Protein–RNA interactions for Protein: P47963

Rpl13, 60S ribosomal protein L13, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 211 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rpl13P47963 Tbcel-204ENSMUST00000128959 1535 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.15■■□□□ 1.94
Rpl13P47963 Popdc3-201ENSMUST00000019994 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.15■■□□□ 1.94
Rpl13P47963 Rbms1-202ENSMUST00000112509 1806 ntTSL 1 (best) BASIC27.14■■□□□ 1.94
Rpl13P47963 Eif2ak3-204ENSMUST00000162950 927 ntTSL 1 (best) BASIC27.14■■□□□ 1.94
Rpl13P47963 Dpf1-204ENSMUST00000108231 2040 ntTSL 5 BASIC27.14■■□□□ 1.93
Rpl13P47963 Ildr2-205ENSMUST00000193860 2320 ntTSL 1 (best) BASIC27.12■■□□□ 1.93
Rpl13P47963 Gm527-201ENSMUST00000058135 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.12■■□□□ 1.93
Rpl13P47963 Kmt5a-202ENSMUST00000100709 1425 ntTSL 1 (best) BASIC27.11■■□□□ 1.93
Rpl13P47963 4921531C22Rik-201ENSMUST00000150145 1905 ntTSL 1 (best) BASIC27.11■■□□□ 1.93
Rpl13P47963 Dcaf15-202ENSMUST00000210279 2199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.1■■□□□ 1.93
Rpl13P47963 Aspscr1-201ENSMUST00000026135 1820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.09■■□□□ 1.93
Rpl13P47963 Hrh3-208ENSMUST00000171736 906 ntTSL 5 BASIC27.09■■□□□ 1.93
Rpl13P47963 Gm10762-201ENSMUST00000099385 1133 ntAPPRIS P1 BASIC27.09■■□□□ 1.93
Rpl13P47963 Dtnb-211ENSMUST00000173240 2218 ntTSL 5 BASIC27.09■■□□□ 1.93
Rpl13P47963 Cnnm3-201ENSMUST00000001166 5193 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC27.08■■□□□ 1.93
Rpl13P47963 Fam241a-201ENSMUST00000057198 1607 ntTSL 1 (best) BASIC27.07■■□□□ 1.92
Rpl13P47963 Smad2-202ENSMUST00000091831 1645 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC27.07■■□□□ 1.92
Rpl13P47963 Gm15672-201ENSMUST00000151512 1354 ntTSL 1 (best) BASIC27.07■■□□□ 1.92
Rpl13P47963 Fkbp8-202ENSMUST00000119353 1720 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.07■■□□□ 1.92
Rpl13P47963 Arl2bp-201ENSMUST00000034228 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.07■■□□□ 1.92
Rpl13P47963 Cetn4-201ENSMUST00000071400 1808 ntTSL 5 BASIC27.06■■□□□ 1.92
Rpl13P47963 Rbm17-201ENSMUST00000040314 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.06■■□□□ 1.92
Rpl13P47963 Clk2-201ENSMUST00000090927 2128 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.06■■□□□ 1.92
Rpl13P47963 Gm17494-201ENSMUST00000072769 1800 ntTSL 1 (best) BASIC27.06■■□□□ 1.92
Rpl13P47963 Snx3-201ENSMUST00000019939 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.06■■□□□ 1.92
Rpl13P47963 Zfp131-206ENSMUST00000223813 2561 ntAPPRIS P3 BASIC27.05■■□□□ 1.92
Rpl13P47963 Fbxo6-201ENSMUST00000030858 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.04■■□□□ 1.92
Rpl13P47963 A430072P03Rik-201ENSMUST00000161480 1510 ntTSL 1 (best) BASIC27.04■■□□□ 1.92
Rpl13P47963 Clk2-203ENSMUST00000121931 2112 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC27.03■■□□□ 1.92
Rpl13P47963 A530058N18Rik-208ENSMUST00000131299 1387 ntTSL 2 BASIC27.03■■□□□ 1.92
Rpl13P47963 Junos-204ENSMUST00000128094 830 ntTSL 1 (best) BASIC27.02■■□□□ 1.92
Rpl13P47963 5730480H06Rik-201ENSMUST00000030968 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.01■■□□□ 1.91
Rpl13P47963 Mpp6-203ENSMUST00000166318 2222 ntTSL 1 (best) BASIC27■■□□□ 1.91
Rpl13P47963 Tlx3-201ENSMUST00000037746 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.98■■□□□ 1.91
Rpl13P47963 1700016A09Rik-201ENSMUST00000192004 835 ntBASIC26.97■■□□□ 1.91
Rpl13P47963 Zfp131-205ENSMUST00000223812 663 ntBASIC26.97■■□□□ 1.91
Rpl13P47963 A730013G03Rik-202ENSMUST00000195012 2097 ntBASIC26.97■■□□□ 1.91
Rpl13P47963 Uncx-201ENSMUST00000172997 2498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.97■■□□□ 1.91
Rpl13P47963 Zfp358-201ENSMUST00000061508 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.96■■□□□ 1.91
Rpl13P47963 Tmem189-201ENSMUST00000006587 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.95■■□□□ 1.91
Rpl13P47963 Srp9-201ENSMUST00000027792 1367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.95■■□□□ 1.9
Rpl13P47963 Kdm2a-203ENSMUST00000116571 2413 ntTSL 1 (best) BASIC26.95■■□□□ 1.9
Rpl13P47963 Stau2-210ENSMUST00000149320 2214 ntTSL 5 BASIC26.94■■□□□ 1.9
Rpl13P47963 Galnt12-202ENSMUST00000107744 2077 ntTSL 1 (best) BASIC26.94■■□□□ 1.9
Rpl13P47963 Dedd-201ENSMUST00000064950 1618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.91■■□□□ 1.9
Rpl13P47963 Mogs-201ENSMUST00000032114 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.91■■□□□ 1.9
Rpl13P47963 Nelfe-204ENSMUST00000173357 1399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.91■■□□□ 1.9
Rpl13P47963 Gsk3a-201ENSMUST00000071739 2260 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC26.9■■□□□ 1.9
Rpl13P47963 Rab2a-201ENSMUST00000060232 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.89■■□□□ 1.9
Rpl13P47963 Cabp1-204ENSMUST00000112113 1621 ntTSL 1 (best) BASIC26.88■■□□□ 1.89
Rpl13P47963 1700069B07Rik-202ENSMUST00000191155 939 ntBASIC26.88■■□□□ 1.89
Rpl13P47963 Phf23-205ENSMUST00000135814 2214 ntTSL 1 (best) BASIC26.87■■□□□ 1.89
Rpl13P47963 March2-205ENSMUST00000173015 1418 ntTSL 3 BASIC26.87■■□□□ 1.89
Rpl13P47963 Caap1-201ENSMUST00000030313 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.86■■□□□ 1.89
Rpl13P47963 Rras2-201ENSMUST00000069449 2275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.86■■□□□ 1.89
Rpl13P47963 Ssx2ip-202ENSMUST00000106149 2416 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.86■■□□□ 1.89
Rpl13P47963 Cnnm3-202ENSMUST00000097776 5292 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.85■■□□□ 1.89
Rpl13P47963 Tdp2-203ENSMUST00000223804 1136 ntBASIC26.85■■□□□ 1.89
Rpl13P47963 Amer2-203ENSMUST00000225247 2662 ntBASIC26.85■■□□□ 1.89
Rpl13P47963 Suds3-202ENSMUST00000166397 1694 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.85■■□□□ 1.89
Rpl13P47963 Pard6a-205ENSMUST00000212430 1261 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.84■■□□□ 1.89
Rpl13P47963 Mcat-201ENSMUST00000061882 1893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.84■■□□□ 1.89
Rpl13P47963 Dazap1-201ENSMUST00000092305 1994 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.8■■□□□ 1.88
Rpl13P47963 Gm960-202ENSMUST00000177696 2262 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC26.8■■□□□ 1.88
Rpl13P47963 Sugct-202ENSMUST00000220514 1351 ntTSL 1 (best) BASIC26.8■■□□□ 1.88
Rpl13P47963 Twist1-201ENSMUST00000049089 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.79■■□□□ 1.88
Rpl13P47963 BC037032-205ENSMUST00000187080 508 ntTSL 5 BASIC26.79■■□□□ 1.88
Rpl13P47963 Mypop-203ENSMUST00000131087 1951 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.78■■□□□ 1.88
Rpl13P47963 Cldn10-203ENSMUST00000100314 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.78■■□□□ 1.88
Rpl13P47963 Dapk3-201ENSMUST00000047665 1676 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.78■■□□□ 1.88
Rpl13P47963 E030037K01Rik-201ENSMUST00000180928 1756 ntBASIC26.78■■□□□ 1.88
Rpl13P47963 Pcgf5-201ENSMUST00000062389 1566 ntTSL 5 BASIC26.77■■□□□ 1.88
Rpl13P47963 Terf2-201ENSMUST00000068388 1915 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.77■■□□□ 1.88
Rpl13P47963 Capns1-201ENSMUST00000001845 1600 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC26.76■■□□□ 1.87
Rpl13P47963 Eif4ebp1-201ENSMUST00000033880 1997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.76■■□□□ 1.87
Rpl13P47963 Amigo1-203ENSMUST00000106659 1360 ntTSL 1 (best) BASIC26.74■■□□□ 1.87
Rpl13P47963 Gltp-203ENSMUST00000112214 944 ntTSL 3 BASIC26.74■■□□□ 1.87
Rpl13P47963 C1ql1-201ENSMUST00000057849 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.74■■□□□ 1.87
Rpl13P47963 Il3ra-201ENSMUST00000090591 1614 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.73■■□□□ 1.87
Rpl13P47963 Kansl2-202ENSMUST00000116400 2110 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.73■■□□□ 1.87
Rpl13P47963 Gm9397-201ENSMUST00000200125 605 ntBASIC26.73■■□□□ 1.87
Rpl13P47963 Slc16a8-201ENSMUST00000039752 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.73■■□□□ 1.87
Rpl13P47963 Hdgf-201ENSMUST00000005017 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.72■■□□□ 1.87
Rpl13P47963 Gm43863-201ENSMUST00000203822 1192 ntBASIC26.72■■□□□ 1.87
Rpl13P47963 Tor1a-201ENSMUST00000028200 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.72■■□□□ 1.87
Rpl13P47963 Mat2b-201ENSMUST00000040167 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.71■■□□□ 1.87
Rpl13P47963 Stard10-202ENSMUST00000163799 1723 ntTSL 1 (best) BASIC26.7■■□□□ 1.87
Rpl13P47963 Tspan33-201ENSMUST00000046750 1994 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.7■■□□□ 1.86
Rpl13P47963 Odc1-201ENSMUST00000171737 2208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.7■■□□□ 1.86
Rpl13P47963 Eid2-201ENSMUST00000059596 1392 ntAPPRIS P1 BASIC26.7■■□□□ 1.86
Rpl13P47963 Terf2-203ENSMUST00000116425 2471 ntTSL 1 (best) BASIC26.7■■□□□ 1.86
Rpl13P47963 Cpsf4-201ENSMUST00000070487 1606 ntTSL 1 (best) BASIC26.69■■□□□ 1.86
Rpl13P47963 1810026B05Rik-206ENSMUST00000187421 519 ntTSL 3 BASIC26.69■■□□□ 1.86
Rpl13P47963 Grb2-202ENSMUST00000106495 2041 ntTSL 5 BASIC26.68■■□□□ 1.86
Rpl13P47963 Rtn2-201ENSMUST00000032559 1990 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.68■■□□□ 1.86
Rpl13P47963 Gsk3a-202ENSMUST00000108411 2248 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.68■■□□□ 1.86
Rpl13P47963 Fam120aos-201ENSMUST00000180775 1780 ntTSL 1 (best) BASIC26.67■■□□□ 1.86
Rpl13P47963 Rtn4r-201ENSMUST00000059589 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.67■■□□□ 1.86
Rpl13P47963 Qrich1-209ENSMUST00000194385 975 ntTSL 2 BASIC26.66■■□□□ 1.86
Rpl13P47963 Stard3nl-210ENSMUST00000222869 1030 ntTSL 5 BASIC26.66■■□□□ 1.86
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 27 ms