Protein–RNA interactions for Protein: P33622

Apoc3, Apolipoprotein C-III, mousemouse

Predictions only

Length 99 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Apoc3P33622 Brwd1-203ENSMUST00000113827 2382 ntTSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
Apoc3P33622 Fcho2-201ENSMUST00000040340 5122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
Apoc3P33622 Cadm1-202ENSMUST00000085909 2126 ntTSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
Apoc3P33622 H2afy-202ENSMUST00000045788 1933 ntTSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
Apoc3P33622 Gm24109-201ENSMUST00000175489 103 ntBASIC21.09■□□□□ 0.97
Apoc3P33622 Smurf1-201ENSMUST00000085684 5343 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
Apoc3P33622 Clk2-201ENSMUST00000090927 2128 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
Apoc3P33622 Gm17641-201ENSMUST00000166328 2350 ntBASIC21.08■□□□□ 0.97
Apoc3P33622 Otud5-204ENSMUST00000115667 2708 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.08■□□□□ 0.96
Apoc3P33622 Fcnaos-201ENSMUST00000127642 1351 ntTSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.96
Apoc3P33622 Wwc1-201ENSMUST00000018993 4531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.96
Apoc3P33622 St7-202ENSMUST00000052113 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
Apoc3P33622 Bzw1-202ENSMUST00000186949 1492 ntTSL 5 BASIC21.07■□□□□ 0.96
Apoc3P33622 Ssbp3-202ENSMUST00000072753 1924 ntTSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
Apoc3P33622 5031425E22Rik-201ENSMUST00000101522 2110 ntBASIC21.06■□□□□ 0.96
Apoc3P33622 Homer3-201ENSMUST00000003669 2323 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
Apoc3P33622 Qk-202ENSMUST00000097414 4658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
Apoc3P33622 Gm6345-201ENSMUST00000180378 1691 ntBASIC21.04■□□□□ 0.96
Apoc3P33622 Kcnc3-203ENSMUST00000207493 2731 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.04■□□□□ 0.96
Apoc3P33622 Sox3-201ENSMUST00000135107 2065 ntAPPRIS P1 BASIC21.03■□□□□ 0.96
Apoc3P33622 Deaf1-201ENSMUST00000080553 2135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
Apoc3P33622 Slc22a17-208ENSMUST00000228119 2348 ntAPPRIS P1 BASIC21.02■□□□□ 0.96
Apoc3P33622 Ccz1-201ENSMUST00000031621 1769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
Apoc3P33622 Habp4-201ENSMUST00000021929 2564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
Apoc3P33622 Phf23-205ENSMUST00000135814 2214 ntTSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
Apoc3P33622 Ccdc9-201ENSMUST00000041010 2379 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
Apoc3P33622 Kctd15-202ENSMUST00000108069 2407 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.01■□□□□ 0.95
Apoc3P33622 Tgfbr1-205ENSMUST00000126171 1829 ntTSL 5 BASIC21.01■□□□□ 0.95
Apoc3P33622 Rnf19b-206ENSMUST00000168461 2532 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.01■□□□□ 0.95
Apoc3P33622 P3h4-201ENSMUST00000066489 2178 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
Apoc3P33622 Ptpn4-203ENSMUST00000163435 2365 ntTSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
Apoc3P33622 Raly-202ENSMUST00000058089 1747 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
Apoc3P33622 Ssbp3-203ENSMUST00000097934 1742 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.98■□□□□ 0.95
Apoc3P33622 Gm17494-201ENSMUST00000072769 1800 ntTSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
Apoc3P33622 Six3-201ENSMUST00000162695 2838 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.98■□□□□ 0.95
Apoc3P33622 Tmem143-201ENSMUST00000069772 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
Apoc3P33622 Tusc1-201ENSMUST00000066774 1374 ntAPPRIS P1 BASIC20.97■□□□□ 0.95
Apoc3P33622 Fam168b-203ENSMUST00000167518 5058 ntTSL 5 BASIC20.97■□□□□ 0.95
Apoc3P33622 Efcc1-202ENSMUST00000159570 2293 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.97■□□□□ 0.95
Apoc3P33622 Gjc1-201ENSMUST00000068933 1903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
Apoc3P33622 Vps37b-201ENSMUST00000040967 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
Apoc3P33622 Smarcc1-203ENSMUST00000197480 1949 ntTSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
Apoc3P33622 Cadps-201ENSMUST00000067491 5421 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
Apoc3P33622 Dpf1-204ENSMUST00000108231 2040 ntTSL 5 BASIC20.96■□□□□ 0.95
Apoc3P33622 Camsap1-212ENSMUST00000183461 5090 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.96■□□□□ 0.95
Apoc3P33622 Fam174a-201ENSMUST00000059975 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
Apoc3P33622 Grin2d-201ENSMUST00000002848 5431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
Apoc3P33622 B4galt2-201ENSMUST00000030266 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
Apoc3P33622 Taf4-201ENSMUST00000041618 4416 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
Apoc3P33622 Cdc42bpg-201ENSMUST00000025681 5995 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.95■□□□□ 0.94
Apoc3P33622 Paqr3-202ENSMUST00000112968 1875 ntTSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
Apoc3P33622 Ran-202ENSMUST00000111343 2423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
Apoc3P33622 Cdc14b-207ENSMUST00000221634 1953 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
Apoc3P33622 Pdcd4-201ENSMUST00000025931 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
Apoc3P33622 Fam204a-201ENSMUST00000065286 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
Apoc3P33622 Spats2-201ENSMUST00000063517 3065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
Apoc3P33622 Hnrnpl-201ENSMUST00000038572 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.91■□□□□ 0.94
Apoc3P33622 Tmem235-201ENSMUST00000093905 1820 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.9■□□□□ 0.94
Apoc3P33622 Prelid3b-201ENSMUST00000016401 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.94
Apoc3P33622 Det1-201ENSMUST00000032839 2269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.94
Apoc3P33622 Ei24-201ENSMUST00000115086 2220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.94
Apoc3P33622 Rtn4r-201ENSMUST00000059589 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.93
Apoc3P33622 Runx3-202ENSMUST00000119564 1855 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.93
Apoc3P33622 Igfbp3-201ENSMUST00000020702 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.93
Apoc3P33622 P3h3-201ENSMUST00000023958 2850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.93
Apoc3P33622 Neurl4-211ENSMUST00000177138 4886 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.93
Apoc3P33622 Kif1bp-206ENSMUST00000162525 2311 ntTSL 5 BASIC20.88■□□□□ 0.93
Apoc3P33622 Pdgfb-201ENSMUST00000000500 2918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
Apoc3P33622 H1f0-201ENSMUST00000180086 2287 ntAPPRIS P1 BASIC20.88■□□□□ 0.93
Apoc3P33622 Ubp1-204ENSMUST00000214095 2320 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
Apoc3P33622 Cadps-203ENSMUST00000112658 5458 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
Apoc3P33622 Ildr2-206ENSMUST00000194964 2467 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
Apoc3P33622 Ctage5-218ENSMUST00000177162 2728 ntTSL 5 BASIC20.86■□□□□ 0.93
Apoc3P33622 Usp12-201ENSMUST00000085614 4327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
Apoc3P33622 Tead1-203ENSMUST00000084705 2543 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
Apoc3P33622 Dvl1-208ENSMUST00000168552 2776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
Apoc3P33622 Zfp358-201ENSMUST00000061508 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
Apoc3P33622 Fkbp8-204ENSMUST00000119698 1799 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
Apoc3P33622 Rhou-201ENSMUST00000045487 3371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
Apoc3P33622 Esyt2-201ENSMUST00000100986 5560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
Apoc3P33622 Capns1-201ENSMUST00000001845 1600 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.85■□□□□ 0.93
Apoc3P33622 Msl2-202ENSMUST00000189616 2612 ntTSL 5 BASIC20.85■□□□□ 0.93
Apoc3P33622 Usp48-205ENSMUST00000105840 5741 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.84■□□□□ 0.93
Apoc3P33622 Gm23366-201ENSMUST00000175022 89 ntBASIC20.84■□□□□ 0.93
Apoc3P33622 Crim1-201ENSMUST00000112498 5995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
Apoc3P33622 2610307P16Rik-205ENSMUST00000148885 1870 ntTSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
Apoc3P33622 St6galnac6-203ENSMUST00000095044 2394 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
Apoc3P33622 Efemp2-201ENSMUST00000070118 1781 ntTSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
Apoc3P33622 Smurf1-203ENSMUST00000110677 5420 ntTSL 5 BASIC20.82■□□□□ 0.92
Apoc3P33622 Ddx43-201ENSMUST00000113367 2207 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.82■□□□□ 0.92
Apoc3P33622 Kcnc3-202ENSMUST00000107907 5281 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.82■□□□□ 0.92
Apoc3P33622 Tgfbrap1-202ENSMUST00000186694 5385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
Apoc3P33622 Hook1-201ENSMUST00000030306 5517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
Apoc3P33622 Il17rd-202ENSMUST00000223942 2186 ntBASIC20.81■□□□□ 0.92
Apoc3P33622 Mapk3-202ENSMUST00000057669 1800 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
Apoc3P33622 Dusp5-201ENSMUST00000038287 2473 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.8■□□□□ 0.92
Apoc3P33622 Slc25a28-201ENSMUST00000046038 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
Apoc3P33622 Lrrc75a-201ENSMUST00000057194 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
Apoc3P33622 AC122428.3-201ENSMUST00000215551 2290 ntBASIC20.8■□□□□ 0.92
Apoc3P33622 St7-208ENSMUST00000115419 2194 ntTSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 17.6 ms