Protein–RNA interactions for Protein: P35601

Rfc1, Replication factor C subunit 1, mousemouse

Predictions only

Length 1,131 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rfc1P35601 Dda1-209ENSMUST00000147642 1865 ntTSL 2 BASIC25.78■■□□□ 1.72
Rfc1P35601 Clec2l-201ENSMUST00000114874 1428 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.77■■□□□ 1.72
Rfc1P35601 Cdr2-201ENSMUST00000033169 2525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
Rfc1P35601 Slc39a13-201ENSMUST00000073575 2469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.71
Rfc1P35601 Gm27322-201ENSMUST00000184007 104 ntBASIC25.76■■□□□ 1.71
Rfc1P35601 Fcnaos-201ENSMUST00000127642 1351 ntTSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
Rfc1P35601 Mapk3-201ENSMUST00000050201 1267 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC25.74■■□□□ 1.71
Rfc1P35601 Susd4-202ENSMUST00000153348 1898 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.74■■□□□ 1.71
Rfc1P35601 Caap1-201ENSMUST00000030313 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
Rfc1P35601 Gnaq-201ENSMUST00000025541 5644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
Rfc1P35601 Pax1-201ENSMUST00000109968 2643 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
Rfc1P35601 Eed-201ENSMUST00000107234 2067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
Rfc1P35601 Enho-201ENSMUST00000127306 1269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
Rfc1P35601 Gm8066-201ENSMUST00000197762 485 ntTSL 3 BASIC25.72■■□□□ 1.71
Rfc1P35601 Spata1-201ENSMUST00000029839 1920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
Rfc1P35601 Nans-201ENSMUST00000030018 2179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
Rfc1P35601 Dapk3-209ENSMUST00000219850 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.7
Rfc1P35601 Fam220a-201ENSMUST00000067145 2198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
Rfc1P35601 Syndig1l-201ENSMUST00000095550 2524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
Rfc1P35601 Mpp6-209ENSMUST00000204545 2418 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.69■■□□□ 1.7
Rfc1P35601 Irf2bp2-201ENSMUST00000054960 5080 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.68■■□□□ 1.7
Rfc1P35601 Tmem260-208ENSMUST00000226400 2281 ntAPPRIS ALT2 BASIC25.66■■□□□ 1.7
Rfc1P35601 Plpp2-201ENSMUST00000063879 1654 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.65■■□□□ 1.7
Rfc1P35601 AC166822.3-201ENSMUST00000227394 661 ntBASIC25.65■■□□□ 1.7
Rfc1P35601 Osbpl10-207ENSMUST00000183104 2477 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.65■■□□□ 1.7
Rfc1P35601 Epb41l4b-203ENSMUST00000095076 6746 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.65■■□□□ 1.7
Rfc1P35601 Isoc1-201ENSMUST00000025503 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.7
Rfc1P35601 Klhl35-201ENSMUST00000037359 1954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.7
Rfc1P35601 Dnpep-201ENSMUST00000066668 2488 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
Rfc1P35601 Mapk1-201ENSMUST00000023462 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
Rfc1P35601 Gm26115-201ENSMUST00000175605 87 ntBASIC25.61■■□□□ 1.69
Rfc1P35601 Acvr2b-202ENSMUST00000165044 2093 ntTSL 2 BASIC25.6■■□□□ 1.69
Rfc1P35601 Tnfsf12-202ENSMUST00000181810 1435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
Rfc1P35601 Ihh-201ENSMUST00000164097 2468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
Rfc1P35601 Foxn3-209ENSMUST00000177451 2882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
Rfc1P35601 Ei24-202ENSMUST00000163192 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
Rfc1P35601 Gnas-207ENSMUST00000109085 1789 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
Rfc1P35601 St3gal2-202ENSMUST00000117534 2177 ntTSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.68
Rfc1P35601 Tm6sf1-201ENSMUST00000041890 2226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
Rfc1P35601 B4galt7-202ENSMUST00000100764 2195 ntTSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
Rfc1P35601 Rundc3a-204ENSMUST00000107105 1861 ntTSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
Rfc1P35601 Olfm1-203ENSMUST00000102879 1072 ntTSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
Rfc1P35601 Gm8109-201ENSMUST00000194076 746 ntBASIC25.56■■□□□ 1.68
Rfc1P35601 Olfm1-201ENSMUST00000028177 2757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
Rfc1P35601 Gjc1-201ENSMUST00000068933 1903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
Rfc1P35601 Tnfsfm13-203ENSMUST00000180587 2235 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC25.54■■□□□ 1.68
Rfc1P35601 Gm12184-201ENSMUST00000104959 1310 ntAPPRIS P1 BASIC25.53■■□□□ 1.68
Rfc1P35601 Dtnb-211ENSMUST00000173240 2218 ntTSL 5 BASIC25.53■■□□□ 1.68
Rfc1P35601 Fzd9-201ENSMUST00000062572 2293 ntAPPRIS P1 BASIC25.53■■□□□ 1.68
Rfc1P35601 Cenpv-201ENSMUST00000018653 1032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
Rfc1P35601 Zfp91-201ENSMUST00000038627 5531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
Rfc1P35601 Abhd17a-201ENSMUST00000003436 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
Rfc1P35601 Gm6345-201ENSMUST00000180378 1691 ntBASIC25.51■■□□□ 1.67
Rfc1P35601 Ppp1cc-202ENSMUST00000102528 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.5■■□□□ 1.67
Rfc1P35601 Mnx1-201ENSMUST00000001608 2018 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.5■■□□□ 1.67
Rfc1P35601 Ssbp3-202ENSMUST00000072753 1924 ntTSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
Rfc1P35601 Rnf130-202ENSMUST00000102776 1502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
Rfc1P35601 Runx3-202ENSMUST00000119564 1855 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
Rfc1P35601 Vsig8-202ENSMUST00000177086 1519 ntTSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
Rfc1P35601 Reep6-203ENSMUST00000105355 2127 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
Rfc1P35601 Reep6-204ENSMUST00000105357 2127 ntTSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
Rfc1P35601 Fus-201ENSMUST00000077609 1831 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
Rfc1P35601 Dusp7-201ENSMUST00000172306 3213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
Rfc1P35601 Cpe-201ENSMUST00000048967 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
Rfc1P35601 Dhrs13-203ENSMUST00000122342 1791 ntTSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
Rfc1P35601 Ccsap-201ENSMUST00000034452 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
Rfc1P35601 Agpat5-201ENSMUST00000033847 2841 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
Rfc1P35601 Smarcc1-203ENSMUST00000197480 1949 ntTSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
Rfc1P35601 Crlf1-201ENSMUST00000008032 1644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
Rfc1P35601 Popdc3-202ENSMUST00000161803 1369 ntTSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
Rfc1P35601 Rras2-201ENSMUST00000069449 2275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
Rfc1P35601 St7-202ENSMUST00000052113 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
Rfc1P35601 Ccsap-202ENSMUST00000122421 2673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
Rfc1P35601 Rnf115-201ENSMUST00000029740 2209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
Rfc1P35601 Fbll1-201ENSMUST00000160726 1503 ntAPPRIS P1 BASIC25.42■■□□□ 1.66
Rfc1P35601 Homer3-206ENSMUST00000140212 2608 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
Rfc1P35601 Clk2-201ENSMUST00000090927 2128 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
Rfc1P35601 Brwd1-203ENSMUST00000113827 2382 ntTSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
Rfc1P35601 Pura-201ENSMUST00000051301 3145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
Rfc1P35601 Wnt2-201ENSMUST00000010941 2255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
Rfc1P35601 Foxa2-202ENSMUST00000109964 2070 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
Rfc1P35601 1700026D11Rik-201ENSMUST00000126910 2033 ntTSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.66
Rfc1P35601 Iars2-202ENSMUST00000110974 2431 ntTSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
Rfc1P35601 Mef2a-203ENSMUST00000076325 2664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
Rfc1P35601 Phf23-205ENSMUST00000135814 2214 ntTSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
Rfc1P35601 Rnf130-201ENSMUST00000054684 1415 ntTSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
Rfc1P35601 Fam168b-201ENSMUST00000047534 5030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
Rfc1P35601 Abhd17b-201ENSMUST00000052556 2475 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.35■■□□□ 1.65
Rfc1P35601 Tcf15-201ENSMUST00000089112 980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
Rfc1P35601 Guf1-201ENSMUST00000031113 1769 ntTSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
Rfc1P35601 Lmo2-201ENSMUST00000111139 1434 ntTSL 5 BASIC25.35■■□□□ 1.65
Rfc1P35601 Dync1i1-203ENSMUST00000115556 2718 ntTSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
Rfc1P35601 Mfsd5-201ENSMUST00000051341 1742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
Rfc1P35601 5031425E22Rik-201ENSMUST00000101522 2110 ntBASIC25.33■■□□□ 1.65
Rfc1P35601 Paip1-203ENSMUST00000126957 1731 ntTSL 5 BASIC25.32■■□□□ 1.64
Rfc1P35601 Cadm1-202ENSMUST00000085909 2126 ntTSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
Rfc1P35601 Sept11-208ENSMUST00000202308 1792 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.31■■□□□ 1.64
Rfc1P35601 Dpf1-204ENSMUST00000108231 2040 ntTSL 5 BASIC25.3■■□□□ 1.64
Rfc1P35601 Fam120a-201ENSMUST00000060805 5105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
Rfc1P35601 Homer3-201ENSMUST00000003669 2323 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 18.5 ms