Protein–RNA interactions for Protein: P28271

Aco1, Cytoplasmic aconitate hydratase, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 889 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Aco1P28271 Gm6345-201ENSMUST00000180378 1691 ntBASIC28.63■■■□□ 2.17
Aco1P28271 Rab40c-201ENSMUST00000026826 2466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.62■■■□□ 2.17
Aco1P28271 Dazap1-203ENSMUST00000105362 2081 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.62■■■□□ 2.17
Aco1P28271 Twist1-201ENSMUST00000049089 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.61■■■□□ 2.17
Aco1P28271 A330023F24Rik-201ENSMUST00000181226 955 ntTSL 1 (best) BASIC28.61■■■□□ 2.17
Aco1P28271 Dapk3-202ENSMUST00000178422 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.58■■■□□ 2.17
Aco1P28271 Pitpna-205ENSMUST00000179445 1665 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC28.58■■■□□ 2.16
Aco1P28271 Dlx6os2-201ENSMUST00000178206 1354 ntBASIC28.57■■■□□ 2.16
Aco1P28271 Ryk-203ENSMUST00000175883 2505 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.56■■■□□ 2.16
Aco1P28271 Tcte2-204ENSMUST00000130033 1462 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.55■■■□□ 2.16
Aco1P28271 Raly-201ENSMUST00000029120 1802 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.55■■■□□ 2.16
Aco1P28271 Fam69b-201ENSMUST00000074240 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.54■■■□□ 2.16
Aco1P28271 Tsen34-203ENSMUST00000108629 1238 ntTSL 1 (best) BASIC28.54■■■□□ 2.16
Aco1P28271 Guf1-201ENSMUST00000031113 1769 ntTSL 1 (best) BASIC28.53■■■□□ 2.16
Aco1P28271 Cetn4-202ENSMUST00000075537 762 ntTSL 3 BASIC28.53■■■□□ 2.16
Aco1P28271 Triobp-206ENSMUST00000130663 1660 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.53■■■□□ 2.16
Aco1P28271 Reps1-206ENSMUST00000154718 2402 ntTSL 5 BASIC28.53■■■□□ 2.16
Aco1P28271 Srp9-201ENSMUST00000027792 1367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.52■■■□□ 2.16
Aco1P28271 Pradc1-202ENSMUST00000113770 610 ntTSL 1 (best) BASIC28.52■■■□□ 2.16
Aco1P28271 Gm15672-201ENSMUST00000151512 1354 ntTSL 1 (best) BASIC28.51■■■□□ 2.16
Aco1P28271 Gm43863-201ENSMUST00000203822 1192 ntBASIC28.51■■■□□ 2.15
Aco1P28271 Ssbp3-202ENSMUST00000072753 1924 ntTSL 1 (best) BASIC28.51■■■□□ 2.15
Aco1P28271 Smarcc1-203ENSMUST00000197480 1949 ntTSL 1 (best) BASIC28.5■■■□□ 2.15
Aco1P28271 Pfdn2-202ENSMUST00000135941 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.49■■■□□ 2.15
Aco1P28271 Pdia5-201ENSMUST00000023550 1808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.48■■■□□ 2.15
Aco1P28271 Crem-227ENSMUST00000149803 1422 ntTSL 1 (best) BASIC28.46■■■□□ 2.15
Aco1P28271 Egr3-201ENSMUST00000035908 1509 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC28.46■■■□□ 2.15
Aco1P28271 Rheb-201ENSMUST00000030787 1784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.46■■■□□ 2.15
Aco1P28271 Rnf220-212ENSMUST00000221654 1949 ntTSL 1 (best) BASIC28.44■■■□□ 2.14
Aco1P28271 Evx2-202ENSMUST00000173623 1428 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.43■■■□□ 2.14
Aco1P28271 Zxda-201ENSMUST00000117281 2621 ntBASIC28.42■■■□□ 2.14
Aco1P28271 Gm12523-201ENSMUST00000148844 599 ntTSL 5 BASIC28.42■■■□□ 2.14
Aco1P28271 2310050C09Rik-201ENSMUST00000163439 1078 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.42■■■□□ 2.14
Aco1P28271 Ccdc9-202ENSMUST00000118976 2175 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.42■■■□□ 2.14
Aco1P28271 Fkbp8-202ENSMUST00000119353 1720 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.41■■■□□ 2.14
Aco1P28271 Ppp1r3e-202ENSMUST00000177403 1957 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.41■■■□□ 2.14
Aco1P28271 Cib1-201ENSMUST00000065163 1047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.4■■■□□ 2.14
Aco1P28271 Ttc19-202ENSMUST00000101075 2193 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.37■■■□□ 2.13
Aco1P28271 Kmt5a-202ENSMUST00000100709 1425 ntTSL 1 (best) BASIC28.37■■■□□ 2.13
Aco1P28271 A530058N18Rik-204ENSMUST00000141209 709 ntTSL 5 BASIC28.37■■■□□ 2.13
Aco1P28271 Tbcel-204ENSMUST00000128959 1535 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.37■■■□□ 2.13
Aco1P28271 Rbms1-202ENSMUST00000112509 1806 ntTSL 1 (best) BASIC28.36■■■□□ 2.13
Aco1P28271 Il3ra-201ENSMUST00000090591 1614 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.36■■■□□ 2.13
Aco1P28271 Efemp2-201ENSMUST00000070118 1781 ntTSL 1 (best) BASIC28.36■■■□□ 2.13
Aco1P28271 Rbm17-201ENSMUST00000040314 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.34■■■□□ 2.13
Aco1P28271 Cdv3-205ENSMUST00000189896 1023 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.33■■■□□ 2.13
Aco1P28271 A430072P03Rik-201ENSMUST00000161480 1510 ntTSL 1 (best) BASIC28.32■■■□□ 2.12
Aco1P28271 AC157572.2-201ENSMUST00000226970 908 ntBASIC28.31■■■□□ 2.12
Aco1P28271 A530058N18Rik-208ENSMUST00000131299 1387 ntTSL 2 BASIC28.3■■■□□ 2.12
Aco1P28271 Dleu2-206ENSMUST00000182537 318 ntTSL 2 BASIC28.3■■■□□ 2.12
Aco1P28271 AY074887-201ENSMUST00000054018 769 ntAPPRIS P1 BASIC28.29■■■□□ 2.12
Aco1P28271 Popdc3-201ENSMUST00000019994 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.29■■■□□ 2.12
Aco1P28271 Eid2-201ENSMUST00000059596 1392 ntAPPRIS P1 BASIC28.28■■■□□ 2.12
Aco1P28271 Ctbp1-201ENSMUST00000079746 2279 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.28■■■□□ 2.12
Aco1P28271 B4galt7-202ENSMUST00000100764 2195 ntTSL 1 (best) BASIC28.27■■■□□ 2.12
Aco1P28271 Dcaf15-202ENSMUST00000210279 2199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.27■■■□□ 2.12
Aco1P28271 Nelfe-204ENSMUST00000173357 1399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.26■■■□□ 2.12
Aco1P28271 Tbx1-201ENSMUST00000009241 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.26■■■□□ 2.11
Aco1P28271 Upp2-202ENSMUST00000071543 2150 ntTSL 1 (best) BASIC28.26■■■□□ 2.11
Aco1P28271 Dazap1-202ENSMUST00000105361 1537 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC28.25■■■□□ 2.11
Aco1P28271 Pth1r-202ENSMUST00000166716 2219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.25■■■□□ 2.11
Aco1P28271 Gm9939-201ENSMUST00000067161 1154 ntBASIC28.25■■■□□ 2.11
Aco1P28271 Tlx3-201ENSMUST00000037746 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.24■■■□□ 2.11
Aco1P28271 Scx-201ENSMUST00000043089 1136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.24■■■□□ 2.11
Aco1P28271 5730480H06Rik-201ENSMUST00000030968 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.24■■■□□ 2.11
Aco1P28271 Snx3-201ENSMUST00000019939 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.24■■■□□ 2.11
Aco1P28271 Gm6206-201ENSMUST00000133472 2199 ntBASIC28.24■■■□□ 2.11
Aco1P28271 Rundc3a-204ENSMUST00000107105 1861 ntTSL 1 (best) BASIC28.23■■■□□ 2.11
Aco1P28271 Micu3-201ENSMUST00000068999 2219 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.23■■■□□ 2.11
Aco1P28271 Gm43445-201ENSMUST00000198564 2091 ntBASIC28.22■■■□□ 2.11
Aco1P28271 Dpf1-204ENSMUST00000108231 2040 ntTSL 5 BASIC28.22■■■□□ 2.11
Aco1P28271 Tcte3-201ENSMUST00000040746 788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.22■■■□□ 2.11
Aco1P28271 Tcte3-202ENSMUST00000097398 632 ntTSL 1 (best) BASIC28.22■■■□□ 2.11
Aco1P28271 Galnt12-201ENSMUST00000045041 2288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.21■■■□□ 2.11
Aco1P28271 Bcl7c-207ENSMUST00000207019 654 ntTSL 3 BASIC28.2■■■□□ 2.1
Aco1P28271 Suds3-202ENSMUST00000166397 1694 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.19■■■□□ 2.1
Aco1P28271 Eif5a-201ENSMUST00000043419 1437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.18■■■□□ 2.1
Aco1P28271 Uba52-205ENSMUST00000129909 705 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.17■■■□□ 2.1
Aco1P28271 Aspscr1-201ENSMUST00000026135 1820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.16■■■□□ 2.1
Aco1P28271 Gm9905-201ENSMUST00000065740 1845 ntBASIC28.15■■■□□ 2.1
Aco1P28271 Fam241a-201ENSMUST00000057198 1607 ntTSL 1 (best) BASIC28.15■■■□□ 2.1
Aco1P28271 Cpsf4-201ENSMUST00000070487 1606 ntTSL 1 (best) BASIC28.15■■■□□ 2.1
Aco1P28271 Sugct-202ENSMUST00000220514 1351 ntTSL 1 (best) BASIC28.14■■■□□ 2.1
Aco1P28271 Stau2-210ENSMUST00000149320 2214 ntTSL 5 BASIC28.13■■■□□ 2.09
Aco1P28271 Smad2-202ENSMUST00000091831 1645 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC28.13■■■□□ 2.09
Aco1P28271 Hexdc-202ENSMUST00000106117 2149 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.13■■■□□ 2.09
Aco1P28271 Cabp1-204ENSMUST00000112113 1621 ntTSL 1 (best) BASIC28.12■■■□□ 2.09
Aco1P28271 Ube2e2-205ENSMUST00000150727 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.12■■■□□ 2.09
Aco1P28271 Uba52-207ENSMUST00000140679 697 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.1■■■□□ 2.09
Aco1P28271 Gm29254-202ENSMUST00000189302 883 ntTSL 1 (best) BASIC28.1■■■□□ 2.09
Aco1P28271 Amigo1-203ENSMUST00000106659 1360 ntTSL 1 (best) BASIC28.09■■■□□ 2.09
Aco1P28271 4921531C22Rik-201ENSMUST00000150145 1905 ntTSL 1 (best) BASIC28.08■■■□□ 2.09
Aco1P28271 Clk2-201ENSMUST00000090927 2128 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC28.08■■■□□ 2.09
Aco1P28271 Stard3nl-201ENSMUST00000039694 1327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.08■■■□□ 2.09
Aco1P28271 Dda1-209ENSMUST00000147642 1865 ntTSL 2 BASIC28.08■■■□□ 2.09
Aco1P28271 Fam196a-201ENSMUST00000171394 2490 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.07■■■□□ 2.08
Aco1P28271 Adap1-201ENSMUST00000110865 2557 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.07■■■□□ 2.08
Aco1P28271 Gm26508-201ENSMUST00000181285 1516 ntTSL 5 BASIC28.07■■■□□ 2.08
Aco1P28271 Dtnb-211ENSMUST00000173240 2218 ntTSL 5 BASIC28.06■■■□□ 2.08
Aco1P28271 4930577N17Rik-201ENSMUST00000139771 1625 ntBASIC28.06■■■□□ 2.08
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 12.2 ms