Protein–RNA interactions for Protein: P01741

Ig heavy chain V region, mousemouse

Predictions only

Length 114 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
P01741 Rpl19-ps4-201ENSMUST00000167150 625 ntBASIC18.6■□□□□ 0.57
P01741 Gm527-203ENSMUST00000220993 1090 ntTSL 5 BASIC18.6■□□□□ 0.57
P01741 Fam120a-201ENSMUST00000060805 5105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
P01741 Tmem243-201ENSMUST00000115365 1040 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.59■□□□□ 0.57
P01741 Htra4-201ENSMUST00000084031 2180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
P01741 Egr3-201ENSMUST00000035908 1509 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
P01741 Srp9-201ENSMUST00000027792 1367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.57
P01741 Tnfsfm13-201ENSMUST00000108649 1049 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.58■□□□□ 0.56
P01741 Gm24970-201ENSMUST00000175582 82 ntBASIC18.58■□□□□ 0.56
P01741 Nrtn-201ENSMUST00000044752 1023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
P01741 Mxra7-202ENSMUST00000047715 757 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
P01741 Cyp26a1-201ENSMUST00000025946 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
P01741 Stard3nl-210ENSMUST00000222869 1030 ntTSL 5 BASIC18.57■□□□□ 0.56
P01741 Cebpb-201ENSMUST00000070642 1504 ntAPPRIS P1 BASIC18.57■□□□□ 0.56
P01741 Gm15672-201ENSMUST00000151512 1354 ntTSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
P01741 1810026B05Rik-202ENSMUST00000184554 782 ntTSL 3 BASIC18.56■□□□□ 0.56
P01741 Lsm4-204ENSMUST00000210071 575 ntTSL 5 BASIC18.55■□□□□ 0.56
P01741 Crip2-201ENSMUST00000084882 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
P01741 C2cd4d-201ENSMUST00000169433 1321 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.54■□□□□ 0.56
P01741 C1qtnf5-201ENSMUST00000114815 1215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
P01741 Pradc1-201ENSMUST00000032080 1038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
P01741 Kmt5a-202ENSMUST00000100709 1425 ntTSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
P01741 A430072P03Rik-201ENSMUST00000161480 1510 ntTSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
P01741 Sh3rf1-201ENSMUST00000034060 5479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
P01741 Mtch1-201ENSMUST00000095427 1922 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
P01741 Hexdc-202ENSMUST00000106117 2149 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
P01741 Twist1-201ENSMUST00000049089 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
P01741 Pradc1-202ENSMUST00000113770 610 ntTSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
P01741 Gm43863-201ENSMUST00000203822 1192 ntBASIC18.52■□□□□ 0.56
P01741 Tbcel-204ENSMUST00000128959 1535 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.52■□□□□ 0.56
P01741 Gm45716-202ENSMUST00000134929 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.55
P01741 Ythdf1-202ENSMUST00000108876 2272 ntTSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
P01741 Zswim5-201ENSMUST00000044823 5582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
P01741 Mrps7-201ENSMUST00000058109 1962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
P01741 Cbln1-201ENSMUST00000034076 2800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
P01741 Gjc1-201ENSMUST00000068933 1903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
P01741 Triobp-206ENSMUST00000130663 1660 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.49■□□□□ 0.55
P01741 Ppp1r14c-202ENSMUST00000217573 2013 ntTSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
P01741 Smad7-202ENSMUST00000168918 1882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
P01741 Gng13-201ENSMUST00000115108 347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
P01741 Smarcc2-205ENSMUST00000218228 603 ntTSL 5 BASIC18.48■□□□□ 0.55
P01741 Dut-202ENSMUST00000082122 1020 ntTSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
P01741 Ywhah-201ENSMUST00000019109 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
P01741 Zfp513-202ENSMUST00000114590 2228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
P01741 Slc16a6-203ENSMUST00000070872 2354 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
P01741 AC150314.2-201ENSMUST00000214135 834 ntTSL 5 BASIC18.47■□□□□ 0.55
P01741 Snx3-201ENSMUST00000019939 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
P01741 Rab40c-201ENSMUST00000026826 2466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
P01741 A530058N18Rik-208ENSMUST00000131299 1387 ntTSL 2 BASIC18.46■□□□□ 0.55
P01741 Nelfe-204ENSMUST00000173357 1399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
P01741 Hoxa13-203ENSMUST00000147595 2395 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC18.46■□□□□ 0.55
P01741 Gm20503-201ENSMUST00000174664 1294 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.45■□□□□ 0.54
P01741 Plekha3-201ENSMUST00000111920 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
P01741 5730480H06Rik-201ENSMUST00000030968 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
P01741 Cldn10-203ENSMUST00000100314 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
P01741 Apcdd1-202ENSMUST00000163716 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
P01741 Il3ra-201ENSMUST00000090591 1614 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
P01741 AC157572.2-201ENSMUST00000226970 908 ntBASIC18.43■□□□□ 0.54
P01741 Pdia5-201ENSMUST00000023550 1808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
P01741 Dapk3-202ENSMUST00000178422 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
P01741 A530058N18Rik-204ENSMUST00000141209 709 ntTSL 5 BASIC18.42■□□□□ 0.54
P01741 Rheb-201ENSMUST00000030787 1784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
P01741 Rbm17-201ENSMUST00000040314 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
P01741 Sugct-202ENSMUST00000220514 1351 ntTSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
P01741 Popdc3-201ENSMUST00000019994 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
P01741 2310050C09Rik-201ENSMUST00000163439 1078 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.4■□□□□ 0.54
P01741 Fam69b-201ENSMUST00000074240 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
P01741 Dlx6os2-201ENSMUST00000178206 1354 ntBASIC18.4■□□□□ 0.54
P01741 C530008M17Rik-201ENSMUST00000086909 1844 ntBASIC18.39■□□□□ 0.54
P01741 Susd4-202ENSMUST00000153348 1898 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.39■□□□□ 0.54
P01741 4932443I19Rik-201ENSMUST00000166277 799 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
P01741 Noxo1-201ENSMUST00000019464 2238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
P01741 Cnot6l-203ENSMUST00000122003 2089 ntTSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
P01741 Gm6345-201ENSMUST00000180378 1691 ntBASIC18.38■□□□□ 0.53
P01741 Ier5l-201ENSMUST00000065134 2683 ntAPPRIS P1 BASIC18.38■□□□□ 0.53
P01741 Dazap1-202ENSMUST00000105361 1537 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
P01741 Eid2-201ENSMUST00000059596 1392 ntAPPRIS P1 BASIC18.37■□□□□ 0.53
P01741 Guf1-201ENSMUST00000031113 1769 ntTSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
P01741 Runx3-202ENSMUST00000119564 1855 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
P01741 Ebag9-203ENSMUST00000227691 1945 ntAPPRIS P1 BASIC18.37■□□□□ 0.53
P01741 Galnt12-201ENSMUST00000045041 2288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
P01741 A330023F24Rik-201ENSMUST00000181226 955 ntTSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
P01741 Cdv3-205ENSMUST00000189896 1023 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
P01741 Gm9905-201ENSMUST00000065740 1845 ntBASIC18.36■□□□□ 0.53
P01741 Ppp1r14b-201ENSMUST00000070850 919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
P01741 Ryk-201ENSMUST00000035142 2852 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
P01741 Cpsf4-201ENSMUST00000070487 1606 ntTSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
P01741 Spg7-201ENSMUST00000108868 845 ntTSL 2 BASIC18.35■□□□□ 0.53
P01741 Dleu2-206ENSMUST00000182537 318 ntTSL 2 BASIC18.34■□□□□ 0.53
P01741 Fkbp8-202ENSMUST00000119353 1720 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
P01741 Mfsd5-201ENSMUST00000051341 1742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
P01741 Irx4-201ENSMUST00000022095 2589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
P01741 2810459M11Rik-201ENSMUST00000027429 1225 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
P01741 Tlx3-201ENSMUST00000037746 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
P01741 Irak1-207ENSMUST00000114360 2441 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
P01741 Gm6206-201ENSMUST00000133472 2199 ntBASIC18.31■□□□□ 0.52
P01741 Cabp1-204ENSMUST00000112113 1621 ntTSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
P01741 Jag2-201ENSMUST00000075827 5106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
P01741 Prr3-201ENSMUST00000055454 2727 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
P01741 St6galnac6-204ENSMUST00000095045 2536 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 12.8 ms