Protein–RNA interactions for Protein: P33610

Prim2, DNA primase large subunit, mousemouse

Predictions only

Length 505 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Prim2P33610 A530058N18Rik-201ENSMUST00000128469 646 ntTSL 2 BASIC24.19■■□□□ 1.46
Prim2P33610 Sh3glb2-203ENSMUST00000113620 1694 ntTSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
Prim2P33610 4921531C22Rik-201ENSMUST00000150145 1905 ntTSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
Prim2P33610 Fcnaos-201ENSMUST00000127642 1351 ntTSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
Prim2P33610 E330040D14Rik-201ENSMUST00000192299 1374 ntBASIC24.16■■□□□ 1.46
Prim2P33610 Ube2f-202ENSMUST00000171112 1547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
Prim2P33610 Ring1-201ENSMUST00000025183 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
Prim2P33610 Ube2m-201ENSMUST00000005714 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
Prim2P33610 Sec63-201ENSMUST00000019937 6032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
Prim2P33610 Kcna7-201ENSMUST00000107774 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
Prim2P33610 Bok-201ENSMUST00000027499 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
Prim2P33610 Gnas-207ENSMUST00000109085 1789 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
Prim2P33610 Grb2-202ENSMUST00000106495 2041 ntTSL 5 BASIC24.11■■□□□ 1.45
Prim2P33610 Fam136a-201ENSMUST00000071492 1643 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
Prim2P33610 AC153890.1-201ENSMUST00000220021 2469 ntBASIC24.11■■□□□ 1.45
Prim2P33610 Ubp1-203ENSMUST00000116492 2111 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
Prim2P33610 Panx2-202ENSMUST00000161372 2314 ntTSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
Prim2P33610 Fam220a-206ENSMUST00000196487 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
Prim2P33610 Gpr12-201ENSMUST00000036211 2219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
Prim2P33610 Arx-202ENSMUST00000113947 2454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
Prim2P33610 Maz-204ENSMUST00000206254 2282 ntTSL 5 BASIC24.07■■□□□ 1.44
Prim2P33610 Gm5814-201ENSMUST00000177586 378 ntAPPRIS P1 BASIC24.05■■□□□ 1.44
Prim2P33610 Bok-205ENSMUST00000201863 883 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.05■■□□□ 1.44
Prim2P33610 Akt1s1-202ENSMUST00000107880 1757 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
Prim2P33610 Atp5a1-202ENSMUST00000114748 2674 ntTSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
Prim2P33610 Neurog2-201ENSMUST00000029587 2227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
Prim2P33610 Srsf9-201ENSMUST00000031513 1162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
Prim2P33610 Ier5l-201ENSMUST00000065134 2683 ntAPPRIS P1 BASIC24.02■■□□□ 1.44
Prim2P33610 Rcan1-202ENSMUST00000060005 2324 ntTSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
Prim2P33610 Gm266-201ENSMUST00000010673 1215 ntAPPRIS P1 BASIC24.01■■□□□ 1.43
Prim2P33610 Dyrk1a-202ENSMUST00000119878 5759 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.01■■□□□ 1.43
Prim2P33610 Irx4-201ENSMUST00000022095 2589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
Prim2P33610 Gm7334-201ENSMUST00000061681 1356 ntAPPRIS P1 BASIC24.01■■□□□ 1.43
Prim2P33610 Cnnm3-201ENSMUST00000001166 5193 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
Prim2P33610 Phlda1-201ENSMUST00000164773 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
Prim2P33610 Hoxc13-201ENSMUST00000001700 2461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
Prim2P33610 2210008F06Rik-201ENSMUST00000180805 1082 ntTSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
Prim2P33610 Gm42984-201ENSMUST00000195990 987 ntTSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
Prim2P33610 Suds3-202ENSMUST00000166397 1694 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
Prim2P33610 Fam220a-205ENSMUST00000169329 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
Prim2P33610 Terf2-201ENSMUST00000068388 1915 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
Prim2P33610 Fam60a-203ENSMUST00000111562 906 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.96■■□□□ 1.43
Prim2P33610 1700028N14Rik-201ENSMUST00000139621 747 ntTSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
Prim2P33610 Cnnm3-202ENSMUST00000097776 5292 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
Prim2P33610 Eif4e2-203ENSMUST00000113230 1569 ntTSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.43
Prim2P33610 Cited2-203ENSMUST00000219558 2411 ntAPPRIS P1 BASIC23.95■■□□□ 1.42
Prim2P33610 Dtnb-203ENSMUST00000164578 2355 ntTSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
Prim2P33610 E2f1-201ENSMUST00000000894 2755 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
Prim2P33610 Gm30346-201ENSMUST00000218641 1699 ntBASIC23.94■■□□□ 1.42
Prim2P33610 Macrod2-205ENSMUST00000110063 845 ntTSL 5 BASIC23.93■■□□□ 1.42
Prim2P33610 Cds2-203ENSMUST00000110158 1247 ntTSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
Prim2P33610 Snta1-202ENSMUST00000109728 2131 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
Prim2P33610 Snta1-201ENSMUST00000028991 2125 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
Prim2P33610 E2f6-201ENSMUST00000020908 2418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
Prim2P33610 Gjc1-201ENSMUST00000068933 1903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
Prim2P33610 Ccdc122-202ENSMUST00000095625 1195 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
Prim2P33610 Cetn4-201ENSMUST00000071400 1808 ntTSL 5 BASIC23.91■■□□□ 1.42
Prim2P33610 Cebpb-201ENSMUST00000070642 1504 ntAPPRIS P1 BASIC23.91■■□□□ 1.42
Prim2P33610 Hmx1-201ENSMUST00000087674 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
Prim2P33610 Hoxa13-201ENSMUST00000047993 1309 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.89■■□□□ 1.42
Prim2P33610 A530058N18Rik-207ENSMUST00000152254 1211 ntTSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.41
Prim2P33610 Nr2f6-201ENSMUST00000002466 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.41
Prim2P33610 6530409C15Rik-202ENSMUST00000143551 1573 ntTSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.41
Prim2P33610 CT030161.2-201ENSMUST00000218666 735 ntTSL 3 BASIC23.88■■□□□ 1.41
Prim2P33610 Aard-201ENSMUST00000090025 1348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
Prim2P33610 Sowahd-201ENSMUST00000060057 1574 ntAPPRIS P1 BASIC23.87■■□□□ 1.41
Prim2P33610 Tmeff1-202ENSMUST00000123476 1224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
Prim2P33610 Eif2ak3-204ENSMUST00000162950 927 ntTSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
Prim2P33610 Gas2l1-201ENSMUST00000037146 2686 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
Prim2P33610 Agap3-201ENSMUST00000024123 3207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
Prim2P33610 Peg12-201ENSMUST00000094339 2640 ntAPPRIS P1 BASIC23.85■■□□□ 1.41
Prim2P33610 Ica1-201ENSMUST00000038403 2075 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
Prim2P33610 Ywhaq-202ENSMUST00000103002 2110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
Prim2P33610 Rnf149-201ENSMUST00000062525 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
Prim2P33610 Rnd2-201ENSMUST00000001347 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
Prim2P33610 Zfp131-205ENSMUST00000223812 663 ntBASIC23.83■■□□□ 1.41
Prim2P33610 Mrps7-201ENSMUST00000058109 1962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
Prim2P33610 Clptm1l-201ENSMUST00000022102 2340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
Prim2P33610 Dda1-209ENSMUST00000147642 1865 ntTSL 2 BASIC23.81■■□□□ 1.4
Prim2P33610 Lpcat4-201ENSMUST00000028554 2275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
Prim2P33610 Gm6345-201ENSMUST00000180378 1691 ntBASIC23.81■■□□□ 1.4
Prim2P33610 Zfp422-201ENSMUST00000057540 2375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
Prim2P33610 Caap1-201ENSMUST00000030313 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
Prim2P33610 Ctbp1-211ENSMUST00000202868 2436 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
Prim2P33610 Runx3-202ENSMUST00000119564 1855 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
Prim2P33610 Znrf3-202ENSMUST00000143746 1022 ntTSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
Prim2P33610 Gm10762-201ENSMUST00000099385 1133 ntAPPRIS P1 BASIC23.8■■□□□ 1.4
Prim2P33610 Tcte2-204ENSMUST00000130033 1462 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
Prim2P33610 Susd4-202ENSMUST00000153348 1898 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.79■■□□□ 1.4
Prim2P33610 Scrt2-201ENSMUST00000064061 3395 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.78■■□□□ 1.4
Prim2P33610 Pitpna-205ENSMUST00000179445 1665 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.78■■□□□ 1.4
Prim2P33610 Zswim6-201ENSMUST00000105097 5456 ntTSL 5 BASIC23.78■■□□□ 1.4
Prim2P33610 Mfsd5-201ENSMUST00000051341 1742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
Prim2P33610 B4galt7-202ENSMUST00000100764 2195 ntTSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
Prim2P33610 Rundc3a-204ENSMUST00000107105 1861 ntTSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
Prim2P33610 Macrod1-201ENSMUST00000040261 1274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
Prim2P33610 Dapk3-202ENSMUST00000178422 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
Prim2P33610 Kcnq5-206ENSMUST00000173404 2775 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.74■■□□□ 1.39
Prim2P33610 Guf1-201ENSMUST00000031113 1769 ntTSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
Prim2P33610 Lrrc4b-201ENSMUST00000058667 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 154.6 ms