Protein–RNA interactions for Protein: P18524

Ig heavy chain V region RF, mousemouse

Predictions only

Length 117 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
P18524 Eif2ak3-204ENSMUST00000162950 927 ntTSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
P18524 Dcaf15-202ENSMUST00000210279 2199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
P18524 Adgrb2-207ENSMUST00000120204 5170 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
P18524 Tbcel-204ENSMUST00000128959 1535 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.48■■□□□ 1.19
P18524 4921531C22Rik-201ENSMUST00000150145 1905 ntTSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
P18524 Popdc3-201ENSMUST00000019994 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
P18524 Gm15672-201ENSMUST00000151512 1354 ntTSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
P18524 Hrh3-208ENSMUST00000171736 906 ntTSL 5 BASIC22.45■■□□□ 1.18
P18524 Kmt5a-202ENSMUST00000100709 1425 ntTSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
P18524 Aspscr1-201ENSMUST00000026135 1820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
P18524 Dtnb-211ENSMUST00000173240 2218 ntTSL 5 BASIC22.45■■□□□ 1.18
P18524 Zxdb-201ENSMUST00000101388 5619 ntAPPRIS P1 BASIC22.44■■□□□ 1.18
P18524 Junos-204ENSMUST00000128094 830 ntTSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
P18524 Zfp131-205ENSMUST00000223812 663 ntBASIC22.44■■□□□ 1.18
P18524 Clk2-201ENSMUST00000090927 2128 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
P18524 Rbm17-201ENSMUST00000040314 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
P18524 Fbxo6-201ENSMUST00000030858 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
P18524 Dda1-209ENSMUST00000147642 1865 ntTSL 2 BASIC22.42■■□□□ 1.18
P18524 Fam241a-201ENSMUST00000057198 1607 ntTSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
P18524 Arl2bp-201ENSMUST00000034228 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
P18524 Mpp6-203ENSMUST00000166318 2222 ntTSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
P18524 Clk2-203ENSMUST00000121931 2112 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.4■■□□□ 1.18
P18524 Mogs-201ENSMUST00000032114 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
P18524 Cetn4-201ENSMUST00000071400 1808 ntTSL 5 BASIC22.39■■□□□ 1.17
P18524 Gm17494-201ENSMUST00000072769 1800 ntTSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
P18524 1700016A09Rik-201ENSMUST00000192004 835 ntBASIC22.39■■□□□ 1.17
P18524 A430072P03Rik-201ENSMUST00000161480 1510 ntTSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
P18524 Stau2-210ENSMUST00000149320 2214 ntTSL 5 BASIC22.39■■□□□ 1.17
P18524 Dedd-201ENSMUST00000064950 1618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
P18524 Smad2-202ENSMUST00000091831 1645 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.39■■□□□ 1.17
P18524 A530058N18Rik-208ENSMUST00000131299 1387 ntTSL 2 BASIC22.38■■□□□ 1.17
P18524 Tlx3-201ENSMUST00000037746 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
P18524 Galnt12-202ENSMUST00000107744 2077 ntTSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
P18524 Snx3-201ENSMUST00000019939 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
P18524 5730480H06Rik-201ENSMUST00000030968 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
P18524 1700069B07Rik-202ENSMUST00000191155 939 ntBASIC22.35■■□□□ 1.17
P18524 Pard6a-205ENSMUST00000212430 1261 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
P18524 A730013G03Rik-202ENSMUST00000195012 2097 ntBASIC22.35■■□□□ 1.17
P18524 Tmem189-201ENSMUST00000006587 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
P18524 Srp9-201ENSMUST00000027792 1367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
P18524 Phf23-205ENSMUST00000135814 2214 ntTSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.16
P18524 Gsk3a-201ENSMUST00000071739 2260 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.32■■□□□ 1.16
P18524 Kdm2a-203ENSMUST00000116571 2413 ntTSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
P18524 March2-205ENSMUST00000173015 1418 ntTSL 3 BASIC22.31■■□□□ 1.16
P18524 Amer2-203ENSMUST00000225247 2662 ntBASIC22.3■■□□□ 1.16
P18524 Dazap1-201ENSMUST00000092305 1994 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
P18524 Suds3-202ENSMUST00000166397 1694 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
P18524 Rras2-201ENSMUST00000069449 2275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
P18524 Nelfe-204ENSMUST00000173357 1399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
P18524 Gltp-203ENSMUST00000112214 944 ntTSL 3 BASIC22.28■■□□□ 1.16
P18524 Zfp358-201ENSMUST00000061508 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
P18524 Rab2a-201ENSMUST00000060232 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
P18524 Twist1-201ENSMUST00000049089 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
P18524 Ssx2ip-202ENSMUST00000106149 2416 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
P18524 BC037032-205ENSMUST00000187080 508 ntTSL 5 BASIC22.27■■□□□ 1.16
P18524 Tdp2-203ENSMUST00000223804 1136 ntBASIC22.27■■□□□ 1.16
P18524 Cabp1-204ENSMUST00000112113 1621 ntTSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
P18524 Caap1-201ENSMUST00000030313 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.15
P18524 Mcat-201ENSMUST00000061882 1893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
P18524 Gm9397-201ENSMUST00000200125 605 ntBASIC22.22■■□□□ 1.15
P18524 Capns1-201ENSMUST00000001845 1600 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.2■■□□□ 1.15
P18524 Hdgf-201ENSMUST00000005017 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
P18524 Sugct-202ENSMUST00000220514 1351 ntTSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
P18524 Gm960-202ENSMUST00000177696 2262 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.19■■□□□ 1.14
P18524 Amigo1-203ENSMUST00000106659 1360 ntTSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
P18524 Dapk3-201ENSMUST00000047665 1676 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.19■■□□□ 1.14
P18524 Mypop-203ENSMUST00000131087 1951 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.19■■□□□ 1.14
P18524 Cldn10-203ENSMUST00000100314 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
P18524 Odc1-201ENSMUST00000171737 2208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
P18524 Kansl2-202ENSMUST00000116400 2110 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
P18524 Eif4ebp1-201ENSMUST00000033880 1997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
P18524 Slc16a8-201ENSMUST00000039752 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
P18524 1810026B05Rik-206ENSMUST00000187421 519 ntTSL 3 BASIC22.18■■□□□ 1.14
P18524 Il3ra-201ENSMUST00000090591 1614 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
P18524 Pcgf5-201ENSMUST00000062389 1566 ntTSL 5 BASIC22.17■■□□□ 1.14
P18524 Irx4-201ENSMUST00000022095 2589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
P18524 Terf2-203ENSMUST00000116425 2471 ntTSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
P18524 Qrich1-209ENSMUST00000194385 975 ntTSL 2 BASIC22.16■■□□□ 1.14
P18524 Gm43863-201ENSMUST00000203822 1192 ntBASIC22.16■■□□□ 1.14
P18524 E030037K01Rik-201ENSMUST00000180928 1756 ntBASIC22.16■■□□□ 1.14
P18524 Eid2-201ENSMUST00000059596 1392 ntAPPRIS P1 BASIC22.15■■□□□ 1.14
P18524 C1ql1-201ENSMUST00000057849 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
P18524 Tor1a-201ENSMUST00000028200 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
P18524 1190005I06Rik-201ENSMUST00000123927 844 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
P18524 2310050C09Rik-201ENSMUST00000163439 1078 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.14■■□□□ 1.13
P18524 Stard3nl-210ENSMUST00000222869 1030 ntTSL 5 BASIC22.14■■□□□ 1.13
P18524 Stard10-202ENSMUST00000163799 1723 ntTSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
P18524 Tspan33-201ENSMUST00000046750 1994 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
P18524 Gsk3a-202ENSMUST00000108411 2248 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.14■■□□□ 1.13
P18524 Terf2-201ENSMUST00000068388 1915 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
P18524 Grb2-202ENSMUST00000106495 2041 ntTSL 5 BASIC22.13■■□□□ 1.13
P18524 Fam120aos-201ENSMUST00000180775 1780 ntTSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
P18524 Mat2b-201ENSMUST00000040167 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
P18524 Rtn4r-201ENSMUST00000059589 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
P18524 Cpsf4-201ENSMUST00000070487 1606 ntTSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
P18524 Gm24970-201ENSMUST00000175582 82 ntBASIC22.11■■□□□ 1.13
P18524 Dleu2-206ENSMUST00000182537 318 ntTSL 2 BASIC22.1■■□□□ 1.13
P18524 Gm45855-201ENSMUST00000212546 880 ntBASIC22.1■■□□□ 1.13
P18524 Yrdc-201ENSMUST00000102628 1634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
P18524 Dazap1-202ENSMUST00000105361 1537 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
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