Protein–RNA interactions for Protein: P23813

Hoxd11, Homeobox protein Hox-D11, mousemouse

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Length 323 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Hoxd11P23813 2310050C09Rik-201ENSMUST00000163439 1078 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.82■■■□□ 2.36
Hoxd11P23813 Hoxa4-201ENSMUST00000101395 1594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.81■■■□□ 2.36
Hoxd11P23813 Crlf1-201ENSMUST00000008032 1644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.8■■■□□ 2.36
Hoxd11P23813 Trp53i13-201ENSMUST00000060417 1463 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.8■■■□□ 2.36
Hoxd11P23813 Ccdc85c-201ENSMUST00000136175 1302 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.79■■■□□ 2.36
Hoxd11P23813 Dnajc19-202ENSMUST00000108195 659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.79■■■□□ 2.36
Hoxd11P23813 Ccl25-201ENSMUST00000024004 1058 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.79■■■□□ 2.36
Hoxd11P23813 Hs3st6-201ENSMUST00000044922 1219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.79■■■□□ 2.36
Hoxd11P23813 Nfic-204ENSMUST00000117966 1655 ntTSL 1 (best) BASIC29.76■■■□□ 2.36
Hoxd11P23813 Gm13889-202ENSMUST00000148314 1240 ntAPPRIS P1 BASIC29.76■■■□□ 2.35
Hoxd11P23813 Fam89b-202ENSMUST00000116558 1189 ntTSL 1 (best) BASIC29.75■■■□□ 2.35
Hoxd11P23813 Ppp4c-211ENSMUST00000206570 1400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.75■■■□□ 2.35
Hoxd11P23813 C2cd4b-201ENSMUST00000171652 1327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.74■■■□□ 2.35
Hoxd11P23813 Pard6a-201ENSMUST00000093195 1265 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.74■■■□□ 2.35
Hoxd11P23813 Gm25007-201ENSMUST00000083808 133 ntBASIC29.73■■■□□ 2.35
Hoxd11P23813 4930412F09Rik-201ENSMUST00000139006 1017 ntTSL 1 (best) BASIC29.72■■■□□ 2.35
Hoxd11P23813 Cited4-201ENSMUST00000094814 1249 ntAPPRIS P1 BASIC29.71■■■□□ 2.35
Hoxd11P23813 Rnd2-201ENSMUST00000001347 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.7■■■□□ 2.35
Hoxd11P23813 Cox4i1-205ENSMUST00000181586 765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.7■■■□□ 2.35
Hoxd11P23813 AC163623.1-201ENSMUST00000213738 727 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC29.68■■■□□ 2.34
Hoxd11P23813 E330040D14Rik-201ENSMUST00000192299 1374 ntBASIC29.67■■■□□ 2.34
Hoxd11P23813 Nemp1-202ENSMUST00000118612 1522 ntTSL 1 (best) BASIC29.67■■■□□ 2.34
Hoxd11P23813 Faim-202ENSMUST00000112911 803 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC29.66■■■□□ 2.34
Hoxd11P23813 Eva1b-202ENSMUST00000106150 1144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.65■■■□□ 2.34
Hoxd11P23813 Unc119-203ENSMUST00000108295 1371 ntTSL 3 BASIC29.64■■■□□ 2.34
Hoxd11P23813 Eid2-201ENSMUST00000059596 1392 ntAPPRIS P1 BASIC29.64■■■□□ 2.33
Hoxd11P23813 Ube2f-202ENSMUST00000171112 1547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.63■■■□□ 2.33
Hoxd11P23813 Rnaseh2c-201ENSMUST00000025864 1126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.63■■■□□ 2.33
Hoxd11P23813 Serp2-204ENSMUST00000228055 705 ntBASIC29.62■■■□□ 2.33
Hoxd11P23813 Znrf1-207ENSMUST00000173506 1238 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.61■■■□□ 2.33
Hoxd11P23813 Gm42555-201ENSMUST00000199304 1039 ntBASIC29.61■■■□□ 2.33
Hoxd11P23813 AC157572.2-201ENSMUST00000226970 908 ntBASIC29.61■■■□□ 2.33
Hoxd11P23813 Sowahd-201ENSMUST00000060057 1574 ntAPPRIS P1 BASIC29.6■■■□□ 2.33
Hoxd11P23813 Gm29994-201ENSMUST00000195495 1193 ntBASIC29.59■■■□□ 2.33
Hoxd11P23813 Gm6311-201ENSMUST00000073790 878 ntBASIC29.58■■■□□ 2.33
Hoxd11P23813 Rps2-ps13-201ENSMUST00000117295 882 ntBASIC29.56■■■□□ 2.32
Hoxd11P23813 Gm12366-201ENSMUST00000121722 873 ntBASIC29.56■■■□□ 2.32
Hoxd11P23813 Rps2-206ENSMUST00000146867 962 ntTSL 5 BASIC29.56■■■□□ 2.32
Hoxd11P23813 Rps2-ps10-201ENSMUST00000076842 879 ntBASIC29.56■■■□□ 2.32
Hoxd11P23813 Gm5786-201ENSMUST00000085368 882 ntBASIC29.56■■■□□ 2.32
Hoxd11P23813 Nt5dc2-204ENSMUST00000227096 1848 ntAPPRIS P5 BASIC29.55■■■□□ 2.32
Hoxd11P23813 Endog-201ENSMUST00000015481 1063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.54■■■□□ 2.32
Hoxd11P23813 AC125444.1-201ENSMUST00000223536 639 ntAPPRIS P1 BASIC29.54■■■□□ 2.32
Hoxd11P23813 Gm28052-201ENSMUST00000150388 380 ntTSL 3 BASIC29.52■■■□□ 2.32
Hoxd11P23813 Isg20-201ENSMUST00000038142 1083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.52■■■□□ 2.32
Hoxd11P23813 Gm5812-201ENSMUST00000061073 957 ntBASIC29.52■■■□□ 2.32
Hoxd11P23813 Smagp-201ENSMUST00000066068 1132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.52■■■□□ 2.32
Hoxd11P23813 Paqr6-203ENSMUST00000147948 837 ntTSL 2 BASIC29.51■■■□□ 2.31
Hoxd11P23813 1700020L24Rik-201ENSMUST00000037378 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.51■■■□□ 2.31
Hoxd11P23813 Dleu7-201ENSMUST00000063169 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.5■■■□□ 2.31
Hoxd11P23813 Tmem240-202ENSMUST00000147721 817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.5■■■□□ 2.31
Hoxd11P23813 Gm7334-201ENSMUST00000061681 1356 ntAPPRIS P1 BASIC29.5■■■□□ 2.31
Hoxd11P23813 Vsig8-202ENSMUST00000177086 1519 ntTSL 1 (best) BASIC29.5■■■□□ 2.31
Hoxd11P23813 Gm10524-201ENSMUST00000181931 1893 ntBASIC29.49■■■□□ 2.31
Hoxd11P23813 Gjd3-201ENSMUST00000062931 837 ntAPPRIS P1 BASIC29.49■■■□□ 2.31
Hoxd11P23813 Srp9-201ENSMUST00000027792 1367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.48■■■□□ 2.31
Hoxd11P23813 AC158982.1-201ENSMUST00000228377 901 ntBASIC29.47■■■□□ 2.31
Hoxd11P23813 Gm27021-201ENSMUST00000181333 758 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC29.46■■■□□ 2.31
Hoxd11P23813 Abhd17a-204ENSMUST00000191440 1529 ntTSL 1 (best) BASIC29.45■■■□□ 2.31
Hoxd11P23813 Gm28510-201ENSMUST00000190572 928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.45■■■□□ 2.31
Hoxd11P23813 Il3ra-201ENSMUST00000090591 1614 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.44■■■□□ 2.3
Hoxd11P23813 Gli3-204ENSMUST00000141194 466 ntTSL 2 BASIC29.43■■■□□ 2.3
Hoxd11P23813 Card19-201ENSMUST00000048946 804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.43■■■□□ 2.3
Hoxd11P23813 Mir155hg-202ENSMUST00000185662 1362 ntTSL 5 BASIC29.42■■■□□ 2.3
Hoxd11P23813 Pi16-201ENSMUST00000114699 1243 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.41■■■□□ 2.3
Hoxd11P23813 Casd1-204ENSMUST00000181734 1063 ntTSL 5 BASIC29.41■■■□□ 2.3
Hoxd11P23813 Gm43573-201ENSMUST00000196445 570 ntTSL 5 BASIC29.41■■■□□ 2.3
Hoxd11P23813 Zcrb1-201ENSMUST00000076070 877 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.41■■■□□ 2.3
Hoxd11P23813 Bloc1s2-201ENSMUST00000079033 878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.41■■■□□ 2.3
Hoxd11P23813 Efhd1os-201ENSMUST00000138844 332 ntTSL 3 BASIC29.4■■■□□ 2.3
Hoxd11P23813 Cox17-201ENSMUST00000050273 444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.4■■■□□ 2.3
Hoxd11P23813 Erf-202ENSMUST00000116343 690 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC29.39■■■□□ 2.3
Hoxd11P23813 Gm27040-201ENSMUST00000181984 504 ntTSL 2 BASIC29.39■■■□□ 2.3
Hoxd11P23813 Dleu2-206ENSMUST00000182537 318 ntTSL 2 BASIC29.39■■■□□ 2.3
Hoxd11P23813 Gm42596-201ENSMUST00000196305 1958 ntBASIC29.39■■■□□ 2.29
Hoxd11P23813 Mrps28-201ENSMUST00000042148 783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.37■■■□□ 2.29
Hoxd11P23813 Abhd17a-201ENSMUST00000003436 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.36■■■□□ 2.29
Hoxd11P23813 Klhl15-202ENSMUST00000113908 1235 ntTSL 1 (best) BASIC29.35■■■□□ 2.29
Hoxd11P23813 Klhl15-203ENSMUST00000113911 1227 ntTSL 1 (best) BASIC29.35■■■□□ 2.29
Hoxd11P23813 Dapk3-209ENSMUST00000219850 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.34■■■□□ 2.29
Hoxd11P23813 Mipep-204ENSMUST00000225043 1548 ntBASIC29.34■■■□□ 2.29
Hoxd11P23813 Arpc5l-202ENSMUST00000112862 1339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.33■■■□□ 2.29
Hoxd11P23813 Tmem55b-206ENSMUST00000161166 1445 ntTSL 1 (best) BASIC29.33■■■□□ 2.29
Hoxd11P23813 Gm44136-201ENSMUST00000203819 1106 ntBASIC29.31■■■□□ 2.28
Hoxd11P23813 Sec24d-208ENSMUST00000200333 307 ntTSL 1 (best) BASIC29.29■■■□□ 2.28
Hoxd11P23813 AC153366.1-201ENSMUST00000218132 1056 ntTSL 1 (best) BASIC29.29■■■□□ 2.28
Hoxd11P23813 Gm13429-202ENSMUST00000128242 692 ntTSL 3 BASIC29.28■■■□□ 2.28
Hoxd11P23813 6530409C15Rik-202ENSMUST00000143551 1573 ntTSL 1 (best) BASIC29.27■■■□□ 2.28
Hoxd11P23813 Ranbp1-202ENSMUST00000115645 1085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.27■■■□□ 2.28
Hoxd11P23813 Dazap1-202ENSMUST00000105361 1537 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC29.25■■■□□ 2.27
Hoxd11P23813 AC167019.3-201ENSMUST00000228225 1266 ntBASIC29.25■■■□□ 2.27
Hoxd11P23813 Fbl-201ENSMUST00000042405 1197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.25■■■□□ 2.27
Hoxd11P23813 H2-Q5-202ENSMUST00000172979 998 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.24■■■□□ 2.27
Hoxd11P23813 Msrb1-201ENSMUST00000101800 1211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.23■■■□□ 2.27
Hoxd11P23813 Gm20865-201ENSMUST00000179095 856 ntAPPRIS P1 BASIC29.23■■■□□ 2.27
Hoxd11P23813 Gm37083-201ENSMUST00000195784 711 ntTSL 2 BASIC29.23■■■□□ 2.27
Hoxd11P23813 Cited1-202ENSMUST00000101336 1090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.21■■■□□ 2.27
Hoxd11P23813 C130046K22Rik-201ENSMUST00000129780 727 ntTSL 5 BASIC29.2■■■□□ 2.26
Hoxd11P23813 Rbmxl2-201ENSMUST00000098135 1472 ntAPPRIS P1 BASIC29.19■■■□□ 2.26
Hoxd11P23813 Gm43356-201ENSMUST00000196582 609 ntTSL 1 (best) BASIC29.19■■■□□ 2.26
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