ENSMUST00000139771 1625 ntBASIC25.31■■□□□ 1.64
SykP48025 Pth1r-202ENSMUST00000166716 2219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
SykP48025 Clk2-201ENSMUST00000090927 2128 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
SykP48025 Stard10-202ENSMUST00000163799 1723 ntTSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
SykP48025 Upp2-202ENSMUST00000071543 2150 ntTSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
SykP48025 Gm6206-201ENSMUST00000133472 2199 ntBASIC25.28■■□□□ 1.64
SykP48025 Slc16a8-201ENSMUST00000039752 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
SykP48025 Yrdc-201ENSMUST00000102628 1634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
SykP48025 Cetn4-201ENSMUST00000071400 1808 ntTSL 5 BASIC25.26■■□□□ 1.63
SykP48025 Ppp1r14b-201ENSMUST00000070850 919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
SykP48025 4921531C22Rik-201ENSMUST00000150145 1905 ntTSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
SykP48025 Galnt12-202ENSMUST00000107744 2077 ntTSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
SykP48025 Tsen34-203ENSMUST00000108629 1238 ntTSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
SykP48025 A330023F24Rik-201ENSMUST00000181226 955 ntTSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
SykP48025 Zfp358-201ENSMUST00000061508 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
SykP48025 Tor1a-201ENSMUST00000028200 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
SykP48025 Cldn10-203ENSMUST00000100314 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
SykP48025 AC150314.2-201ENSMUST00000214135 834 ntTSL 5 BASIC25.23■■□□□ 1.63
SykP48025 Cldnd1-201ENSMUST00000023426 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
SykP48025 Zfp787-201ENSMUST00000094870 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
SykP48025 Msi2-202ENSMUST00000107908 695 ntTSL 5 BASIC25.22■■□□□ 1.63
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 213.6 ms