Protein–RNA interactions for Protein: P23818

Gria1, Glutamate receptor 1, mousemouse

Predictions only

Length 907 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gria1P23818 Hdgf-201ENSMUST00000005017 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
Gria1P23818 Fezf2-202ENSMUST00000224023 1917 ntBASIC23.51■■□□□ 1.35
Gria1P23818 2210008F06Rik-201ENSMUST00000180805 1082 ntTSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
Gria1P23818 4921531C22Rik-201ENSMUST00000150145 1905 ntTSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
Gria1P23818 Gm6345-201ENSMUST00000180378 1691 ntBASIC23.5■■□□□ 1.35
Gria1P23818 Gm30346-201ENSMUST00000218641 1699 ntBASIC23.5■■□□□ 1.35
Gria1P23818 Ryk-201ENSMUST00000035142 2852 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
Gria1P23818 2410017I17Rik-202ENSMUST00000090537 2053 ntTSL 2 BASIC23.49■■□□□ 1.35
Gria1P23818 Gsk3a-202ENSMUST00000108411 2248 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.49■■□□□ 1.35
Gria1P23818 Runx3-202ENSMUST00000119564 1855 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
Gria1P23818 Gm7334-201ENSMUST00000061681 1356 ntAPPRIS P1 BASIC23.47■■□□□ 1.35
Gria1P23818 Ssbp3-202ENSMUST00000072753 1924 ntTSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
Gria1P23818 Srsf9-201ENSMUST00000031513 1162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
Gria1P23818 Igfbp3-202ENSMUST00000135887 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
Gria1P23818 Eif4e2-203ENSMUST00000113230 1569 ntTSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
Gria1P23818 Fam60a-203ENSMUST00000111562 906 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.44■■□□□ 1.34
Gria1P23818 Gpr27-201ENSMUST00000101122 2388 ntAPPRIS P1 BASIC23.44■■□□□ 1.34
Gria1P23818 Macrod2-205ENSMUST00000110063 845 ntTSL 5 BASIC23.43■■□□□ 1.34
Gria1P23818 Foxc1-201ENSMUST00000062292 5844 ntAPPRIS P1 BASIC23.43■■□□□ 1.34
Gria1P23818 Bin1-202ENSMUST00000091967 2118 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
Gria1P23818 Klhl25-205ENSMUST00000206019 2299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
Gria1P23818 Smarcc1-203ENSMUST00000197480 1949 ntTSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
Gria1P23818 Gm5814-201ENSMUST00000177586 378 ntAPPRIS P1 BASIC23.42■■□□□ 1.34
Gria1P23818 Maz-201ENSMUST00000032916 2347 ntTSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
Gria1P23818 Cebpb-201ENSMUST00000070642 1504 ntAPPRIS P1 BASIC23.41■■□□□ 1.34
Gria1P23818 B4galt7-202ENSMUST00000100764 2195 ntTSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
Gria1P23818 Cds2-203ENSMUST00000110158 1247 ntTSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
Gria1P23818 Susd4-202ENSMUST00000153348 1898 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.4■■□□□ 1.34
Gria1P23818 Rgs7-206ENSMUST00000194555 2431 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
Gria1P23818 Hmx1-201ENSMUST00000087674 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.34
Gria1P23818 Mrps7-201ENSMUST00000058109 1962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
Gria1P23818 Ccdc122-202ENSMUST00000095625 1195 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
Gria1P23818 Mfsd5-201ENSMUST00000051341 1742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
Gria1P23818 Adgrb1-203ENSMUST00000185682 2744 ntTSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
Gria1P23818 Aard-201ENSMUST00000090025 1348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
Gria1P23818 Rab40c-209ENSMUST00000179998 2456 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.37■■□□□ 1.33
Gria1P23818 Fam168b-201ENSMUST00000047534 5030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
Gria1P23818 Tmeff1-202ENSMUST00000123476 1224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
Gria1P23818 Ywhaq-202ENSMUST00000103002 2110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
Gria1P23818 6530409C15Rik-202ENSMUST00000143551 1573 ntTSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
Gria1P23818 Sowahd-201ENSMUST00000060057 1574 ntAPPRIS P1 BASIC23.36■■□□□ 1.33
Gria1P23818 Rundc3a-204ENSMUST00000107105 1861 ntTSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
Gria1P23818 Rcor2-201ENSMUST00000066646 2801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
Gria1P23818 Marveld2-202ENSMUST00000163163 2187 ntTSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
Gria1P23818 Hoxa13-201ENSMUST00000047993 1309 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.35■■□□□ 1.33
Gria1P23818 Fam120a-201ENSMUST00000060805 5105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
Gria1P23818 Grb2-202ENSMUST00000106495 2041 ntTSL 5 BASIC23.35■■□□□ 1.33
Gria1P23818 Guf1-201ENSMUST00000031113 1769 ntTSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
Gria1P23818 Kansl2-201ENSMUST00000023727 2311 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.34■■□□□ 1.33
Gria1P23818 Zfp91-201ENSMUST00000038627 5531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
Gria1P23818 Jag2-201ENSMUST00000075827 5106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
Gria1P23818 CT030161.2-201ENSMUST00000218666 735 ntTSL 3 BASIC23.33■■□□□ 1.33
Gria1P23818 Gm10762-201ENSMUST00000099385 1133 ntAPPRIS P1 BASIC23.33■■□□□ 1.33
Gria1P23818 Zfp131-205ENSMUST00000223812 663 ntBASIC23.32■■□□□ 1.32
Gria1P23818 Cetn4-201ENSMUST00000071400 1808 ntTSL 5 BASIC23.31■■□□□ 1.32
Gria1P23818 Rnd2-201ENSMUST00000001347 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
Gria1P23818 A530058N18Rik-207ENSMUST00000152254 1211 ntTSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
Gria1P23818 Dtnb-211ENSMUST00000173240 2218 ntTSL 5 BASIC23.3■■□□□ 1.32
Gria1P23818 Ubp1-203ENSMUST00000116492 2111 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
Gria1P23818 Terf2-201ENSMUST00000068388 1915 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
Gria1P23818 Dpf1-204ENSMUST00000108231 2040 ntTSL 5 BASIC23.28■■□□□ 1.32
Gria1P23818 Efemp2-201ENSMUST00000070118 1781 ntTSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
Gria1P23818 Macrod1-201ENSMUST00000040261 1274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
Gria1P23818 Dapk3-202ENSMUST00000178422 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
Gria1P23818 Eif2ak3-204ENSMUST00000162950 927 ntTSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
Gria1P23818 Suds3-202ENSMUST00000166397 1694 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
Gria1P23818 Irak1-207ENSMUST00000114360 2441 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
Gria1P23818 Gm960-204ENSMUST00000225896 2202 ntAPPRIS ALT2 BASIC23.26■■□□□ 1.31
Gria1P23818 Clk2-201ENSMUST00000090927 2128 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
Gria1P23818 Pitpna-205ENSMUST00000179445 1665 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.25■■□□□ 1.31
Gria1P23818 Smurf1-202ENSMUST00000100461 2725 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
Gria1P23818 Fam69b-201ENSMUST00000074240 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
Gria1P23818 Kcna7-201ENSMUST00000107774 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
Gria1P23818 Tcte2-204ENSMUST00000130033 1462 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
Gria1P23818 Pard6a-205ENSMUST00000212430 1261 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
Gria1P23818 Arhgdia-201ENSMUST00000067936 2150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
Gria1P23818 Neurog2-201ENSMUST00000029587 2227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
Gria1P23818 Caap1-201ENSMUST00000030313 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
Gria1P23818 Clk2-202ENSMUST00000121212 2154 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
Gria1P23818 Pdia5-201ENSMUST00000023550 1808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
Gria1P23818 Znrf3-202ENSMUST00000143746 1022 ntTSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
Gria1P23818 Dtnb-203ENSMUST00000164578 2355 ntTSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
Gria1P23818 Triobp-206ENSMUST00000130663 1660 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.19■■□□□ 1.3
Gria1P23818 Epb41l4b-203ENSMUST00000095076 6746 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.18■■□□□ 1.3
Gria1P23818 1700069B07Rik-202ENSMUST00000191155 939 ntBASIC23.18■■□□□ 1.3
Gria1P23818 Tbx1-201ENSMUST00000009241 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
Gria1P23818 Gm527-201ENSMUST00000058135 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
Gria1P23818 Phf23-205ENSMUST00000135814 2214 ntTSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
Gria1P23818 Pradc1-202ENSMUST00000113770 610 ntTSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
Gria1P23818 Gm17494-201ENSMUST00000072769 1800 ntTSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
Gria1P23818 Rheb-201ENSMUST00000030787 1784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
Gria1P23818 Panx2-202ENSMUST00000161372 2314 ntTSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
Gria1P23818 Irx4-201ENSMUST00000022095 2589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
Gria1P23818 Crem-227ENSMUST00000149803 1422 ntTSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
Gria1P23818 Dda1-209ENSMUST00000147642 1865 ntTSL 2 BASIC23.15■■□□□ 1.3
Gria1P23818 1700016A09Rik-201ENSMUST00000192004 835 ntBASIC23.15■■□□□ 1.3
Gria1P23818 Rras2-201ENSMUST00000069449 2275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
Gria1P23818 Fbxo6-201ENSMUST00000030858 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.3
Gria1P23818 Rcan1-202ENSMUST00000060005 2324 ntTSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.3
Gria1P23818 Aspscr1-201ENSMUST00000026135 1820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 49.1 ms