Protein–RNA interactions for Protein: P0DN91

Tmem254c, Transmembrane protein 254c, mousemouse

Predictions only

Length 123 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tmem254cP0DN91 Nr2f6-201ENSMUST00000002466 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Tmem254cP0DN91 Taf4-204ENSMUST00000227325 4380 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.68■□□□□ 0.1
Tmem254cP0DN91 Irak1-202ENSMUST00000068286 2537 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Tmem254cP0DN91 Suds3-202ENSMUST00000166397 1694 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Tmem254cP0DN91 Clptm1l-201ENSMUST00000022102 2340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Tmem254cP0DN91 Nhlrc1-201ENSMUST00000052747 2294 ntAPPRIS P1 BASIC15.67■□□□□ 0.1
Tmem254cP0DN91 Cntln-204ENSMUST00000169371 5365 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.66■□□□□ 0.1
Tmem254cP0DN91 Ppp4r2-201ENSMUST00000063854 4874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Tmem254cP0DN91 Kmt2b-202ENSMUST00000108154 8454 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Tmem254cP0DN91 Pwwp2a-202ENSMUST00000094294 1814 ntTSL 5 BASIC15.65■□□□□ 0.1
Tmem254cP0DN91 Cdr2-201ENSMUST00000033169 2525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Tmem254cP0DN91 Ctbp1-211ENSMUST00000202868 2436 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Tmem254cP0DN91 Mypop-201ENSMUST00000059331 2173 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
Tmem254cP0DN91 Zfp422-201ENSMUST00000057540 2375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Tmem254cP0DN91 Lgi2-201ENSMUST00000039750 6456 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Tmem254cP0DN91 Arhgef26-201ENSMUST00000079300 5638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Tmem254cP0DN91 Fcho2-203ENSMUST00000109403 1523 ntTSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
Tmem254cP0DN91 Mprip-204ENSMUST00000116371 8766 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Tmem254cP0DN91 B4galt6-201ENSMUST00000070080 5808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Tmem254cP0DN91 1700026D11Rik-201ENSMUST00000126910 2033 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Tmem254cP0DN91 Pds5a-209ENSMUST00000201948 8934 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
Tmem254cP0DN91 Brd1-203ENSMUST00000109381 4886 ntTSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
Tmem254cP0DN91 Cetn4-201ENSMUST00000071400 1808 ntTSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Tmem254cP0DN91 Otud5-205ENSMUST00000115668 2543 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Tmem254cP0DN91 Slc30a1-201ENSMUST00000044954 5244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Tmem254cP0DN91 Phf10-201ENSMUST00000024657 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Tmem254cP0DN91 Stard10-201ENSMUST00000032927 1400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Tmem254cP0DN91 Dpy19l1-206ENSMUST00000170356 4715 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Tmem254cP0DN91 Ring1-201ENSMUST00000025183 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Tmem254cP0DN91 Slc39a13-201ENSMUST00000073575 2469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Tmem254cP0DN91 Osbpl10-207ENSMUST00000183104 2477 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Tmem254cP0DN91 Ksr1-201ENSMUST00000018478 5495 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Tmem254cP0DN91 St3gal2-202ENSMUST00000117534 2177 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Tmem254cP0DN91 Dnpep-201ENSMUST00000066668 2488 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Tmem254cP0DN91 Raly-204ENSMUST00000116389 1759 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Tmem254cP0DN91 Cdkn2c-202ENSMUST00000097921 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Tmem254cP0DN91 Eed-201ENSMUST00000107234 2067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Tmem254cP0DN91 Nans-201ENSMUST00000030018 2179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Tmem254cP0DN91 Mgrn1-201ENSMUST00000023159 3293 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Tmem254cP0DN91 Mgrn1-202ENSMUST00000070658 3290 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Tmem254cP0DN91 Lmtk3-202ENSMUST00000120005 4997 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Tmem254cP0DN91 Mfn1-201ENSMUST00000091257 4562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Tmem254cP0DN91 1810026B05Rik-203ENSMUST00000184587 5738 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Tmem254cP0DN91 Lemd3-202ENSMUST00000119944 4743 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Tmem254cP0DN91 Osbp-201ENSMUST00000025590 4578 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Tmem254cP0DN91 Klhl35-201ENSMUST00000037359 1954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Tmem254cP0DN91 Ei24-202ENSMUST00000163192 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Tmem254cP0DN91 Zcchc2-201ENSMUST00000118196 5796 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.07
Tmem254cP0DN91 Gsx1-201ENSMUST00000065382 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Tmem254cP0DN91 Mapk1-201ENSMUST00000023462 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Tmem254cP0DN91 AC124392.1-201ENSMUST00000225172 5324 ntBASIC15.51■□□□□ 0.07
Tmem254cP0DN91 Tmem260-208ENSMUST00000226400 2281 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Tmem254cP0DN91 Gm20634-201ENSMUST00000090779 2956 ntBASIC15.51■□□□□ 0.07
Tmem254cP0DN91 Tmem235-201ENSMUST00000093905 1820 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Tmem254cP0DN91 Syndig1l-201ENSMUST00000095550 2524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Tmem254cP0DN91 H2afy-202ENSMUST00000045788 1933 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Tmem254cP0DN91 Yy1-201ENSMUST00000021692 6178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Tmem254cP0DN91 Ccsap-202ENSMUST00000122421 2673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Tmem254cP0DN91 Ralgapa1-204ENSMUST00000219432 6631 ntTSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Tmem254cP0DN91 Homer3-206ENSMUST00000140212 2608 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Tmem254cP0DN91 Qk-201ENSMUST00000042296 6718 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Tmem254cP0DN91 Wnt2-201ENSMUST00000010941 2255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Tmem254cP0DN91 Dda1-209ENSMUST00000147642 1865 ntTSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Tmem254cP0DN91 Kcnmb4-201ENSMUST00000068233 1367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Tmem254cP0DN91 Foxa2-202ENSMUST00000109964 2070 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Tmem254cP0DN91 Cdan1-201ENSMUST00000110700 5996 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Tmem254cP0DN91 Caap1-201ENSMUST00000030313 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Tmem254cP0DN91 Ppp1cc-202ENSMUST00000102528 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Tmem254cP0DN91 Olfm1-201ENSMUST00000028177 2757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Tmem254cP0DN91 Nectin3-203ENSMUST00000096052 1746 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Tmem254cP0DN91 Ammecr1-201ENSMUST00000041317 5437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Tmem254cP0DN91 Foxn3-209ENSMUST00000177451 2882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
Tmem254cP0DN91 Fus-201ENSMUST00000077609 1831 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Tmem254cP0DN91 Mpp6-209ENSMUST00000204545 2418 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Tmem254cP0DN91 Gnai2-202ENSMUST00000192615 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Tmem254cP0DN91 Stat5b-201ENSMUST00000004143 5062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Tmem254cP0DN91 Trp53i13-201ENSMUST00000060417 1463 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Tmem254cP0DN91 B4galt7-202ENSMUST00000100764 2195 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Tmem254cP0DN91 Cadm1-202ENSMUST00000085909 2126 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Tmem254cP0DN91 Isoc1-201ENSMUST00000025503 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Tmem254cP0DN91 Dirc2-201ENSMUST00000023554 5395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Tmem254cP0DN91 Acvr2b-202ENSMUST00000165044 2093 ntTSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Tmem254cP0DN91 Znrf3-201ENSMUST00000109867 6311 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Tmem254cP0DN91 Slc22a17-208ENSMUST00000228119 2348 ntAPPRIS P1 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Tmem254cP0DN91 Ccsap-201ENSMUST00000034452 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Tmem254cP0DN91 Dusp7-201ENSMUST00000172306 3213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Tmem254cP0DN91 Fzd9-201ENSMUST00000062572 2293 ntAPPRIS P1 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Tmem254cP0DN91 Adgrb1-201ENSMUST00000042035 6228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Tmem254cP0DN91 Mnx1-201ENSMUST00000001608 2018 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Tmem254cP0DN91 Aars-201ENSMUST00000034441 5750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Tmem254cP0DN91 Gm17641-201ENSMUST00000166328 2350 ntBASIC15.42■□□□□ 0.06
Tmem254cP0DN91 Iars2-202ENSMUST00000110974 2431 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Tmem254cP0DN91 Capns1-201ENSMUST00000001845 1600 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Tmem254cP0DN91 Mras-201ENSMUST00000035045 4701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Tmem254cP0DN91 Tspan3-201ENSMUST00000034876 1716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Tmem254cP0DN91 Frmd4a-201ENSMUST00000075767 6761 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Tmem254cP0DN91 Hp1bp3-205ENSMUST00000105827 5155 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Tmem254cP0DN91 Zfp131-207ENSMUST00000224946 1783 ntBASIC15.4■□□□□ 0.06
Tmem254cP0DN91 Abhd17b-201ENSMUST00000052556 2475 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Tmem254cP0DN91 Rhobtb3-202ENSMUST00000109606 1676 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 17.8 ms