Protein–RNA interactions for Protein: P21278

Gna11, Guanine nucleotide-binding protein subunit alpha-11, mousemouse

Predictions only

Length 359 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gna11P21278 Fkbp8-202ENSMUST00000119353 1720 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28,43■■■□□ 2,14
Gna11P21278 Pfdn2-202ENSMUST00000135941 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28,43■■■□□ 2,14
Gna11P21278 Ttc19-202ENSMUST00000101075 2193 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28,43■■■□□ 2,14
Gna11P21278 Rab40c-201ENSMUST00000026826 2466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28,42■■■□□ 2,14
Gna11P21278 5730480H06Rik-201ENSMUST00000030968 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28,42■■■□□ 2,14
Gna11P21278 Twist1-201ENSMUST00000049089 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28,42■■■□□ 2,14
Gna11P21278 Gm24970-201ENSMUST00000175582 82 ntBASIC28,41■■■□□ 2,14
Gna11P21278 1810026B05Rik-202ENSMUST00000184554 782 ntTSL 3 BASIC28,4■■■□□ 2,14
Gna11P21278 Stard3nl-210ENSMUST00000222869 1030 ntTSL 5 BASIC28,4■■■□□ 2,14
Gna11P21278 Rbms1-202ENSMUST00000112509 1806 ntTSL 1 (best) BASIC28,4■■■□□ 2,14
Gna11P21278 Cdk2ap1-201ENSMUST00000031341 1315 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28,4■■■□□ 2,14
Gna11P21278 Nelfe-204ENSMUST00000173357 1399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28,39■■■□□ 2,14
Gna11P21278 Tmem243-201ENSMUST00000115365 1040 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28,38■■■□□ 2,13
Gna11P21278 Gm43863-201ENSMUST00000203822 1192 ntBASIC28,36■■■□□ 2,13
Gna11P21278 Ppp1r3e-202ENSMUST00000177403 1957 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28,35■■■□□ 2,13
Gna11P21278 Dtnbp1-201ENSMUST00000072329 1362 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28,35■■■□□ 2,13
Gna11P21278 Efemp2-201ENSMUST00000070118 1781 ntTSL 1 (best) BASIC28,34■■■□□ 2,13
Gna11P21278 Tbx1-201ENSMUST00000009241 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28,34■■■□□ 2,13
Gna11P21278 Rnf220-212ENSMUST00000221654 1949 ntTSL 1 (best) BASIC28,33■■■□□ 2,13
Gna11P21278 Tlx3-201ENSMUST00000037746 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28,33■■■□□ 2,13
Gna11P21278 Mthfd2l-203ENSMUST00000202781 688 ntTSL 1 (best) BASIC28,33■■■□□ 2,13
Gna11P21278 Zxda-201ENSMUST00000117281 2621 ntBASIC28,32■■■□□ 2,12
Gna11P21278 Nrtn-201ENSMUST00000044752 1023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28,32■■■□□ 2,12
Gna11P21278 Il3ra-201ENSMUST00000090591 1614 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28,32■■■□□ 2,12
Gna11P21278 Ryk-203ENSMUST00000175883 2505 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28,31■■■□□ 2,12
Gna11P21278 Gm527-203ENSMUST00000220993 1090 ntTSL 5 BASIC28,29■■■□□ 2,12
Gna11P21278 2310050C09Rik-201ENSMUST00000163439 1078 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28,28■■■□□ 2,12
Gna11P21278 Reps1-206ENSMUST00000154718 2402 ntTSL 5 BASIC28,28■■■□□ 2,12
Gna11P21278 Cabp1-204ENSMUST00000112113 1621 ntTSL 1 (best) BASIC28,26■■■□□ 2,11
Gna11P21278 Smad2-202ENSMUST00000091831 1645 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC28,26■■■□□ 2,11
Gna11P21278 C2cd4d-201ENSMUST00000169433 1321 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC28,26■■■□□ 2,11
Gna11P21278 Dcaf15-202ENSMUST00000210279 2199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28,26■■■□□ 2,11
Gna11P21278 Crip2-201ENSMUST00000084882 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28,26■■■□□ 2,11
Gna11P21278 Sugct-202ENSMUST00000220514 1351 ntTSL 1 (best) BASIC28,25■■■□□ 2,11
Gna11P21278 Eid2-201ENSMUST00000059596 1392 ntAPPRIS P1 BASIC28,25■■■□□ 2,11
Gna11P21278 B4galt7-202ENSMUST00000100764 2195 ntTSL 1 (best) BASIC28,24■■■□□ 2,11
Gna11P21278 Dlx6os2-201ENSMUST00000178206 1354 ntBASIC28,24■■■□□ 2,11
Gna11P21278 A530058N18Rik-204ENSMUST00000141209 709 ntTSL 5 BASIC28,23■■■□□ 2,11
Gna11P21278 AC157572.2-201ENSMUST00000226970 908 ntBASIC28,22■■■□□ 2,11
Gna11P21278 Amigo1-203ENSMUST00000106659 1360 ntTSL 1 (best) BASIC28,22■■■□□ 2,11
Gna11P21278 Cpsf4-201ENSMUST00000070487 1606 ntTSL 1 (best) BASIC28,21■■■□□ 2,11
Gna11P21278 Suds3-202ENSMUST00000166397 1694 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28,2■■■□□ 2,11
Gna11P21278 Dazap1-202ENSMUST00000105361 1537 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC28,2■■■□□ 2,1
Gna11P21278 Gtf2a2-203ENSMUST00000119413 1034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28,2■■■□□ 2,1
Gna11P21278 Rundc3a-204ENSMUST00000107105 1861 ntTSL 1 (best) BASIC28,2■■■□□ 2,1
Gna11P21278 Tnfsfm13-201ENSMUST00000108649 1049 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28,19■■■□□ 2,1
Gna11P21278 Dleu2-206ENSMUST00000182537 318 ntTSL 2 BASIC28,19■■■□□ 2,1
Gna11P21278 Dda1-209ENSMUST00000147642 1865 ntTSL 2 BASIC28,18■■■□□ 2,1
Gna11P21278 Fam241a-201ENSMUST00000057198 1607 ntTSL 1 (best) BASIC28,18■■■□□ 2,1
Gna11P21278 Smarcc2-205ENSMUST00000218228 603 ntTSL 5 BASIC28,17■■■□□ 2,1
Gna11P21278 Mxra7-202ENSMUST00000047715 757 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28,17■■■□□ 2,1
Gna11P21278 Dpf1-204ENSMUST00000108231 2040 ntTSL 5 BASIC28,15■■■□□ 2,1
Gna11P21278 Ctbp1-201ENSMUST00000079746 2279 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28,14■■■□□ 2,1
Gna11P21278 Gm20503-201ENSMUST00000174664 1294 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28,13■■■□□ 2,09
Gna11P21278 Aspscr1-201ENSMUST00000026135 1820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28,13■■■□□ 2,09
Gna11P21278 Pcgf5-201ENSMUST00000062389 1566 ntTSL 5 BASIC28,12■■■□□ 2,09
Gna11P21278 Ccdc9-202ENSMUST00000118976 2175 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28,12■■■□□ 2,09
Gna11P21278 C1qtnf5-201ENSMUST00000114815 1215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28,12■■■□□ 2,09
Gna11P21278 Galnt12-201ENSMUST00000045041 2288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28,11■■■□□ 2,09
Gna11P21278 Gm43445-201ENSMUST00000198564 2091 ntBASIC28,11■■■□□ 2,09
Gna11P21278 Cdv3-205ENSMUST00000189896 1023 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28,11■■■□□ 2,09
Gna11P21278 Micu3-201ENSMUST00000068999 2219 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28,1■■■□□ 2,09
Gna11P21278 Dut-202ENSMUST00000082122 1020 ntTSL 1 (best) BASIC28,1■■■□□ 2,09
Gna11P21278 Mcat-201ENSMUST00000061882 1893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28,1■■■□□ 2,09
Gna11P21278 Lsm4-204ENSMUST00000210071 575 ntTSL 5 BASIC28,09■■■□□ 2,09
Gna11P21278 C1ql1-201ENSMUST00000057849 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28,08■■■□□ 2,09
Gna11P21278 A730013G03Rik-202ENSMUST00000195012 2097 ntBASIC28,08■■■□□ 2,09
Gna11P21278 Rpl19-ps4-201ENSMUST00000167150 625 ntBASIC28,08■■■□□ 2,09
Gna11P21278 Gng13-201ENSMUST00000115108 347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28,07■■■□□ 2,08
Gna11P21278 Fgf20-201ENSMUST00000034014 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28,07■■■□□ 2,08
Gna11P21278 Gm9905-201ENSMUST00000065740 1845 ntBASIC28,06■■■□□ 2,08
Gna11P21278 Pth1r-202ENSMUST00000166716 2219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28,06■■■□□ 2,08
Gna11P21278 Hexdc-202ENSMUST00000106117 2149 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28,05■■■□□ 2,08
Gna11P21278 Stau2-210ENSMUST00000149320 2214 ntTSL 5 BASIC28,04■■■□□ 2,08
Gna11P21278 Gm17494-201ENSMUST00000072769 1800 ntTSL 1 (best) BASIC28,04■■■□□ 2,08
Gna11P21278 Dtnb-211ENSMUST00000173240 2218 ntTSL 5 BASIC28,03■■■□□ 2,08
Gna11P21278 Clk2-201ENSMUST00000090927 2128 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC28,03■■■□□ 2,08
Gna11P21278 Upp2-202ENSMUST00000071543 2150 ntTSL 1 (best) BASIC28,03■■■□□ 2,08
Gna11P21278 Zmynd12-201ENSMUST00000094819 1464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28,02■■■□□ 2,08
Gna11P21278 Gm6206-201ENSMUST00000133472 2199 ntBASIC28,01■■■□□ 2,08
Gna11P21278 Pm20d2-201ENSMUST00000098181 1445 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28,01■■■□□ 2,07
Gna11P21278 4930577N17Rik-201ENSMUST00000139771 1625 ntBASIC28■■■□□ 2,07
Gna11P21278 Gm26508-201ENSMUST00000181285 1516 ntTSL 5 BASIC27,99■■■□□ 2,07
Gna11P21278 Stard10-202ENSMUST00000163799 1723 ntTSL 1 (best) BASIC27,99■■■□□ 2,07
Gna11P21278 Galnt12-202ENSMUST00000107744 2077 ntTSL 1 (best) BASIC27,98■■■□□ 2,07
Gna11P21278 Slc16a8-201ENSMUST00000039752 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27,97■■■□□ 2,07
Gna11P21278 4921531C22Rik-201ENSMUST00000150145 1905 ntTSL 1 (best) BASIC27,96■■■□□ 2,07
Gna11P21278 Cetn4-201ENSMUST00000071400 1808 ntTSL 5 BASIC27,95■■■□□ 2,07
Gna11P21278 Ppp1r14b-201ENSMUST00000070850 919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27,95■■■□□ 2,06
Gna11P21278 Yrdc-201ENSMUST00000102628 1634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27,95■■■□□ 2,06
Gna11P21278 Cldnd1-201ENSMUST00000023426 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27,94■■■□□ 2,06
Gna11P21278 Tsen34-203ENSMUST00000108629 1238 ntTSL 1 (best) BASIC27,93■■■□□ 2,06
Gna11P21278 A330023F24Rik-201ENSMUST00000181226 955 ntTSL 1 (best) BASIC27,93■■■□□ 2,06
Gna11P21278 AC150314.2-201ENSMUST00000214135 834 ntTSL 5 BASIC27,93■■■□□ 2,06
Gna11P21278 Zfp358-201ENSMUST00000061508 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27,93■■■□□ 2,06
Gna11P21278 Cldn10-203ENSMUST00000100314 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27,92■■■□□ 2,06
Gna11P21278 Zfp787-201ENSMUST00000094870 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27,91■■■□□ 2,06
Gna11P21278 Ildr2-205ENSMUST00000193860 2320 ntTSL 1 (best) BASIC27,91■■■□□ 2,06
Gna11P21278 Tspan33-201ENSMUST00000046750 1994 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27,9■■■□□ 2,06
Gna11P21278 Spg7-201ENSMUST00000108868 845 ntTSL 2 BASIC27,9■■■□□ 2,06
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 28,9 ms