Protein–RNA interactions for Protein: P0DN90

Tmem254b, Transmembrane protein 254b, mousemouse

Predictions only

Length 123 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tmem254bP0DN90 Nr2f6-201ENSMUST00000002466 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Tmem254bP0DN90 Taf4-204ENSMUST00000227325 4380 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.68■□□□□ 0.1
Tmem254bP0DN90 Irak1-202ENSMUST00000068286 2537 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Tmem254bP0DN90 Suds3-202ENSMUST00000166397 1694 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Tmem254bP0DN90 Clptm1l-201ENSMUST00000022102 2340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Tmem254bP0DN90 Nhlrc1-201ENSMUST00000052747 2294 ntAPPRIS P1 BASIC15.67■□□□□ 0.1
Tmem254bP0DN90 Cntln-204ENSMUST00000169371 5365 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.66■□□□□ 0.1
Tmem254bP0DN90 Ppp4r2-201ENSMUST00000063854 4874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Tmem254bP0DN90 Kmt2b-202ENSMUST00000108154 8454 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Tmem254bP0DN90 Pwwp2a-202ENSMUST00000094294 1814 ntTSL 5 BASIC15.65■□□□□ 0.1
Tmem254bP0DN90 Cdr2-201ENSMUST00000033169 2525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Tmem254bP0DN90 Ctbp1-211ENSMUST00000202868 2436 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Tmem254bP0DN90 Mypop-201ENSMUST00000059331 2173 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
Tmem254bP0DN90 Zfp422-201ENSMUST00000057540 2375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Tmem254bP0DN90 Lgi2-201ENSMUST00000039750 6456 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Tmem254bP0DN90 Arhgef26-201ENSMUST00000079300 5638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Tmem254bP0DN90 Fcho2-203ENSMUST00000109403 1523 ntTSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
Tmem254bP0DN90 Mprip-204ENSMUST00000116371 8766 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Tmem254bP0DN90 B4galt6-201ENSMUST00000070080 5808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Tmem254bP0DN90 1700026D11Rik-201ENSMUST00000126910 2033 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Tmem254bP0DN90 Pds5a-209ENSMUST00000201948 8934 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
Tmem254bP0DN90 Brd1-203ENSMUST00000109381 4886 ntTSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
Tmem254bP0DN90 Cetn4-201ENSMUST00000071400 1808 ntTSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Tmem254bP0DN90 Otud5-205ENSMUST00000115668 2543 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Tmem254bP0DN90 Slc30a1-201ENSMUST00000044954 5244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Tmem254bP0DN90 Phf10-201ENSMUST00000024657 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Tmem254bP0DN90 Stard10-201ENSMUST00000032927 1400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Tmem254bP0DN90 Dpy19l1-206ENSMUST00000170356 4715 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Tmem254bP0DN90 Ring1-201ENSMUST00000025183 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Tmem254bP0DN90 Slc39a13-201ENSMUST00000073575 2469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Tmem254bP0DN90 Osbpl10-207ENSMUST00000183104 2477 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Tmem254bP0DN90 Ksr1-201ENSMUST00000018478 5495 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Tmem254bP0DN90 St3gal2-202ENSMUST00000117534 2177 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Tmem254bP0DN90 Dnpep-201ENSMUST00000066668 2488 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Tmem254bP0DN90 Raly-204ENSMUST00000116389 1759 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Tmem254bP0DN90 Cdkn2c-202ENSMUST00000097921 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Tmem254bP0DN90 Eed-201ENSMUST00000107234 2067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Tmem254bP0DN90 Nans-201ENSMUST00000030018 2179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Tmem254bP0DN90 Mgrn1-201ENSMUST00000023159 3293 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Tmem254bP0DN90 Mgrn1-202ENSMUST00000070658 3290 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Tmem254bP0DN90 Lmtk3-202ENSMUST00000120005 4997 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Tmem254bP0DN90 Mfn1-201ENSMUST00000091257 4562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Tmem254bP0DN90 1810026B05Rik-203ENSMUST00000184587 5738 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Tmem254bP0DN90 Lemd3-202ENSMUST00000119944 4743 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Tmem254bP0DN90 Osbp-201ENSMUST00000025590 4578 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Tmem254bP0DN90 Klhl35-201ENSMUST00000037359 1954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Tmem254bP0DN90 Ei24-202ENSMUST00000163192 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Tmem254bP0DN90 Zcchc2-201ENSMUST00000118196 5796 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.07
Tmem254bP0DN90 Gsx1-201ENSMUST00000065382 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Tmem254bP0DN90 Mapk1-201ENSMUST00000023462 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Tmem254bP0DN90 AC124392.1-201ENSMUST00000225172 5324 ntBASIC15.51■□□□□ 0.07
Tmem254bP0DN90 Tmem260-208ENSMUST00000226400 2281 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Tmem254bP0DN90 Gm20634-201ENSMUST00000090779 2956 ntBASIC15.51■□□□□ 0.07
Tmem254bP0DN90 Tmem235-201ENSMUST00000093905 1820 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Tmem254bP0DN90 Syndig1l-201ENSMUST00000095550 2524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Tmem254bP0DN90 H2afy-202ENSMUST00000045788 1933 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Tmem254bP0DN90 Yy1-201ENSMUST00000021692 6178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Tmem254bP0DN90 Ccsap-202ENSMUST00000122421 2673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Tmem254bP0DN90 Ralgapa1-204ENSMUST00000219432 6631 ntTSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Tmem254bP0DN90 Homer3-206ENSMUST00000140212 2608 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Tmem254bP0DN90 Qk-201ENSMUST00000042296 6718 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Tmem254bP0DN90 Wnt2-201ENSMUST00000010941 2255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Tmem254bP0DN90 Dda1-209ENSMUST00000147642 1865 ntTSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Tmem254bP0DN90 Kcnmb4-201ENSMUST00000068233 1367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Tmem254bP0DN90 Foxa2-202ENSMUST00000109964 2070 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Tmem254bP0DN90 Cdan1-201ENSMUST00000110700 5996 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Tmem254bP0DN90 Caap1-201ENSMUST00000030313 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Tmem254bP0DN90 Ppp1cc-202ENSMUST00000102528 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Tmem254bP0DN90 Olfm1-201ENSMUST00000028177 2757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Tmem254bP0DN90 Nectin3-203ENSMUST00000096052 1746 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Tmem254bP0DN90 Ammecr1-201ENSMUST00000041317 5437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Tmem254bP0DN90 Foxn3-209ENSMUST00000177451 2882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
Tmem254bP0DN90 Fus-201ENSMUST00000077609 1831 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Tmem254bP0DN90 Mpp6-209ENSMUST00000204545 2418 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Tmem254bP0DN90 Gnai2-202ENSMUST00000192615 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Tmem254bP0DN90 Stat5b-201ENSMUST00000004143 5062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Tmem254bP0DN90 Trp53i13-201ENSMUST00000060417 1463 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Tmem254bP0DN90 B4galt7-202ENSMUST00000100764 2195 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Tmem254bP0DN90 Cadm1-202ENSMUST00000085909 2126 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Tmem254bP0DN90 Isoc1-201ENSMUST00000025503 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Tmem254bP0DN90 Dirc2-201ENSMUST00000023554 5395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Tmem254bP0DN90 Acvr2b-202ENSMUST00000165044 2093 ntTSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Tmem254bP0DN90 Znrf3-201ENSMUST00000109867 6311 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Tmem254bP0DN90 Slc22a17-208ENSMUST00000228119 2348 ntAPPRIS P1 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Tmem254bP0DN90 Ccsap-201ENSMUST00000034452 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Tmem254bP0DN90 Dusp7-201ENSMUST00000172306 3213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Tmem254bP0DN90 Fzd9-201ENSMUST00000062572 2293 ntAPPRIS P1 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Tmem254bP0DN90 Adgrb1-201ENSMUST00000042035 6228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Tmem254bP0DN90 Mnx1-201ENSMUST00000001608 2018 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Tmem254bP0DN90 Aars-201ENSMUST00000034441 5750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Tmem254bP0DN90 Gm17641-201ENSMUST00000166328 2350 ntBASIC15.42■□□□□ 0.06
Tmem254bP0DN90 Iars2-202ENSMUST00000110974 2431 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Tmem254bP0DN90 Capns1-201ENSMUST00000001845 1600 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Tmem254bP0DN90 Mras-201ENSMUST00000035045 4701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Tmem254bP0DN90 Tspan3-201ENSMUST00000034876 1716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Tmem254bP0DN90 Frmd4a-201ENSMUST00000075767 6761 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Tmem254bP0DN90 Hp1bp3-205ENSMUST00000105827 5155 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Tmem254bP0DN90 Zfp131-207ENSMUST00000224946 1783 ntBASIC15.4■□□□□ 0.06
Tmem254bP0DN90 Abhd17b-201ENSMUST00000052556 2475 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Tmem254bP0DN90 Rhobtb3-202ENSMUST00000109606 1676 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 32 ms